- Echobase-devel - mailman.cloud.codelutin.com

Fw: [Echobase-commits] [ANN] - EchoBase 2.2 released
by Tony Chemit Sept. 17, 2013

Sept. 17, 2013

Begin forwarded message: Date: Tue, 17 Sep 13 19:35:09 +0200 From: "forge.codelutin.com Release Notification" <noreply(a)forge.codelutin.com> To: echobase-commits(a)list.forge.codelutin.com Subject: [Echobase-commits] [ANN] - EchoBase 2.2 released The EchoBase team is pleased to announce the echobase-2.2 release! The French Institute for the Exploitation of the Sea (Ifremer) has designed an open software suite for storing fisheries acoustic data and computing acoustic indicators for survey-based ecosystem monitoring. It comprises a postgreSQL database designed to store acoustic, navigation and fishing data from ecosystemic surveys (EchoBase) and a suite of R codes (EchoR) for computing fish population indicators based on Echobase data. Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/echobase Changes ------- Changes in this version include: New features: o Spatialisation des données pour la production de cartes Issue: 3037. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Utiliser le favicon d'echobase pour les application embarquée Issue: 2876. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Permettre l'import séparé des voyages, transits, transects Issue: 3028. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Import de cartes avec paramètres non rattachés à une espèce de poissons (physique...) Issue: 3029. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Pouvoir se connecter à la base de travail avec un autre utilisateur Issue: 2245. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. Fixed Bugs: o Paramètres manquants dans la doc d'import de données Issue: 2250. Thanks to Mathieu Doray. Resolved by tchemit. Changes: o Normalisation du nom des requètes Issue: 2875. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Updates mavenpom to 4.1 Issue: 3049. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Mise à jour des librairies Issue: 2870. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Updates topia to 3.0-alpha-3 Issue: 3261. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Updates eugene to 2.7.1 Issue: 3260. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/echobase/files * echobase-referentiel-2.2.echobase - http://forge.codelutin.com/attachments/download/1085 * echobase-ui-2.2-embedded.war - http://forge.codelutin.com/attachments/download/1086 * echobase-ui-2.2-embedded.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/1087 * echobase-ui-2.2.war - http://forge.codelutin.com/attachments/download/1088 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -EchoBase team -- Tony Chemit -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: chemit(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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Précisions sur les données spatiales à visualiser
by Tony Chemit Sept. 16, 2013

Sept. 16, 2013

Bonjour Mathieu, J'ai avancé sur echobase (la spatialisation de la base + les améliorations sont faites). J'allais commencé la partie visualisation des données spatiales et j'ai des petits soucis... En fait on n'a pas assez discuté je pense de ce que tu voulais afficher et surtout comment l'afficher. Peux-tu de ton côté réflechir précisement sur ce que tu veux visualiser (quelles types de cellules, sur quels critères,...). Sélection des données --------------------- Pour t'aider/inspirer, je t'explique ce que j'ai commencé à faire sur le sujet : - sélection d'une campagne (*) - sélection d'un type de dataMetata (*) - sélection d'une catégorie (**) - sélection d'un échotype (**) (*) donnée obligatoire (**) une des données est obligatoire o Ne devrait pas aussi filtrer sur le type de cellule ? o Vois-tu autre chose comme filtre ? Affichage des données --------------------- Après pour savoir comment afficher les résultats, c'est assez compliqué car il y a trop de points à afficher tel quel (des milliers (voire des dizaines de milliers) de points). Je me pose aussi la question sur le lien avec coser, car dans coser on affiche enfait des zones alors que là on a des cellules esdu - élémentaires (donc des points). Voici un exemple de ce qu'on pourrait faire ? http://www.patrick-wied.at/static/heatmapjs/example-heatmap-leaflet.html Planning -------- Comme tu peux le constater c'est assez flou cette partie affichage données spatiales :( Je pars ce soir en vacances et rentre normalement mi-septembre, on en reparlera à ce moment là. Je ne te fais pas nouvelle version avant mon départ vu que pour l'exploiter il te faut une base compatible postgis (et que la documentation n'est pas finalisée...). tony.

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[ANN] - EchoBase 2.1 released
by forge.codelutin.com Release Notification April 4, 2013

April 4, 2013

The EchoBase team is pleased to announce the echobase-2.1 release! Projet EchoBase Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/echobase Changes ------- Changes in this version include: Fixed Bugs: o Problème de suppression de voyage Issue: 2082. Thanks to Mathieu Doray. Resolved by tchemit. o Problème d'import de résultats-voyages : échotypes Issue: 2088. Thanks to Mathieu Doray. Resolved by tchemit. o Problème à la suppression d'import de résultats de voyage Issue: 2154. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Les résultats de type "carte" ne s'affichent pas dans le tableau de bord Issue: 2070. Thanks to Mathieu Doray. Resolved by tchemit. o Pb de mise à jour des champs du tableau de bord Issue: 2089. Thanks to Mathieu Doray. Resolved by tchemit. o Pb affichage liste utilisateurs Echobase Issue: 2021. Thanks to Mathieu Doray. Resolved by tchemit. o Pb formattage Informations de connexion à la base de données Issue: 2098. Thanks to Mathieu Doray. Resolved by tchemit. Changes: o Updates some dependencies Issue: 2152. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/echobase/files * echobase-referentiel-2.1.echobase - http://forge.codelutin.com/attachments/download/657 * echobase-ui-2.1-embedded.war - http://forge.codelutin.com/attachments/download/658 * echobase-ui-2.1-embedded.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/659 * echobase-ui-2.1.war - http://forge.codelutin.com/attachments/download/660 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -EchoBase team

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[ANN] - EchoBase 2.0 released
by forge.codelutin.com Release Notification Jan. 15, 2013

Jan. 15, 2013

The EchoBase team is pleased to announce the echobase-2.0 release! Projet EchoBase Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/echobase What's up in EchoBase ? ----------------------- To begin a happy new year, EchoBase 2.0 is out! Feel free to use it and report any bug (if any can be found...). Changes ------- Changes in this version include: Fixed Bugs: o Problème d'encoding dans les fichiers javascripts Issue: 1906. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/echobase/files * echobase-referentiel-2.0.echobase - http://forge.codelutin.com/attachments/download/567 * echobase-ui-2.0-embedded.war - http://forge.codelutin.com/attachments/download/568 * echobase-ui-2.0-embedded.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/569 * echobase-ui-2.0.war - http://forge.codelutin.com/attachments/download/570 Have fun! -EchoBase team

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Version 2.0 ?
by Tony Chemit Jan. 15, 2013

Jan. 15, 2013

Bonjour, Je voudrais produire la version finale 2.0 d'EchoBase. Mathieu, pas de contre-indication ? J'ai déplacé l'anomalie http://forge.codelutin.com/issues/1659 dans les voeux pieux 2013 :) Si tu es ok, je lance ça dès que possible histoire de cloturer ce chapitre, et venir de l'installer bien gentillement sur acoustica. -- Tony Chemit -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: chemit(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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[ANN] - EchoBase 2.0-rc-2 released
by forge.codelutin.com Release Notification Nov. 25, 2012

Nov. 25, 2012

The EchoBase team is pleased to announce the echobase-2.0-rc-2 release! Projet EchoBase Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/echobase Changes ------- Changes in this version include: New features: o Revoir les décoration des entités du référentiel pour une recherche efficace Issue: 1660. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. Fixed Bugs: o Can not start embedded application on Linux OS Issue: 1732. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. Changes: o Updates to topia 2.7.1 Issue: 1745. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Updates to eugene 2.5.6.1 Issue: 1744. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Updates to slf4j 1.7.2 Issue: 1739. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Updates to jquery-struts2 3.4.0 Issue: 1738. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Updates to struts 2.3.7 Issue: 1737. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Updates to nuitonweb 1.12-beta-1 Issue: 1736. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Updates to mavenpom 3.4.4 Issue: 1735. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Updates to nuiton-utils 2.6.4 Issue: 1734. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Ne plus déployer les fichiers de données lors d'une nouvelle version Issue: 1733. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Créer un module dans le svn pour y mettre les procédures de création des fichiers d'import Issue: 1062. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/echobase/files * echobase-referentiel-2.0-rc-2.echobase - http://forge.codelutin.com/attachments/download/544 * echobase-ui-2.0-rc-2-embedded.war - http://forge.codelutin.com/attachments/download/545 * echobase-ui-2.0-rc-2-embedded.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/546 * echobase-ui-2.0-rc-2.war - http://forge.codelutin.com/attachments/download/547 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -EchoBase team

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Cr réunion 30/10/2012
by Tony Chemit Oct. 30, 2012

Oct. 30, 2012

Hello, le voici en pj (il est très court...). Par contre en traitant la dernière (enfin j'espère anomalie) http://forge.codelutin.com/issues/1659 je vois qu'on crée un data de type sorted même dans le cas où c'est un sample de type unsorted ? C'est normal ça ? J'ai un doute. J'ai mis le code incriminé dans le ticket. A suivre. tony. -- Tony Chemit -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: chemit(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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[ANN] - EchoBase 2.0-rc-1 released
by forge.codelutin.com Release Notification Oct. 29, 2012

Oct. 29, 2012

The EchoBase team is pleased to announce the echobase-2.0-rc-1 release! Projet EchoBase Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/echobase What's up in EchoBase ? ----------------------- We are starting the Release candidate process for the version 2.0 of EchoBase. No more feature will be integrated, just bug fixes. Feel free to report any bug at http://forge.codelutin.com/projects/echobase/issues. A new release candidate will be performed, until no more bugs are declared at a frequency of 10 days (more or less). Changes ------- Changes in this version include: New features: o Améliorer la gestion des requêtes libre-office Issue: 1528. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Permettre d'utiliser des requêtes imbriquées Issue: 1595. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Améliorer l'import des données de pêche Issue: 1590. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. Fixed Bugs: o Certaines cellules esdu ne sont pas importées Issue: 1594. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Problèmes sur le filtre de recherche Issue: 1607. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Certains échantillons n'ont pas été importé du à un mauvais depthStratum Issue: 1591. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Il manque des données de pêche Issue: 1601. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Permettre de changer le nom d'une requête clonée Issue: 1606. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Impossible de rechercher via un opérateur de comparaison de chaine de caractères sur un nombre Issue: 1604. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Impossible de faire une recherche sur Operation.id Issue: 1602. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Problème de format des positions pour les données de type localisation Issue: 1593. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Problème de format de date sur les cell-data Issue: 1592. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Le filtre sur les campagnes dans l'écran de suppression ne fonctionne pas Issue: 1571. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Erreur lors de la création d'une application embarqué si pas de campagne sélectionnée Issue: 1570. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. Changes: o Lissage des données anciennes Issue: 1436. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Faire en sorte que l'application embarquée se lance bien depuis un répertoire avec des espaces Issue: 1596. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Faire fonctionner l'application embarqué juste avec une jre et non plus une jdk Issue: 1569. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. o Mise à jour de librairies Issue: 1568. Thanks to Tony Chemit. Resolved by tchemit. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/echobase/files * echobase-legacyData-2.0-rc-1.echobase - http://forge.codelutin.com/attachments/download/520 * echobase-legacyData-extraCells-1998_2004-2.0-rc-1.echobase - http://forge.codelutin.com/attachments/download/521 * echobase-legacyData-extraCells-2005_2010-2.0-rc-1.echobase - http://forge.codelutin.com/attachments/download/522 * echobase-referentiel-2.0-rc-1.echobase - http://forge.codelutin.com/attachments/download/523 * echobase-ui-2.0-rc-1-embedded.war - http://forge.codelutin.com/attachments/download/524 * echobase-ui-2.0-rc-1-embedded.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/525 * echobase-ui-2.0-rc-1.war - http://forge.codelutin.com/attachments/download/526 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -EchoBase team

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concernant les cellules esdu manquantes
by Tony Chemit Oct. 18, 2012

Oct. 18, 2012

hello, Je viens de regarder le fichier que tu m'as donné, avec le format actuel j'arrive pas à faire ce que je veux, car il est : trop éloigné des imports format EchoBase trop éloigné des imports légendaires qui utilisaient plusieurs tables) Est-ce possible pour toi qu'on mette ça au format EchoBase, c'est le plus safe pour moi. A savoir qu'il a du coup aussi des imports de Region (car on gérait ça) Si tu peux faire comme ça, ça sera plus simple, ... pour moi :( Tu me redis. -- Tony Chemit -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: chemit(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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Re: [Echobase-devel] données et code positions
by Tony Chemit Oct. 12, 2012

Oct. 12, 2012

On Thu, 11 Oct 2012 12:45:18 +0200 Mathieu Doray <mathieu.doray(a)ifremer.fr> wrote: > si x est la position géographique débile de baracouda, alors : > > x1=floor(x/100) > unique(x1) > x2=floor(x-x1*100)/60 > unique(x2) > x3=((x-x1*100)-x2*60)/100 > x=(x1+x2+x3) > > x est alors au bon format : degré décimal (signé) > voila le résultat que j'obtiens : 12 Oct 2012 10:23:05 INFO [main] (FixCellsIT.java:163) fixDataPosition - Treat data position 4509.4921875 to 45.154921875 12 Oct 2012 10:23:05 INFO [main] (FixCellsIT.java:163) fixDataPosition - Treat data position 312.7869873046875 to -3.2078698730468753 12 Oct 2012 10:23:05 INFO [main] (FixCellsIT.java:142) fixDateFormat - Treat date Wed Apr 26 06:21:03 CEST 2000 - to 2000-04-26 06:21:03.0000 12 Oct 2012 10:23:05 INFO [main] (FixCellsIT.java:163) fixDataPosition - Treat data position 4509.8759765625 to 45.158759765625 12 Oct 2012 10:23:05 INFO [main] (FixCellsIT.java:163) fixDataPosition - Treat data position 311.5830078125 to -3.189163411458333 12 Oct 2012 10:23:05 INFO [main] (FixCellsIT.java:142) fixDateFormat - Treat date Wed Apr 26 06:26:19 CEST 2000 - to 2000-04-26 06:26:19.0000 12 Oct 2012 10:23:06 INFO [main] (FixCellsIT.java:163) fixDataPosition - Treat data position 4510.501953125 to 45.171686197916664 12 Oct 2012 10:23:06 INFO [main] (FixCellsIT.java:163) fixDataPosition - Treat data position 310.1820068359375 to -3.1684867350260415 12 Oct 2012 10:23:06 INFO [main] (FixCellsIT.java:142) fixDateFormat - Treat date Wed Apr 26 06:33:02 CEST 2000 - to 2000-04-26 06:33:02.0000 12 Oct 2012 10:23:06 INFO [main] (FixCellsIT.java:163) fixDataPosition - Treat data position 4510.9560546875 to 45.176227213541665 12 Oct 2012 10:23:06 INFO [main] (FixCellsIT.java:163) fixDataPosition - Treat data position 309.0140075683594 to -3.1501400756835936 12 Oct 2012 10:23:06 INFO [main] (FixCellsIT.java:142) fixDateFormat - Treat date Wed Apr 26 06:38:31 CEST 2000 - to 2000-04-26 06:38:31.0000 12 Oct 2012 10:23:06 INFO [main] (FixCellsIT.java:163) fixDataPosition - Treat data position 4511.52001953125 to 45.18853352864583 12 Oct 2012 10:23:06 INFO [main] (FixCellsIT.java:163) fixDataPosition - Treat data position 307.59100341796875 to -3.1225767008463543 12 Oct 2012 10:23:06 INFO [main] (FixCellsIT.java:142) fixDateFormat - Treat date Wed Apr 26 06:45:20 CEST 2000 - to 2000-04-26 06:45:20.0000 Si c'est ok pour toi je ferme les deux tickets (position et date) -- Tony Chemit -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: chemit(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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