October 2021 - Cantharella-devel - mailman.cloud.codelutin.com

Mise à jour de la demo
by Jean Couteau Oct. 27, 2021

Oct. 27, 2021

Sylvain, j'ai déployé une nouvelle version en demo qui corrige quasiment tous les points relevés (si j'ai rien oublié). Il restera : - le tout sélectionner - la carte qui passe par dessus le texte Quelques petites remarques sur tes questions : - Les références et numDepot sont limitées à 10 caractères en base, nous avons donc intégré le contrôle dans les imports - le code Inchi invalide est déclaré comme tel par la librairie utilisée (https://cdk.github.io/index.html) du coup je ne sais pas trop quoi dire. Jean NB : Penses bien à vider ton cache navigateur pour tester

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Re: [Cantharella-devel] Tests 18/10/2021> Affichage sur la carte
by Sylvain PETEK Oct. 23, 2021

Oct. 23, 2021

Bonjour à tous, Au niveau de la Recherche, concernant l'affichage des résultats sur la carte (stations, spécimens et échantillons), Il faudrait pouvoir les afficher tous, car à l'usage ça perd beaucoup de son intérêt (et c'est très déroutant) si on n'a qu'un affichage partiel. Merci d'avance, Bonne journée, Sylvain -----Message d'origine----- De : Cantharella-devel <cantharella-devel-bounces(a)list.forge.codelutin.com> De la part de Jean Couteau Envoyé : mardi 19 octobre 2021 17:46 À : cantharella-devel(a)list.forge.codelutin.com Objet : Re: [Cantharella-devel] Tests 18/10/2021 Bonjour, je n'ai pas encore travaillé sur ces retours, mais je peux déjà répondre sur plusieurs points : Le Mon, 18 Oct 2021 18:18:42 +0200, "Sylvain PETEK " <sylvain.petek(a)ird.fr> a écrit : > Ø Tests au niveau de la Recherche de données : > > o J’ai fait une recherche * + pays = Polynésie française : > > § Au niveau de la carte il manque beaucoup de stations : 18 affichées > < > 589 dans le tableau Tu n'en a que 18 dans le tableau, les autres ne sont pas affichées. Il faudrait tout remonter pour les afficher. Nous en avions déjà parlé pendant la démo. > Ø Interface Campagne : BSM-FIDJI > > o au niveau de la carte, des stations sont manquantes : > > > Campagne BSM-FIDJI : > > Google Earth à partir du fichier GPS stocké sur la fiche Campagne : > Si tu regardes bien elles sont toutes présentes, mais les Fidji sont à cheval sur la démarcation E/W et tu as 2 lots de marqueurs : ceux de l'ouest et ceux de l'est. Malheureusement, on ne pourra pas faire grand chose pour ça. Jean _______________________________________________ Cantharella-devel mailing list Cantharella-devel(a)list.forge.codelutin.com http://list.forge.codelutin.com/cgi-bin/mailman/listinfo/cantharella-devel

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Tests 22/10/2021
by Sylvain PETEK Oct. 23, 2021

Oct. 23, 2021

Bonjour à tous, Voici ce que j'ai noté aujourd’hui 22/10, avec les fichiers correspondants : Ø Test fonction d’import Station : o à partir du fichier : ListStationsPageHeaders-Essai3.csv § Dans ce fichier, j’ai mis O pour la longitude > l’erreur n’est pas détectée et l’import est effectué mais les données de longitude ne sont pas enregistrées : § Détecte bien une station déjà existante o à partir du fichier : ListStationsPageHeaders-Essai4.csv § Détecte bien si Lat > 90 et si Long > 180 § Import réussi d’un fichier >90ko (plus de 100 lignes) § Quand on souhaite visualiser les stations importées via la Recherche sur essai* Toutes les stations ne sont pas affichées ce que l’on remarque par ces trous dans la série, et ce même en faisant une recherche dans la zone, pour laquelle je devrais avoir 24 stations Ø Test fonction d’import Spécimen : o A partir du fichier ListSpecimensPageHeaders-Essai1.csv § La longueur du numDepot est limitée à 10 caractères, c’est normal ? Serait-il possible d’augmenter le nb de caractère ? o A partir du fichier ListSpecimensPageHeaders-Essai2b.csv § La longueur de la référence est limitée à 10 caractères, c’est normal ? Serait-il possible d’augmenter le nb de caractère ? § Le message est en anglais Ø Test fonction d’import Lot : o A partir du fichier ListLotsPageHeaders-Essai5.csv § Signale bien la partie qu’il ne trouve pas > Serait-il possible d’ajouter un ‘ pour avoir n’a à la place de na dans le message d’erreur o A partir du fichier ListLotsPageHeaders-Essai5a.csv § L’import des 168 lignes se fait bien Ø Test fonction d’import Extraction : o A partir du fichier ListExtractionsPageHeaders-Essai1.csv § L’import se fait bien o A partir du fichier ListExtractionsPageHeaders-Essai2.csv > Erreur interne o A partir du fichier ListExtractionsPageHeaders-Essai3.csv > Erreur interne o A partir du fichier ListExtractionsPageHeaders-Essai5.csv § Détecte bien que les extraits existent déjà o A partir du fichier ListExtractionsPageHeaders-Essai6.csv § Dans ce fichier, j’ai une erreur au niveau du N° de manip (j’ai 2 fois le même N°) il faudrait modifier le message d’erreur ci-dessous pour l’associer au N° de manip, pour avoir qqchose du type : « L3 : un extrait du même type a déjà été associé à l’extraction ‘SPESS04’ » o A partir du fichier ListExtractionsPageHeaders-Essai7.csv § Dans ce fichier, j’ai une « erreur » au niveau de la Masse à extraire (pour la même manip. la masse à extraire est différente entre la 1ere et la 2e ligne) et le système enregistre la première valeur… > Est-ce qu’il serait possible qu’il y ait un contrôle à ce niveau, la masse devant être la même entre toutes les lignes d’une même manip ? Ø Test fonction d’import Molécules : o A partir du fichier ListMoleculesPageHeaders-Essai5.csv § J’ai l’erreur ci-dessous concernant le code InChI, alors que j’ai fait un copier-coller d’un code InChI valide… Je ne sais pas d’où vient l’erreur Merci d’avance, Bonne journée, Sylvain

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Tests 19/10/2021
by Sylvain PETEK Oct. 19, 2021

Oct. 19, 2021

Bonjour à tous, Voici ce que j'ai noté aujourd’hui 19/10: Ø Au niveau d’un document précédemment enregistré, j’ai voulu modifier sa fiche pour changer le type de document > Erreur interne à la validation Ø Au niveau de la Recherche de documents: o Je fais une recherche sur Suberea + pays = Polynésie française § Il me sort bien les photos des organismes § Si je clique sur une colonne pour la trier > Erreur interne Ø Au niveau de la Recherche : o Je fais une recherche sur les stations en saisissant : SR1? > il ne me sort aucun résultat alors que je devrais avoir SR10 et SR11 Ø Connecté en tant qu’utilisateur Sylvain PETEK UT : o Je fais une recherche sur Wallis* : § Au niveau des données rien ne sort > Normal (je n’ai pas les droits sur Wallis 2018) § Au niveau des documents : les docs de la Campagne Wallis 2018 apparaissent alors que je n’ai pas les droits dessus >> et j’arrive à aller sur la fiche campagne Wallis 2018 Merci d’avance, Bonne soirée, Sylvain

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Tests 18/10/2021
by Sylvain PETEK Oct. 19, 2021

Oct. 19, 2021

Bonjour à tous, Suite des tests à différents niveaux, voici ce que j'ai noté aujourd’hui 18/10: Ø Tests au niveau de la Recherche de données : o J’ai fait une recherche * + pays = Polynésie française : § Au niveau de la carte il manque beaucoup de stations : 18 affichées < > 589 dans le tableau § Il n’y a aucun résultat pour: · Purifications · Tests biologiques · Molécules Même en ayant reconstruit l’index (alors que ça sort sur l’instance IRD). Ø Tests au niveau de la Recherche de documents: o Serait-il possible d’ajouter sur chaque tableau de résultats, une case permettant de sélectionner tous les documents d’un tableau d’un coup, pour pouvoir procéder à l’export Zip plus facilement? o Quand on fait une recherche sur un type de document, exemple : « Photo in situ », après avoir cliqué sur Rechercher, le champ « Type de document » est remis sur le premier de la liste à savoir « Article » > Serait-il possible qu’il reste sur le choix du document qui vient d’être fait, plutôt que de le réinitialiser ? o De la même manière que pour les tableaux de données, serait-il possible de mettre les liens quand ils existent pour les stations, spécimens, lots, etc… ? o L’export en Zip marche bien o Le visionnage des images fonctionne bien : la visionneuse permet de parcourir les images présentes sur la page quel que soit le tableau. Est-il possible de modifier ce comportement, pour que la visionneuse enchaine vers les photos de la page suivante d’un tableau, plutôt que d’enchainer sur les images du tableau suivant sur la page ? o J’ai fait une recherche * + pays = Polynésie française, et je suis passé sur l’onglet Recherche de Documents : § Il manque des résultats au niveau de : · Campagnes : 1 document alors que je devrais en avoir plus de 25 · Purifications : 0 document alors que je devrais en avoir ~5 · Tests biologiques : 0 document alors que je devrais en avoir au moins 1 · Molécules : 0 document alors que je devrais en avoir ~12-13 § Au niveau de Stations, Spécimens quand j’ai voulu passer à la page 2 > Erreur Interne o Recherche de Documents, pour BSM-FIDJI (et pour d’autres noms de Campagne) > Erreur interne o J’ai lancé une recherche directement dans l’onglet Recherche de documents, avec * et Type de document = Article > Erreur interne Ø Interface Station : o La carte vient chevaucher/masquer le texte : Demo : Cantharella IRD : Ø Interface Campagne : BSM-FIDJI o au niveau de la carte, des stations sont manquantes : Campagne BSM-FIDJI : Google Earth à partir du fichier GPS stocké sur la fiche Campagne : o Le lien pour exporter en PNG ne fonctionne pas Merci d’avance, Bonne soirée, Sylvain

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Retours sur les tests
by Jean Couteau Oct. 18, 2021

Oct. 18, 2021

Sylvain, voici tous mes retours sur tes tests. L'instance de démo est à jours avec ces modifications (et les soucis de disponibilité corrigés). Il ne reste que : - le rafraichissement des interfaces - le soucis dans le tableau molecules. A noter que si tu cliques sur l'import (sans avoir de fichier), cela rafraichit la page et le problème disparait (c'est un contournement pour les tests, il nous faudra corriger la cause). # Fonction d’import <> fichier CSV : - Personnes : essai import du fichier ListPersonnesPageHeaders-Essai1.csv > Erreur interne -> Corrigé - Stations : essai import fichier ListStationsPageHeaders-Essai1.csv o le code pays est demandé > de quel code s’agit-il ? Peut-être mettre un lien vers la liste des codes pays, après l’info bulle ? -> Lien vers la liste ISO des code pays ajoutée (sur tous les imports, concerne également les personnes par exemple o Au niveau de la longitude il n’accepte pas O, voir si possible d’ajouter O, ou alors changer l’entête de la colonne pour mettre E/W à la place de E/O -> J'ai changé l'entête de la colonne, la valeur déjà utilisée étant W (cela conservera la cohérence) o Pour long/lat, au niveau du message d’erreur, préciser le champ qui génère l’erreur -> c'est déjà le cas, qu'est ce qui pose problème ? o Pour le référentiel, vu qu’il n’y a qu’une seule valeur possible : WGS84, supprimer la colonne et préciser dans l’info bulle que les coordonnées sont dans ce référentiel, surtout que la saisie est « bizarre » [[WGS84]] et elle me renvoie une erreur (même en supprimant la valeur) -> Normalement WGS84 aurait dû fonctionner. Pour l'instant j'ai supprimé la colonne et ajouté dans l'info-bulle - Specimens : essai import fichier ListSpecimensPageHeaders-Essai1.csv o Le Nom et le Prénom de l’identificateur ne sont pas des champs obligatoires. Dans mon fichier je ne l’ai pas renseigné et ça me renvoie une erreur : -> Effectivement, c'est corrigé o Essai import ListSpecimensPageHeaders-Essai2.csv > Erreur interne -> Effectivement, c'est corrigé - Lots : essai import fichier ListLotsPageHeaders-Essai1.csv o Pour les champs Ech Collection, Ech Identification, Ech Phylogenie, pour lesquels on attend oui / non, au niveau du message d’erreur il faudrait préciser de quel champ il s’agit, sinon on ne sait pas forcément où se situe l’erreur. -> Modifié o essai import fichier ListLotsPageHeaders-Essai5.csv > avec 168 lignes pour 30,2 ko ça renvoie l’erreur ci-dessous concernant la taille du fichier. Peut-on augmenter cette limite ? -> Passage de la limite à 1 MB (on était déjà passé de 10 à 20kB) - Extractions : o avant d’importer un fichier, j’ai voulu cliquer sur nouvelle extraction > Erreur interne -> Je n'ai pas réussi à reproduire, sur la demo ou en local o Essai d’import du fichier ListExtractionsPageHeaders-Essai1.csv, renvoie l’erreur ci-dessous alors que je me sers du fichier d’exemple : -> Corrigé, ça m'a permis d'identifier un autre soucis que j'ai corrigé. - Purifications : essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai1.csv o Au niveau du message d’erreur il faudrait remplacer repere par Numéro fraction pour que ça corresponde au champ en question -> Modifié o Suite à l’import du fichier Purification ci-dessus, le système marque « Import effectué », mais le site « tourne en boucle » -> C'est malheureusement dû au besoin de redémarrage dont il faut que j'identifie la cause précise (il doit y avoir une connexion à la base de donnée non libérée à un endroit) o Au niveau de la purification (SPPurEs01) importée via ListPurificationsPageHeaders-Essai1.csv § Lorsque l’on consulte la Purification en question, en mode édition : les différents champs correspondant aux paramètres de la purification n’apparaissent pas (même en changeant la méthode). En essayant de saisir une nouvelle purification à la main, j’ai le même comportement. -> On n'a rien changé. A vérifier en production o Essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai2.csv > avec 133 lignes pour 38 ko ça renvoie l’erreur ci-dessous concernant la taille du fichier. Peut-on augmenter cette limite ? è Cette limitation en taille a l’air d’être générale quelle que soit la fonction d’import. -> Effectivement, cela a été passé à 1Mb pour tous les imports o Lorsque l’on vient d’importer une / des purifications, elles n’apparaissent pas dans le tableau récapitulatif des purifications. Pour les « voir » on est obligé d’aller cliquer sur Purification dans le menu pour rafraichir le tableau. è C’est un comportement général au niveau des différentes interfaces, on est obligé d’aller rafraichir manuellement pour faire apparaitre les nouvelles données. -> Reste à faire o Essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai4.csv, dans ce cas de figure j’ai donné la même Ref. Purification, pour 2 purifications différentes (2 produits différents), ce que le système détecte bien : Serait-il possible de modifier le message d’erreur pour avoir dans ce cas : « L.3 : La référence de purification ‘SPPurEs03’ a déjà été donnée pour le produit W1-F01-sf01 » -> Modifié o Essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai5.csv -> RAS o Essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai6.csv, dans ce cas de figure j’ai redonné une Réf. Fraction déjà existante dans le système > Erreur interne -> Corrigé o Essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai7.csv -> RAS - Molécules : o Au niveau du fichier CSV ou dans l’info-bulle, il faudrait préciser que pour la formule développée il faut rentrer le code InChI ? Dans le CSV on pourrait mettre « code InChI » à la place de « Formule développée » ? -> Changé dans le CSV o Essai import fichier ListMoleculesPageHeaders-Essai1.csv, il me signale l’erreur sur la campagne que j’ai rentré « Exemple » à la place de « EXEMPLE » § Serait-il possible d’éviter que la casse soit discriminante ? -> Modifié o Suite à l’import réalisé avec ListMoleculesPageHeaders-Essai2.csv, il y a un problème d’affichage des molécules dans le tableau : § A la consultation de la fiche molécule importée > Erreur interne -> Le code InChI était invalide et l'import continuait quand même -> la formule développée était nulle et ce cas n'était pas géré dans les interfaces (la formule n'est pas obligatoire en base, mais toujours renseignée donc ça n'avait pas été identifié précédemment). J'ai corrigé la gestion d'erreur. Désormais Code InChI invalide = erreur et pas d'import. o Suite à l’import réalisé avec ListMoleculesPageHeaders-Essai4.csv, en ayant supprimé le code InChI § A la consultation de la fiche molécule importée > Erreur interne -> Idem au dessus. è Pour le moment tous les imports « réussis » de molécules renvoient une erreur interne à la consultation -> Idem

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Tests 15/10/2021
by Sylvain PETEK Oct. 15, 2021

Oct. 15, 2021

Bonjour à tous, Suite des tests à différents niveaux, voici ce que j'ai noté, avec ci-joint les fichiers testés: Connecté en tant qu’utilisateur « Sylvain PETEK UT » : Ø Tests de la gestion des droits sur les fonctions d’import : - Lots : essai import fichier ListLotsPageHeaders-Essai7-droit.csv, en ayant indiqué une campagne et 2 spécimens pour lesquels je n’ai pas les droits, et dont l’une des références est en minuscule o Visiblement le spécimen qu’il ne trouve pas correspond à celui en minuscule > serait-il possible d’éviter que la casse soit discriminante ? o Pour la campagne (BSM-NC) et le premier spécimen auquel je n’ai pas accès normalement, il ne signale pas d’erreur. o Essai import fichier ListLotsPageHeaders-Essai8-droit.csv, en ayant corrigé la référence du spécimen en minuscule > l’import se fait sans erreur, alors que je n’aurai pas dû pouvoir faire l’import… § Conséquence : j’obtiens l’accès aux spécimens P214 et P216 pour lesquels je n’ai pas les droits normalement, et par voie de conséquence à leur station de prélèvement, et à la fiche campagne BSM-NC, auquel je n’avais pas accès auparavant. - D’une manière générale, il faudrait qu’il y ait une vérification des droits pour pouvoir importer des données liées à d’autres préexistantes, sinon on contourne la gestion des droits. Ø Tests Administrateur de Campagne : o Sur la campagne BSM-PF, j’ai mis Sylvain PETEK UT <https://cantharella.demo.codelutin.com/campagne/view?44-2.-Campagne.adminis…> comme administrateur. § Ca fonctionne, même si <https://cantharella.demo.codelutin.com/campagne/view?44-2.-Campagne.adminis…> Sylvain PETEK UT est en ligne, il accède bien à la fiche campagne. o Connecté en tant que Sylvain PETEK UT, pour cette campagne BSM-PF : § Lorsque j’y accède en consultation, il n’y a pas le bouton « Modifier » en bas de page pour que je puisse modifier la campagne. > Il faut que je clique dans le menu sur Campagnes pour pouvoir passer en mode édition via le tableau des campagnes. > Depuis le mode Consultation, si je clique sur « précédent » au niveau du navigateur, il ne me propose pas l’icône édition au niveau du tableau des campagnes : § Une fois en mode Edition, lorsque je souhaite ajouter des droits d’accès à qq’un, en l’occurrence PETEK U Sylvain > il ne me propose qu’une liste restreinte d’échantillons, alors qu’il y en a 70… § Si l’on va sur la fiche utilisateur de Sylvain PETEK UT, on ne visualise pas qu’il a les droits sur la campagne BSM-PF. - Lorsque je lance une recherche sur cette campagne BSM-PF en tant qu’Administrateur de campagne > le système s’est mis en défaut – inaccessible Ø Tests au niveau de la Recherche : o En faisant une recherche « * » > le système s’est mis en défaut – inaccessible (le 15/10) o Si on fait la recherche uniquement sur un/des échantillons ou une espèces> ça ne le localise pas sur la carte. § Il faudrait que les stations présentes au niveau des spécimens et des lots s’affichent sur la carte. o Au niveau de la carte affichée : § si une seule station sort à l’issue de la recherche, le zoom est trop « fort », et du coup la carte ne s’affiche pas. Il faudrait dé-zoomer d’un cran pour que la carte s’affiche. § si aucune station ne sort, le zoom est très haut, centré sur l’antarctique > serait-il possible de le redescendre un peu, avec un centrage par défaut « classique » sur l’Atlantique? § Le lien pour exporter en PNG ne fonctionne pas § Certaines stations ne sont pas affichées, par exemple ci-dessous pour une recherche sur la campagne LOF-SOCIETE, il manque 3 stations /7 au niveau de cette île, alors qu’elles apparaissent bien sur la carte de l’interface campagne, et que les stations « manquantes » figurent bien dans le tableau Stations à l’issue de la recherche. En faisant une « recherche dans la zone affichée » on arrive bien à les faire apparaître. Interface Campagne LOF-SOCIETE Recherche sur LOF-SOCIETE Ø Au niveau des cartes d’une manière générale : o Serait-il possible d’avoir un zooming « plus fin », de manière à pouvoir ajuster plus finement la carte ? o Concernant le fichier KML exporté, serait-il possible d’y faire figurer les références des stations, car sinon on ne sait pas de quelle station il s’agit o Concernant le fichier GeoJSON exporté, serait-il également possible d’y faire figurer les références des stations ? o Serait-il possible d’avoir une fonctionnalité qui permette d’afficher ou non toutes les étiquettes des stations, plutôt que de devoir cliquer une à une pour savoir de quelle station il s’agit ? o Est-ce que les fichiers PNG exportés pourraient être en 1920 x 1080 (ou un format avoisinant) ? Ø Interface Campagne (testée sur BSM-Fidji) : - Au niveau de la carte : o Serait-il possible d’aligner le bord gauche avec le bord des tableaux ? o Les étiquettes des stations ne s’affichent pas quand on clique dessus. o Serait-il possible d’avoir une fonctionnalité qui permette d’afficher ou non toutes les étiquettes des stations, plutôt que de devoir cliquer une à une pour savoir de quelle station il s’agit ? Ø Interface Station (testée sur PFS04) : - Au niveau de la carte : o Quand il n’y a pas de coordonnées GPS, la carte ne s’affiche pas, et il y a malgré tout les liens (qui lorsque l’on clique dessus renvoient vers la page d’accueil) o En l’absence de coordonnées GPS, serait-il possible d’afficher la carte en la centrant sur le pays (qui est une donnée obligatoire), sans repère ? Ø Interface Molécule : o Serait-il possible de mettre la barre d’outil de ChemDoodle au-dessus de la fenêtre ? Ø Problème d’affichage du menu : A plusieurs reprises, en accédant à une interface (sous Firefox et/ou Edge), je me suis retrouvé avec un problème d’affichage du Menu comme ci-dessous, qui ne se solutionne pas en rafraichissant la page : Ø Ajout de documents >1Mo et < 5Mo réussi Merci d’avance, Bonne fin de journée et bon WE, Sylvain

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Tests 13/10/2021 : Fcts import
by Sylvain PETEK Oct. 14, 2021

Oct. 14, 2021

Bonjour à tous, Suite des tests au niveau des fonctions d'import : Voici ce que j'ai noté, avec ci-joint les fichiers testés: - Purifications : o Au niveau de la purification (SPPurEs01 <https://cantharella.demo.codelutin.com/purification/list?3-1.-ListPurificat…> ) importée via ListPurificationsPageHeaders-Essai1.csv § Toutes les fractions ont bien été importées et on peut en rajouter à la main si besoin § Lorsque l’on consulte la Purification en question, en mode édition : les différents champs correspondant aux paramètres de la purification n’apparaissent pas (même en changeant la méthode). En essayant de saisir une nouvelle purification à la main, j’ai le même comportement. Demo Cantharella (IRD) o Essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai2.csv > avec 133 lignes pour 38 ko ça renvoie l’erreur ci-dessous concernant la taille du fichier. Peut-on augmenter cette limite ? è Cette limitation en taille a l’air d’être générale quelle que soit la fonction d’import. o Lorsque l’on vient d’importer une / des purifications, elles n’apparaissent pas dans le tableau récapitulatif des purifications. Pour les « voir » on est obligé d’aller cliquer sur Purification dans le menu pour rafraichir le tableau. è C’est un comportement général au niveau des différentes interfaces, on est obligé d’aller rafraichir manuellement pour faire apparaitre les nouvelles données. o Essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai4.csv, dans ce cas de figure j’ai donné la même Ref. Purification, pour 2 purifications différentes (2 produits différents), ce que le système détecte bien : Serait-il possible de modifier le message d’erreur pour avoir dans ce cas : « L.3 : La référence de purification ‘SPPurEs03’ a déjà été donnée pour le produit W1-F01-sf01 » o Essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai5.csv § L’import de plusieurs purifications différentes au sein d’un même fichier fonctionne § Le système prend bien en compte les purifications déjà saisies/importées précédemment (essai d’import du même fichier) o Essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai6.csv, dans ce cas de figure j’ai redonné une Réf. Fraction déjà existante dans le système > Erreur interne o Essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai7.csv § Les différentes erreurs du fichier ont bien été remontées - Molécules : o Au niveau du fichier CSV ou dans l’info-bulle, il faudrait préciser que pour la formule développée il faut rentrer le code InChI ? Dans le CSV on pourrait mettre « code InChI » à la place de « Formule développée » ? o Essai import fichier ListMoleculesPageHeaders-Essai1.csv, il me signale l’erreur sur la campagne que j’ai rentré « Exemple » à la place de « EXEMPLE » § Serait-il possible d’éviter que la casse soit discriminante ? o Suite à l’import réalisé avec ListMoleculesPageHeaders-Essai2.csv, il y a un problème d’affichage des molécules dans le tableau : § A la consultation de la fiche molécule importée > Erreur interne o Suite à l’import réalisé avec ListMoleculesPageHeaders-Essai4.csv, en ayant supprimé le code InChI § A la consultation de la fiche molécule importée > Erreur interne è Pour le moment tous les imports « réussis » de molécules renvoient une erreur interne à la consultation Voilà pour le moment le tour des tests sur les fonctions d’import. Bonne AM, Sylvain

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Démo Cantharella > non accessible
by Sylvain PETEK Oct. 13, 2021

Oct. 13, 2021

Bonjour, J'ai essayé de me reconnecter ce matin, le système tourne en boucle. Merci d'avance pour votre intervention. Bonne journée, Sylvain -----Message d'origine----- De : Cantharella-devel <cantharella-devel-bounces(a)list.forge.codelutin.com> De la part de Jean Couteau Envoyé : mardi 12 octobre 2021 11:47 À : cantharella-devel(a)list.forge.codelutin.com Objet : [Cantharella-devel] Démo Cantharella disponible Bonjour Sylvain, nous avons terminé les développements et avons mis en place une instance de demo sur laquelle tu as déjà un compte (ce sont d'anciennes données de prod donc ça doit être tes identifiants de prod) : https://cantharella.demo.codelutin.com Tu peux maintenant effectuer les tests. N'hésite pas à nous poser des questions si besoin ou remonter les soucis rencontrés. Bonne journée. Jean _______________________________________________ Cantharella-devel mailing list Cantharella-devel(a)list.forge.codelutin.com http://list.forge.codelutin.com/cgi-bin/mailman/listinfo/cantharella-devel

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Premiers Tests : Fcts import
by Sylvain PETEK Oct. 12, 2021

Oct. 12, 2021

Bonjour à tous, Je reviens vers vous suite à une première série de tests, au niveau des fonctions d'import. Voici ce que j'ai noté, avec ci-joint les fichiers testés: Ø Fonction d’import <> fichier CSV : - Personnes : essai import du fichier ListPersonnesPageHeaders-Essai1.csv > Erreur interne - Stations : essai import fichier ListStationsPageHeaders-Essai1.csv o le code pays est demandé > de quel code s’agit-il ? Peut-être mettre un lien vers la liste des codes pays, après l’info bulle ? o Au niveau de la longitude il n’accepte pas O, voir si possible d’ajouter O, ou alors changer l’entête de la colonne pour mettre E/W à la place de E/O o Pour long/lat, au niveau du message d’erreur, préciser le champ qui génère l’erreur o Pour le référentiel, vu qu’il n’y a qu’une seule valeur possible : WGS84, supprimer la colonne et préciser dans l’info bulle que les coordonnées sont dans ce référentiel, surtout que la saisie est « bizarre » [[WGS84]] et elle me renvoie une erreur (même en supprimant la valeur) - Specimens : essai import fichier ListSpecimensPageHeaders-Essai1.csv o Le Nom et le Prénom de l’identificateur ne sont pas des champs obligatoires. Dans mon fichier je ne l’ai pas renseigné et ça me renvoie une erreur : o Essai import ListSpecimensPageHeaders-Essai2.csv > Erreur interne - Lots : essai import fichier ListLotsPageHeaders-Essai1.csv o Pour les champs Ech Collection, Ech Identification, Ech Phylogenie, pour lesquels on attend oui / non, au niveau du message d’erreur il faudrait préciser de quel champ il s’agit, sinon on ne sait pas forcément où se situe l’erreur. o essai import fichier ListLotsPageHeaders-Essai5.csv > avec 168 lignes pour 30,2 ko ça renvoie l’erreur ci-dessous concernant la taille du fichier. Peut-on augmenter cette limite ? o Prend bien en compte : § Que les dates ne peuvent pas être dans le futur § Quand une référence de lot existe déjà - Extractions : o avant d’importer un fichier, j’ai voulu cliquer sur nouvelle extraction > Erreur interne o Essai d’import du fichier ListExtractionsPageHeaders-Essai1.csv, renvoie l’erreur ci-dessous alors que je me sers du fichier d’exemple : - Purifications : essai import fichier ListPurificationsPageHeaders-Essai1.csv o Prend bien en compte : § Que le N° de fraction doit être unique o Au niveau du message d’erreur il faudrait remplacer repere par Numéro fraction pour que ça corresponde au champ en question o Suite à l’import du fichier Purification ci-dessus, le système marque « Import effectué », mais le site « tourne en boucle » Voilà pour aujourd’hui. Bonne fin de journée, Sylvain

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