[Isis-fish-users] Nouvelle année, nouvelles questions

Stephanie MAHEVAS Stephanie.Mahevas at ifremer.fr
Lun 8 Jan 11:50:34 CET 2024


Le 08/01/2024 à 11:46, Stephanie MAHEVAS a écrit :
>
> hello
>
> Le 08/01/2024 à 11:12, aricouar a écrit :
>> Isissiennes, isissiens,
>>
>> Bonjour et bonne année 2024 ! Je vous souhaite des simulations 
>> réussies et tout le bonheur possible dans vos vies réelles et 
>> personnelles.
>>
>> Pour attaquer cette nouvelle année du bon pied, je modifie les 
>> équations de reproduction (ou de recrutement, c'est selon) des 
>> espèces de mon modèle pour y intégrer des relations stock-recrutement 
>> à partir d'un certain nombre d'années de simulation. Cela implique de 
>> calculer la biomasse reproductrice.
>>
>> Pour la sole (déjà codée par Audric) cela compile bien. Voici comment 
>> est calculée cette biomasse pour cette espèce:
>>
>> for (Zone zone:zoneRepro){
>>         for (PopulationGroup cr : groups){
>>                      ssb += cr.getMaturityOgive()*N.getValue(cr,zone) 
>> * cr.getMeanWeight() *prepro ;
>>          }
>>     }
>>
>
>>
>> (je ne sais pas où sont définies les variables prepro et N).
>
> prepro est le vecteur de distribution de la repro dans la saison de 
> reproduction (onglet saison). C'est cette valeur qui etait à 0 pour la 
> sole...
>
> N est l'abondance (MatrixAbundance) calculée par ISIS
>
>>
>> Pour la cardine (Lepidorhombus whiffiagonis) qui n'avait pas déjà de 
>> relation stock-recrutement, par contre, j'ai recopié ces lignes de 
>> codes (l. 29-33 dans la nouvelle équation) et cela ne compile plus. 
>> Quelle est la bonne syntaxe a adopter ?
> Les variables auxquelles on a accès dans eq repro et eq recrutement ne 
> sont pas les memes
>
> je t'appelle
>
> steph
>
>>
>> Ci-joint la base sur laquelle je travaille actuellement.
>>
>> Merci beaucoup, à bientôt,
>>
>> Antoine
>>
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