Re: [Echobase-devel] Acoustic format change request?
Je pense qu'il y a des soucis côté CIEM, car j'ai sur le meme fichier : https://acoustic.ices.dk/ValidationReport/Index/Biotic/0123141312_Validation... On Tue, 22 Jan 2019 16:28:09 +0100 Mathieu Doray <mathieu.doray@ifremer.fr> wrote:
houla, pas très bon ce rapport de validation du biotic :
https://acoustic.ices.dk/ValidationReport/Index/Biotic/0122211411_Validation...
??
Le 22/01/2019 à 11:41, Jean Couteau a écrit :
Bonjour Mathieu,
tu trouveras en pièce-jointe un test d'export ICES de PELGAS2015. Ça devrait te permettre de vérifier le Biotic, et me dire pour l'Acoustic, car pour tous les echotypes, je n'ai jamais de SpeciesCategory dans les results (j'ai bien une category, mais elle n'a pas de speciesCategory ou sizeCategory, donc impossible de faire le lien avec les espèces (que j'ai bien)).
Jean
Dans l'echotype, j'ai les species, mais pas leur catégorie (à moins que ce soit le EchotypeCategory). Dans le Biotic, je récupère les category via le subsample.getCategories.getSpecies. Chose que je ne peux pas faire ici...
Que dois-je donc mettre ici ? Il faut utiliser en plus la table "echotype_species" en plus de la table "echotype" pour avoir toutes les infos sur les échotypes. Exemple de requête :
SELECT voyage.name voyage, echotype.name echotype, species.baracoudacode species, sizecategory.name sizeCategory, depthstratum.id depthStratum FROM public.echotype_species echotype_species, public.echotype echotype, public.species species, public.speciescategory speciescategory, public.voyage voyage, public.sizecategory sizecategory, public.depthstratum depthstratum WHERE echotype_species.echotype = echotype.topiaid AND echotype_species.species = species.topiaid AND speciescategory.species = species.topiaid AND echotype.voyage = voyage.topiaid AND speciescategory.sizecategory = sizecategory.topiaid AND echotype.depthstratum = depthstratum.topiaid
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On Wed, 23 Jan 2019 08:55:12 +0100 Jean Couteau <couteau@codelutin.com> wrote:
Je pense qu'il y a des soucis côté CIEM, car j'ai sur le meme fichier : https://acoustic.ices.dk/ValidationReport/Index/Biotic/0123141312_Validation...
Sur le fichier Acoustic, il semblerait que le CIEM ne soit pas encore à jour par rapport aux specs que tu m'as annoncées. Echotype n'est pas encore pris en compte : https://acoustic.ices.dk/ValidationReport/Index/Acoustic/0123141312_Validati... Jean
Le CIEM devrait avoir fini l'implémentation des échotypes dans leur base mercredi prochain Mathieu Le 23/01/2019 à 08:58, Jean Couteau a écrit :
On Wed, 23 Jan 2019 08:55:12 +0100 Jean Couteau <couteau@codelutin.com> wrote:
Je pense qu'il y a des soucis côté CIEM, car j'ai sur le meme fichier : https://acoustic.ices.dk/ValidationReport/Index/Biotic/0123141312_Validation...
Sur le fichier Acoustic, il semblerait que le CIEM ne soit pas encore à jour par rapport aux specs que tu m'as annoncées. Echotype n'est pas encore pris en compte :
https://acoustic.ices.dk/ValidationReport/Index/Acoustic/0123141312_Validati...
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-- Mathieu Doray, PhD Ifremer Unité Ecologie et Modèles pour l'Halieutique rue de l'Ile d'Yeu B.P. 21105 44311 Nantes Cedex 03 mathieu.doray@ifremer.fr Tel./Phone: 02 40 37 41 65 / International: 332 40 37 41 65 Fax : 02.40.37.40.01 / International: 332 40 37 40 01 CV / resume: http://annuaire.ifremer.fr/cv/17093/
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