Eric, J'ai teste avec la v4.5 et la petite Region MIMI : l'export fonctionne et le resultat FishingMortaliy est bien present avec la base Macco, j'ai toujours le meme bug pas fichier d'export vide et pas de resultat FishingMortaliy voici un lien vers le debug <https://filesender.renater.fr/?s=download&token=9a71ffed-e83b-4b2d-b1b5-af3e0117c360> https://filesender.renater.fr/?s=download&token=9a71ffed-e83b-4b2d-b1b5-af3e0117c360 Merci d'avance de ton aide Stephanie Le 04/06/2026 à 10:08, Antoine Ricouard a écrit :
Salut Stéphanie,
pas de nouvelles d'Eric à ce sujet ? Bonne journée,
---------- Forwarded message --------- De : *Antoine Ricouard* <antoine.ricouard.oceano@gmail.com> Date: lun. 1 juin 2026 à 15:47 Subject: Re: [Isis-fish-users] ***UNCHECKED*** MatrixFishingMortality To: <isis-fish-users@list.isis-fish.org>
Bonjour,
J'ai effectué la correction de l'export indiquée dans le précédent échange de mail et je confirme que le F n'est pas exporté et que la matrice MatrixFishingMortality n'apparaît pas dans les résultats bien qu'elle ait été sélectionnée au moment du lancement de la simulation. Ci-joint fichier parameters.properties, le script d'export et le csv (vide) exporté. Peux-tu nous indiquer ce qui ne va pas ? Merci beaucoup,
Le ven. 29 mai 2026 à 11:07, Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> a écrit :
Il n'y a pas de raison de ne pas l'avoir dans les résultats, surtout s'il est exporté.
Je viens de tester, je l'ai bien en résultat.
Le 29/05/2026 à 10:05, Stephanie MAHEVAS a écrit : > > Bonjour > > merci beaucoup Eric pour la correction de l'erreur dans l'export. > > Question restante... pourquoi je n'ai pas dans les résultats la matrice > FishingMortality ? >
-- Éric Chatellier - www.codelutin.com <http://www.codelutin.com> - 02.40.50.29.28
_______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org https://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users Archives et moteur de recherche: http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/
-- *Antoine RICOUARD* (PhD) Attaché Temporaire Enseignement et Recherche Aix-Marseille Université, Université de Toulon Institut Méditerranéen d'Océanologie (MIO) Campus de Luminy 13288 Marseille Cedex 9 France
-- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ UMR MARBEC (MARine Biodiversity, Exploitation & Conservation) IRD, IFREMER, CNRS, Univ Montpellier IFREMER/LMH (Laboratoire Méditerranée Halieutique) Station Ifremer, avenue Jean Monnet, CS 30171, 34203 Sète cedex Tel: (33) 4 99 57 32 39 - 06 75 83 59 33 Salle de réunion personnelle ZOOM https://umontpellier-fr.zoom.us/j/8237835263?pwd=Y6VOgaGKn9c54T9i4c6bKmQ52M3... o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................
Bonjour, Il y a un problème avec le debug. Il fait seulement "22 octets". Le 04/06/2026 à 18:31, Stephanie MAHEVAS a écrit :
Eric,
J'ai teste avec la v4.5 et la petite Region MIMI : l'export fonctionne et le resultat FishingMortaliy est bien present
avec la base Macco, j'ai toujours le meme bug pas fichier d'export vide et pas de resultat FishingMortaliy
voici un lien vers le debug <https://filesender.renater.fr/?s=download&token=9a71ffed-e83b-4b2d-b1b5-af3e0117c360> https://filesender.renater.fr/?s=download&token=9a71ffed-e83b-4b2d-b1b5-af3e0117c360
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Bonjour Eric, Je serai intéressé d'avoir une réponse à cette question. Tu pourras trouver le dossier zippé d'une simulation réalisée avec la base macco sur le lien suivant : https://amubox.univ-amu.fr/s/nsbzQQ4stFrdTsX On voit bien que la matrice FishingMortality n'apparaît pas dans les résultats, ce qui est probablement lié avec le fait que l'export de la mortalité par pêche par zone par mois soit vide (pas de données, seulement les titres de colonnes). Merci de ton aide, Antoine Le jeu. 4 juin 2026 à 19:40, Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> a écrit :
Bonjour,
Il y a un problème avec le debug. Il fait seulement "22 octets".
Le 04/06/2026 à 18:31, Stephanie MAHEVAS a écrit :
Eric,
J'ai teste avec la v4.5 et la petite Region MIMI : l'export fonctionne
et le
resultat FishingMortaliy est bien present
avec la base Macco, j'ai toujours le meme bug pas fichier d'export vide et pas de resultat FishingMortaliy
voici un lien vers le debug < https://filesender.renater.fr/?s=download&token=9a71ffed-e83b-4b2d-b1b5-af3e0117c360>
https://filesender.renater.fr/?s=download&token=9a71ffed-e83b-4b2d-b1b5-af3e0117c360
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Rebonjour, En fait, il n'y a pas d'erreur dans la simulation. J'ai plutôt l'impression que lorsque l'on utilise le simulateur par cellule (SimulatorEffortByCell), ce résultat ne semble pas calculé. Cela semble calculer un autre résultat "matrixFishingMortalityPerCell" à la place. Le 11/06/2026 à 11:42, Antoine Ricouard a écrit :
Bonjour Eric,
Je serai intéressé d'avoir une réponse à cette question. Tu pourras trouver le dossier zippé d'une simulation réalisée avec la base macco sur le lien suivant : https://amubox.univ-amu.fr/s/nsbzQQ4stFrdTsX On voit bien que la matrice FishingMortality n'apparaît pas dans les résultats, ce qui est probablement lié avec le fait que l'export de la mortalité par pêche par zone par mois soit vide (pas de données, seulement les titres de colonnes). Merci de ton aide,
-- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28
Bonsoir, Dans ce cas, existe-t-il un export de la mortalité par cellule ? Dans le cas contraire est-il possible d'en coder un ? Merci beaucoup, Antoine Le jeu. 11 juin 2026 à 17:51, Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> a écrit :
Rebonjour,
En fait, il n'y a pas d'erreur dans la simulation.
J'ai plutôt l'impression que lorsque l'on utilise le simulateur par cellule (SimulatorEffortByCell), ce résultat ne semble pas calculé.
Cela semble calculer un autre résultat "matrixFishingMortalityPerCell" à la place.
Bonjour Eric,
Je serai intéressé d'avoir une réponse à cette question. Tu pourras
Le 11/06/2026 à 11:42, Antoine Ricouard a écrit : trouver le
dossier zippé d'une simulation réalisée avec la base macco sur le lien suivant : https://amubox.univ-amu.fr/s/nsbzQQ4stFrdTsX On voit bien que la matrice FishingMortality n'apparaît pas dans les résultats, ce qui est probablement lié avec le fait que l'export de la mortalité par pêche par zone par mois soit vide (pas de données, seulement les titres de colonnes). Merci de ton aide,
-- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28
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salut Pour créer un export, il faut d'abord créer la matrice résultat dont tu as besoin (dans isis-database>resultinfos) ici MatrixFishingMortalityPerCell.java (attaché) puis tu peux créer l'export ici FishingMortalityPopZoneMoisPerCell.java (attaché) je n'avais pas isis d'ouvert donc il faut tester si ca compile et si ca donne le bon resultat (par rapport à l'autre export, j'ai prisle resultat MatrixFishingMortalityPerCell et à qq trucs pres, j'ai simplement ajouté la somme sur les cellules de la zone ) a+ Steph Le 11/06/2026 à 19:04, Antoine Ricouard a écrit :
Bonsoir,
Dans ce cas, existe-t-il un export de la mortalité par cellule ? Dans le cas contraire est-il possible d'en coder un ? Merci beaucoup,
Antoine
Le jeu. 11 juin 2026 à 17:51, Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> a écrit :
Rebonjour,
En fait, il n'y a pas d'erreur dans la simulation.
J'ai plutôt l'impression que lorsque l'on utilise le simulateur par cellule (SimulatorEffortByCell), ce résultat ne semble pas calculé.
Cela semble calculer un autre résultat "matrixFishingMortalityPerCell" à la place.
Le 11/06/2026 à 11:42, Antoine Ricouard a écrit : > Bonjour Eric, > > Je serai intéressé d'avoir une réponse à cette question. Tu pourras trouver le > dossier zippé d'une simulation réalisée avec la base macco sur le lien suivant > : https://amubox.univ-amu.fr/s/nsbzQQ4stFrdTsX > On voit bien que la matrice FishingMortality n'apparaît pas dans les > résultats, ce qui est probablement lié avec le fait que l'export de la > mortalité par pêche par zone par mois soit vide (pas de données, seulement les > titres de colonnes). > Merci de ton aide, > -- Éric Chatellier - www.codelutin.com <http://www.codelutin.com> - 02.40.50.29.28
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Salut Stéphanie, Merci ! Je viens de tester, les scripts compilent correctement mais lors d'une simulation, au lieu d'une matrice F par cellule, on obtient une "MatrixNoActivity" et dans les exports, toujours un fichier vide de données, contenant seulement les titres des colonnes. Bonne journée, Antoine Le jeu. 11 juin 2026 à 21:21, Stephanie MAHEVAS < Stephanie.Mahevas@ifremer.fr> a écrit :
salut
Pour créer un export, il faut d'abord créer la matrice résultat dont tu as besoin (dans isis-database>resultinfos)
ici MatrixFishingMortalityPerCell.java (attaché)
puis tu peux créer l'export
ici FishingMortalityPopZoneMoisPerCell.java (attaché)
je n'avais pas isis d'ouvert donc il faut tester si ca compile et si ca donne le bon resultat (par rapport à l'autre export, j'ai prisle resultat MatrixFishingMortalityPerCell et à qq trucs pres, j'ai simplement ajouté la somme sur les cellules de la zone )
a+
Steph Le 11/06/2026 à 19:04, Antoine Ricouard a écrit :
Bonsoir,
Dans ce cas, existe-t-il un export de la mortalité par cellule ? Dans le cas contraire est-il possible d'en coder un ? Merci beaucoup,
Antoine
Le jeu. 11 juin 2026 à 17:51, Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> a écrit :
Rebonjour,
En fait, il n'y a pas d'erreur dans la simulation.
J'ai plutôt l'impression que lorsque l'on utilise le simulateur par cellule (SimulatorEffortByCell), ce résultat ne semble pas calculé.
Cela semble calculer un autre résultat "matrixFishingMortalityPerCell" à la place.
Bonjour Eric,
Je serai intéressé d'avoir une réponse à cette question. Tu pourras
Le 11/06/2026 à 11:42, Antoine Ricouard a écrit : trouver le
dossier zippé d'une simulation réalisée avec la base macco sur le lien suivant : https://amubox.univ-amu.fr/s/nsbzQQ4stFrdTsX On voit bien que la matrice FishingMortality n'apparaît pas dans les résultats, ce qui est probablement lié avec le fait que l'export de la mortalité par pêche par zone par mois soit vide (pas de données, seulement les titres de colonnes). Merci de ton aide,
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Bonjour Eric, J'ai fait une tentative d'export de la mortalité par cellule : même problème, j'obtiens un fichier vide dans les exports. Dans les résultats, pas de matrice de mortalité par cellule mais une "MatrixNoActivity". Le dossier de la simulation se trouve ici : https://amubox.univ-amu.fr/s/SotH7GtgKnDBF6o Peux-tu me dire ce qui ne va pas ? Merci beaucoup, Antoine Le jeu. 11 juin 2026 à 17:51, Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> a écrit :
Rebonjour,
En fait, il n'y a pas d'erreur dans la simulation.
J'ai plutôt l'impression que lorsque l'on utilise le simulateur par cellule (SimulatorEffortByCell), ce résultat ne semble pas calculé.
Cela semble calculer un autre résultat "matrixFishingMortalityPerCell" à la place.
Bonjour Eric,
Je serai intéressé d'avoir une réponse à cette question. Tu pourras
Le 11/06/2026 à 11:42, Antoine Ricouard a écrit : trouver le
dossier zippé d'une simulation réalisée avec la base macco sur le lien suivant : https://amubox.univ-amu.fr/s/nsbzQQ4stFrdTsX On voit bien que la matrice FishingMortality n'apparaît pas dans les résultats, ce qui est probablement lié avec le fait que l'export de la mortalité par pêche par zone par mois soit vide (pas de données, seulement les titres de colonnes). Merci de ton aide,
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