Autant pour moi la simu "simple" etait foireuse. Ca marche avec datasession0.
J ai aussi trouvé un moyen de lancer les plans de simus depuis datarmor sans transferts de fichiers (meme system qu avec calibrar avec un wrapper R). Je privilegierai ce system autant que possible avant la prochaine version.
Merci
Le 2020-03-24 23:31, slehuta a écrit :
Bonsoir,
J ai testé une simu simple sur datarmor en remplacant le serveur datarmor par datasession0
la simu s arrete en janvier 0 et voici le debug. je n y vois rien d instructif... Et toi ?
Merci
2020-03-24 23:11:33,378 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:206) setText - backup database en cours
2020-03-24 23:11:33,430 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:206) setText - backup database terminé
2020-03-24 23:11:33,435 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:206) setText - Compilation des scripts
2020-03-24 23:11:33,816 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:206) setText - Temps de compilation 0.379s
2020-03-24 23:11:33,928 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationJob.java:210) run - Start simulation: sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11
2020-03-24 23:11:33,932 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationMonitor.java:347) simulationStart - Saving simulation sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11 as started
2020-03-24 23:11:33,932 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:166) message - Connexion à Datarmor
2020-03-24 23:11:33,932 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationControl.java:206) setText - Connexion à Datarmor
2020-03-24 23:11:33,937 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:532) openSSHSession - Try to log on slehuta@datasession0:22
2020-03-24 23:11:33,937 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:548) openSSHSession - Can't read ssh key : C:\Users\slehuta\.ssh\isis_rsa
2020-03-24 23:11:33,941 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationStorage.java:571) getSimulation - Try to open simulation sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11(C:\Users\slehuta\isis-fish-4\isis-database\simulations\sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11)
2020-03-24 23:11:39,616 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:166) message - Upload de la simulation
2020-03-24 23:11:39,617 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationControl.java:206) setText - Upload de la simulation
2020-03-24 23:11:39,617 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:700) uploadSimulation - Creating remote temp directory (if not exists) /home1/datahome/slehuta/isis-tmp/
2020-03-24 23:11:40,094 INFO [pool-4-thread-1] (SSHUtils.java:221) exec - JSch channel exit-status: 0
2020-03-24 23:11:44,227 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:166) message - Attente du démarrage de la simulation
2020-03-24 23:11:44,228 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationControl.java:206) setText - Attente du démarrage de la simulation
2020-03-24 23:11:45,477 INFO [pool-4-thread-1] (SSHUtils.java:221) exec - JSch channel exit-status: 0
2020-03-24 23:11:45,477 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:1159) sendStartSimulationRequest - Job submitted with job id : 8129535.datarmor0
2020-03-24 23:15:35,949 INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:206) setText - Téléchargement des résultats
2020-03-24 23:15:40,421 INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:206) setText - Simulation terminée
2020-03-24 23:15:40,422 INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:206) setText - Suppression des fichiers de simulation
2020-03-24 23:15:40,807 INFO [monitor-thread] (SSHUtils.java:221) exec - JSch channel exit-status: 0
2020-03-24 23:15:41,065 WARN [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:533) checkProgression - Simulation exception : java.lang.NullPointerException
at fr.ifremer.isisfish.result.ResultInfoHelper.extractRecursiveResults(ResultInfoHelper.java:93)
at fr.ifremer.isisfish.result.ResultInfoHelper.extractAllNecessaryResults(ResultInfoHelper.java:71)
at fr.ifremer.isisfish.simulator.ResultManager.isEnabled(ResultManager.java:208)
at simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:178)
at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:430)
at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:260)2020-03-24 23:15:41,065 INFO [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:457) waitAndCheckProgression - Job sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11 finished
2020-03-24 23:15:41,065 INFO [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:568) doPostSimulationOperation - Do post simulation operation for sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11
2020-03-24 23:15:41,066 INFO [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:391) simulationStop - Saving simulation sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11 as stopped
2020-03-24 23:24:05,559 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:103) <init> - fr.ifremer.isisfish.logging.console.LogConsoleHandler@389b7dbd
2020-03-24 23:24:05,563 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:399) getLevelReader - (levels:[])(file:simulation.log (offsetfile:offsets_0, nbLines:30))
2020-03-24 23:24:05,564 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:125) start - with reader (levels:[])(file:simulation.log (offsetfile:offsets_0, nbLines:30)) in 5
2020-03-24 23:24:05,564 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsole.java:118) newConsole - handler start in 5
2020-03-24 23:24:05,590 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsole.java:160) <init> - fr.ifremer.isisfish.logging.console.LogConsole[$JFrame0,0,0,543x509,invalid,hidden,layout=java.awt.BorderLayout,title=Console de log simulation 'sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11',resizable,normal,defaultCloseOperation=DISPOSE_ON_CLOSE,rootPane=javax.swing.JRootPane[,8,31,527x470,invalid,layout=javax.swing.JRootPane$RootLayout,alignmentX=0.0,alignmentY=0.0,border=javax.swing.plaf.synth.SynthBorder@1d31d011,flags=16777673,maximumSize=,minimumSize=,preferredSize=],rootPaneCheckingEnabled=true]
2020-03-24 23:24:05,590 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:263) propertyChange - change newLinesInEditor : 30 --> 26
2020-03-24 23:24:05,605 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationLoggerUtil.java:82) showSimulationLogConsole - affichage de la console de log pour la simulation sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11
2020-03-24 23:24:05,613 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:263) propertyChange - change newLinesInEditor : 26 --> 25
2020-03-24 23:24:07,383 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:263) propertyChange - change newLinesInEditor : 25 --> 67
Le 2020-03-24 14:36, D Croizé-Fillon a écrit :
Cela devrait également être possible pour vous maintenant
Denis
Le 24/03/2020 à 10:17, D Croizé-Fillon a écrit :C'est un problème d'accès via pulse._______________________________________________
J'attends des ajustements mais ce n'est pas encore en place.
Pour l'instant, elle vous est inaccessible via pulse mais Sigrid a l'accès
Denis
Le 24/03/2020 à 10:11, Eric Chatellier a écrit :Le 24/03/2020 à 09:00, D Croizé-Fillon a écrit :Bonjour,
pourriez vous essayer en ne changeant que le serveur cible ?
La soumission de job est possible (mais je n'ai pas beaucoup validé, c'est du test). Le qsub interactif ne fonctionne pour l'instant pas.
Bonjour,
Je voulais tester, mais j'ai l'impression que la machine est inacessible
ssh echatell@datasession0.ifremer.fr
ssh: connect to host datasession0.ifremer.fr port 22: Connection timed out
J'y arrive sans problème sur "datarmor.ifremer.fr"
Isis-fish-users mailing list
Isis-fish-users@list.isis-fish.org
http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users
_______________________________________________
Isis-fish-users mailing list
Isis-fish-users@list.isis-fish.org
http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users