[Isis-fish-users] Calibration

Mar 6 Juin 15:34:47 CEST 2023

Bonjour les "ISISusers", c'est encore moi ! 

Voici l'objet de ma nouvelle bouteille à la mer : 

J'essaye de réaliser la calibration des accessibilités d'une espèce de
raie (Raja clavata). Dans mon modèle, la population n'a qu'un groupe
(groupe 0). Il y a une erreur dans la simulation 31 sur les 55 de la
première génération : 

2023-06-06 12:57:08,299 ERROR [SimThread Calib_Raja_2015_AlGen_Prep_i31]
(SqlExceptionHelper.java:142) logExceptions - Table "POPULATION" non
trouvée
Table "POPULATION" not found; SQL statement:
select population0_.topiaId as topiaid1_11_, population0_.topiaVersion
as topiaver2_11_, population0_.topiaCreateDate as topiacre3_11_,
population0_.name as name4_11_, population0_.geographicId as
geograph5_11_, population0_.plusGroup as plusgrou6_11_,
population0_.growth as growth7_11_, population0_.growthReverse as
growthre8_11_, population0_.comment as comment9_11_,
population0_.meanWeight as meanwei10_11_, population0_.price as
price11_11_, population0_.naturalDeathRate as natural12_11_,
population0_.fishingMortalityOtherFleets as fishing13_11_,
population0_.caractBioComment as caractb14_11_,
population0_.reproductionEquation as reprodu15_11_,
population0_.monthGapBetweenReproRecrutement as monthga16_11_,
population0_.recruitmentDistribution_name as recruit17_11_,
population0_.recruitmentDistribution_dim as recruit18_11_,
population0_.recruitmentDistribution_dimNames as recruit19_11_,
population0_.recruitmentDistribution_semantics as recruit20_11_,
population0_.recruitmentDistribution_data as recruit21_11_,
population0_.recruitmentEquation as recruit22_11_,
population0_.recruitmentComment as recruit23_11_,
population0_.zonesComment as zonesco24_11_, population0_.seasonsComment
as seasons25_11_, population0_.capturabilityComment as captura26_11_,
population0_.migrationComment as migrati27_11_,
population0_.mappingZoneReproZoneRecru_name as mapping28_11_,
population0_.mappingZoneReproZoneRecru_dim as mapping29_11_,
population0_.mappingZoneReproZoneRecru_dimNames as mapping30_11_,
population0_.mappingZoneReproZoneRecru_semantics as mapping31_11_,
population0_.mappingZoneReproZoneRecru_data as mapping32_11_,
population0_.capturability_name as captura33_11_,
population0_.capturability_dim as captura34_11_,
population0_.capturability_dimNames as captura35_11_,
population0_.capturability_semantics as captura36_11_,
population0_.capturability_data as captura37_11_,
population0_.capturabilityEquationUsed as captura38_11_,
population0_.capturabilityEquation as captura39_11_,
population0_.maturityOgiveEquation as maturit40_11_,
population0_.reproductionRateEquation as reprodu41_11_,
population0_.fbarGroupMin as fbargro42_11_, population0_.fbarGroupMax as
fbargro43_11_, population0_.abundanceReferenceMonth as abundan44_11_,
population0_.computeFOnLandings as compute45_11_, population0_.species
as species46_11_ from population population0_ where population0_.name=?
limit ? [42102-199]
2023-06-06 12:57:08,306 ERROR [SimThread Calib_Raja_2015_AlGen_Prep_i31]
(InProcessSimulatorLauncher.java:483) localSimulateSameThread - Error
during simulation
javax.persistence.PersistenceException:
org.hibernate.exception.SQLGrammarException: could not prepare statement

Cela évoque-t-il quelque chose à quelqu'un ?  

Ci-joint également : 

* les debugs : pbs, R, et le debug ISIS contenant l'erreur (les autres
n'en contiennent pas, a priori) 

* les deux règles utilisées lors de la calibration 

* la region utilisée 

* les répertoires master et data_calib utilisés 

* le script R "calibr_run" 

* le script main 

* la simu isis préparée 

Merci pour toute aide :)
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Nom : debugPBS_raja2015.log
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Nom : debugPBS_raja2015.log
URL : <http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/attachments/20230606/84c7c234/attachment-0005.log>
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Nom: Calib_Raja_2015_AlGen_Prep.zip
Type: application/zip
Taille: 1245409 octets
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Nom: calibr_main_raja2015.pbs
Type: text/x-shellscript
Taille: 3777 octets
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Nom : calibr_run_raja2015.R
URL : <http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/attachments/20230606/84c7c234/attachment-0005.ksh>
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Nom: MACCO_BoB_MixFish_2015Inf_09Mai2023.zip
Type: application/zip
Taille: 1117823 octets
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