Simu qui ne se lance pas sur Caparmor
Bonjour, Je voulais faire tourner une grosse AS sur caparmor cette nuit, et ce matin j'ai retrouvé ISIS avec pleins de fenêtres d'erreurs sans texte. Quand je les ai fermées cela a fermé ISIS également, et après l'avoir relancé je me retrouve avec une belle liste de simus en attente... mais rien ne tourne et l'AS n'apparait pas dans la liste des choses entrain de tourner sur caparmor. Le debug ne semble pas indiquer d'erreur, donc je ne pige pas pourquoi ça fait ça... Loïc
Le 24/05/2012 09:05, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
Je voulais faire tourner une grosse AS sur caparmor cette nuit, et ce matin j'ai retrouvé ISIS avec pleins de fenêtres d'erreurs sans texte. Quand je les ai fermées cela a fermé ISIS également, et après l'avoir relancé je me retrouve avec une belle liste de simus en attente... mais rien ne tourne et l'AS n'apparait pas dans la liste des choses entrain de tourner sur caparmor.
Le debug ne semble pas indiquer d'erreur, donc je ne pige pas pourquoi ça fait ça...
Loïc
J'ai réussi à "arrêter" les simulations qui ne tournaient pas (avec encore moult fenêtres sensées contenir des messages d'erreur mais n'affichant rien) et je les ai relancées... Par contre : - c'est d'une lenteur extrême - les simus n'apparaissent pas comme d'habitude mais sont en "sequentiel", autrement dit je me retrouve avec des milliers de simus à mon nom qui essayent de tourner sur caparmor... Afin de ne pas me faire disputer par Tina et comme c'est de toute façon très lent j'ai arrêté les simus pour le moment... Par contre si quelqu'un a une idée de la cause de ce problème je suis prneur.
Le 24/05/2012 09:41, Loic GASCHE a écrit :
Le 24/05/2012 09:05, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
Je voulais faire tourner une grosse AS sur caparmor cette nuit, et ce matin j'ai retrouvé ISIS avec pleins de fenêtres d'erreurs sans texte. Quand je les ai fermées cela a fermé ISIS également, et après l'avoir relancé je me retrouve avec une belle liste de simus en attente... mais rien ne tourne et l'AS n'apparait pas dans la liste des choses entrain de tourner sur caparmor.
Le debug ne semble pas indiquer d'erreur, donc je ne pige pas pourquoi ça fait ça...
Loïc
J'ai réussi à "arrêter" les simulations qui ne tournaient pas (avec encore moult fenêtres sensées contenir des messages d'erreur mais n'affichant rien) et je les ai relancées...
Par contre : - c'est d'une lenteur extrême - les simus n'apparaissent pas comme d'habitude mais sont en "sequentiel", autrement dit je me retrouve avec des milliers de simus à mon nom qui essayent de tourner sur caparmor...
Afin de ne pas me faire disputer par Tina et comme c'est de toute façon très lent j'ai arrêté les simus pour le moment... Par contre si quelqu'un a une idée de la cause de ce problème je suis prneur.
Bon voilà c'est fait, malgré tout je me suis fait disputer par Tina parce qu'on lançait des centaines de simus en même temps. J'ai eu un autre truc surprenant: en fait toutes les simulations sauf une s'arrêtaient quand je demandais de toutes les arrêter, et impossible d'arrêter cette simu restante. En plus en fermant ISIS et en le relançant, je me retrouvais à nouveau avec toutes les simus de mon AS dans la liste des simus en attente, comme si je ne les avais pas arrêtées.
Le 24/05/2012 10:57, Loic GASCHE a écrit :
Bon voilà c'est fait, malgré tout je me suis fait disputer par Tina parce qu'on lançait des centaines de simus en même temps.
J'ai eu un autre truc surprenant: en fait toutes les simulations sauf une s'arrêtaient quand je demandais de toutes les arrêter, et impossible d'arrêter cette simu restante. En plus en fermant ISIS et en le relançant, je me retrouvais à nouveau avec toutes les simus de mon AS dans la liste des simus en attente, comme si je ne les avais pas arrêtées.
Dans l'interface de configuration de caparmor, après avoir tester la conf, il y a 2 boutons pour nettoyer le compte caparmor. Tu est a 11Go, je voudrais être sur que ce n'est pas un problème de quota. Tu peut tester d'en relancer une après avoir nettoyer ton compte ? J'y verrai plus clair ensuite. -- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
Le 24/05/2012 11:10, Eric Chatellier a écrit :
Le 24/05/2012 10:57, Loic GASCHE a écrit :
Bon voilà c'est fait, malgré tout je me suis fait disputer par Tina parce qu'on lançait des centaines de simus en même temps.
J'ai eu un autre truc surprenant: en fait toutes les simulations sauf une s'arrêtaient quand je demandais de toutes les arrêter, et impossible d'arrêter cette simu restante. En plus en fermant ISIS et en le relançant, je me retrouvais à nouveau avec toutes les simus de mon AS dans la liste des simus en attente, comme si je ne les avais pas arrêtées.
Dans l'interface de configuration de caparmor, après avoir tester la conf, il y a 2 boutons pour nettoyer le compte caparmor. Tu est a 11Go, je voudrais être sur que ce n'est pas un problème de quota. Tu peut tester d'en relancer une après avoir nettoyer ton compte ? J'y verrai plus clair ensuite.
J'ai fait le ménage et relancé une AS plus petite. A priori pour le moment ça tourne comme il faut sur caparmor, même si ISIS n'a pas encore commencé à télécharger les résultats. A suivre...
Le 24/05/2012 12:04, Loic GASCHE a écrit :
Le 24/05/2012 11:10, Eric Chatellier a écrit :
Le 24/05/2012 10:57, Loic GASCHE a écrit :
Bon voilà c'est fait, malgré tout je me suis fait disputer par Tina parce qu'on lançait des centaines de simus en même temps.
J'ai eu un autre truc surprenant: en fait toutes les simulations sauf une s'arrêtaient quand je demandais de toutes les arrêter, et impossible d'arrêter cette simu restante. En plus en fermant ISIS et en le relançant, je me retrouvais à nouveau avec toutes les simus de mon AS dans la liste des simus en attente, comme si je ne les avais pas arrêtées.
Dans l'interface de configuration de caparmor, après avoir tester la conf, il y a 2 boutons pour nettoyer le compte caparmor. Tu est a 11Go, je voudrais être sur que ce n'est pas un problème de quota. Tu peut tester d'en relancer une après avoir nettoyer ton compte ? J'y verrai plus clair ensuite.
J'ai fait le ménage et relancé une AS plus petite. A priori pour le moment ça tourne comme il faut sur caparmor, même si ISIS n'a pas encore commencé à télécharger les résultats. A suivre...
Bon ben ma seconde tentative pour faire une grosse AS est aussi un échec. Comme hier les simulations apparaissent dans la liste des simulations en attente, et rien ne tourne sur caparmor. La différence est que le (gros) débug semble plus explicite : il semble y avoir eu un grand nombre d'erreurs...
Le 25/05/2012 09:28, Loic GASCHE a écrit :
Bon ben ma seconde tentative pour faire une grosse AS est aussi un échec. Comme hier les simulations apparaissent dans la liste des simulations en attente, et rien ne tourne sur caparmor. La différence est que le (gros) débug semble plus explicite : il semble y avoir eu un grand nombre d'erreurs...
/usr/pbs/bin/qsub -m n -J 0-15999 "/home1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-as_IG_16params_V4101_AvecRegles_LHS_50pcts_2012-05-24-15-07-script.seq"|tee "/home1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-as_IG_16params_V4101_AvecRegles_LHS_50pcts_2012-05-24-15-07-pbs.id" qsub: Array job exceeds server or queue size limit un multi job de 15999 simulation ca semble être trop pour caparmor il ne le lance même pas. -- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
Le 25/05/2012 11:42, Eric Chatellier a écrit :
/usr/pbs/bin/qsub -m n -J 0-15999 "/home1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-as_IG_16params_V4101_AvecRegles_LHS_50pcts_2012-05-24-15-07-script.seq"|tee "/home1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-as_IG_16params_V4101_AvecRegles_LHS_50pcts_2012-05-24-15-07-pbs.id" qsub: Array job exceeds server or queue size limit
un multi job de 15999 simulation ca semble être trop pour caparmor il ne le lance même pas.
Tu as trouvé une solution ? Car 16000 c'est beaucoup, mais si tu as vraiment besoin, on peut demander a tina s'il est possible de modifier la limite (pas sur qu'elle accepte). -- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
Le 31/05/2012 15:06, Eric Chatellier a écrit :
Le 25/05/2012 11:42, Eric Chatellier a écrit :
/usr/pbs/bin/qsub -m n -J 0-15999 "/home1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-as_IG_16params_V4101_AvecRegles_LHS_50pcts_2012-05-24-15-07-script.seq"|tee "/home1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-as_IG_16params_V4101_AvecRegles_LHS_50pcts_2012-05-24-15-07-pbs.id" qsub: Array job exceeds server or queue size limit
un multi job de 15999 simulation ca semble être trop pour caparmor il ne le lance même pas.
Tu as trouvé une solution ?
Car 16000 c'est beaucoup, mais si tu as vraiment besoin, on peut demander a tina s'il est possible de modifier la limite (pas sur qu'elle accepte).
Oui oui je me suis débrouillé autrement, pas de soucis !
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Eric Chatellier -
Loic GASCHE