May 2011 - Nuiton-matrix-commits - mailman.cloud.codelutin.com

r369 - trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix
by echatellier＠users.nuiton.org May 30, 2011

May 30, 2011

Author: echatellier Date: 2011-05-30 18:27:57 +0200 (Mon, 30 May 2011) New Revision: 369 Url: http://nuiton.org/repositories/revision/nuiton-matrix/369 Log: Fix comment Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/SemanticMapper.java Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/SemanticMapper.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/SemanticMapper.java 2011-05-30 10:11:56 UTC (rev 368) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/SemanticMapper.java 2011-05-30 16:27:57 UTC (rev 369) @@ -40,7 +40,7 @@ /** * Return class for type identified by typeName. * - * For example : "Population" can return "fr.ifremer.enetities.Population.class" + * For example : "Population" can return "fr.ifremer.entities.Population.class" * * Return {@code String} by default. *

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r368 - in trunk/nuiton-matrix/src: main/java/org/nuiton/math/matrix test/java/org/nuiton/math/matrix
by echatellier＠users.nuiton.org May 30, 2011

May 30, 2011

Author: echatellier Date: 2011-05-30 12:11:56 +0200 (Mon, 30 May 2011) New Revision: 368 Url: http://nuiton.org/repositories/revision/nuiton-matrix/368 Log: #1549 : Add import/export support for matrix with dimension > 2 Added: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/SemanticMapper.java Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixException.java trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixFactory.java trunk/nuiton-matrix/src/test/java/org/nuiton/math/matrix/ImportExportMatrixTest.java Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java 2011-05-30 10:10:30 UTC (rev 367) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java 2011-05-30 10:11:56 UTC (rev 368) @@ -31,10 +31,13 @@ import java.util.ArrayList; import java.util.Arrays; import java.util.Collections; +import java.util.Iterator; import java.util.List; import java.util.regex.Pattern; import org.apache.commons.collections.primitives.ArrayIntList; +import org.apache.commons.collections.primitives.IntList; +import org.apache.commons.lang.ArrayUtils; import org.apache.commons.lang.ObjectUtils; import org.apache.commons.lang.math.NumberUtils; import org.apache.commons.logging.Log; @@ -1096,7 +1099,7 @@ @Override @Deprecated public boolean isSupportedCSV() { - return getDimCount() <= 2; + return true; } /** @@ -1108,6 +1111,18 @@ */ @Override public void importCSV(Reader reader, int[] origin) throws IOException { + + // test file format + reader.mark(1); + char firstChar = (char)reader.read(); + reader.reset(); + if (firstChar == '[') { + importCSVND(reader, origin); + return; + } + + // if run here, it's a normal 1D or 2D import + // as before 2.2 version int rowsCount = 0; List<Double> row = new ArrayList<Double>(); StringBuffer number = new StringBuffer(20); @@ -1138,7 +1153,7 @@ number.setLength(0); if (!row.isEmpty()) { - if (getDim().length == 1) { + if (getDimCount() == 1) { int columnNumber = origin[0]; for (Double value : row) { if (columnNumber < getDim(0)) { @@ -1171,6 +1186,161 @@ } /** + * Import CSV file defined in Matrix ND format. + * + * @param reader reader containing content + * @param origin not used + * @throws IOException + */ + protected void importCSVND(Reader reader, int[] origin) throws IOException { + + int c = -1; + StringBuffer number = new StringBuffer(20); + IntList coordinates = new ArrayIntList(); + + // read dimension + reader.read(); // skip [ + while ((c = reader.read()) != -1) { + if (c == ' ') { + // skip space + } else if (c == ',' || c == ']') { + if (NUMBER.matcher(number.toString()).matches()) { + int coord = Integer.parseInt(number.toString()); + coordinates.add(coord); + } + number.setLength(0); + + if (c == ']') { + break; + } + } else { + number.append((char) c); + } + } + int[] dimensions = coordinates.toArray(); + coordinates.clear(); + // / read dimension + + // read defaut value + while ((c = reader.read()) != -1) { + if (c == ',' || c == ' ') { + // skip + } + else if (c == '\n' || c == '\r') { + break; + } + else { + number.append((char) c); + } + } + double defaultValue = 0.0; + if (NUMBER.matcher(number.toString()).matches()) { + defaultValue = Double.parseDouble(number.toString()); + MatrixHelper.fill(this, defaultValue); + } + number.setLength(0); + // / read default value + + List[] semantics = new List[dimensions.length]; + for (int indexDim = 0 ; indexDim < dimensions.length ; indexDim++) { + List dimension = importCSVNDReadDimension(reader); + if (dimension != null && dimension.size() != dimensions[indexDim]) { + throw new MatrixException(String.format("Semantics %d count not equals to semantics dimension, excepted %d, got %d", + indexDim, dimensions[indexDim], dimension.size())); + } + semantics[indexDim] = dimension; + } + + if (ArrayUtils.contains(semantics, null)) { + throw new MatrixException("Wrong semantics definition : " + Arrays.toString(semantics)); + } + MatrixND matrix = MatrixFactory.getInstance().create(semantics); + MatrixHelper.fill(matrix, defaultValue); + do { + c = reader.read(); + if (c == ' ') { + // skip space + } else if (c == CSV_SEPARATOR) { + if (NUMBER.matcher(number.toString()).matches()) { + int coord = Integer.parseInt(number.toString()); + coordinates.add(coord); + } + number.setLength(0); + } else if (c == -1 || c == '\n' || c == '\r' || c == -1) { + // is line return or equivalent char because space is already + // skiped + // or end of stream + + // at end of line, we must see if the leave number* + Double val = null; + if (NUMBER.matcher(number.toString()).matches()) { + val = Double.valueOf(number.toString()); + } + number.setLength(0); + + if (!coordinates.isEmpty()) { + int[] coords = coordinates.toArray(); + matrix.setValue(coords, val); + coordinates.clear(); + } + } else { + number.append((char) c); + } + } while (c != -1); + + // finally paste loaded matrix into this + paste(matrix); + } + + /** + * Read a line and convert line to semantic value. + * + * Use: + * - mapper to convert semantics values + * - return null if line is empty + * + * @param reader reader to read + * @return semantics for readed line + * @throws IOException + */ + protected List importCSVNDReadDimension(Reader reader) throws IOException { + + StringBuffer buffer = new StringBuffer(); + int c = -1; + while ((c = reader.read()) != -1) { + if (c == '\n') { + break; + } + else { + buffer.append((char)c); + } + } + + // read must be in form: + // type : PK1, PK2, PK3... + List sems = null; + if (buffer.length() > 0) { + sems = new ArrayList(); + // get type + int twodIndex = buffer.indexOf(":"); + if (twodIndex == -1) { + throw new MatrixException("Can't parse semantics line as 'Type: ids'"); + } + String type = buffer.substring(0, twodIndex).trim(); + Class typeClass = MatrixFactory.getSemanticMapper().getType(type); + + // get semantics value + String semanticsStrings = buffer.substring(twodIndex +1).trim(); + String[] semanticsPKs = semanticsStrings.split("\\s*,\\s*"); + for (String semanticsPK : semanticsPKs) { + Object value = MatrixFactory.getSemanticMapper().getValue(typeClass, semanticsPK); + sems.add(value); + } + } + return sems; + } + + /** * Export dans un writer au format CSV de la matrice * * @param writer le writer ou copier la matrice @@ -1178,17 +1348,29 @@ * writer */ @Override - public void exportCSV(Writer writer, boolean withSemantics) + public void exportCSV(Writer writer, boolean withSemantics) throws IOException { + if (getDimCount() <= 2) { + exportCSV2D(writer, withSemantics); + } + else { + exportCSVND(writer, withSemantics); + } + } + + /** + * Export dans un writer au format CSV de la matrice + * + * @param writer le writer ou copier la matrice + * @param withSemantics export ou pas des semantiques de la matrice dans le + * writer + */ + protected void exportCSV2D(Writer writer, boolean withSemantics) throws IOException { int dimsCount = getDimCount(); int rowsCount = dimsCount == 1 ? 1 : getDim(0); int columnsCount = dimsCount == 1 ? getDim(0) : getDim(1); int[] coordinates; - if (!isSupportedCSV()) { - throw new UnsupportedOperationException(); - } - /* Création de l'entete */ if (withSemantics) { /* Recuperation de la liste sur la bonne dimenssion */ @@ -1217,5 +1399,53 @@ writer.append("\n"); } } + + /** + * Export dans un writer au format CSV de la matrice + * + * @param writer le writer ou copier la matrice + * @param withSemantics export ou pas des semantiques de la matrice dans le + * writer + */ + protected void exportCSVND(Writer writer, boolean withSemantics) + throws IOException { + + SemanticMapper mapper = MatrixFactory.getSemanticMapper(); + // add meta + writer.append(Arrays.toString(getDim())).append("\n"); + for (List<?> semantic : getSemantics()) { + if (semantic != null) { + Object first = semantic.get(0); + if (first != null) { + writer.append(mapper.getTypeName(first)); + writer.append(':'); + Iterator itValue = semantic.iterator(); + while (itValue.hasNext()) { + Object value = itValue.next(); + writer.append(mapper.getValueId(value)); + if (itValue.hasNext()) { + writer.append(','); + } + } + } + } + writer.append('\n'); + } + + // add data + MatrixIterator matrixIterator = iterator(); + while (matrixIterator.hasNext()) { + matrixIterator.next(); + int[] coordinates = matrixIterator.getCoordinates(); + for (int i = 0 ; i < coordinates.length ; ++i) { + writer.append(String.valueOf(coordinates[i])); + writer.append(CSV_SEPARATOR); + } + // add data value + writer.append(String.valueOf(matrixIterator.getValue())); + writer.append('\n'); + } + } + } // AbstractMatrixND Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixException.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixException.java 2011-05-30 10:10:30 UTC (rev 367) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixException.java 2011-05-30 10:11:56 UTC (rev 368) @@ -5,7 +5,7 @@ * $Id$ * $HeadURL$ * %% - * Copyright (C) 2004 - 2010 CodeLutin + * Copyright (C) 2004 - 2011 CodeLutin, Chatellier Eric * %% * This program is free software: you can redistribute it and/or modify * it under the terms of the GNU Lesser General Public License as @@ -23,6 +23,8 @@ * #L% */ +package org.nuiton.math.matrix; + /** * MatriceException.java * @@ -34,8 +36,6 @@ * Mise a jour: $Date$ * par : $Author$ */ -package org.nuiton.math.matrix; - public class MatrixException extends RuntimeException { /** serialVersionUID. */ Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixFactory.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixFactory.java 2011-05-30 10:10:30 UTC (rev 367) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixFactory.java 2011-05-30 10:11:56 UTC (rev 368) @@ -5,7 +5,7 @@ * $Id$ * $HeadURL$ * %% - * Copyright (C) 2004 - 2010 CodeLutin + * Copyright (C) 2004 - 2011 CodeLutin, Chatellier Eric * %% * This program is free software: you can redistribute it and/or modify * it under the terms of the GNU Lesser General Public License as @@ -48,6 +48,8 @@ protected Class<?> vectorClass = null; + protected static SemanticMapper defaultSemanticMapper = new SemanticMapper();; + protected MatrixFactory(Class<?> vectorClass) { this.vectorClass = vectorClass; } @@ -60,6 +62,14 @@ return defaultVectorClass; } + public static void setSemanticMapper(SemanticMapper semanticMapper) { + defaultSemanticMapper = semanticMapper; + } + + public static SemanticMapper getSemanticMapper() { + return defaultSemanticMapper; + } + /** * Retourne une factory utilisant vectorClass comme classe de base a * l'implantation des matrices. Added: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/SemanticMapper.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/SemanticMapper.java (rev 0) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/SemanticMapper.java 2011-05-30 10:11:56 UTC (rev 368) @@ -0,0 +1,86 @@ +/* + * #%L + * + * + * $Id$ + * $HeadURL$ + * %% + * Copyright (C) 2011 Codelutin, Chatellier Eric + * %% + * This program is free software: you can redistribute it and/or modify + * it under the terms of the GNU Lesser General Public License as + * published by the Free Software Foundation, either version 3 of the + * License, or (at your option) any later version. + * + * This program is distributed in the hope that it will be useful, + * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of + * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the + * GNU General Lesser Public License for more details. + * + * You should have received a copy of the GNU General Lesser Public + * License along with this program. If not, see + * <http://www.gnu.org/licenses/lgpl-3.0.html>. + * #L% + */ + +package org.nuiton.math.matrix; + +/** + * Mapper used during import/export to map CSV file semantics to + * real semantics value depending on execution context. + * + * @author chatellier + * @version $Revision$ + * + * Last update : $Date$ + * By : $Author$ + */ +public class SemanticMapper { + + /** + * Return class for type identified by typeName. + * + * For example : "Population" can return "fr.ifremer.enetities.Population.class" + * + * Return {@code String} by default. + * + * @param typeName type to get class. + * @return type for typeId + */ + public Class getType(String typeName) { + return String.class; + } + + /** + * Return value identified by valueId and type {@code type}. + * + * Return {@code valueId} by default; + * + * @param type + * @param valueId + * @return value identified by {valueId} + */ + public Object getValue(Class type, String valueId) { + return valueId; + } + + /** + * Return type name for given type. + * + * @param type type to get name + * @return type name + */ + public String getTypeName(Object type) { + return type.getClass().getName(); + } + + /** + * Get value id for value. + * + * @param value value to get id + * @return value id + */ + public String getValueId(Object value) { + return value.toString(); + } +} Property changes on: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/SemanticMapper.java ___________________________________________________________________ Added: svn:keywords + Author Date Id Revision HeadURL Modified: trunk/nuiton-matrix/src/test/java/org/nuiton/math/matrix/ImportExportMatrixTest.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/test/java/org/nuiton/math/matrix/ImportExportMatrixTest.java 2011-05-30 10:10:30 UTC (rev 367) +++ trunk/nuiton-matrix/src/test/java/org/nuiton/math/matrix/ImportExportMatrixTest.java 2011-05-30 10:11:56 UTC (rev 368) @@ -5,7 +5,7 @@ * $Id$ * $HeadURL$ * %% - * Copyright (C) 2004 - 2010 CodeLutin + * Copyright (C) 2004 - 2011 CodeLutin, Chatellier Eric * %% * This program is free software: you can redistribute it and/or modify * it under the terms of the GNU Lesser General Public License as @@ -32,9 +32,10 @@ import java.util.List; import org.junit.Assert; -import org.junit.Before; -import org.junit.Ignore; +import org.junit.BeforeClass; import org.junit.Test; +import org.nuiton.i18n.I18n; +import org.nuiton.i18n.init.ClassPathI18nInitializer; /** * Test de l'import et export CSV. @@ -47,16 +48,41 @@ */ public class ImportExportMatrixTest { - protected MatrixND mat1D; - protected MatrixND mat2D; - protected MatrixND mat2DSemantics; + /** One dimension matrix. */ + protected static MatrixND mat1D; - public MatrixFactory getFactory() throws Exception { + /** Two dimension matrix. */ + protected static MatrixND mat2D; + + /** Two dimension matrix with semantics. */ + protected static MatrixND mat2DSemantics; + + /** Three dimension matrix. */ + protected static MatrixND mat3D; + + /** Four dimension matrix. */ + protected static MatrixND mat4D; + + /** + * Return factory configured with double. + * + * @return MatrixFactory + */ + public static MatrixFactory getFactory() { return MatrixFactory.getInstance(DoubleVector.class); } - @Before - public void setUp() throws Exception { + /** + * Setup all matrix with value. + * + * @throws Exception + */ + @BeforeClass + public static void init() throws Exception { + + I18n.init(new ClassPathI18nInitializer(), null); + + // One dimension matrix. mat1D = new MatrixNDImpl(getFactory(), new int[] { 10 }); mat1D.setValue(new int[] { 0 }, 0); mat1D.setValue(new int[] { 1 }, 1); @@ -64,6 +90,7 @@ mat1D.setValue(new int[] { 3 }, 3); mat1D.setValue(new int[] { 4 }, -4.0E-7); + // Two dimension matrix. mat2D = new MatrixNDImpl(getFactory(), new int[] { 20, 10 }); mat2D.setValue(new int[] { 0, 0 }, 0); mat2D.setValue(new int[] { 0, 1 }, 1); @@ -76,13 +103,49 @@ mat2D.setValue(new int[] { 1, 8 }, 4); mat2D.setValue(new int[] { 2, 9 }, -4.0E-7); - List sem1 = Arrays - .asList(new String[] { "toto", "titi", "tutu", "trtr" }); + // Two dimension matrix with semantics. + List sem1 = Arrays.asList(new String[] { "toto", "titi", "tutu", "trtr" }); List sem2 = Arrays.asList(new String[] { "tata", "tete", "tyty" }); mat2DSemantics = new MatrixNDImpl(getFactory(), "name", new List[] { sem1, sem2 }, new String[] { "dim1", "dim2" }); + + // Three dimension matrix. + mat3D = new MatrixNDImpl(getFactory(), new int[] { 4, 5, 4 }); + mat3D.setSemantic(0, Arrays.asList(new String[]{"2009","2010","2011","2012"})); + mat3D.setSemantic(1, Arrays.asList(new String[]{"Nantes","Lille","Paris","Lyon","Marseille"})); + mat3D.setSemantic(2, Arrays.asList(new String[]{"Informatique","Administration","Developpement","Recherche"})); + mat3D.setValue(new int[] { 0, 0, 0 }, 0); + mat3D.setValue(new int[] { 0, 0, 1 }, 1); + mat3D.setValue(new int[] { 0, 2, 0 }, 2); + mat3D.setValue(new int[] { 3, 0, 0 }, -4.0E-7); + mat3D.setValue(new int[] { 1, 1, 1 }, 42.0); + mat3D.setValue(new int[] { 1, 2, 3 }, 4); + mat3D.setValue(new int[] { 3, 2, 1 }, 4); + mat3D.setValue(new int[] { 2, 2, 2 }, 2); + mat3D.setValue(new int[] { 3, 4, 3 }, 0.004); + + // Four dimension matrix. + mat4D = new MatrixNDImpl(getFactory(), new int[] { 4, 5, 4, 3}); + mat4D.setSemantic(0, Arrays.asList(new String[]{"2009","2010","2011","2012"})); + mat4D.setSemantic(1, Arrays.asList(new String[]{"Nantes","Lille","Paris","Lyon","Marseille"})); + mat4D.setSemantic(2, Arrays.asList(new String[]{"Informatique","Administration","Developpement","Recherche"})); + mat4D.setSemantic(3, Arrays.asList(new String[]{"Test","Beta","Stable"})); + mat4D.setValue(new int[] { 0, 0, 0, 0 }, 0); + mat4D.setValue(new int[] { 0, 0, 0, 1 }, 1); + mat4D.setValue(new int[] { 0, 2, 0, 2 }, 2); + mat4D.setValue(new int[] { 3, 0, 0, 1 }, -4.0E-7); + mat4D.setValue(new int[] { 1, 1, 1, 1 }, 42.0); + mat4D.setValue(new int[] { 1, 2, 3, 2 }, 4); + mat4D.setValue(new int[] { 3, 2, 1, 0 }, 4); + mat4D.setValue(new int[] { 2, 2, 2, 2 }, 2); + mat4D.setValue(new int[] { 3, 4, 3, 2 }, 0.004); } + /** + * Test d'import d'une matrice 2D. + * + * @throws IOException + */ @Test public void testImport() throws IOException { String test = "5.0E-7;1.0;2.0;3.0;4.0;4.0;4.0;4.0;0.3;0.0\n" @@ -104,24 +167,38 @@ Assert.assertEquals(mat2D.getValue(2, 9), 4.0, 0); } + /** + * Test les sorties des exports suivit des export des imports. + * + * @throws IOException + */ @Test public void testExport() throws IOException { - testExport(mat1D, false); - testExport(mat2D, false); + exportCompare(mat1D, false); + exportCompare(mat2D, false); - testExport(mat1D, true); - testExport(mat2D, true); + exportCompare(mat1D, true); + exportCompare(mat2D, true); - testExport(mat2DSemantics, false); - testExport(mat2DSemantics, true); + exportCompare(mat2DSemantics, false); + exportCompare(mat2DSemantics, true); + + exportCompare(mat3D, true); + exportCompare(mat4D, false); } - @Ignore - protected void testExport(MatrixND matrixND, boolean withSemantics) + /** + * L'export de la matrice et l'export apres l'import doivent + * redonner le même résultat. + * + * @param matrixND matrix to test + * @param withSemantics with semantics + * @throws IOException + */ + protected void exportCompare(MatrixND matrixND, boolean withSemantics) throws IOException { StringWriter writer = new StringWriter(); matrixND.exportCSV(writer, withSemantics); - StringReader writerToReader = new StringReader(writer.toString()); matrixND.importCSV(writerToReader, new int[] { 0, 0 }); @@ -131,13 +208,133 @@ Assert.assertEquals(writer.toString(), readerToWriter.toString()); } + /** + * Test que l'import d'une matrice à partir d'une chaine produit + * l'import voulu. + * @throws IOException + */ @Test - public void testSupport() throws Exception { - Assert.assertEquals(true, new MatrixNDImpl(getFactory(), new int[] { 1 }) - .isSupportedCSV()); - Assert.assertEquals(true, new MatrixNDImpl(getFactory(), new int[] { 2, 2 }) - .isSupportedCSV()); - Assert.assertEquals(false, new MatrixNDImpl(getFactory(), - new int[] { 3, 3, 3 }).isSupportedCSV()); + public void testMatrix2DImport() throws IOException { + + String matrix3D = "[2, 2, 2]\n" + + "java.lang.String:2009,2010\n" + + "java.lang.String:Nantes,Lille\n" + + "java.lang.String:Informatique,Administration\n" + + "0;0;0;0.0\n" + + "0;0;1;1.0\n" + + "0;1;1;4.0\n" + + "1;0;0;-4.0E-7\n" + + "1;0;1;2.0\n" + + "1;1;0;4.0\n" + + "1;1;1;42.0"; + + MatrixND m = MatrixFactory.getInstance().create(new int[]{2, 2, 2}); + m.importCSV(new StringReader(matrix3D), null); + // dim + Assert.assertArrayEquals(new int[]{2, 2, 2}, m.getDim()); + // default value + Assert.assertEquals(0.0, m.getValue(0, 1, 0), 0.0001); + // some test + Assert.assertEquals(-4.0e-7, m.getValue(1, 0, 0), 0.0001); + Assert.assertEquals(42, m.getValue(1, 1, 1), 0.0001); } + + /** + * Test que l'import d'une matrice à partir d'une chaine produit + * l'import voulu avec une valeur par defaut. + * + * @throws IOException + */ + @Test + public void testMatrix2DImportDefaultValue() throws IOException { + + String matrix3D = "[2, 2, 2] , 3.14159265 \n" + + "java.lang.String:2009,2010\n" + + "java.lang.String:Nantes,Lille\n" + + "java.lang.String:Informatique,Administration\n" + + "0;0;0;0.0\n" + + "0;0;1;1.0\n" + + "0;1;1;4.0\n" + + "1;0;0;-4.0E-7\n" + + "1;0;1;2.0\n" + + "1;1;0;4.0\n" + + "1;1;1;42.0"; + + MatrixND m = MatrixFactory.getInstance().create(new int[]{2, 2, 2}); + m.importCSV(new StringReader(matrix3D), null); + // default value + Assert.assertEquals(Math.PI, m.getValue(0, 1, 0), 0.00001); + } + + /** + * Test que l'import d'une matrice à partir d'une chaine produit + * l'import voulu avec error de nmbre de valeur de semantiques. + * + * @throws IOException + */ + @Test(expected=MatrixException.class) + public void testMatrix2DImportSemError() throws IOException { + + String matrix3D = "[2, 2, 2] , 3.14159265 \n" + + "java.lang.String:2009,2010\n" + + "java.lang.String:Nantes\n" + + "java.lang.String:Informatique,Administration\n" + + "0;0;0;0.0\n" + + "0;0;1;1.0\n" + + "0;1;1;4.0\n" + + "1;0;0;-4.0E-7\n" + + "1;0;1;2.0\n" + + "1;1;0;4.0\n" + + "1;1;1;42.0"; + + MatrixND m = MatrixFactory.getInstance().create(new int[]{2, 2, 2}); + m.importCSV(new StringReader(matrix3D), null); + } + + /** + * Test que l'import d'une matrice à partir d'une chaine produit + * l'import voulu avec error semantics vide. + * + * @throws IOException + */ + @Test(expected=MatrixException.class) + public void testMatrix2DImportSemError2() throws IOException { + + String matrix3D = "[2, 2, 2]\n" + + "java.lang.String:2009,2010\n" + + "java.lang.String:Nantes, Lille\n" + + "\n" + + "0;0;0;0.0\n" + + "0;0;1;1.0\n" + + "0;1;1;4.0\n" + + "1;0;0;-4.0E-7\n" + + "1;0;1;2.0\n" + + "1;1;0;4.0\n" + + "1;1;1;42.0"; + + MatrixND m = MatrixFactory.getInstance().create(new int[]{2, 2, 2}); + m.importCSV(new StringReader(matrix3D), null); + } + + /** + * Test que l'import d'une matrice à partir d'une chaine produit + * l'import voulu avec 0 semantics. + * + * @throws IOException + */ + @Test(expected=MatrixException.class) + public void testMatrix2DImportSemError3() throws IOException { + + String matrix3D = "[2, 2, 2] , 3.14159265 \n" + + "0;0;0;0.0\n" + + "0;0;1;1.0\n" + + "0;1;1;4.0\n" + + "1;0;0;-4.0E-7\n" + + "1;0;1;2.0\n" + + "1;1;0;4.0\n" + + "1;1;1;42.0"; + + MatrixND m = MatrixFactory.getInstance().create(new int[]{2, 2, 2}); + m.importCSV(new StringReader(matrix3D), null); + } }

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r367 - trunk/nuiton-matrix
by echatellier＠users.nuiton.org May 30, 2011

May 30, 2011

Author: echatellier Date: 2011-05-30 12:10:30 +0200 (Mon, 30 May 2011) New Revision: 367 Url: http://nuiton.org/repositories/revision/nuiton-matrix/367 Log: Add assembly profile Modified: trunk/nuiton-matrix/pom.xml Modified: trunk/nuiton-matrix/pom.xml =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/pom.xml 2011-05-25 08:51:21 UTC (rev 366) +++ trunk/nuiton-matrix/pom.xml 2011-05-30 10:10:30 UTC (rev 367) @@ -86,4 +86,39 @@ </plugins> </build> + + <profiles> + <profile> + <id>assembly-profile</id> + <activation> + <property> + <name>performRelease</name> + <value>true</value> + </property> + </activation> + <build> + <plugins> + <plugin> + <artifactId>maven-assembly-plugin</artifactId> + <executions> + <execution> + <id>create-assemblies</id> + <phase>verify</phase> + <goals> + <goal>single</goal> + </goals> + </execution> + </executions> + <configuration> + <attach>false</attach> + <descriptorRefs> + <descriptorRef>deps</descriptorRef> + <descriptorRef>full</descriptorRef> + </descriptorRefs> + </configuration> + </plugin> + </plugins> + </build> + </profile> + </profiles> </project>

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r366 - in trunk: . nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix nuiton-matrix/src/main/resources/i18n nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/gui nuiton-matrix-gui/src/main/resources/i18n
by echatellier＠users.nuiton.org May 25, 2011

May 25, 2011

Author: echatellier Date: 2011-05-25 10:51:21 +0200 (Wed, 25 May 2011) New Revision: 366 Url: http://nuiton.org/repositories/revision/nuiton-matrix/366 Log: Update nuiton-utils, nuiton-i18n Modified: trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/gui/MatrixTableModelOption.java trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix-gui_en_GB.properties trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix-gui_fr_FR.properties trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixProxy.java trunk/nuiton-matrix/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix_fr_FR.properties trunk/pom.xml Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixProxy.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixProxy.java 2011-05-25 08:31:11 UTC (rev 365) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixProxy.java 2011-05-25 08:51:21 UTC (rev 366) @@ -5,7 +5,7 @@ * $Id$ * $HeadURL$ * %% - * Copyright (C) 2010 Codelutin, Chatellier Eric + * Copyright (C) 2010 - 2011 Codelutin, Chatellier Eric * %% * This program is free software: you can redistribute it and/or modify * it under the terms of the GNU Lesser General Public License as @@ -26,7 +26,6 @@ package org.nuiton.math.matrix; import java.util.ArrayList; -import java.util.Arrays; import java.util.List; import org.apache.commons.lang.ArrayUtils; Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix_fr_FR.properties =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix_fr_FR.properties 2011-05-25 08:31:11 UTC (rev 365) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix_fr_FR.properties 2011-05-25 08:51:21 UTC (rev 366) @@ -1,2 +1,2 @@ -nuitonmatrix.invalid.element=L'\u00E9l\u00E9ment demand\u00E9 %s n'existe pas dans la matrice %s -nuitonmatrix.invalid.size=La dimension demand\u00E9e n'est pas correcte\: 0 <\= %d <\= %d +nuitonmatrix.invalid.element=L'élément demandé %s n'existe pas dans la matrice %s +nuitonmatrix.invalid.size=La dimension demandée n'est pas correcte\: 0 <\= %d <\= %d Modified: trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/gui/MatrixTableModelOption.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/gui/MatrixTableModelOption.java 2011-05-25 08:31:11 UTC (rev 365) +++ trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/gui/MatrixTableModelOption.java 2011-05-25 08:51:21 UTC (rev 366) @@ -139,10 +139,10 @@ public String getColumnName(int columnIndex) { String result = null; if (sumOption && columnIndex == delegate.getColumnCount() + 0) { - result = null; //_("matrix.gui.model.sum"); + result = null; //_("nuitonmatrix.gui.model.sum"); } else if (meanOption && columnIndex == delegate.getColumnCount() + 1) { - result = null; //_("matrix.gui.model.mean"); + result = null; //_("nuitonmatrix.gui.model.mean"); } else { result = delegate.getColumnName(columnIndex); @@ -205,14 +205,14 @@ // une seule operation if (columnIndex == 0) { if (rowIndex == rowCount + 1) { - result = _("matrix.gui.model.mean"); + result = _("nuitonmatrix.gui.model.mean"); } else { if (sumOption) { - result = _("matrix.gui.model.sum"); + result = _("nuitonmatrix.gui.model.sum"); } else { - result = _("matrix.gui.model.mean"); + result = _("nuitonmatrix.gui.model.mean"); } } } @@ -254,14 +254,14 @@ // une seule operation if (rowIndex == 0) { if (columnIndex == columnCount + 1) { - result = _("matrix.gui.model.mean"); + result = _("nuitonmatrix.gui.model.mean"); } else { if (sumOption) { - result = _("matrix.gui.model.sum"); + result = _("nuitonmatrix.gui.model.sum"); } else { - result = _("matrix.gui.model.mean"); + result = _("nuitonmatrix.gui.model.mean"); } } } Modified: trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix-gui_en_GB.properties =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix-gui_en_GB.properties 2011-05-25 08:31:11 UTC (rev 365) +++ trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix-gui_en_GB.properties 2011-05-25 08:51:21 UTC (rev 366) @@ -1,5 +1,3 @@ -matrix.gui.model.mean=Mean -matrix.gui.model.sum=Sum nuitonmatrix.create.matrix.button=New matrix nuitonmatrix.create.matrix.message=Matrix size (separate by ';') nuitonmatrix.create.matrix.title=New matrix @@ -9,6 +7,8 @@ nuitonmatrix.error.file.read=Cannot read file nuitonmatrix.error.file.write=Cannot write file nuitonmatrix.gui.meanOption=Mean +nuitonmatrix.gui.model.mean=Mean +nuitonmatrix.gui.model.sum=Sum nuitonmatrix.gui.sumOption=Sum nuitonmatrix.gui.transposeOption=Transpose nuitonmatrix.menu.action=Copy/Paste Modified: trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix-gui_fr_FR.properties =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix-gui_fr_FR.properties 2011-05-25 08:31:11 UTC (rev 365) +++ trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/resources/i18n/nuiton-matrix-gui_fr_FR.properties 2011-05-25 08:51:21 UTC (rev 366) @@ -1,41 +1,41 @@ -matrix.gui.model.mean=Moyenne -matrix.gui.model.sum=Somme -nuitonmatrix.create.matrix.button=Cr\u00E9er une matrice -nuitonmatrix.create.matrix.message=Dimensions de la matrice (s\u00E9par\u00E9es par ';') -nuitonmatrix.create.matrix.title=Cr\u00E9er une matrice +nuitonmatrix.create.matrix.button=Créer une matrice +nuitonmatrix.create.matrix.message=Dimensions de la matrice (séparées par ';') +nuitonmatrix.create.matrix.title=Créer une matrice nuitonmatrix.error=Erreur -nuitonmatrix.error.clipboard.read=Donn\u00E9e corrompu dans le bloc note -nuitonmatrix.error.clipboard.write=Impossible d'\u00E9crire dans le bloc note +nuitonmatrix.error.clipboard.read=Donnée corrompu dans le bloc note +nuitonmatrix.error.clipboard.write=Impossible d'écrire dans le bloc note nuitonmatrix.error.file.read=Impossible de lire le fichier -nuitonmatrix.error.file.write=Impossible d'\u00E9crire dans le fichier +nuitonmatrix.error.file.write=Impossible d'écrire dans le fichier nuitonmatrix.gui.meanOption=Moyenne +nuitonmatrix.gui.model.mean=Moyenne +nuitonmatrix.gui.model.sum=Somme nuitonmatrix.gui.sumOption=Somme -nuitonmatrix.gui.transposeOption=Transpos\u00E9e +nuitonmatrix.gui.transposeOption=Transposée nuitonmatrix.menu.action=Copier/Coller nuitonmatrix.menu.action.copy=Copier -nuitonmatrix.menu.action.copy.selection=Copier la s\u00E9lection +nuitonmatrix.menu.action.copy.selection=Copier la sélection nuitonmatrix.menu.action.paste=Coller -nuitonmatrix.menu.action.paste.position=Coller \u00E0 la position courante +nuitonmatrix.menu.action.paste.position=Coller à la position courante nuitonmatrix.menu.csv=Importer/Exporter fichier CSV nuitonmatrix.menu.csv.export.file=Exporter dans un fichier -nuitonmatrix.menu.csv.export.selection=Exporter la s\u00E9lection +nuitonmatrix.menu.csv.export.selection=Exporter la sélection nuitonmatrix.menu.csv.import.file=Importer depuis un fichier -nuitonmatrix.menu.csv.import.position=Importer \u00E0 la position courante -nuitonmatrix.menu.data=Donn\u00E9es +nuitonmatrix.menu.csv.import.position=Importer à la position courante +nuitonmatrix.menu.data=Données nuitonmatrix.menu.data.fillvalue=Remplir avec une valeur nuitonmatrix.menu.data.fillvalue.ask=Entrez la valeur avec laquelle remplir la matrice \: -nuitonmatrix.menu.data.identity=Convertir en matrice identit\u00E9 -nuitonmatrix.menu.option.semantics=Exporter/Copier avec la s\u00E9mantique +nuitonmatrix.menu.data.identity=Convertir en matrice identité +nuitonmatrix.menu.option.semantics=Exporter/Copier avec la sémantique nuitonmatrix.viewer.dimnameindex=Dimension %d nuitonmatrix.viewer.graphcomborender.bar=Rendu en barres verticales nuitonmatrix.viewer.graphcomborender.bar.3d=Rendu en barres verticales 3D -nuitonmatrix.viewer.graphcomborender.bar.stacked=Rendu en barres verticales empil\u00E9es +nuitonmatrix.viewer.graphcomborender.bar.stacked=Rendu en barres verticales empilées nuitonmatrix.viewer.graphcomborender.line=Rendu en ligne nuitonmatrix.viewer.graphcomborender.line.3d=Rendu en ligne 3D nuitonmatrix.viewer.graphcomborender.min.max=Rendu en MinMax nuitonmatrix.viewer.graphcomborender.surface=Rendu en aire -nuitonmatrix.viewer.graphcomborender.surface.stacked=Rendu en aires empil\u00E9es -nuitonmatrix.viewer.matrix.more.2d=Matrice de plus de 2 dimensions \!\nS\u00E9lectionnez moins d'\u00E9l\u00E9ments ou utilisez l'op\u00E9rateur somme. +nuitonmatrix.viewer.graphcomborender.surface.stacked=Rendu en aires empilées +nuitonmatrix.viewer.matrix.more.2d=Matrice de plus de 2 dimensions \!\nSélectionnez moins d'éléments ou utilisez l'opérateur somme. nuitonmatrix.viewer.renderer.chart=Graphique nuitonmatrix.viewer.renderer.exportascsv=Exporter en CSV nuitonmatrix.viewer.renderer.panel=Matrice Modified: trunk/pom.xml =================================================================== --- trunk/pom.xml 2011-05-25 08:31:11 UTC (rev 365) +++ trunk/pom.xml 2011-05-25 08:51:21 UTC (rev 366) @@ -93,8 +93,8 @@ <projectId>nuiton-matrix</projectId> <jaxxVersion>2.4</jaxxVersion> - <nuitonUtilsVersion>2.1.1</nuitonUtilsVersion> - <nuitonI18nVersion>2.3.2</nuitonI18nVersion> + <nuitonUtilsVersion>2.2</nuitonUtilsVersion> + <nuitonI18nVersion>2.4</nuitonI18nVersion> </properties>

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r365 - trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/viewer/renderer/jfreechart
by echatellier＠users.nuiton.org May 25, 2011

May 25, 2011

Author: echatellier Date: 2011-05-25 10:31:11 +0200 (Wed, 25 May 2011) New Revision: 365 Url: http://nuiton.org/repositories/revision/nuiton-matrix/365 Log: Fix variable name Modified: trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/viewer/renderer/jfreechart/GraphMatrixNDDataset.java Modified: trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/viewer/renderer/jfreechart/GraphMatrixNDDataset.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/viewer/renderer/jfreechart/GraphMatrixNDDataset.java 2011-05-25 08:26:27 UTC (rev 364) +++ trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/viewer/renderer/jfreechart/GraphMatrixNDDataset.java 2011-05-25 08:31:11 UTC (rev 365) @@ -76,13 +76,13 @@ String baseName = DataPackageResources.class.getCanonicalName(); ResourceBundle resources = ResourceBundle.getBundle(baseName); - int series_count = mat.getDim(1); - if (series_count > 0) { + int seriesCount = mat.getDim(1); + if (seriesCount > 0) { // set up the series names... if (seriesNames != null) { - if (seriesNames.size() != series_count) { + if (seriesNames.size() != seriesCount) { throw new IllegalArgumentException( "DefaultCategoryDataset: the number of " + "series names does not match the number of series in the data."); @@ -93,7 +93,7 @@ String prefix = resources .getString("series.default-prefix") + " "; - this.seriesNames = this.generateNames(series_count, prefix); + this.seriesNames = this.generateNames(seriesCount, prefix); } if (mat.getDimCount() > 1) {

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r364 - trunk
by echatellier＠users.nuiton.org May 25, 2011

May 25, 2011

Author: echatellier Date: 2011-05-25 10:26:27 +0200 (Wed, 25 May 2011) New Revision: 364 Url: http://nuiton.org/repositories/revision/nuiton-matrix/364 Log: Unify project name Modified: trunk/pom.xml Modified: trunk/pom.xml =================================================================== --- trunk/pom.xml 2011-05-25 08:25:02 UTC (rev 363) +++ trunk/pom.xml 2011-05-25 08:26:27 UTC (rev 364) @@ -77,7 +77,7 @@   - <name>NuitonMatrix</name> + <name>Nuiton Matrix</name> <description>Multiple dimensions matrix library</description> <inceptionYear>2004</inceptionYear> <url>http://maven-site.nuiton.org/nuiton-matrix</url>

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r363 - trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix
by echatellier＠users.nuiton.org May 25, 2011

May 25, 2011

Author: echatellier Date: 2011-05-25 10:25:02 +0200 (Wed, 25 May 2011) New Revision: 363 Url: http://nuiton.org/repositories/revision/nuiton-matrix/363 Log: Fix comment, javadoc Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixND.java Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java 2011-05-25 07:59:15 UTC (rev 362) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java 2011-05-25 08:25:02 UTC (rev 363) @@ -132,8 +132,7 @@ public AbstractMatrixND(MatrixFactory factory, String name, int[] dim, String[] dimNames) { - this(factory, dim); - setName(name); + this(factory, name, dim); for (int i = 0; dimNames != null && i < dimNames.length; i++) { setDimensionName(i, dimNames[i]); } @@ -1023,7 +1022,7 @@ throw new MatrixException( "La multiplication de matrice n'est pas applicable aux matrices de plus de 2 dimensions"); } - if (!((this.getDim(1) == m.getDim(0)))) { + if (this.getDim(1) != m.getDim(0)) { throw new MatrixException( "Le nombre de colonnes de la matrice m1 doit etre egal au nombre de lignes de la matrice m2"); } @@ -1091,8 +1090,11 @@ * Determine si la matrice supporte l'import et l'export CSV * * @return support du CSV + * @deprecated since 2.2, always return {@code true}, CSV import/export is + * always supported */ @Override + @Deprecated public boolean isSupportedCSV() { return getDimCount() <= 2; } @@ -1166,47 +1168,6 @@ number.append((char) c); } } - - // cette implatation avec StreamTokenizer ne fonctionne pas - // car il ne sait pas reconnaitre tous les nombres: 5.0E-7 - // int rowsCount = 0; - // StreamTokenizer tokenizer; - // List<Double> row = new ArrayList<Double>(); - // boolean stop = false; - // - // tokenizer = new StreamTokenizer(reader); - // tokenizer.eolIsSignificant(true); - // - // while(!stop) { - // tokenizer.nextToken(); - // - // switch (tokenizer.ttype) { - // case StreamTokenizer.TT_EOF: - // stop = true; // no break we do next case too - // case StreamTokenizer.TT_EOL: - // if(!row.isEmpty()) { - // MatrixND matrix = getFactory().create(new int[]{1, row.size()}); - // int columnNumber = 0; - // for (Double value : row) { - // matrix.setValue(new int[]{0, columnNumber}, value); - // columnNumber++; - // } - // paste(new int[]{origin[0] + rowsCount, origin[1]}, matrix); - // rowsCount ++; - // row.clear(); - // } - // break; - // case StreamTokenizer.TT_NUMBER: - // System.out.println("+++++++++ " + tokenizer.nval); - // row.add(tokenizer.nval); - // break; - // case StreamTokenizer.TT_WORD: - // System.out.println("--------- " + tokenizer.nval); - // break; - // default: - // break; - // } - // } } /** Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixND.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixND.java 2011-05-25 07:59:15 UTC (rev 362) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixND.java 2011-05-25 08:25:02 UTC (rev 363) @@ -5,7 +5,7 @@ * $Id$ * $HeadURL$ * %% - * Copyright (C) 2004 - 2010 CodeLutin, Chatellier Eric + * Copyright (C) 2004 - 2011 CodeLutin, Chatellier Eric * %% * This program is free software: you can redistribute it and/or modify * it under the terms of the GNU Lesser General Public License as @@ -239,27 +239,6 @@ */ public MatrixND map(MapFunction f); - // /** - // * Retourne la sous matrice demandée en fonction des dimensions - // * passé en paramètre. - // * - // * Exemple: Si on a un matrice 3D. - // * get([1,1,1]) retourne un element de la matrice. - // * get([0,0]) retourne une matrice 1D. - // * get([3]) retourne une matrice 2D. - // * get([-1,1]) retourne une matrice 2D. - // * get([-1,-1,1]) retourne une matrice 2D. - // * - // * @param dimensions les différentes dimension à extraire. - // * - // * @return une MatrixND. - // */ - // public MatrixND get(int [] dimensions); - // public MatrixND get(int x); - // public MatrixND get(int x, int y); - // public MatrixND get(int x, int y, int z); - // public MatrixND get(int x, int y, int z, int t); - /** * Renvoie un element de la matrice demandée en fonction des dimensions * passé en paramètre. @@ -275,46 +254,100 @@ */ public double getValue(int[] dimensions); + /** + * Return a 1D matrix value. + * + * @param x first dimension index + * + * @return double value at specified dimensions + */ public double getValue(int x); + /** + * Return a 2D matrix value. + * + * @param x first dimension index + * @param y second dimension index + * + * @return double value at specified dimensions + */ public double getValue(int x, int y); + /** + * Return a 3D matrix value. + * + * @param x first dimension index + * @param y second dimension index + * @param z third dimension index + * + * @return double value at specified dimensions + */ public double getValue(int x, int y, int z); + /** + * Return a 4D matrix value. + * + * @param x first dimension index + * @param y second dimension index + * @param z third dimension index + * @param t fourth dimension index + * + * @return double value at specified dimensions + */ public double getValue(int x, int y, int z, int t); + /** + * Renvoie un element de la matrice demandée en fonction des dimensions + * passé en paramètre. + * + * @param coordinates semantics values to get matrix value + * + * @return double value at specified dimensions + */ public double getValue(Object[] coordinates); + /** + * Return a 1D matrix value. + * + * @param x first dimension + * + * @return double value at specified dimensions + */ public double getValue(Object x); + /** + * Return a 2D matrix value. + * + * @param x first dimension + * @param y second dimension + * + * @return double value at specified dimensions + */ public double getValue(Object x, Object y); + /** + * Return a 3D matrix value. + * + * @param x first dimension + * @param y second dimension + * @param z third dimension + * + * @return double value at specified dimensions + */ public double getValue(Object x, Object y, Object z); + /** + * Return a 4D matrix value. + * + * @param x first dimension + * @param y second dimension + * @param z third dimension + * @param t fourth dimension + * + * @return double value at specified dimensions + */ public double getValue(Object x, Object y, Object z, Object t); - // /** - // * Modifie la sous matrice demandée en fonction des dimensions - // * passé en paramètre. - // * - // * Exemple: Si on a un matrice 3D. - // * set([1,1,1], m) modifie un element de la matrice. - // * set([0,0], m) modifie une matrice 1D. - // * set([3], m) modifie une matrice 2D. - // * set([-1,1], m) modifie une matrice 2D. - // * set([-1,-1,1], m) modifie une matrice 2D. - // * - // * @param dimensions les différentes dimension à extraire. - // * - // * @param m la matrice qui doit remplacer la sous matrice spécifié - // * par l'argument dimensions - // */ - // public void set(int [] dimensions, MatrixND m); - // public void set(int x, MatrixND m); - // public void set(int x, int y, MatrixND m); - // public void set(int x, int y, int z, MatrixND m); - // public void set(int x, int y, int z, int t, MatrixND m); - /** * Modifie un element de la matrice en fonction des dimensions passé en * paramètre. @@ -322,29 +355,104 @@ * Exemple: Si on a un matrice 3D. * set([1,1,1], m) modifie un element de la matrice. * - * @param dimensions les différentes dimension à extraire. + * @param dimensions dimension indices * - * @param d l'entier double qui doit remplacer l'entier double spécifié par - * l'argument dimensions + * @param d new double value to set into matrix at specified dimensions */ public void setValue(int[] dimensions, double d); + /** + * Modify a 1D matrix value. + * + * @param x first dimension index + * + * @param d new double value to set into matrix at specified dimensions + */ public void setValue(int x, double d); + /** + * Modify a 2D matrix value. + * + * @param x first dimension index + * @param y second dimension index + * + * @param d new double value to set into matrix at specified dimensions + */ public void setValue(int x, int y, double d); + /** + * Modify a 3D matrix value. + * + * @param x first dimension index + * @param y second dimension index + * @param z third dimension index + * + * @param d new double value to set into matrix at specified dimensions + */ public void setValue(int x, int y, int z, double d); + /** + * Modify a 4D matrix value. + * + * @param x first dimension index + * @param y second dimension index + * @param z third dimension index + * @param t fourth dimension index + * + * @param d new double value to set into matrix at specified dimensions + */ public void setValue(int x, int y, int z, int t, double d); + /** + * Modifie un element de la matrice en fonction des dimensions passé en + * paramètre. + * + * @param coordinates semantics value to set matrix value + * + * @param d new double value to set into matrix at specified dimensions + */ public void setValue(Object[] coordinates, double d); + /** + * Modify a 1D matrix value. + * + * @param x first dimension index + * + * @param d new double value to set into matrix at specified dimensions + */ public void setValue(Object x, double d); + /** + * Modify a 2D matrix value. + * + * @param x first dimension + * @param y second dimension + * + * @param d new double value to set into matrix at specified dimensions + */ public void setValue(Object x, Object y, double d); + /** + * Modify a 3D matrix value. + * + * @param x first dimension + * @param y second dimension + * @param z third dimension + * + * @param d new double value to set into matrix at specified dimensions + */ public void setValue(Object x, Object y, Object z, double d); + /** + * Modify a 4D matrix value. + * + * @param x first dimension + * @param y second dimension + * @param z third dimension + * @param t fourth dimension + * + * @param d new double value to set into matrix at specified dimensions + */ public void setValue(Object x, Object y, Object z, Object t, double d); /** @@ -362,14 +470,6 @@ */ public MatrixND clone(); - // /** - // * Verifie si les dimensions sont valide pour cette matrice - // * @return vrai si dim a la même taille que le tableau de dimensions de la - // * matrice et si chaque valeur de dim est comprise entre 0 (inclus) et - // * la taille de la dimension (exclus). - // */ - // public boolean dimValid(int [] dim); - /** * Somme toutes les valeurs de la matrice. * @@ -568,42 +668,6 @@ */ public MatrixND pasteSemantics(MatrixND mat); - // /** - // * Permet de prendre une sous matrice dans la matrice. - // * par exemple pour la matrice suivante - // * <pre> - // * 1 2 3 4 5 - // * 2 3 4 5 6 - // * 3 4 5 6 7 - // * 4 5 6 7 8 - // * 5 6 7 8 9 - // * </pre> - // * un getSubMatrix([1,2], [-1, -1], [2,-1]) donnera - // * <pre> - // * 4 5 - // * 5 6 - // * 6 7 - // * </pre> - // * @param origine point à partir duquel on souhaite extraire la matrice - // * toutes les valeurs de ce tableau doivent être renseigné par des nombres - // * positif et inferieur au maximum de chaque dimension respective - // * @param toExtract permet d'indiquer les dimensions que l'on souhaite - // * extraire. Les dimensions que l'on souhaite sont marqué par un -1. Si - // * une dimension n'a pas de -1 alors on ne prend qu'une ligne dans cette - // * dimension. Le nombre de -1 indique la taille de la matrice resultante - // * S'il y a 3 -1 dans le tableau, la matrice aura 3 dimensions - // * @param nbToExtract permet de limite le nombre d'élément à prendre dans - // * une dimension. Si le tableau contient -1 alors toutes les valeurs de - // * origin à la fin seront prise, si le tableau contient une valeur - // positive - // * alors seul le nombre indique sera pris à partir d'origin. Une valeur - // * différente de -1 n'a de sens que pour les dimensions qui ont une valeur - // * -1 dans le paramètre toExtract - // * @return une sous matrice de la matrice - // */ - // public MatrixND getSubMatrix(int [] origin, int [] toExtract, int [] - // nbToExtract); - /** * Permet de prendre une sous matrice dans la matrice courante. La sous * matrice a le même nombre de dimensions mais sur une des dimensions on ne @@ -798,7 +862,10 @@ * Determine si la matrice supporte l'import et l'export CSV * * @return support du CSV + * @deprecated since 2.2, always return {@code true}, CSV import/export is + * always supported */ + @Deprecated public boolean isSupportedCSV(); /** @@ -830,30 +897,4 @@ */ public boolean equalsValues(MatrixND mat); - // /** - // * Multiplication d'une vecteur [i] avec une matrice [i,j], - // * le resultat est result[i,j]=matrice[i,j]*vecteur[i] - // */ - // public MatrixND multv(MatrixND v); - // /** - // * Multiplication d'une vecteur [i] avec une matrice [g,h,i,j,k,..], - // * le resultat est - // result[g,h,i,j,k,..]=matrice[g,h,i,j,k,l,...]*vecteur[i] - // * @param v le vecteur - // * @param dim la position de la dimension avec lequel il faut multiplier - // * le vecteur. - // */ - // public MatrixND multv(MatrixND v, int dim); - // /** - // * Addition d'un vecteur [i] avec une matrice [g,h,i,j,k,..], - // * le resultat est - // result[g,h,i,j,k,..]=matrice[g,h,i,j,k,l,...]+vecteur[i] - // * @param v le vecteur - // * @param dim la dimension ou on doit mettre le vecteur doit etre egal a - // -1 - // * [0, -1, 3 ] ajoutera le vecteur dans la dimension 2 - // */ - // public MatrixND addv(MatrixND v, int [] dim); - } // MatrixND -

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r362 - trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix
by echatellier＠users.nuiton.org May 25, 2011

May 25, 2011

Author: echatellier Date: 2011-05-25 09:59:15 +0200 (Wed, 25 May 2011) New Revision: 362 Url: http://nuiton.org/repositories/revision/nuiton-matrix/362 Log: Fix javadoc Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixND.java Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixND.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixND.java 2011-05-24 14:40:35 UTC (rev 361) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/MatrixND.java 2011-05-25 07:59:15 UTC (rev 362) @@ -69,7 +69,7 @@ * @return la semantique de la dimension on null s'il n'y a pas de * semantique * - * @deprecated use #getSemantic(int) instead + * @deprecated (since 1.0.3) use #getSemantic(int) instead */ @Deprecated public List<?> getSemantics(int dim); @@ -90,7 +90,7 @@ * @param dim dimension to modify semantic * @param sem new semantic to set * - * @deprecated (since 1.0.3) use #setSemantics(int, List<E>) instead + * @deprecated (since 1.0.3) use #setSemantic(int, List<E>) instead */ @Deprecated public <E> void setSemantics(int dim, List<E> sem);

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r361 - trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix
by echatellier＠users.nuiton.org May 24, 2011

May 24, 2011

Author: echatellier Date: 2011-05-24 16:40:35 +0200 (Tue, 24 May 2011) New Revision: 361 Url: http://nuiton.org/repositories/revision/nuiton-matrix/361 Log: Fix javadoc Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java Modified: trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java 2011-05-24 07:58:26 UTC (rev 360) +++ trunk/nuiton-matrix/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/AbstractMatrixND.java 2011-05-24 14:40:35 UTC (rev 361) @@ -5,7 +5,7 @@ * $Id$ * $HeadURL$ * %% - * Copyright (C) 2004 - 2010 CodeLutin + * Copyright (C) 2004 - 2011 CodeLutin, Chatellier Eric * %% * This program is free software: you can redistribute it and/or modify * it under the terms of the GNU Lesser General Public License as @@ -187,7 +187,7 @@ /** * {@inheritDoc} * - * @deprecated Use #getSemantics(dim) + * @deprecated Use #getSemantic(dim) */ @Deprecated @Override

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r360 - trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/gui
by echatellier＠users.nuiton.org May 24, 2011

May 24, 2011

Author: echatellier Date: 2011-05-24 09:58:26 +0200 (Tue, 24 May 2011) New Revision: 360 Url: http://nuiton.org/repositories/revision/nuiton-matrix/360 Log: Fix error when auto appending file extension Modified: trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/gui/MatrixPopupMenu.java Modified: trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/gui/MatrixPopupMenu.java =================================================================== --- trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/gui/MatrixPopupMenu.java 2011-05-14 11:44:55 UTC (rev 359) +++ trunk/nuiton-matrix-gui/src/main/java/org/nuiton/math/matrix/gui/MatrixPopupMenu.java 2011-05-24 07:58:26 UTC (rev 360) @@ -252,10 +252,10 @@ int returnVal = getFileChooser().showOpenDialog(matrixEditor); if (returnVal == JFileChooser.APPROVE_OPTION) { File selectedFile = getFileChooser().getSelectedFile(); - + // add csv extension if not already set in selected file - if (selectedFile.getName().endsWith(".csv")) { - selectedFile = new File(selectedFile.getName() + ".csv"); + if (!selectedFile.getName().endsWith(".csv")) { + selectedFile = new File(selectedFile.getAbsolutePath() + ".csv"); } return FileUtil.getWriter(selectedFile); }

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