Pb de téléchargement de simus caparmor
J'ai un petit soucis de récupération de simus d'une AS que je fais tourner sur caparmor : - La plupart des simus restent à l'état "attente de démarrage" - Puis il y a une phase de téléchargement presque instantanée (alors que d'habitude c'est ce qui prend le plus de temps) - Le téléchargement semble bloqué à Janvier 0 et la simu passe à l'état "Suppression des fichiers" - Aucune des simulations ne passe dans la liste du bas des simulations terminées... Cette AS tourne sans soucis sur mon PC, donc je ne pense pas que le problème vienne de l'AS en elle-même. A priori les simulations tournent comme il faut sur caparmor, c'est pour cela que je pense que le problème vient de la récupération des simulations... Une idée ? Loïc
Le 07/09/2012 10:57, Loic GASCHE a écrit :
J'ai un petit soucis de récupération de simus d'une AS que je fais tourner sur caparmor : - La plupart des simus restent à l'état "attente de démarrage" - Puis il y a une phase de téléchargement presque instantanée (alors que d'habitude c'est ce qui prend le plus de temps) - Le téléchargement semble bloqué à Janvier 0 et la simu passe à l'état "Suppression des fichiers" - Aucune des simulations ne passe dans la liste du bas des simulations terminées... Je pense que tes simus ne fonctionne pas sur caparmor s'il tente la suppression a Janvier 0. Mais je n'arrive pas a me connecter sur caparmor avec ton compte.
-- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
Le 07/09/2012 11:05, Eric Chatellier a écrit :
Le 07/09/2012 10:57, Loic GASCHE a écrit :
J'ai un petit soucis de récupération de simus d'une AS que je fais tourner sur caparmor : - La plupart des simus restent à l'état "attente de démarrage" - Puis il y a une phase de téléchargement presque instantanée (alors que d'habitude c'est ce qui prend le plus de temps) - Le téléchargement semble bloqué à Janvier 0 et la simu passe à l'état "Suppression des fichiers" - Aucune des simulations ne passe dans la liste du bas des simulations terminées... Je pense que tes simus ne fonctionne pas sur caparmor s'il tente la suppression a Janvier 0. Mais je n'arrive pas a me connecter sur caparmor avec ton compte. C'est une vrai 4.1.1.1 ou une snapshot que tu as là ? Dans la dernière release il y a un changement incompatible avec la dernier version installée sur caparmor.
-- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
Le 07/09/2012 11:25, Eric Chatellier a écrit :
Le 07/09/2012 11:05, Eric Chatellier a écrit :
Le 07/09/2012 10:57, Loic GASCHE a écrit :
J'ai un petit soucis de récupération de simus d'une AS que je fais tourner sur caparmor : - La plupart des simus restent à l'état "attente de démarrage" - Puis il y a une phase de téléchargement presque instantanée (alors que d'habitude c'est ce qui prend le plus de temps) - Le téléchargement semble bloqué à Janvier 0 et la simu passe à l'état "Suppression des fichiers" - Aucune des simulations ne passe dans la liste du bas des simulations terminées... Je pense que tes simus ne fonctionne pas sur caparmor s'il tente la suppression a Janvier 0. Mais je n'arrive pas a me connecter sur caparmor avec ton compte. C'est une vrai 4.1.1.1 ou une snapshot que tu as là ? Dans la dernière release il y a un changement incompatible avec la dernier version installée sur caparmor.
Normalement c'est la vraie 4.1.1.1 que j'ai téléchargé après avoir reçu le mail de la release
Le 07/09/2012 11:35, Loic GASCHE a écrit :
Normalement c'est la vraie 4.1.1.1 que j'ai téléchargé après avoir reçu le mail de la release
Ok, alors verifie que dans la configuration caparmor, la version d'isis est bien "/home3/caparmor/poussin/isis-fish-4.1.1". -- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
Le 07/09/2012 11:36, Eric Chatellier a écrit :
Le 07/09/2012 11:35, Loic GASCHE a écrit :
Normalement c'est la vraie 4.1.1.1 que j'ai téléchargé après avoir reçu le mail de la release
Ok, alors verifie que dans la configuration caparmor, la version d'isis est bien "/home3/caparmor/poussin/isis-fish-4.1.1".
Après avoir fait le changement mes simus ont tourné correctement ! Il y a pas mal d'erreurs affichées à la fin du log de simulation, mais ça ne vient pas directement d'ISIS à priori ?
Le 07/09/2012 12:58, Loic GASCHE a écrit :
Après avoir fait le changement mes simus ont tourné correctement !
Il y a pas mal d'erreurs affichées à la fin du log de simulation, mais ça ne vient pas directement d'ISIS à priori ?
SI ca vient d'isis, pendant les exports, mais ca ne bloque pas. Les exports sont cohérents ? -- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
Le 07/09/2012 13:21, Eric Chatellier a écrit :
Le 07/09/2012 12:58, Loic GASCHE a écrit :
Après avoir fait le changement mes simus ont tourné correctement !
Il y a pas mal d'erreurs affichées à la fin du log de simulation, mais ça ne vient pas directement d'ISIS à priori ?
SI ca vient d'isis, pendant les exports, mais ca ne bloque pas.
Les exports sont cohérents ?
J'ai un "SensitivityBiomass" et les "SensitivityGenitorBiomass" qui sont a zero dans le RData et dans les .csv Les autres résultats semblent cohérents.
Le 07/09/2012 13:40, Loic GASCHE a écrit :
Le 07/09/2012 13:21, Eric Chatellier a écrit :
Le 07/09/2012 12:58, Loic GASCHE a écrit :
Après avoir fait le changement mes simus ont tourné correctement !
Il y a pas mal d'erreurs affichées à la fin du log de simulation, mais ça ne vient pas directement d'ISIS à priori ?
SI ca vient d'isis, pendant les exports, mais ca ne bloque pas.
Les exports sont cohérents ?
J'ai un "SensitivityBiomass" et les "SensitivityGenitorBiomass" qui sont a zero dans le RData et dans les .csv
Les autres résultats semblent cohérents.
Et j'ai les mêmes problèmes avec l'AS que j'ai fait tourner sur mon PC, donc le soucis ne vient pas de caparmor. J'ai peut-être fait une erreur quelque part dans mes scripts ou en lançant l'AS...
Le 07/09/2012 13:43, Loic GASCHE a écrit :
Et j'ai les mêmes problèmes avec l'AS que j'ai fait tourner sur mon PC, donc le soucis ne vient pas de caparmor. J'ai peut-être fait une erreur quelque part dans mes scripts ou en lançant l'AS...
Il y a ca comme erreur sinon: FATAL|10:09:31,585|PopulationSeasonInfoImpl.java|836|getReproductionMatrix|Error in matrix reproduction creation fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Impossible d'évaluer l'équation: double RES7D = context.getValueAndCompute("Sole7D.reproductionEquation.REO7DE", 1.0); for (MatrixIterator i=result.iterator(); i.hasNext();) { i.next(); i.setValue(REO7DE*2.251E+08); } return 0; RES7D au lieu de REO7DE ? Si c'est ca que tu essaye de faire varier par exemple, ca prend 0 si ca compile pas. -- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
Le 07/09/2012 13:47, Eric Chatellier a écrit :
Le 07/09/2012 13:43, Loic GASCHE a écrit :
Et j'ai les mêmes problèmes avec l'AS que j'ai fait tourner sur mon PC, donc le soucis ne vient pas de caparmor. J'ai peut-être fait une erreur quelque part dans mes scripts ou en lançant l'AS...
Il y a ca comme erreur sinon:
FATAL|10:09:31,585|PopulationSeasonInfoImpl.java|836|getReproductionMatrix|Error in matrix reproduction creation fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Impossible d'évaluer l'équation: double RES7D = context.getValueAndCompute("Sole7D.reproductionEquation.REO7DE", 1.0);
for (MatrixIterator i=result.iterator(); i.hasNext();) { i.next(); i.setValue(REO7DE*2.251E+08); } return 0;
RES7D au lieu de REO7DE ?
Si c'est ca que tu essaye de faire varier par exemple, ca prend 0 si ca compile pas.
Ah oui il y avait une erreur dans j'avais mis RES7D au lieu de REO7DE comme Ktemp dans l'équation de reproduction de la population "Others7DE". J'ai refait une petite AS après correction et j'ai toujours le même soucis : toutes mes SSB sont à 0. Par contre je n'avais pas fait attention mais dans les logs des simulations les messages d'erreur font directement référence à l'ogive de maturité : WARN|16:09:02,901|PopulationGroupImpl.java|172|getMaturityOgive|Error in maturityOgive equation Ca pourrait expliquer pourquoi je n'arrive pas à avoir de biomasse féconde...
Le 07/09/2012 16:26, Loic GASCHE a écrit :
Le 07/09/2012 13:47, Eric Chatellier a écrit :
Le 07/09/2012 13:43, Loic GASCHE a écrit :
Et j'ai les mêmes problèmes avec l'AS que j'ai fait tourner sur mon PC, donc le soucis ne vient pas de caparmor. J'ai peut-être fait une erreur quelque part dans mes scripts ou en lançant l'AS...
Il y a ca comme erreur sinon:
FATAL|10:09:31,585|PopulationSeasonInfoImpl.java|836|getReproductionMatrix|Error
in matrix reproduction creation fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Impossible d'évaluer l'équation: double RES7D = context.getValueAndCompute("Sole7D.reproductionEquation.REO7DE", 1.0);
for (MatrixIterator i=result.iterator(); i.hasNext();) { i.next(); i.setValue(REO7DE*2.251E+08); } return 0;
RES7D au lieu de REO7DE ?
Si c'est ca que tu essaye de faire varier par exemple, ca prend 0 si ca compile pas.
Ah oui il y avait une erreur dans j'avais mis RES7D au lieu de REO7DE comme Ktemp dans l'équation de reproduction de la population "Others7DE".
J'ai refait une petite AS après correction et j'ai toujours le même soucis : toutes mes SSB sont à 0.
Par contre je n'avais pas fait attention mais dans les logs des simulations les messages d'erreur font directement référence à l'ogive de maturité : WARN|16:09:02,901|PopulationGroupImpl.java|172|getMaturityOgive|Error in maturityOgive equation Ca pourrait expliquer pourquoi je n'arrive pas à avoir de biomasse féconde...
J'ai réinstallé la v4.1.1.0 et refait tourner une simu et mon AS : pas de problème, j'ai bien une biomasse et une SSB pour toutes mes populations (sauf Others7DE mais c'est normal)
Le 07/09/2012 17:44, Loic GASCHE a écrit :
Par contre je n'avais pas fait attention mais dans les logs des simulations les messages d'erreur font directement référence à l'ogive de maturité : WARN|16:09:02,901|PopulationGroupImpl.java|172|getMaturityOgive|Error in maturityOgive equation Ca pourrait expliquer pourquoi je n'arrive pas à avoir de biomasse féconde...
J'ai réinstallé la v4.1.1.0 et refait tourner une simu et mon AS : pas de problème, j'ai bien une biomasse et une SSB pour toutes mes populations (sauf Others7DE mais c'est normal)
Oui, ca à l'air d'être une regression par rapport a une modification pour faire tourner les simulations de stéphanie. Tu peux m'envoyer l'export BiomasseFeconde stp ? Tu veux que j'install la 4.1.1.0 sur caparmor en attendant ? -- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
Le 07/09/2012 17:50, Eric Chatellier a écrit :
Le 07/09/2012 17:44, Loic GASCHE a écrit :
Par contre je n'avais pas fait attention mais dans les logs des simulations les messages d'erreur font directement référence à l'ogive de maturité : WARN|16:09:02,901|PopulationGroupImpl.java|172|getMaturityOgive|Error in maturityOgive equation Ca pourrait expliquer pourquoi je n'arrive pas à avoir de biomasse féconde...
J'ai réinstallé la v4.1.1.0 et refait tourner une simu et mon AS : pas de problème, j'ai bien une biomasse et une SSB pour toutes mes populations (sauf Others7DE mais c'est normal)
Oui, ca à l'air d'être une regression par rapport a une modification pour faire tourner les simulations de stéphanie.
Tu peux m'envoyer l'export BiomasseFeconde stp ?
Tu veux que j'install la 4.1.1.0 sur caparmor en attendant ?
Ben ça dépend combien de temps cela peut prendre de régler le problème car je ne vais pas faire tourner d'AS ce weekend et on n'est pas là lundi... Après si c'est le seul moyen et que ça n' handicape personne d'autre ça me va.
Le 07/09/2012 17:57, Loic GASCHE a écrit :
Ben ça dépend combien de temps cela peut prendre de régler le problème car je ne vais pas faire tourner d'AS ce weekend et on n'est pas là lundi... Après si c'est le seul moyen et que ça n' handicape personne d'autre ça me va.
Tu peux rester sur la 4.1.1.0 en attendant ? Il suffit de configurer caparmor sur la version d'isis : /home3/caparmor/poussin/isis-fish-4.1.1.0 On finalize on nouveau stockage de resultat pour résoudre tous ces problèmes, on est en train de le tester. -- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
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