Author: jcouteau Date: 2011-12-06 14:16:57 +0100 (Tue, 06 Dec 2011) New Revision: 52 Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/52 Log:

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See the -.. * GNU General Public License for more details. -.. * -.. * You should have received a copy of the GNU General Public -.. * License along with this program. If not, see -.. * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>. -.. * #L% -.. - -Page de dépôt de scripts -======================== - -Cette page a pour vocation d'accueillir des scripts non génériques des -utilisateurs qui souhaitent les partager. -Merci d'indiquer - * l'auteur, - * la version pour laquelle le script fonctionne, - * la région, - * de préciser, pour les plans d'analyse, de quel type ils sont (exploration, analyse de sensibilité,...) - * et de produire un descriptif de l'action du script. - -Plans d'analyse ---------------- - -P_As_planFactFractV-12param sur la pêcherie Anchois -~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ - -Sigrid V3.1.3, Plan d'analyse : pour l'analyse de sensibilité sur la pêcherie -Anchois du GdG: - -Méthode de groupe screening, les facteurs de l'analyse sont 12 groupes de -paramètres (facteurs de standardisation, mortalité naturelle adulte, mortalité -naturelle juvénile, valeurs de capturabilité,valeurs de fécondité, coefficients -de migration, bornes des classes de longueur,équations de sélectivité,équations -des facteurs de ciblage, valeur d'inactivité, valeur du TAC (français et -espagnol), paramètres de l'aire marine protegee), le plan est un plan factoriel -fractionnaire de résolution V (256 simulations). - -`Plan d analyse et Fichiers Parametres et matrice`_ - -.. _Plan d analyse et Fichiers Parametres et matrice: ../downloads/P_As_planFactFract_12param_Anchois.zip - -Calibration du paramètre de capturabilité -~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ - -Sigrid V 3.3.0.2, Plan d'analyse : pour la calibration d un parametre de -capturabilité : algorithme décrit dans Walters, F.H., Parker, L.R., Morgan, S.L. -and Deming, S.N. 1991. Sequential Simplex optimization: a technique for -improving quality and productivity in reasearch, development, and manufacturing -(Chemometrics series). B.R. CRC Press LLC. 402 pp. On spécifie 5 valeurs -initiales séparées d'un meme pas, puis l'algorithme trouve la valeur qui -minimise la fonction objectif en explorant le voisinage de la meilleure valeur -avec un pas de plus en plus petit. `Plan d'analyse`_ - -.. _Plan d'analyse: ../downloads/P_Calibration_1param.zip - -Plan qui modifie les regles de gestion / modifying management rules -~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ - -Sigrid V 3.3.0.8 , Plan d'analyse pour la pecherie anchois : modifie les regles -de gestion a chaque simulation `Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan`_ - -.. _Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan: ../downloads/PlanModifRules.zip - -Plan qui modifie regle de gestion et parametres / modify rules and parameters -~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ - -Sigrid V 3.3.0.8 , Plan d'analyse pour la pecherie anchois : modifie les regles -de gestion, et des parametres (equations et nb de jours d'inactivite) a chaque -simulation `Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan`_ - -.. _Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan: ../downloads/PlanRulesParam.zip - -Règles de gestion ------------------ - -Sigrid V3.3.0.4, Règle de gestion : modification du script de TAC pour qu'il -s'applique de juillet à juin, pour qu'il ne concerne qu'une stratégie et que la -pêcherie soit fermée si la biomasse passe sous un seuil defini. `TAC modifie`_ - -.. _TAC modifie: ../downloads/TACfix_Es_Anchois.java - -Sigrid V3.3.0.8, Regle de gestion : Effort Reduction en modifiant le temps -d'inactivite. `Effort reduction`_ - -.. _Effort reduction: ../downloads/EffortReduction.java - -Sigrid V3.3.0.8, Regle de gestion : le pourcentage d'effort par metier chaque -mois est force a des valeurs lues dans un fichier `% Effort`_ - -.. _% Effort: ../downloads/Effort_2000_2004_MultiSp.java - -A venir: - -* regle implementant un RUM (modele de comportement de peche) -* regle de gestion incluant RUM et gestion par TAC -* HCR : TAC definit annuellement en fonction de la Biomasse du stock - -Exports -------- - -Analyses de sensibilité ------------------------ - -Exports pour analyse de sensibilité ------------------------------------ - -Simulateurs ------------ - -Équations ---------- - -Quelques exemples d'equations compliquees pour donner des idees du possible (Sigrid, Anchois) - -* `Equation de croissance simple VBGF`_ -* `Equation de Poids qui change selon le mois`_ -* `Equation de mortalite naturelle spatialisee`_ et variant chaque annee pour le premier groupe -* `Equation de reproduction`_ qui force la valeur les trois premieres annees puis la calcule -* `Equation de migration densite dependante`_ -* `Equation de migration`_ dont les coefficients sont forces aux valeurs observees tous les ans -* `Equation de prix en fonction des debarquements`_ - -.. _Equation de croissance simple VBGF: ../downloads/VGBFAnchois.java -.. _Equation de Poids qui change selon le mois: ../downloads/Weight_month.java -.. _Equation de mortalite naturelle spatialisee: ../downloads/MzonesAnneeMpertMgdg.java -.. _Equation de reproduction: ../downloads/Repro_recru0-2_StocksOeufs_Spatialisee061107.java -.. _Equation de migration densite dependante: ../downloads/MigrationAout.java -.. _Equation de migration: ../downloads/MigrationAdultsAvrilHistoric.java -.. _Equation de prix en fonction des debarquements: ../downloads/prixAnchois.java - -Scripts -------- +.. - +.. * #%L +.. * IsisFish +.. * +.. * $Id$ +.. * $HeadURL$ +.. * %% +.. * Copyright (C) 1999 - 2010 Ifremer, Code Lutin +.. * %% +.. * This program is free software: you can redistribute it and/or modify +.. * it under the terms of the GNU General Public License as +.. * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the +.. * License, or (at your option) any later version. +.. * +.. * This program is distributed in the hope that it will be useful, +.. * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of +.. * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the +.. * GNU General Public License for more details. +.. * +.. * You should have received a copy of the GNU General Public +.. * License along with this program. If not, see +.. * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>. +.. * #L% +.. - +Page de dépôt de scripts +======================== + +Cette page a pour vocation d'accueillir des scripts non génériques des +utilisateurs qui souhaitent les partager. +Merci d'indiquer + * l'auteur, + * la version pour laquelle le script fonctionne, + * la région, + * de préciser, pour les plans d'analyse, de quel type ils sont (exploration, analyse de sensibilité,...) + * et de produire un descriptif de l'action du script. + +Plans de simulation +------------------- + +P_As_planFactFractV-12param sur la pêcherie Anchois +~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ + +Sigrid V3.1.3, Plan d'analyse : pour l'analyse de sensibilité sur la pêcherie +Anchois du GdG: + +Méthode de groupe screening, les facteurs de l'analyse sont 12 groupes de +paramètres (facteurs de standardisation, mortalité naturelle adulte, mortalité +naturelle juvénile, valeurs de capturabilité,valeurs de fécondité, coefficients +de migration, bornes des classes de longueur,équations de sélectivité,équations +des facteurs de ciblage, valeur d'inactivité, valeur du TAC (français et +espagnol), paramètres de l'aire marine protegee), le plan est un plan factoriel +fractionnaire de résolution V (256 simulations). + +`Plan d analyse et Fichiers Parametres et matrice`_ + +.. _Plan d analyse et Fichiers Parametres et matrice: ../downloads/P_As_planFactFract_12param_Anchois.zip + +Calibration du paramètre de capturabilité +~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ + +Sigrid V 3.3.0.2, Plan d'analyse : pour la calibration d un parametre de +capturabilité : algorithme décrit dans Walters, F.H., Parker, L.R., Morgan, S.L. +and Deming, S.N. 1991. Sequential Simplex optimization: a technique for +improving quality and productivity in reasearch, development, and manufacturing +(Chemometrics series). B.R. CRC Press LLC. 402 pp. On spécifie 5 valeurs +initiales séparées d'un meme pas, puis l'algorithme trouve la valeur qui +minimise la fonction objectif en explorant le voisinage de la meilleure valeur +avec un pas de plus en plus petit. `Plan d'analyse`_ + +.. _Plan d'analyse: ../downloads/P_Calibration_1param.zip + +Plan qui modifie les regles de gestion / modifying management rules +~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ + +Sigrid V 3.3.0.8 , Plan d'analyse pour la pecherie anchois : modifie les regles +de gestion a chaque simulation `Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan`_ + +.. _Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan: ../downloads/PlanModifRules.zip + +Plan qui modifie regle de gestion et parametres / modify rules and parameters +~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ + +Sigrid V 3.3.0.8 , Plan d'analyse pour la pecherie anchois : modifie les regles +de gestion, et des parametres (equations et nb de jours d'inactivite) a chaque +simulation `Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan`_ + +.. _Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan: ../downloads/PlanRulesParam.zip + +Règles de gestion +----------------- + +Sigrid V3.3.0.4, Règle de gestion : modification du script de TAC pour qu'il +s'applique de juillet à juin, pour qu'il ne concerne qu'une stratégie et que la +pêcherie soit fermée si la biomasse passe sous un seuil defini. `TAC modifie`_ + +.. _TAC modifie: ../downloads/TACfix_Es_Anchois.java + +Sigrid V3.3.0.8, Regle de gestion : Effort Reduction en modifiant le temps +d'inactivite. `Effort reduction`_ + +.. _Effort reduction: ../downloads/EffortReduction.java + +Sigrid V3.3.0.8, Regle de gestion : le pourcentage d'effort par metier chaque +mois est force a des valeurs lues dans un fichier `% Effort`_ + +.. _% Effort: ../downloads/Effort_2000_2004_MultiSp.java + +A venir: + +* regle implementant un RUM (modele de comportement de peche) +* regle de gestion incluant RUM et gestion par TAC +* HCR : TAC definit annuellement en fonction de la Biomasse du stock + +Exports +------- + +Analyses de sensibilité +----------------------- + +Exports pour analyse de sensibilité +----------------------------------- + +Simulateurs +----------- + +Équations +--------- + +Quelques exemples d'equations compliquees pour donner des idees du possible (Sigrid, Anchois) + +* `Equation de croissance simple VBGF`_ +* `Equation de Poids qui change selon le mois`_ +* `Equation de mortalite naturelle spatialisee`_ et variant chaque annee pour le premier groupe +* `Equation de reproduction`_ qui force la valeur les trois premieres annees puis la calcule +* `Equation de migration densite dependante`_ +* `Equation de migration`_ dont les coefficients sont forces aux valeurs observees tous les ans +* `Equation de prix en fonction des debarquements`_ + +.. _Equation de croissance simple VBGF: ../downloads/VGBFAnchois.java +.. _Equation de Poids qui change selon le mois: ../downloads/Weight_month.java +.. _Equation de mortalite naturelle spatialisee: ../downloads/MzonesAnneeMpertMgdg.java +.. _Equation de reproduction: ../downloads/Repro_recru0-2_StocksOeufs_Spatialisee061107.java +.. _Equation de migration densite dependante: ../downloads/MigrationAout.java +.. _Equation de migration: ../downloads/MigrationAdultsAvrilHistoric.java +.. _Equation de prix en fonction des debarquements: ../downloads/prixAnchois.java + +Scripts +-------