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De : "Stephanie.Mahevas@ifremer.fr" <Stephanie.Mahevas@ifremer.fr>
À : isis-fish-users@list.isis-fish.org
Envoyé le : Sam 5 Décembre 2009, 16 h 40 min 24 s
Objet : Re: [Isis-fish-users] sensitivity

Salut

Sigrid et Jean ont tout a fait raison. Un plan complet n'est pas la solution quand on a autant de parametres.
Une premiere approche simple est d'utiliser un plan de Morris (qui est dans la librairie des analyses de sensibilite d'ISIS). Quelle est la nature de tes parametres? Continu, discret?
S'ils sont tous continus alors c'est tout simple car la methode s'applique directement.
Si par contre certains sont discrets, a toi de trouver une astuce pour les traiter de maniere continue. Par exemple lorsque le parametre à tester est une courbe de croissance VB avec deux modalites (courbe 1, courbe 2) et que chaque courbe correspond à un changement dans la valeur de K alors tu peux considerer que le parametre à tester est K et tu te rammenes à un parametre continu.
Pour mieux connaitre les methodes d'analyse de sensibilite, je te conseille de lire les bouquins de Saltelli.

Saltelli, A., Ratto, M., Andres, T., Campolongo, F., Cariboni, J., Gatelli, D. Saisana, M., Tarantola, S., 2008, Global Sensitivity Analysis. The Primer, John Wiley & Sons publishers.

Saltelli A. Tarantola S., Campolongo, F. and Ratto, M., 2004, Sensitivity Analysis in Practice. A Guide to Assessing Scientific Models, John Wiley & Sons publishers.

Car la demarche n'est pas toujours evidente pour construire un plan d'experience et ensuite interpreter les coefficient de sensibilite.
Tu peux aussi avoir de l'aide sur les methodes sous R en chargeant les librairies sensitivity et LHS.

Si cela t'interesse, il y aura une ecole chercheur sur le sujet en Juin prochain (du 7 au 11) avec un TP sur ISIS. J'enverrai l'annonce en janvier lorsque l'on aura arrete la plaquette.

bon courage
Stephanie



Sigrid LEHUTA <Sigrid.Lehuta@ifremer.fr> a écrit :

> Salut Chirine
> si tu as 87 paramètres ça ne me semble pas raisonnable de faire un plan complet ! comme l'a dit Jean ca fait beaucoup trop de simulations.
> Deux solutions :
> - Si tu n'es pas intéressée par toutes les interactions, il existent d'autres types de plans d'expériences : fractionnaires, optimisés, etc qui permettent de réduire le nombre de simulations pour estimer les effets principaux et certaines interactions. Mais j ai peur que ca ne suffise pas...
> - Si tu n'es pas interessée par l'effet de chaque paramètre tu peux réduire le nombre de paramètres en groupant des paramètres qui ont des effets attendus de même direction genre tous les paramètres qui se rapportent a la taille des poissons etc ca s 'appelle "group-screening" (cf le papier d'Hilaire dans ALR : Drouineau, 2006)
> - soit les deux en même temps !
>
> Bonne chance
>
>
> Jean Couteau a écrit :
>> Juste un petit calcul :
>>
>> avec 2 modalités, cela fait 7569 simulations
>>
>> avec 3 modalités, cela fait 658503 simulations
>>
>>
>> les tests que nous sommes en train de réaliser portent sur 1500 simulations et elles sont réalisées sur caparmor en 15 heures. Pour 7569 simulations, il faudrait environ 52 jours sur un pc personnel (en comptant 10 minutes par simulations)
>>
>> Le plan complet pour un si grand nombre de facteur n'est pas une très bonne idée il me semble.
>>
>> Jean
>>
>> Jean Couteau wrote:
>>> Combien y avait-il de modalités pour les facteurs ?
>>>
>>> Le problème vient surement d'un problème de mémoire, le plan complet générant énormément de simulations.
>>>
>>> Est-il possible d'avoir le debug ?
>>>
>>> chirine HUSSEIN wrote:
>>>> bonjour à tous,
>>>> toujours avec les methode de la sensibilité,
>>>> pour la methode "SensitivityCalculatorJavaExpandGrid", si le  nombre de parametre assez grang ( dans mon cas 87 ) les simulations de la sensibilité ne tournent pas, en sachant que j'ai fait un essai sur 5 paramètres et la methode fonctionne bien.
>>>> merci bien
>>>> chirine
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>  Doctorante
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