matrices de mortalité par pêche différentes entre deux simus
Bonjour, J'ai fait tourner la simu* sim_sim_WestMed_closures_Saisine_2023-10-19-00-55_0_nouvelEssai_sansRegles_avecNouveauPlan_2024-08-21-15-14_0* après avoir chargé la simu *sim_WestMed_closures_Saisine_2023-10-19-00-55_0* dans l'interface. J'ai pris soin de supprimer les règles sélectionnées dans l'interface pour qu'elles ne s'appliquent pas en double, étant donné qu'elles sont déjà appelées dans le plan de simu. Lorsque je compare les sorties des deux simulations, tous les résultats semblent similaires à l'exception de la matrice de mortalité par pêche MatrixFishingMortalityPerGroup (et MatrixTotalFishingMortality qui en dépend). D'après le doc dans le resultinfo, cette matrice est calculée à partir de trois autres matrices qui ne présentent pas de différences entre les deux simulations : • MatrixAbundanceBeginMonth • MatrixCatchPerStrategyMetPerZonePop • MatrixLandingPerMet C'est donc probablement la méthode de calcul de la matrice MatrixFishingMortalityPerGroup qui diffère entre les deux simulations. Pourriez-vous svp m'indiquer où trouver le script qui permet de calculer MatrixFishingMortalityPerGroup ? Ci-dessous un lien WeTransfer pour télécharger les deux simus zippées et la région : https://we.tl/t-EgcGAPZ3qM Merci d'avance pour votre aide ! Bonne journée, Sophie
Hello Le 22/08/2024 à 12:00, Sophie LEFORESTIER a écrit :
Bonjour,
J'ai fait tourner la simu/sim_sim_WestMed_closures_Saisine_2023-10-19-00-55_0_nouvelEssai_sansRegles_avecNouveauPlan_2024-08-21-15-14_0/ après avoir chargé la simu /sim_WestMed_closures_Saisine_2023-10-19-00-55_0/ dans l'interface. J'ai pris soin de supprimer les règles sélectionnées dans l'interface pour qu'elles ne s'appliquent pas en double, étant donné qu'elles sont déjà appelées dans le plan de simu.
L'apparition des règles en double est effectivement un bug
Lorsque je compare les sorties des deux simulations, tous les résultats semblent similaires à l'exception de la matrice de mortalité par pêche MatrixFishingMortalityPerGroup (et MatrixTotalFishingMortality qui en dépend).
D'après le doc dans le resultinfo, cette matrice est calculée à partir de trois autres matrices qui ne présentent pas de différences entre les deux simulations : • MatrixAbundanceBeginMonth • MatrixCatchPerStrategyMetPerZonePop • MatrixLandingPerMet
C'est effectivement pas normal... peut-etre verifier la version avec laquelle le plan avait tourné. Eric, une idée ?
C'est donc probablement la méthode de calcul de la matrice MatrixFishingMortalityPerGroup qui diffère entre les deux simulations. Pourriez-vous svp m'indiquer où trouver le script qui permet de calculer MatrixFishingMortalityPerGroup ?
C'est dans scripts/SiMatrix.java Steph
Ci-dessous un lien WeTransfer pour télécharger les deux simus zippées et la région : https://we.tl/t-EgcGAPZ3qM
Merci d'avance pour votre aide !
Bonne journée, Sophie
_______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org https://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users Archives et moteur de recherche:http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/
-- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS UMR MARBEC - site de Sète IFREMER/HM https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ Tel: (33) 04 99 57 32 39 (8239) - 06 75 83 59 33 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................
Merci Steph pour ton retour ! La simulation de référence avait tourné avec la version 4.7.5 et la nouvelle simulation avec la version 4.8.1. Pour préciser le problème, les valeurs de F pour les classes d'âge 1, 4 et 5 sont similaires entre les deux simus. Il y a des différences pour les classes d'âge 0, 2, et 3 pour lesquelles F est égal à 1,9999 quelle que soit l'année pour la nouvelle simu *sim_sim_WestMed_closures_Saisine_2023-10-19-00-55_0_nouvelEssai_sansRegles_avecNouveauPlan_2024-08-21-15-14_0* (cf. screenshot des matrices de F en PJ). Pourtant les captures et abondances de ces classes d'âge sont bien identiques entre les deux simulations… Une idée de l'origine du problème ? Merci, Sophie On Thu, Aug 22, 2024 at 12:42 PM Stephanie MAHEVAS < Stephanie.Mahevas@ifremer.fr> wrote:
Hello Le 22/08/2024 à 12:00, Sophie LEFORESTIER a écrit :
Bonjour,
J'ai fait tourner la simu* sim_sim_WestMed_closures_Saisine_2023-10-19-00-55_0_nouvelEssai_sansRegles_avecNouveauPlan_2024-08-21-15-14_0* après avoir chargé la simu *sim_WestMed_closures_Saisine_2023-10-19-00-55_0* dans l'interface. J'ai pris soin de supprimer les règles sélectionnées dans l'interface pour qu'elles ne s'appliquent pas en double, étant donné qu'elles sont déjà appelées dans le plan de simu.
L'apparition des règles en double est effectivement un bug
Lorsque je compare les sorties des deux simulations, tous les résultats semblent similaires à l'exception de la matrice de mortalité par pêche MatrixFishingMortalityPerGroup (et MatrixTotalFishingMortality qui en dépend).
D'après le doc dans le resultinfo, cette matrice est calculée à partir de trois autres matrices qui ne présentent pas de différences entre les deux simulations : • MatrixAbundanceBeginMonth • MatrixCatchPerStrategyMetPerZonePop • MatrixLandingPerMet
C'est effectivement pas normal...
peut-etre verifier la version avec laquelle le plan avait tourné.
Eric, une idée ?
C'est donc probablement la méthode de calcul de la matrice MatrixFishingMortalityPerGroup qui diffère entre les deux simulations. Pourriez-vous svp m'indiquer où trouver le script qui permet de calculer MatrixFishingMortalityPerGroup ?
C'est dans scripts/SiMatrix.java
Steph
Ci-dessous un lien WeTransfer pour télécharger les deux simus zippées et la région : https://we.tl/t-EgcGAPZ3qM
Merci d'avance pour votre aide !
Bonne journée, Sophie
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