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r2811 - in isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator: . launcher
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org Dec. 10, 2009

Dec. 10, 2009

Author: chatellier Date: 2009-12-10 14:30:26 +0000 (Thu, 10 Dec 2009) New Revision: 2811 Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationControl.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationServiceTableModel.java Log: Change progress type from int to long. Update javadoc. Format code. Make xml-rpc only method deprecated. Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationControl.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationControl.java 2009-12-10 14:28:48 UTC (rev 2810) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationControl.java 2009-12-10 14:30:26 UTC (rev 2811) @@ -1,6 +1,5 @@ /* *##% - * Copyright (C) 2002 - 2009 Code Lutin, Cédric Pineau, - Benjamin Poussin + * Copyright (C) 2002 - 2009 Ifremer, Code Lutin, Cédric Pineau, Benjamin Poussin * * This program is free software; you can redistribute it and/or * modify it under the terms of the GNU General Public License @@ -51,18 +50,19 @@ protected PropertyChangeSupport listeners = new PropertyChangeSupport(this); protected boolean inUpdateFromHashtable = false; protected transient SimulationStorage simulation = null; - + protected String id = null; protected boolean started = false; protected boolean running = true; protected boolean stop = false; - protected Date date = new Date(); - protected int progressMax = 0; - protected int progress = 0; + protected Date date; + protected long progressMax = 0; + protected long progress = 0; protected String text = ""; - + + /** @deprecated only used in isis xml-rpc server. */ protected Map<String, Object> update = new Hashtable<String, Object>(); - + /** * * @param id simulation id @@ -79,11 +79,11 @@ started = false; running = true; stop = false; - date = new Date(); + date = null; progressMax = 0; progress = 0; } - + /** * Retourne la simulation associe a ce control * @return retourne null si la simulation n'existe pas encore @@ -94,29 +94,30 @@ } return simulation; } - + public void addPropertyChangeListener(String propName, PropertyChangeListener l) { listeners.addPropertyChangeListener(propName, l); } - + public void addPropertyChangeListener(PropertyChangeListener l) { listeners.addPropertyChangeListener(l); } - - public void removePropertyChangeListener(String propName, PropertyChangeListener l) { + + public void removePropertyChangeListener(String propName, + PropertyChangeListener l) { listeners.removePropertyChangeListener(propName, l); } - + public void removePropertyChangeListener(PropertyChangeListener l) { listeners.removePropertyChangeListener(l); } - + public boolean isStarted() { return started; } - + /** - * appelee juste avant de reellement demarrer le thread de simulation + * Appelee juste avant de reellement demarrer le thread de simulation * indique que cette simulation est en cours et qu'il ne faut plus la lancer * * @param started The running to set. @@ -128,7 +129,7 @@ } /** - * Method running + * Method running. * * @return faux une fois que stopSimulation a ete appele. */ @@ -146,14 +147,14 @@ } /** - * Method startSimulation appele lors du debut de la simulation + * Appele lors du debut de la simulation. */ public void startSimulation() { setRunning(true); } /** - * Method stopSimulation appele lors de la fin reelle de la simulation + * Appele lors de la fin reelle de la simulation. */ public void stopSimulation() { setRunning(false); @@ -165,7 +166,7 @@ public String getText() { return this.text; } - + /** * @param text The text to set. */ @@ -177,53 +178,63 @@ this.text = text; listeners.firePropertyChange("text", oldValue, this.text); } - + /** * @return Returns the progressMax. */ - public int getProgressMax() { + public long getProgressMax() { return this.progressMax; } - + /** - * @param progressMax The progressMax to set. + * Set max progress. + * + * @param progressMax progressMax to set. */ - public void setProgressMax(int progressMax) { - int oldValue = this.progressMax; + public void setProgressMax(long progressMax) { + long oldValue = this.progressMax; this.progressMax = progressMax; listeners.firePropertyChange("progressMax", oldValue, this.progressMax); } - + /** - * @return Returns the progress. + * Get current progress. + * + * @return the progress. */ - public int getProgress() { + public long getProgress() { return this.progress; } - + /** - * @param progress The progress to set. + * Set current progress. + * + * @param progress progress to set. */ - public void setProgress(int progress) { - int oldValue = this.progress; + public void setProgress(long progress) { + long oldValue = this.progress; this.progress = progress; - if(log.isTraceEnabled()) { - log.trace("control fire event 'progress' (" + oldValue + "/" + this.progress); + if (log.isTraceEnabled()) { + log.trace("control fire event 'progress' (" + oldValue + "/" + + this.progress); } listeners.firePropertyChange("progress", oldValue, this.progress); } - + /** - * demande l'arret de la simulation - * @param val + * Demande l'arret de la simulation. + * + * @param val {@code true} to stop */ - public void setStopSimulationRequest(boolean val){ + public void setStopSimulationRequest(boolean val) { boolean oldValue = this.stop; this.stop = val; listeners.firePropertyChange("stop", oldValue, this.stop); } - + /** + * Is stop request been asked. + * * @return retourne vrai si l'arret de la simulation a ete demandee */ public boolean isStopSimulationRequest() { @@ -231,7 +242,7 @@ } /** - * Method getId donne id de la simulation + * Method getId donne id de la simulation. * * @return l'id de la simulation */ @@ -240,39 +251,44 @@ } /** - * Method getDate donne la date utiliser par la simulation + * Method getDate donne la date utiliser par la simulation. * * @return donne la date utiliser par la simulation */ public Date getDate() { return date; } - /** - * Modifie la date de la simulation + * Modifie la date de la simulation. + * * @param d la nouvelle date */ public void setDate(Date d) { - int oldValue = this.date.getDate(); + int oldValue = 0; + if (this.date != null) { + oldValue = this.date.getDate(); + } this.date = d; listeners.firePropertyChange("date", oldValue, this.date.getDate()); } /** * Convert current object in hashtable representation, and clear hashtable - * that contains last modified field + * that contains last modified field. + * * @return object hashtable representation + * @deprecated only used in xml-rpc isis server */ public Hashtable<String, Object> getUpdateHashtable() { Hashtable<String, Object> result = new Hashtable<String, Object>(update); update.clear(); - + result.put("id", getId()); - + return result; } - + /** * Met dans un Properties tous les champs * @return un Properties avec tous les champs @@ -283,14 +299,16 @@ result.setProperty("started", String.valueOf(started)); result.setProperty("running", String.valueOf(running)); result.setProperty("stop", String.valueOf(stop)); - result.setProperty("date", String.valueOf(date.getDate())); + if (date != null) { + result.setProperty("date", String.valueOf(date.getDate())); + } result.setProperty("progressMax", String.valueOf(progressMax)); result.setProperty("progress", String.valueOf(progress)); result.setProperty("text", text); - + return result; } - + /** * update current object from Properties representation * @@ -299,36 +317,41 @@ public void updateFromProperties(Properties props) { inUpdateFromHashtable = true; - if(log.isTraceEnabled()) { + if (log.isTraceEnabled()) { log.trace("updateFromProperties properties = " + props.toString()); } - + // warning : props.contains("started") // seems to not works on properties :( // use containsKey() try { if (props.containsKey("started")) { - boolean started = "true".equalsIgnoreCase(props.getProperty("started")); + boolean started = "true".equalsIgnoreCase(props + .getProperty("started")); setStarted(started); } if (props.containsKey("running")) { - boolean running = "true".equalsIgnoreCase(props.getProperty("running")); + boolean running = "true".equalsIgnoreCase(props + .getProperty("running")); setRunning(running); } if (props.containsKey("stop")) { - boolean stop = "true".equalsIgnoreCase(props.getProperty("stop")); + boolean stop = "true".equalsIgnoreCase(props + .getProperty("stop")); setStopSimulationRequest(stop); } if (props.containsKey("date")) { - Date date = new Date(Integer.parseInt(props.getProperty("date"))); + Date date = new Date(Integer + .parseInt(props.getProperty("date"))); setDate(date); } if (props.containsKey("progressMax")) { - int progressMax = Integer.parseInt(props.getProperty("progressMax")); + long progressMax = Long.parseLong(props + .getProperty("progressMax")); setProgressMax(progressMax); } if (props.containsKey("progress")) { - int progress = Integer.parseInt(props.getProperty("progress")); + long progress = Long.parseLong(props.getProperty("progress")); setProgress(progress); } if (props.containsKey("text")) { @@ -339,41 +362,41 @@ inUpdateFromHashtable = false; } } - - + /** * update current object from hashtable representation - * + * + * @deprecated only used in xml-rpc isis server */ public void updateFromHashtable(Hashtable<String, Object> h) { inUpdateFromHashtable = true; try { if (h.containsKey("started")) { - boolean started = (Boolean)h.get("started"); + boolean started = (Boolean) h.get("started"); setStarted(started); } if (h.containsKey("running")) { - boolean running = (Boolean)h.get("running"); + boolean running = (Boolean) h.get("running"); setRunning(running); } if (h.containsKey("stop")) { - boolean stop = (Boolean)h.get("stop"); + boolean stop = (Boolean) h.get("stop"); setStopSimulationRequest(stop); } if (h.containsKey("date")) { - Date date = new Date((Integer)h.get("date")); + Date date = new Date((Integer) h.get("date")); setDate(date); } if (h.containsKey("progressMax")) { - int progressMax = (Integer)h.get("progressMax"); + long progressMax = (Long) h.get("progressMax"); setProgressMax(progressMax); } if (h.containsKey("progress")) { - int progress = (Integer)h.get("progress"); + long progress = (Long) h.get("progress"); setProgress(progress); } if (h.containsKey("text")) { - String text = (String)h.get("text"); + String text = (String) h.get("text"); setText(text); } } finally { @@ -396,5 +419,5 @@ } } } - + } // SimulationControl Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationServiceTableModel.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationServiceTableModel.java 2009-12-10 14:28:48 UTC (rev 2810) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationServiceTableModel.java 2009-12-10 14:30:26 UTC (rev 2811) @@ -21,19 +21,23 @@ import static org.nuiton.i18n.I18n._; -import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationControl; -import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationParameter; import java.beans.PropertyChangeEvent; import java.beans.PropertyChangeListener; import java.util.ArrayList; import java.util.HashMap; import java.util.Map; import java.util.WeakHashMap; + import javax.swing.JProgressBar; import javax.swing.table.AbstractTableModel; + import org.apache.commons.logging.Log; import org.apache.commons.logging.LogFactory; +import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationControl; +import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationParameter; +import fr.ifremer.isisfish.types.Date; + /** * Model de table pour suivre l'evolution des differentes simulations en cours. * @@ -248,10 +252,14 @@ break; case 4: JProgressBar pb = getProgressBar(job); - pb.setMaximum(control.getProgressMax()); - pb.setValue(control.getProgress()); - pb.setString(control.getDate().getMonth() + "/" - + control.getDate().getYear()); + pb.setMaximum((int)control.getProgressMax()); + pb.setValue((int)control.getProgress()); + + // progress can be used for other things + Date date = control.getDate(); + if (date != null) { + pb.setString(date.getMonth() + "/" + date.getYear()); + } result = pb; break; }

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r2810 - isis-fish/trunk
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org Dec. 10, 2009

Dec. 10, 2009

Author: chatellier Date: 2009-12-10 14:28:48 +0000 (Thu, 10 Dec 2009) New Revision: 2810 Modified: isis-fish/trunk/pom.xml Log: Revert beta2 use Modified: isis-fish/trunk/pom.xml =================================================================== --- isis-fish/trunk/pom.xml 2009-12-10 14:25:19 UTC (rev 2809) +++ isis-fish/trunk/pom.xml 2009-12-10 14:28:48 UTC (rev 2810) @@ -435,8 +435,8 @@ <properties>  <jaxx.version>1.7.1</jaxx.version> - <eugene.version>2.0.0-beta-2-SNAPSHOT</eugene.version> - <topia.version>2.3.0-beta-2-SNAPSHOT</topia.version> + <eugene.version>2.0.0-beta-SNAPSHOT</eugene.version> + <topia.version>2.3.0-beta-SNAPSHOT</topia.version> <nuiton-utils.version>1.1.2-SNAPSHOT</nuiton-utils.version> <nuiton-i18n.version>1.0.1</nuiton-i18n.version> <nuiton-widgets.version>1.0.1-SNAPSHOT</nuiton-widgets.version>

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r2809 - isis-fish/trunk
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org Dec. 10, 2009

Dec. 10, 2009

Author: chatellier Date: 2009-12-10 14:25:19 +0000 (Thu, 10 Dec 2009) New Revision: 2809 Modified: isis-fish/trunk/pom.xml Log: Use never snapshot Modified: isis-fish/trunk/pom.xml =================================================================== --- isis-fish/trunk/pom.xml 2009-12-10 10:07:50 UTC (rev 2808) +++ isis-fish/trunk/pom.xml 2009-12-10 14:25:19 UTC (rev 2809) @@ -435,8 +435,8 @@ <properties>  <jaxx.version>1.7.1</jaxx.version> - <eugene.version>2.0.0-beta-SNAPSHOT</eugene.version> - <topia.version>2.3.0-beta-SNAPSHOT</topia.version> + <eugene.version>2.0.0-beta-2-SNAPSHOT</eugene.version> + <topia.version>2.3.0-beta-2-SNAPSHOT</topia.version> <nuiton-utils.version>1.1.2-SNAPSHOT</nuiton-utils.version> <nuiton-i18n.version>1.0.1</nuiton-i18n.version> <nuiton-widgets.version>1.0.1-SNAPSHOT</nuiton-widgets.version>

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r2808 - isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org Dec. 10, 2009

Dec. 10, 2009

Author: chatellier Date: 2009-12-10 10:07:50 +0000 (Thu, 10 Dec 2009) New Revision: 2808 Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java Log: Prepare to display better download ui. Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java 2009-12-10 09:06:10 UTC (rev 2807) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java 2009-12-10 10:07:50 UTC (rev 2808) @@ -388,7 +388,7 @@ log.debug("MD5 Control file have been downloaded : " + md5ControlFile.getAbsolutePath()); } - File resultArchiveFile = downloadResultsArchive(sshSession, control.getId(), md5sum); + File resultArchiveFile = downloadResultsArchive(sshSession, control, md5sum); if (resultArchiveFile != null) { @@ -687,7 +687,7 @@ * @throws SSHException if download fail (can happen if remote file doesn't exist * @throws IOException if download fail (can happen if remote file doesn't exist */ - protected File downloadResultsArchive(Session session, String simulationId, String md5sum) + protected File downloadResultsArchive(Session session, SimulationControl simulationControl, String md5sum) throws SSHException, IOException { File localFile = File.createTempFile("simulation-results", ".zip"); @@ -699,6 +699,7 @@ // build remote file path // FIXME this path should be given by remote IsisFish app + String simulationId = simulationControl.getId(); String remoteFile = getRemoteResultArchivePath(simulationId); try {

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r2807 - isis-fish/trunk
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org Dec. 10, 2009

Dec. 10, 2009

Author: chatellier Date: 2009-12-10 09:06:10 +0000 (Thu, 10 Dec 2009) New Revision: 2807 Modified: isis-fish/trunk/pom.xml Log: Use freemarker 2.3.16 Modified: isis-fish/trunk/pom.xml =================================================================== --- isis-fish/trunk/pom.xml 2009-12-08 09:33:27 UTC (rev 2806) +++ isis-fish/trunk/pom.xml 2009-12-10 09:06:10 UTC (rev 2807) @@ -302,7 +302,7 @@ <dependency> <groupId>org.freemarker</groupId> <artifactId>freemarker</artifactId> - <version>2.3.15</version> + <version>2.3.16</version> </dependency> <dependency>

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r2806 - isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org Dec. 8, 2009

Dec. 8, 2009

Author: chatellier Date: 2009-12-08 09:33:27 +0000 (Tue, 08 Dec 2009) New Revision: 2806 Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java Log: Fix control file been erased by setText property change Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java 2009-12-08 09:33:27 UTC (rev 2806) @@ -407,14 +407,16 @@ resultArchiveFile.delete(); - // clear all simulation input/output files on remote - // server temp directory - clearSimulationFiles(sshSession, control); - // read control from downloaded simulation synchronized (control) { SimulationStorage.readControl(control.getId(), control, "stop"); } + + // clear all simulation input/output files on remote + // server temp directory + // control need to be read before, otherwize, setText + // in clearSimulationFiles will erase file :( + clearSimulationFiles(sshSession, control); } else { if (log.isWarnEnabled()) {

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r2805 - in isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish: . aspect datastore entities equation map simulator simulator/launcher ui/config ui/script ui/script/model ui/sensitivity ui/widget/editor util/ssh
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org Dec. 7, 2009

Dec. 7, 2009

Author: chatellier Date: 2009-12-07 15:46:49 +0000 (Mon, 07 Dec 2009) New Revision: 2805 Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisConfig.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/aspect/RuleAspect.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultStorage.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationStorage.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulatorStorage.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/VersionStorage.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/entities/PopulationSeasonInfoImpl.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/equation/PopulationMeanWeight.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/IsisMapBean.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/MetierMonitor.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/PopulationMonitor.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationService.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/package-info.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigAction.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/script/ScriptAction.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/script/model/ScriptTreeModel.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/EditorHelper.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/EquationContinuousPanelUI.jaxx isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/FactorWizardUI.jaxx isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/editor/ParameterTableCellEditor.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHUtils.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/package-info.java Log: Global javadoc fix (@return warning, etc...) Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisConfig.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisConfig.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisConfig.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -124,8 +124,9 @@ } /** - * le nombre global ex: 3.2.0.0 - * @return + * Le nombre global ex: 3.2.0.0 + * + * @return full version */ static public String getVersion() { String result = version.toString(); @@ -134,7 +135,8 @@ /** * La version de la base ex: 3.2 - * @return + * + * @return database version */ public static Version getDatabaseVersion() { return databaseVersion; @@ -142,7 +144,8 @@ /** * La version de l'api de programmation ex: 3.2.0 - * @return + * + * @return api version */ public static Version getApiVersion() { return apiVersion; @@ -189,7 +192,8 @@ /** * Retourne le repertoire racine de toutes les donnees (script, simulation * region, ...) - * @return + * + * @return database directory */ public File getDatabaseDirectory() { File result = getOptionAsFile(Option.DATABASE_DIRECTORY.key); @@ -268,8 +272,9 @@ } /** - * Retourne l'encoding a utiliser pour les fichiers textes - * @return + * Retourne l'encoding a utiliser pour les fichiers textes. + * + * @return encoding to use */ public String getEncoding() { String result = getOption(Option.ENCODING.key); @@ -277,8 +282,9 @@ } /** - * Retourne le serveur SMTP a utiliser pour l'envoie de mail - * @return + * Retourne le serveur SMTP a utiliser pour l'envoie de mail. + * + * @return smtp server address */ public String getSmtpServer() { String result = getOption(Option.SMTP_SERVER.key); @@ -286,8 +292,9 @@ } /** - * Retourne le nom usuel de l'utilisateur - * @return + * Retourne le nom usuel de l'utilisateur. + * + * @return username */ public String getUserName() { String result = getOption(Option.USER_NAME.key); @@ -295,8 +302,9 @@ } /** - * Retourne l'email de l'utilisateur - * @return + * Retourne l'email de l'utilisateur. + * + * @return user email */ public String getUserMail() { String result = getOption(Option.USER_MAIL.key); Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/aspect/RuleAspect.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/aspect/RuleAspect.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/aspect/RuleAspect.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -103,8 +103,7 @@ * Effectue l'appel reel en calculant le temps pris. * * @param jp join point - * @param state - * @param aspectized class return object + * @param state state * @throws Throwable */ protected Object makeTimedCall(JoinPoint jp, State state) throws Throwable { Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultStorage.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultStorage.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultStorage.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -123,19 +123,20 @@ /** * Retourne le nom de tous les resultats disponibles le nom est constitué - * de la date et du nom du resultat - * @return + * de la date et du nom du resultat. + * + * @return available results */ protected Set<String> getAvailableResult() { if (availableResult == null) { availableResult = new HashSet<String>(); try { - TopiaContext tx = null; - boolean mustClose = false; + TopiaContext tx = null; + boolean mustClose = false; - if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { - tx = SimulationContext.get().getDbResult(); - } + if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { + tx = SimulationContext.get().getDbResult(); + } if (tx == null) { // not in simulation, create transaction @@ -163,15 +164,17 @@ * Verifie si un resultat est disponible pour une date donnée * @param date * @param name - * @return + * @return {@code true} if result is available */ protected boolean isAvailableResult(Date date, String name) { String key = date.getDate() + ":" + name; boolean result = getAvailableResult().contains(key); return result; } + /** - * Ajoute un resultat comme etant disponible pour une date donnée + * Ajoute un resultat comme etant disponible pour une date donnée. + * * @param date * @param name */ @@ -181,9 +184,12 @@ } /** - * Permet de savoir si lorsque l'on ajoutera ce resultat, il sera - * sauvé ou non. - */ + * Permet de savoir si lorsque l'on ajoutera ce resultat, il sera + * sauvé ou non. + * + * @param name result name + * @return {@code true} if result is enabled + */ public boolean isEnabled(String name){ name = name.trim(); if (enabledResult == null) { @@ -267,12 +273,12 @@ protected void doAddResult(Date date, String name, MatrixND mat) throws IsisFishException{ try { - TopiaContext tx = null; - boolean mustClose = false; + TopiaContext tx = null; + boolean mustClose = false; - if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { - tx = SimulationContext.get().getDbResult(); - } + if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { + tx = SimulationContext.get().getDbResult(); + } if (tx == null) { // not in simulation, create transaction tx = simulation.getStorage().beginTransaction(); @@ -290,9 +296,9 @@ protected void doAddResult(Date date, String name, MatrixND mat, TopiaContext tx) throws IsisFishException{ // si la matrice n'a pas de semantique on refuse - for(int i=0; i<mat.getNbDim(); i++){ + for (int i=0; i<mat.getNbDim(); i++) { // la semantique n'est pas bonne des qu'il y a un null dedans - if(mat.getSemantics(i).contains(null)){ + if (mat.getSemantics(i).contains(null)) { throw new SimulationException("Erreur le résultat que vous souhaitez enregistrer n'a pas d'information convenable pour la dimension: " + i + " " + mat.getDimensionName(i) ); } } @@ -316,12 +322,12 @@ public void addActiveRule(Date date, Rule rule) throws IsisFishException { try { - TopiaContext tx = null; - boolean mustClose = false; + TopiaContext tx = null; + boolean mustClose = false; - if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { - tx = SimulationContext.get().getDbResult(); - } + if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { + tx = SimulationContext.get().getDbResult(); + } if (tx == null) { // not in simulation, create transaction tx = simulation.getStorage().beginTransaction(); @@ -343,21 +349,20 @@ } /** - * Retourne la liste de tous les résultats. Si le résultat est categorisé - * par une population alors le nom de la population est automatiquement - * ajouté au nom du résultat - */ - @SuppressWarnings("unchecked") - public List<String> getResultName(){ + * Retourne la liste de tous les résultats. Si le résultat est categorisé + * par une population alors le nom de la population est automatiquement + * ajouté au nom du résultat. + */ + public List<String> getResultName() { List<String> result = null; try { - TopiaContext tx = null; - boolean mustClose = false; + TopiaContext tx = null; + boolean mustClose = false; - if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { - tx = SimulationContext.get().getDbResult(); - } + if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { + tx = SimulationContext.get().getDbResult(); + } if (tx == null) { // not in simulation, create transaction tx = simulation.getStorage().beginTransaction(); @@ -381,14 +386,15 @@ } return result; } + /** - * Retourne la matrice stocke pour un pas de temps - * @param date le pas de temps que l'on souhaite - * @param pop la population pour lequelle on souhaite le resultat - * @param name le nom des resultats dont on veut la matrice - * @return La matrice demandée ou null si aucune matrice ne correspond a - * la demande. - */ + * Retourne la matrice stocke pour un pas de temps + * @param date le pas de temps que l'on souhaite + * @param pop la population pour lequelle on souhaite le resultat + * @param name le nom des resultats dont on veut la matrice + * @return La matrice demandée ou null si aucune matrice ne correspond a + * la demande. + */ public MatrixND getMatrix(Date date, Population pop, String name) { String newName = name + " " + pop; return getMatrix(date, newName); @@ -398,12 +404,12 @@ MatrixND mat = getInCache(date, name); if (mat == null && isAvailableResult(date, name)) { try { - TopiaContext tx = null; - boolean mustClose = false; + TopiaContext tx = null; + boolean mustClose = false; - if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { - tx = SimulationContext.get().getDbResult(); - } + if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { + tx = SimulationContext.get().getDbResult(); + } if (tx == null) { // not in simulation, create transaction tx = simulation.getStorage().beginTransaction(); @@ -428,14 +434,15 @@ } /** - * Retourne la matrice stocke pour un pas de temps - * @param date le pas de temps que l'on souhaite - * @param name le nom des resultats dont on veut la matrice - * @param tx TopiaContext a utiliser pour recuperer les resultats et donc les semantiques - * @return La matrice demandée ou null si aucune matrice ne correspond a - * la demande. - */ - public MatrixND getMatrix(Date date, String name, TopiaContext tx){ + * Retourne la matrice stocke pour un pas de temps. + * + * @param date le pas de temps que l'on souhaite + * @param name le nom des resultats dont on veut la matrice + * @param tx TopiaContext a utiliser pour recuperer les resultats et donc les semantiques + * @return La matrice demandée ou {@code null} si aucune matrice ne correspond a + * la demande. + */ + public MatrixND getMatrix(Date date, String name, TopiaContext tx) { MatrixND mat = getInCache(date, name); if (mat == null && isAvailableResult(date, name)) { try { @@ -459,7 +466,7 @@ * @param pop la population pour lequel on souhaite la matrice * @param name le nom des resultats dont on veut une matrice globale. */ - public MatrixND getMatrix(Population pop, String name){ + public MatrixND getMatrix(Population pop, String name) { String newName = name + " " + pop; return getMatrix(newName); } @@ -468,15 +475,15 @@ * Retourne une matrice contenant tous les pas de temps. * @param name le nom des resultats dont on veut une matrice globale. */ - public MatrixND getMatrix(String name){ + public MatrixND getMatrix(String name) { MatrixND resultMat = null; try { - TopiaContext tx = null; - boolean mustClose = false; + TopiaContext tx = null; + boolean mustClose = false; - if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { - tx = SimulationContext.get().getDbResult(); - } + if (simulation == SimulationContext.get().getSimulationStorage()) { + tx = SimulationContext.get().getDbResult(); + } if (tx == null) { // not in simulation, create transaction tx = simulation.getStorage().beginTransaction(); @@ -500,12 +507,11 @@ } /** - * Retourne une matrice contenant tous les pas de temps. - * @param name le nom des resultats dont on veut une matrice globale. - * @param tx TopiaContext a utiliser pour recuperer les resultats et donc les semantiques - */ - @SuppressWarnings("unchecked") - public MatrixND getMatrix(String name, TopiaContext tx){ + * Retourne une matrice contenant tous les pas de temps. + * @param name le nom des resultats dont on veut une matrice globale. + * @param tx TopiaContext a utiliser pour recuperer les resultats et donc les semantiques + */ + public MatrixND getMatrix(String name, TopiaContext tx) { log.debug("Get result: " + name); MatrixND resultMat = getInCache(name); @@ -525,7 +531,7 @@ } // s'il n'y pas de resultat, on retourne null - if(results == null || results.size() == 0){ + if (results == null || results.size() == 0) { return null; } @@ -536,12 +542,12 @@ List<Date> dates = new ArrayList<Date>(); Date date = new Date(0); dates.add(date); - while(date.before(lastDate)){ + while (date.before(lastDate)) { date = date.next(); dates.add(date); } - if(log.isTraceEnabled()) { + if (log.isTraceEnabled()) { log.trace("List des dates: "+ dates); } @@ -551,7 +557,7 @@ // recuperation des noms des dimensions String [] dimNames = new String[1 + mat.getNbDim()]; dimNames[0] = _("isisfish.common.date"); - for(int i=1; i<dimNames.length; i++){ + for (int i=1; i<dimNames.length; i++) { dimNames[i] = mat.getDimensionName(i-1); } @@ -560,30 +566,28 @@ List [] sem = new List[1 + mat.getNbDim()]; sem[0] = dates; - for(int i=1; i<sem.length; i++){ + for (int i=1; i<sem.length; i++) { sem[i] = new HashList(); } - for(Result result: results){ + for (Result result: results) { MatrixND mattmp = result.getMatrix(); - if(log.isTraceEnabled()) { + if (log.isTraceEnabled()) { log.trace("Ajout de la semantics: "+ Arrays.asList(mattmp.getSemantics())); } - - for(int s=0; s<mattmp.getNbDim(); s++){ + for (int s=0; s<mattmp.getNbDim(); s++) { sem[s+1].addAll(mattmp.getSemantics(s)); } } - if(log.isTraceEnabled()) { + if (log.isTraceEnabled()) { log.trace("La semantique final est: "+ Arrays.asList(sem)); } // creation de la matrice resultat resultMat = MatrixFactory.getInstance().create(name, sem, dimNames); - // recuperation du resultat pour chaque date de la simulation, de Date(0) à lastDate for(Result result: results){ Date d = result.getResultDate(); @@ -608,7 +612,9 @@ } /** - * @return + * Get last simulation date. + * + * @return last simulation date */ public Date getLastDate() { int monthNumber = simulation.getParameter().getNumberOfYear() * Month.NUMBER_OF_MONTH; @@ -616,9 +622,10 @@ return result; } - /* (non-Javadoc) + /* * @see fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationResultListener#addResult(fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext, fr.ifremer.isisfish.types.Date, java.lang.String, org.nuiton.math.matrix.MatrixND) */ + @Override public void addResult(SimulationContext context, Date date, String name, MatrixND mat) throws IsisFishException { try { doAddResult(date, name, mat, context.getDbResult()); @@ -627,9 +634,10 @@ } } - /* (non-Javadoc) + /* * @see fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationResultGetter#getMatrix(fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext, fr.ifremer.isisfish.types.Date, java.lang.String) */ + @Override public MatrixND getMatrix(SimulationContext context, Date date, String name) { MatrixND result = null; try { @@ -642,9 +650,10 @@ return result; } - /* (non-Javadoc) + /* * @see fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationResultGetter#getMatrix(fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext, java.lang.String) */ + @Override public MatrixND getMatrix(SimulationContext context, String name) { MatrixND result = null; try { @@ -657,15 +666,17 @@ return result; } - /* (non-Javadoc) + /* * @see fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationListener#afterSimulation(fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext) */ + @Override public void afterSimulation(SimulationContext context) { } - /* (non-Javadoc) + /* * @see fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationListener#beforeSimulation(fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext) */ + @Override public void beforeSimulation(SimulationContext context) { } Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationStorage.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationStorage.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationStorage.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -146,10 +146,11 @@ } /** - * Retourne le repertoire de stockage des exports de resulatat d'une + * Retourne le repertoire de stockage des exports de resultat d'une * simulation. + * * @param root le repertoire de stockage de la simulation - * @return + * @return result export directory */ public static File getResultExportDirectory(File root) { File result = new File(root, RESULT_EXPORT_DIRECTORY); @@ -160,9 +161,10 @@ } /** - * Retourne le fichier de stockage des parametres de la simulation + * Retourne le fichier de stockage des parametres de la simulation. + * * @param root le repertoire de stockage de la simulation - * @return + * @return parameter file */ public static File getSimulationParametersFile(File root) { File result = new File(root, PARAMETERS_FILENAME); @@ -170,9 +172,10 @@ } /** - * Retourne le fichier de stockage des inforations de la simulation + * Retourne le fichier de stockage des inforations de la simulation. + * * @param root le repertoire de stockage de la simulation - * @return + * @return information file */ public static File getSimulationInformationFile(File root) { File result = new File(root, INFORMATION_FILENAME); @@ -184,7 +187,7 @@ * de la simulation. * * @param root le repertoire de stockage de la simulation - * @return + * @return mexico xml file */ public static File getSimulationResultXmlFile(File root) { File result = new File(root, RESULT_XML_FILENAME); @@ -194,7 +197,7 @@ /** * Retourne le fichier de stockage des parametres de la simulation courante. * - * @return + * @return parameter file */ protected File getSimulationParametersFile() { File result = getSimulationParametersFile(getDirectory()); @@ -215,8 +218,9 @@ /** * Retourne le fichier de stockage du fichier de control de la simulation. * Ce fichier conserve l'etat de la simulation, cela permet a un processus - * externe de connaitre l'etat d'une simulation distante - * @return + * externe de connaitre l'etat d'une simulation distante. + * + * @return simulation control file */ protected File getSimulationControlFile() { if (simulationControlFile == null) { @@ -228,8 +232,9 @@ /** * Retourne le fichier de stockage du fichier de control de la simulation. * Ce fichier conserve l'etat de la simulation, cela permet a un processus - * externe de connaitre l'etat d'une simulation distante - * @return + * externe de connaitre l'etat d'une simulation distante. + * + * @return simulation control file */ protected static File getSimulationControlFile(String id) { File result = new File(getSimulationDirectory(id), CONTROL_FILENAME); @@ -256,7 +261,7 @@ } /** - * Reli le fichier contenant les infos de SimulationControl, en excluant + * Relit le fichier contenant les infos de SimulationControl, en excluant * certain champs. * * @param id l'identifiant de la simulation a lire @@ -424,8 +429,9 @@ } /** - * Retourne le nom du fichier contenant les informations de simulation - * @return + * Retourne le nom du fichier contenant les informations de simulation. + * + * @return information file */ protected File getInformationFile() { File result = new File(getDirectory(), INFORMATION_FILENAME); @@ -433,7 +439,9 @@ } /** - * @return Returns the information. + * Get simulation informations. + * + * @return simulation information */ public SimulationInformation getInformation() { if (information == null) { @@ -443,7 +451,9 @@ } /** - * @return le ResultStorage a utiliser pour cette simulation + * Get simulation {@link ResultStorage}. + * + * @return le {@link ResultStorage} a utiliser pour cette simulation */ public ResultStorage getResultStorage() { if (resultStorage == null) { @@ -453,7 +463,8 @@ } /** - * Indique si la simulation demandée existe ou non + * Indique si la simulation demandée existe ou non. + * * @param name le nom de la simulation à tester * @return true si la simulation existe déjà */ @@ -465,7 +476,8 @@ } /** - * Indique si la simulation demandée existe ou non + * Indique si la simulation demandée existe ou non. + * * @param name le nom de la simulation à tester * @return true si la simulation existe déjà */ @@ -475,6 +487,7 @@ /** * Retourne la simulation demandée. + * * @param name name of the required simulation * @return la simulation souhaitée ou null si la simulation n'existe pas */ @@ -530,7 +543,8 @@ } /** - * Retourne la liste des noms de toutes les régions disponible en local + * Retourne la liste des noms de toutes les régions disponible en local. + * * @return la liste des noms de toutes les régions disponible en local */ public static List<String> getSimulationNames() { @@ -540,7 +554,8 @@ /** * Retourne la liste des noms de toutes les régions disponible en local qui - * ne sont pas encore sur le serveur CVS + * ne sont pas encore sur le serveur VCS. + * * @return liste de noms de simulations */ public static List<String> getNewSimulationNames() { @@ -551,9 +566,10 @@ /** * Retourne la liste des noms de toutes les régions disponible sur le - * serveur CVS + * serveur VCS. + * * @return la liste des noms de toutes les régions disponible sur le - * serveur CVS. Si le serveur n'est pas disponible la liste retournée + * serveur VCS. Si le serveur n'est pas disponible la liste retournée * est vide. */ public static List<String> getRemoteSimulationNames() { @@ -563,7 +579,8 @@ /** * Retourne la liste des noms de toutes les régions disponible sur le - * serveur CVS qui ne sont pas encore en local + * serveur VCS qui ne sont pas encore en local. + * * @return liste de noms de simulations */ public static List<String> getNewRemoteSimulationNames() { @@ -573,9 +590,10 @@ } /** - * Retourne la {@link FisheryRegion} associee a cette simulation - * @param context - * @return + * Retourne la {@link FisheryRegion} associee a cette simulation. + * + * @param context context + * @return simulation's {@link FisheryRegion} * @throws StorageException */ public static FisheryRegion getFisheryRegion(TopiaContext context) @@ -810,23 +828,6 @@ } /* - * @see fr.ifremer.isisfish.datastore.DataStorage#prepare() - * - @Override - protected void prepare() { - super.prepare(); - - // force parameter save - // because they can have unsaved modification - if (log.isDebugEnabled()) { - log.debug("Save simulation parameters"); - } - setParameter(parameter); - - this methods sometime force save of empty parameters - }*/ - - /* * @see fr.ifremer.isisfish.datastore.DataStorage#createZip(java.io.File) */ @Override Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulatorStorage.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulatorStorage.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulatorStorage.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -47,9 +47,12 @@ /** Template freemarker pour les scripts. */ public static final String SIMULATOR_TEMPLATE = "templates/script/simulator.ftl"; - + + /** Simulators cache. */ + static private Map<String, SimulatorStorage> simulatorsCache = (Map<String, SimulatorStorage>) new ReferenceMap(); + /** - * Constructeur + * Constructeur. * * @param rootSrc */ @@ -68,7 +71,7 @@ /** * Retourne une nouvelle instance de la regle. Compile le fichier si besoin * - * @return + * @return new rule instance * @throws IsisFishException */ public Simulator getNewSimulatorInstance() throws IsisFishException { @@ -145,8 +148,4 @@ result.removeAll(getSimulatorNames()); return result; } - - @SuppressWarnings("unchecked") - static private Map<String, SimulatorStorage> simulatorsCache = (Map<String, SimulatorStorage>) new ReferenceMap(); - } Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/VersionStorage.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/VersionStorage.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/VersionStorage.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -345,7 +345,7 @@ /** * Fire a change event to all registred listeners. * - * For example, to notify, that a {@link JavaStorage} file has been added... + * For example, to notify, that a {@link JavaSourceStorage} file has been added... * * @param event event to fire */ Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/entities/PopulationSeasonInfoImpl.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/entities/PopulationSeasonInfoImpl.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/entities/PopulationSeasonInfoImpl.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -224,7 +224,7 @@ /** * Create not initialized no spacialized change group matrix. * - * @return + * @return not initialized no spacialized change group matrix */ public MatrixND createNoSpacializedChangeGroupMatrix() { Population pop = getPopulation(); @@ -263,7 +263,7 @@ /** * Create not initialized spacialized change group matrix. * - * @return + * @return not initialized spacialized change group matrix */ protected MatrixND createSpacializedChangeGroupMatrix() { Population pop = getPopulation(); Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/equation/PopulationMeanWeight.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/equation/PopulationMeanWeight.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/equation/PopulationMeanWeight.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -17,37 +17,32 @@ * Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA 02111-1307, USA. *##%*/ -/* * - * PopulationMeanWeight.java - * - * Created: 23 août 2006 11:14:46 - * - * @author poussin - * @version $Revision$ - * - * Last update: $Date$ - * by : $Author$ - */ - package fr.ifremer.isisfish.equation; import fr.ifremer.isisfish.entities.PopulationGroup; import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext; import fr.ifremer.isisfish.util.Args; - /** + * PopulationMeanWeight equation. + * + * Created: 23 août 2006 11:14:46 + * * @author poussin + * @version $Revision$ * + * Last update: $Date$ + * by : $Author$ */ - public interface PopulationMeanWeight { /** + * Compute population mean weight. * - * @param context + * @param context simulation context * @param group le groupe dont on souhaite le poids moyen - * @return + * @return population mean weight + * @throws Exception */ @Args({"context", "group"}) public double compute(SimulationContext context, PopulationGroup group) throws Exception; Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/IsisMapBean.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/IsisMapBean.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/IsisMapBean.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -502,7 +502,7 @@ * @param fillColor fill color * * @return vpf layer - * @see vpfLayer + * @see VPFLayer */ protected Layer getVPFLayer(String layerId, String mapFile, String lineColor, String fillColor) { Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/MetierMonitor.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/MetierMonitor.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/MetierMonitor.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -116,11 +116,11 @@ /** * Metier is forbidden is can be found in {@link #forbiddenMetier} or in - * {@link #forbiddenMetierMonth} + * {@link #forbiddenMetierMonth}. * * @param metier * @param month - * @return + * @return {@code true} if metier forbidden */ public boolean isForbidden(Metier metier, Month month) { boolean result = forbiddenMetier.contains(metier); @@ -223,7 +223,7 @@ * @param metier * @param firstMonth * @param lastMonth - * @return + * @return limited period */ public boolean isLimitedPeriode(Metier metier, Month firstMonth, Month lastMonth) { for(Month i = firstMonth; i.compareTo(lastMonth) <= 0; i = i.next()) { @@ -254,7 +254,7 @@ /** * @param metier * @param i - * @return + * @return proportion month */ private double computeProportionMonth(Metier metier, Month month) { double prop = 0; @@ -280,7 +280,7 @@ /** * @param metier * @param nbLicences - * @return + * @return proportion max total */ private double computeProportionMaxTotal(Metier metier, int nbLicences) { int nbBoat = 0; Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/PopulationMonitor.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/PopulationMonitor.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/PopulationMonitor.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -104,9 +104,10 @@ } /** - * Return current biomass for species - * @param species - * @return + * Return current biomass for species. + * + * @param species species + * @return species biomass */ public double getBiomass(Species species) { double result = 0; @@ -119,9 +120,10 @@ } /** - * Return current biomass for population - * @param pop - * @return + * Return current biomass for population. + * + * @param pop population + * @return population biomass */ public double getBiomass(Population pop) { double result = 0; @@ -140,9 +142,10 @@ } /** - * Return current numbers for population - * @param pop - * @return + * Return current numbers for population. + * + * @param pop population + * @return population numbers */ public MatrixND getN(Population pop) { MatrixND result = Ns.get(pop); @@ -162,7 +165,9 @@ } /** - * @return Returns the reproduction. + * Return reproduction. + * + * @return the reproduction. */ public MatrixND getReproduction(Date date, Population pop) { return this.reproductions.get(pop).get(date); @@ -203,14 +208,15 @@ } /** - * @todo les reproductions qui sont trop veille pour encore servir + * + * TODO les reproductions qui sont trop veille pour encore servir * doivent être supprimées. c-a-d date < currentDate - etalement - gap between repro recru * Une autre facon de faire est de supprimer les repro == 0 car normalement * toute la repro doit etre utilisé au bout d'un certain temps * * @param date * @param pop - * @return + * @return population recruitment */ public MatrixND getRecruitment(Date date, Population pop) { MatrixND matEtalement = pop.getRecruitmentDistribution(); @@ -306,6 +312,7 @@ } /** + * @param pop population * @param catchPerStrategyMet */ public void holdCatch(Population pop, MatrixND catchPerStrategyMet) { @@ -327,8 +334,10 @@ } /** - * @param pop - * @return + * Get population catch. + * + * @param pop population + * @return population catch */ public MatrixND getCatch(Population pop) { MatrixND result = catchs.get(pop); @@ -336,8 +345,10 @@ } /** - * @param pop - * @return + * Get population hold catch. + * + * @param pop population + * @return population hold catch */ public MatrixND getHoldCatch(Population pop) { MatrixND result = holdCatchs.get(pop); @@ -345,8 +356,10 @@ } /** - * @param pop - * @return + * Population total hold catch. + * + * @param pop population + * @return population total hold catch */ public double getTotalHoldCatch(Population pop) { double result = totalHoldCatch; @@ -354,7 +367,7 @@ } /** - * raz capture cumulée de toutes les pops + * RAZ capture cumulée de toutes les pops. */ public void clearCatch() { catchs.clear(); @@ -392,7 +405,7 @@ discards.get(pop).put(date, tmp); } } - + /** * FIXME: discards n'est jamais vider, on le conserve pour toutes les annees * il serait bon de faire un peu le menage de temps en temps. @@ -413,6 +426,4 @@ } } } - - } Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -1109,7 +1109,7 @@ /** * Get remote directory absolute path. * - * Don't use {@link File.separator} here, caparmor is always unix. + * Don't use {@link java.io.File.separator} here, caparmor is always unix. * * @return remote temp directory path */ Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationService.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationService.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationService.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -232,8 +232,9 @@ } /** - * Retourne la liste de tous les {@link SimulatorLauncher} disponible - * @return + * Retourne la liste de tous les {@link SimulatorLauncher} disponible. + * + * @return {@link SimulatorLauncher}s */ protected Set<SimulatorLauncher> getSimulatorLaunchers() { return executors.keySet(); Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/package-info.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/package-info.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/package-info.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -37,9 +37,9 @@ * * <h2>Principe general</h2> * <p> - * Les simulations sont soumises au {@link SimulationService} via sa methode - * submit. Un objet {@link SimulationJob} est alors cree et ajoute a la liste - * des simulations presentes ({@link SimulationService#getJobs}). Si la + * Les simulations sont soumises au {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService} via sa methode + * submit. Un objet {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationJob} est alors cree et ajoute a la liste + * des simulations presentes ({@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService#getJobs()}). Si la * simulation est une simple simulation ou une simulation avec plan d'analyse * dependant, elle est alors directement ajoutee a la queue de simulation * (simulation a faire). Si @@ -52,8 +52,9 @@ * * <p> * Lorsqu'un thread recupere un job dans la queue, il leve un event {@link - * SimulationListener#start}, la simulation est alors ajoutee a la liste des - * simulations visibles si elle ne l'etait pas encore. + * fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationServiceListener#simulationStart(SimulationService, SimulationJob)}, + * la simulation est alors ajoutee a la liste des simulations visibles si elle + * ne l'etait pas encore. * </p> * * <p> @@ -62,60 +63,65 @@ * </p> * * <p> - * Le {@link SimulationService#autoLaunch} permet d'indique si le service est + * Le {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService#autoLaunch} permet d'indique si le service est * actif ou non. S'il n'est pas actif, il accepte les simulations mais ne les * execute pas (elles sont en attente). S'il est actif alors les differents - * {@link SimulationExecutor}) prenent les jobs de la queue pour faire les + * {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationExecutor}) prenent les jobs de la queue pour faire les * simulations. * </p> * * <h2>SimulationExecutor</h2> * <p> - * Lors de sa creation le {@link SimulationService} a initialise different - * {@link SimulationExecutor} en fonction de la configuration. Ces {@link - * SimulationExecutor} sont responsable de l'execution des simulations de la - * queue. Chaque {@link SimulationExecutor} a un {@link SimulatorLauncher} - * qu'il utilise si la simulation n'a pas encore de {@link SimulatorLauncher} + * Lors de sa creation le {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService} a initialise different + * {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationExecutor} en fonction de la configuration. Ces {@link + * fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationExecutor} sont responsable de l'execution des simulations de la + * queue. Chaque {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationExecutor} a un + * {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulatorLauncher} qu'il utilise + * si la simulation n'a pas encore de {@link SimulatorLauncher} * d'assigne. * </p> * <p> - * Un {@link SimulationExecutor} peut etre mis en pause puis relance. Lorsqu'il - * est en pause, il termine les simulations en cours mais n'en reprend pas de - * nouvelle. Cela permet d'arrete un {@link SimulationExecutor} particulier + * Un {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationExecutor} peut etre + * mis en pause puis relance. Lorsqu'il est en pause, il termine les simulations + * en cours mais n'en reprend pas de nouvelle. Cela permet d'arrete un + * {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationExecutor} particulier * sans devoir arreter tout le service de simulation. * </p> - * <p>Si un {@link SimulationExecutor} prend un job ayant deja un {@link - * SimulatorLauncher} d'assigne, il utilise alors ce launcher plutot que le - * sien. Ce choix est derangeant lorsque l'on souhaite utilise un nombre de - * thread limite pour un launcher particulier, mais il est le plus raisonnable - * car l'autre possibilite est que le job soit resoumis au {@link - * SimulationService} jusqu'a ce que le bon {@link SimulationExecutor} le + * <p>Si un {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationExecutor} + * prend un job ayant deja un {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulatorLauncher} + * d'assigne, il utilise alors ce launcher plutot que le sien. Ce choix est derangeant + * lorsque l'on souhaite utilise un nombre de thread limite pour un launcher particulier, + * mais il est le plus raisonnable car l'autre possibilite est que le job soit + * resoumis au {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService} + * jusqu'a ce que le bon {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationExecutor} le * prenne pour l'executer. On risque dans ce cas d'arriver a une forte - * consommation CPU si le seul {@link SimulationExecutor} disponible ne gere - * pas les jobs en queue. + * consommation CPU si le seul {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationExecutor} + * disponible ne gere pas les jobs en queue. * </p> * * <h2>SimulationJob</h2> * * <p> * Le simulation Job encapsule l'appel pour que les implantantations des {@link - * SimulatorLauncher} soit la plus simple possible. Il gere les simulations - * avec plan dependant, les exports depandes par l'utilisateur, ainsi que - * l'effacement des simulations si seul les exports interessait l'utilisateur. + * fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulatorLauncher} soit la plus simple + * possible. Il gere les simulations avec plan dependant, les exports depandes + * par l'utilisateur, ainsi que l'effacement des simulations si seul les exports + * interessait l'utilisateur. * </p> * * <p> - * Si le job n'arrive pas a utilise le {@link SimulatorLauncher} il en notifie - * le {@link SimulationService} qui resoumet le job dans la queue pour qu'un - * autre {@link SimulationExecutor} prenne ce job. Si trop d'erreurs sont - * notifiees pour un meme {@link SimulatorLauncher}, le {@link - * SimulatorService} prend alors la decision d'arreter l'executor associe. + * Si le job n'arrive pas a utilise le {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulatorLauncher} + * il en notifie le {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService} + * qui resoumet le job dans la queue pour qu'un autre {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationExecutor} + * prenne ce job. Si trop d'erreurs sont notifiees pour un meme {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulatorLauncher}, + * le {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService} prend alors la decision d'arreter l'executor associe. * </p> * <p> * Pour les simulations ou l'utilisateur avait fixe un {@link - * SimulatorLauncher} particulier en cas de notification d'erreur au {@link - * SimulationService} ce {@link SimulatorLauncher} n'est plus pris en compte et - * n'importe quel {@link SimulatorLauncher} peut faire cette simulation. + * fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulatorLauncher} particulier en cas + * de notification d'erreur au {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService} + * ce {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulatorLauncher} n'est plus pris en compte et + * n'importe quel {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulatorLauncher} peut faire cette simulation. * </p> */ package fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher; Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigAction.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigAction.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigAction.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -375,7 +375,7 @@ /** * Clear specified directory. * - * @param session opened session + * @param path path to clear */ protected void clearFolder(String path) { Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/script/ScriptAction.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/script/ScriptAction.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/script/ScriptAction.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -508,9 +508,7 @@ } /** - * Save script, and disply commit UI. - * - * @return + * Save script, and display commit UI. */ public void commitScript() { Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/script/model/ScriptTreeModel.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/script/model/ScriptTreeModel.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/script/model/ScriptTreeModel.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -183,7 +183,7 @@ /** * Filter input file array and return only sorted collection with only directories. * - * @param files file array + * @param filesArray file array * @return sorted list */ protected List<File> getVersionnableSortedFiles(File[] filesArray) { Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/EditorHelper.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/EditorHelper.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/EditorHelper.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -292,7 +292,7 @@ * * @param component component * @param entity entity - * @return + * @return bound editor */ protected static JTextField getNewBoundEditor(JComponent component, TopiaEntity entity) { String fieldName = getMethod(component); @@ -379,6 +379,10 @@ public static JComponent getEditorWithValue(JComponent component, Object value) { JComponent result = null; + if (log.isDebugEnabled()) { + log.debug("Get editor for " + component + " with value = " + value); + } + try { result = component.getClass().newInstance(); @@ -688,7 +692,7 @@ * * @param entity * @param fieldName - * @return + * @return method return value */ protected static Object getMethodValue(TopiaEntity entity, String fieldName) { Object result = null; Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/EquationContinuousPanelUI.jaxx =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/EquationContinuousPanelUI.jaxx 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/EquationContinuousPanelUI.jaxx 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -220,7 +220,7 @@ } }); } -protected void add(){ +protected void add() { EquationContinuousDomain domain = new EquationContinuousDomain(); // fixe NPE in table model renderer domain.setCoefficient(1.0); @@ -228,7 +228,7 @@ newButton(); setTable(); } -protected void remove(){ +protected void remove() { int i = params.getSelectedRow(); if (i != -1){ datas.remove(i); Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/FactorWizardUI.jaxx =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/FactorWizardUI.jaxx 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/FactorWizardUI.jaxx 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -26,7 +26,7 @@ <Boolean id='existingValue' javaBean='false'/> - <script><![CDATA[ + <script><![CDATA[ import org.apache.commons.lang.StringUtils; import org.nuiton.topia.persistence.TopiaEntity; import fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.SimulAction; @@ -228,7 +228,7 @@ </cell> </row> <row> - <cell fill='both' columns='4' weightx='1' weighty='0.5'> + <cell columns='4' fill='both' weightx='1' weighty='0.5'> <JPanel id='continuousPanelContainer' layout='{new BorderLayout()}'/> </cell> </row> Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/editor/ParameterTableCellEditor.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/editor/ParameterTableCellEditor.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/editor/ParameterTableCellEditor.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -224,12 +224,12 @@ /** * Get type for value. * - * Must be overriden (value can be null). + * Must be overridden (value can be null). * * @param value * @param row * @param column - * @return + * @return type for value */ protected Class<?> getType(Object value, int row, int column) { // default to value's class Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHUtils.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHUtils.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHUtils.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -508,8 +508,9 @@ * Open sftp channel. * * @param session - * @return + * @return sftp channel * @throws JSchException + * @see ChannelSftp */ protected static ChannelSftp openSftpChannel(Session session) throws JSchException { ChannelSftp channel = (ChannelSftp) session.openChannel("sftp"); Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/package-info.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/package-info.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/package-info.java 2009-12-07 15:46:49 UTC (rev 2805) @@ -1,5 +1,5 @@ /** - * Utility classes for {@link SSHSimulatorLauncher}. + * Utility classes for {@link fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SSHSimulatorLauncher}. * * Contains : * - SSH utility code

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r2804 - in isis-fish/trunk/src/main: java/fr/ifremer/isisfish/datastore/migration resources/i18n
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org Dec. 7, 2009

Dec. 7, 2009

Author: chatellier Date: 2009-12-07 15:46:13 +0000 (Mon, 07 Dec 2009) New Revision: 2804 Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/migration/SwingMigrationCallbackHandler.java isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-en_GB.properties isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-fr_FR.properties Log: Add translation for database migration Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/migration/SwingMigrationCallbackHandler.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/migration/SwingMigrationCallbackHandler.java 2009-12-07 11:12:57 UTC (rev 2803) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/migration/SwingMigrationCallbackHandler.java 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) @@ -18,6 +18,8 @@ package fr.ifremer.isisfish.datastore.migration; +import static org.nuiton.i18n.I18n._; + import java.sql.Connection; import java.sql.PreparedStatement; import java.sql.SQLException; @@ -53,11 +55,9 @@ String dbVersion, String applicationVersion) { int answer = JOptionPane.showConfirmDialog( - null, "La base de donn\u00E9e est en version : " + dbVersion - + ".\n\nUne migration en version " + applicationVersion - + " est n\u00E9c\u00E9ssaire.\nVoulez vous migrer la base de donn\u00E9es ?", - "Migration de base de donn\u00E9es", - JOptionPane.YES_NO_OPTION, JOptionPane.QUESTION_MESSAGE); + null, _("isisfish.misc.databasemigration.question", dbVersion, applicationVersion), + _("isisfish.misc.databasemigration.title"), + JOptionPane.YES_NO_OPTION, JOptionPane.QUESTION_MESSAGE); MigrationChoice result = (answer == JOptionPane.YES_OPTION) ? MigrationChoice.MIGRATION : MigrationChoice.NO_MIGRATION; @@ -71,10 +71,10 @@ /** * Perform real migration. * - * @param dbManager - * @param dbVersion - * @param applicationVersion - * @return + * @param dbManager database manager + * @param dbVersion database version + * @param applicationVersion application version + * @return {@code MigrationChoice.CUSTOM_MIGRATION} if success, {@code MigrationChoice.NO_MIGRATION} otherwise. */ protected MigrationChoice migrate(DatabaseManager dbManager, String dbVersion, String applicationVersion) { @@ -118,7 +118,10 @@ } protected void migrateTo3_2(Connection conn) throws SQLException { - log.info("Migrate to version 3.2"); + if (log.isInfoEnabled()) { + log.info("Migrate to version 3.2"); + } + //alteration du schema // nouvelles equations dans les tables @@ -137,9 +140,9 @@ } protected void migrateTo3_3(Connection conn) throws SQLException { - log.info("Migrate to version 3.3"); - //alteration du schema - // nouvelles equations dans les tables + if (log.isInfoEnabled()) { + log.info("Migrate to version 3.3"); + } String[] sqls = new String[] { // replace in equation @@ -157,7 +160,6 @@ "update STRATEGYMONTHINFO set proportionMetier_semantics = replace(proportionMetier_semantics, 'org.codelutin.', 'org.nuiton.') where proportionMetier_semantics IS NOT null;", // add .shp default extension "update FISHERYREGION set MAPFILES = regexp_replace(MAPFILES, '(,|$)', '.shp$1') where MAPFILES IS NOT null;" - }; for (String sql : sqls) { log.info("try " + sql); Modified: isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-en_GB.properties =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-en_GB.properties 2009-12-07 11:12:57 UTC (rev 2803) +++ isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-en_GB.properties 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) @@ -641,6 +641,8 @@ isisfish.metierSeasonInfoZone.season=Season isisfish.metierSeasonInfoZone.selectSeason=Select a season isisfish.metierSeasonInfoZone.title=Seasons / Zones +isisfish.misc.databasemigration.question=La base de donn\u00E9e est en version \: %s.\n\nUne migration en version %s est n\u00E9c\u00E9ssaire.\nVoulez vous migrer la base de donn\u00E9es ? +isisfish.misc.databasemigration.title=Database migration isisfish.misc.nuitonmigration=IsisFish has detected some code based on CodeLutin libraries in following user scripts.\nDo you want to migrate those script on new nuiton libraries ? isisfish.monitor.title=Application Monitor isisfish.month.april=april Modified: isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-fr_FR.properties =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-fr_FR.properties 2009-12-07 11:12:57 UTC (rev 2803) +++ isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-fr_FR.properties 2009-12-07 15:46:13 UTC (rev 2804) @@ -641,6 +641,8 @@ isisfish.metierSeasonInfoZone.season=Saison isisfish.metierSeasonInfoZone.selectSeason=S\u00E9lectionnez une saison isisfish.metierSeasonInfoZone.title=Saison / Zones +isisfish.misc.databasemigration.question=La base de donn\u00E9e est en version \: %s.\n\nUne migration en version %s est n\u00E9cessaire.\nVoulez vous migrer la base de donn\u00E9es ? +isisfish.misc.databasemigration.title=Migration de base de donn\u00E9es isisfish.misc.nuitonmigration=IsisFish a d\u00E9tect\u00E9 l'utilisation de librairies CodeLutin dans les scripts suivants.\nVoulez vous migrer ces scripts vers les nouvelles librairies nuiton ? isisfish.monitor.title=Moniteur de l'application isisfish.month.april=avril

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r2803 - in isis-fish/trunk/src/main: java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher java/fr/ifremer/isisfish/ui/config resources/i18n
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org Dec. 7, 2009

Dec. 7, 2009

Author: chatellier Date: 2009-12-07 11:12:57 +0000 (Mon, 07 Dec 2009) New Revision: 2803 Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigAction.java isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigUI.jaxx isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-en_GB.properties isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-fr_FR.properties Log: Suppression des fichiers de simulations apres un t?\195?\169l?\195?\169chargement r?\195?\169ussi des r?\195?\169sultats. Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java 2009-12-07 08:37:23 UTC (rev 2802) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java 2009-12-07 11:12:57 UTC (rev 2803) @@ -74,14 +74,13 @@ * - $ISIS-TMP/simulation-$id-output.txt * - $ISIS-TMP/simulation-$id-pbs.id * - * TODO revome all $ISIS-TMP/simulation-$id* after simulation end ? - * * @see JSch * * @author chatellier * @version $Revision$ * - * Last update : $Date$ By : $Author$ + * Last update : $Date$ + * By : $Author$ */ public class SSHSimulatorLauncher implements SimulatorLauncher { @@ -297,16 +296,22 @@ * * Se connecte au serveur distant et télécharge les résultats de la * simulation. + * + * Simulation must have been downloaded with + * {@link #updateControl(SimulationService, SimulationControl)} before calling + * this method. */ @Override public SimulationStorage getSimulationStorage( SimulationService simulationService, SimulationControl control) throws RemoteException { - // TODO change, now getSimulationStorage() - // is common to all launchers + // make sure that simulation has been downloaded by #updateControl() + // before calling this method + String simulationId = control.getId(); + SimulationStorage simulationStorage = SimulationStorage - .getSimulation(control.getId()); + .getSimulation(simulationId); return simulationStorage; } @@ -316,6 +321,11 @@ * * Se connecte au serveur distant et télécharge le fichier de control. * Injecte ensuite ce fichier dans le {@link SimulationControl}. + * + * Essaye aussi de telecharger le fichier md5 de la simulation, et, s'il + * est present, l'archive de résultat. + * Supprime tous les fichiers de la simulations apres avoir télécharger les + * résultats. */ @Override public void updateControl(SimulationService simulationService, @@ -334,7 +344,7 @@ // CONTROL file try { // download control file - File controlFile = downloadControlFile(sshSession, control.getId(), + File controlFile = downloadSimulationFile(sshSession, control.getId(), SimulationStorage.CONTROL_FILENAME); if (log.isDebugEnabled()) { log.debug("Control have been downloaded : " @@ -357,8 +367,7 @@ // file doesn't exist if (log.isDebugEnabled()) { // not add ,e plz :) - log.debug(_("Remote control file doesn't exists %s", e - .getMessage())); + log.debug(_("Remote control file doesn't exists %s", e.getMessage())); } } @@ -383,10 +392,6 @@ if (resultArchiveFile != null) { - // FIXME too slow methods - //SimulationStorage.importZip(resultZipFile); - //ZipUtil.uncompress(resultArchiveFile, SimulationStorage.getSimulationDirectory()); - // FIXME big hacks here, only extract non first simulation // only for AS if (control.getId().startsWith("as_") && !control.getId().endsWith("_0")) { @@ -400,14 +405,16 @@ log.debug("Simulation imported : " + resultArchiveFile.getAbsolutePath()); } + resultArchiveFile.delete(); + + // clear all simulation input/output files on remote + // server temp directory + clearSimulationFiles(sshSession, control); + // read control from downloaded simulation synchronized (control) { SimulationStorage.readControl(control.getId(), control, "stop"); } - - resultArchiveFile.delete(); - - // TODO remove remote md5 and zip on remote } else { if (log.isWarnEnabled()) { @@ -427,7 +434,7 @@ // INFORMATION file try { - File infoFile = downloadControlFile(sshSession, control.getId(), + File infoFile = downloadSimulationFile(sshSession, control.getId(), SimulationStorage.INFORMATION_FILENAME); if (log.isDebugEnabled()) { log.debug("Information have been downloaded : " @@ -488,23 +495,6 @@ } /** - * Get opened ssh session or try to open a new one. - * - * This method must synchronized. - * - * @return opened ssh session. - * @throws JSchException - */ - protected synchronized Session getSSHSftpSession() throws JSchException { - - if (sshSftpSession == null || !sshSftpSession.isConnected()) { - sshSftpSession = openSSHSession(); - } - - return sshSftpSession; - } - - /** * Connect to remote server throw SSH, and return session. * * @return valid opened session @@ -742,7 +732,7 @@ * @throws IOException * @throws SSHException if remote file doesn't exists */ - protected File downloadControlFile(Session sshSession, String simulationId, String fileName) + protected File downloadSimulationFile(Session sshSession, String simulationId, String fileName) throws IOException, SSHException { File localFile = null; @@ -800,6 +790,32 @@ } /** + * Remove all {@code $ISIS-TMP/simulation-$id-*} files on caparmor. + * + * @param session valid opened ssh session + * @param control simulation control + */ + protected void clearSimulationFiles(Session session, + SimulationControl control) throws IOException, SSHException { + + control.setText(_("isisfish.simulation.remote.message.deletingfiles")); + + // execute rm -f "isis-tmp/simulation-$id-"* + // on remote. Note * outside quotes !!! + String simulationId = control.getId(); + String command = "rm -f \"" + getRemoteTempDirectory() + "simulation-" + simulationId + "-\"*"; + + if (log.isDebugEnabled()) { + log.debug("Deleting simulation files with command : " + command); + } + + SSHUtils.exec(session, command); + + // can return other things than 0 + // but not a big deal + } + + /** * Upload script on remote server. * * @param session valid opened ssh session @@ -1093,7 +1109,7 @@ /** * Get remote directory absolute path. * - * Don't use File.separator here, caparmor is always unix. + * Don't use {@link File.separator} here, caparmor is always unix. * * @return remote temp directory path */ Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigAction.java =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigAction.java 2009-12-07 08:37:23 UTC (rev 2802) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigAction.java 2009-12-07 11:12:57 UTC (rev 2803) @@ -63,7 +63,7 @@ protected SSHLauncherConfigUI configUI; protected String currentSSHserver; - protected String currentSSHsftpServer; + //protected String currentSSHsftpServer; protected String currentSSHUsername; protected File currentSSHKey; protected String currentSSHUserhome; @@ -89,7 +89,7 @@ public void resetSSHConfiguration() { // server config configUI.getSshServerField().setText(IsisFish.config.getSimulatorSshServer()); - configUI.getSshSftpServerField().setText(IsisFish.config.getSimulatorSshSftpServer()); + //configUI.getSshSftpServerField().setText(IsisFish.config.getSimulatorSshSftpServer()); configUI.getUsernameField().setText(IsisFish.config.getSimulatorSshUsername()); configUI.getSshKeyField().setText(IsisFish.config.getSSHPrivateKeyFilePath().getAbsolutePath()); @@ -133,8 +133,8 @@ } // copy values - currentSSHsftpServer = configUI.getSshSftpServerField().getText() - .trim(); + //currentSSHsftpServer = configUI.getSshSftpServerField().getText().trim(); + // can be empty (optionnal use) currentSSHUsername = configUI.getUsernameField().getText().trim(); if (!currentSSHUsername.matches("\\w+")) { @@ -205,7 +205,7 @@ */ public void saveSSHConfiguration() { IsisFish.config.setSimulatorSshServer(currentSSHserver); - IsisFish.config.setSimulatorSshSftpServer(currentSSHsftpServer); + //IsisFish.config.setSimulatorSshSftpServer(currentSSHsftpServer); IsisFish.config.setSimulatorSshUsername(currentSSHUsername); IsisFish.config.setSSHPrivateKeyFilePath(currentSSHKey); Modified: isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigUI.jaxx =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigUI.jaxx 2009-12-07 08:37:23 UTC (rev 2802) +++ isis-fish/trunk/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/config/SSHLauncherConfigUI.jaxx 2009-12-07 11:12:57 UTC (rev 2803) @@ -40,7 +40,7 @@ onKeyReleased="getAction().doCheck()" /> </cell> </row> - <row> +  <row fill='horizontal'> <cell> <JLabel id='usernameLabel' text='isisfish.config.main.simulation.ssh.username' Modified: isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-en_GB.properties =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-en_GB.properties 2009-12-07 08:37:23 UTC (rev 2802) +++ isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-en_GB.properties 2009-12-07 11:12:57 UTC (rev 2803) @@ -178,7 +178,6 @@ isisfish.config.main.simulation.ssh.pbsbinpath.description=PBS executables (qsub, qdel...) directory isisfish.config.main.simulation.ssh.server=Simulation server isisfish.config.main.simulation.ssh.server.description=Simulation server address -isisfish.config.main.simulation.ssh.sftpserver=Transfer server isisfish.config.main.simulation.ssh.sftpserver.description=Transfer server address (set empty to use scp from simulation server) isisfish.config.main.simulation.ssh.tmppath=Server temp directory isisfish.config.main.simulation.ssh.tmppath.description=Server temp directory @@ -920,6 +919,7 @@ isisfish.simulation.menu.simulation=Simulation isisfish.simulation.name=Simulation name isisfish.simulation.remote.message.connection=Connecting to Caparmor +isisfish.simulation.remote.message.deletingfiles=Deleting simulation files isisfish.simulation.remote.message.downloadresults=Downloading results isisfish.simulation.remote.message.upload=Uploading simulation isisfish.simulation.remote.message.waitingstart=Waiting for simulation start Modified: isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-fr_FR.properties =================================================================== --- isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-fr_FR.properties 2009-12-07 08:37:23 UTC (rev 2802) +++ isis-fish/trunk/src/main/resources/i18n/isis-fish-fr_FR.properties 2009-12-07 11:12:57 UTC (rev 2803) @@ -178,7 +178,6 @@ isisfish.config.main.simulation.ssh.pbsbinpath.description=Emplacement des commandes PBS (qsub, qdel...) sur le serveur isisfish.config.main.simulation.ssh.server=Serveur de simulation isisfish.config.main.simulation.ssh.server.description=Adresse du serveur de simulation -isisfish.config.main.simulation.ssh.sftpserver=Serveur de fichier isisfish.config.main.simulation.ssh.sftpserver.description=Adresse du serveur de transfert de fichier (laisser vide pour utiliser directement scp sur le serveur de simulation) isisfish.config.main.simulation.ssh.tmppath=Dossier temporaire isisfish.config.main.simulation.ssh.tmppath.description=Emplacement du dossier temporaire @@ -920,6 +919,7 @@ isisfish.simulation.menu.simulation=Simulation isisfish.simulation.name=Nom de la simulation isisfish.simulation.remote.message.connection=Connexion \u00E0 Caparmor +isisfish.simulation.remote.message.deletingfiles=Suppression des fichiers de simulation isisfish.simulation.remote.message.downloadresults=T\u00E9l\u00E9chargement des r\u00E9sultats isisfish.simulation.remote.message.upload=Upload de la simulation isisfish.simulation.remote.message.waitingstart=Attente du d\u00E9marrage de la simulation

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r2802 - isis-fish/trunk
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org Dec. 7, 2009

Dec. 7, 2009

Author: chatellier Date: 2009-12-07 08:37:23 +0000 (Mon, 07 Dec 2009) New Revision: 2802 Modified: isis-fish/trunk/pom.xml Log: Update h2 Modified: isis-fish/trunk/pom.xml =================================================================== --- isis-fish/trunk/pom.xml 2009-12-07 08:37:11 UTC (rev 2801) +++ isis-fish/trunk/pom.xml 2009-12-07 08:37:23 UTC (rev 2802) @@ -215,7 +215,7 @@ <dependency> <groupId>com.h2database</groupId> <artifactId>h2</artifactId> - <version>1.2.124</version> + <version>1.2.125</version> <scope>compile</scope> </dependency>

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