May 2013 - Cantharella-commits - mailman.cloud.codelutin.com

r235 - trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/personne
by echatellier＠users.forge.codelutin.com 29 May '13

29 May '13

Author: echatellier Date: 2013-05-29 10:49:38 +0200 (Wed, 29 May 2013) New Revision: 235 Url: http://forge.codelutin.com/projects/cantharella/repository/revisions/235 Log: Make personn list table exportable Added: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/personne/TypeDroitColumn.java Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/personne/ListPersonnesPage.java Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/personne/ListPersonnesPage.java =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/personne/ListPersonnesPage.java 2013-05-28 13:05:00 UTC (rev 234) +++ trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/personne/ListPersonnesPage.java 2013-05-29 08:49:38 UTC (rev 235) @@ -38,6 +38,7 @@ import nc.ird.cantharella.web.utils.CallerPage; import nc.ird.cantharella.web.utils.columns.LinkPropertyColumn; import nc.ird.cantharella.web.utils.columns.LinkableImagePropertyColumn; +import nc.ird.cantharella.web.utils.data.TableExportToolbar; import nc.ird.cantharella.web.utils.models.LoadableDetachableSortableListDataProvider; import nc.ird.cantharella.web.utils.security.AuthRole; import nc.ird.cantharella.web.utils.security.AuthRoles; @@ -135,20 +136,7 @@ } }); - columns.add(new AbstractColumn<Personne, String>(getStringModel("Utilisateur.typeDroit")) { - @Override - public void populateItem(Item<ICellPopulator<Personne>> item, String componentId, IModel<Personne> rowModel) { - String typeDroit; - if (rowModel.getObject() instanceof Utilisateur) { - Utilisateur util = (Utilisateur) rowModel.getObject(); - typeDroit = enumValueMessage(util.getTypeDroit()) - + (util.isValide() ? "" : " " + getString(getResource() + ".IsNotValid")); - } else { - typeDroit = getString(Personne.class.getSimpleName()); - } - item.add(new Label(componentId, typeDroit)); - } - }); + columns.add(new TypeDroitColumn(getStringModel("Utilisateur.typeDroit"), this)); columns.add(new DocumentTooltipColumn<Personne, String>(getStringModel("ListDocumentsPage.AttachedDocuments")) { @Override @@ -189,7 +177,8 @@ final DataTable<Personne, String> personnesDataTable = new AjaxFallbackDefaultDataTable<Personne, String>( "ListPersonnesPage.Personnes", columns, personnesDataProvider, WebContext.ROWS_PER_PAGE); - + personnesDataTable.addBottomToolbar(new TableExportToolbar(personnesDataTable, "personnes", getSession() + .getLocale())); personnesRefresh.add(personnesDataTable); } Added: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/personne/TypeDroitColumn.java =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/personne/TypeDroitColumn.java (rev 0) +++ trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/personne/TypeDroitColumn.java 2013-05-29 08:49:38 UTC (rev 235) @@ -0,0 +1,87 @@ +/* + * #%L + * Cantharella :: Web + * $Id$ + * $HeadURL$ + * %% + * Copyright (C) 2009 - 2013 IRD (Institut de Recherche pour le Developpement) and by respective authors (see below) + * %% + * This program is free software: you can redistribute it and/or modify + * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published by + * the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or + * (at your option) any later version. + * + * This program is distributed in the hope that it will be useful, + * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of + * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the + * GNU General Public License for more details. + * + * You should have received a copy of the GNU Affero General Public License + * along with this program. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. + * #L% + */ +package nc.ird.cantharella.web.pages.domain.personne; + +import java.io.Serializable; + +import nc.ird.cantharella.data.model.Personne; +import nc.ird.cantharella.data.model.Utilisateur; +import nc.ird.cantharella.web.pages.TemplatePage; + +import org.apache.wicket.extensions.markup.html.repeater.data.grid.ICellPopulator; +import org.apache.wicket.extensions.markup.html.repeater.data.table.AbstractColumn; +import org.apache.wicket.extensions.markup.html.repeater.data.table.export.IExportableColumn; +import org.apache.wicket.markup.html.basic.Label; +import org.apache.wicket.markup.repeater.Item; +import org.apache.wicket.model.IModel; +import org.apache.wicket.model.Model; + +/** + * Define TypeDroit column as exportable column. + * + * @author Eric Chatellier + */ +public class TypeDroitColumn extends AbstractColumn<Personne, String> implements + IExportableColumn<Personne, String, Serializable> { + + /** Template page. */ + protected TemplatePage templatePage; + + /** + * Constructor. + * + * @param displayModel model used to generate header text + * @param templatePage templatePage + */ + public TypeDroitColumn(IModel<String> displayModel, TemplatePage templatePage) { + super(displayModel); + this.templatePage = templatePage; + } + + /** {@inheritDoc} */ + @Override + public void populateItem(Item<ICellPopulator<Personne>> item, String componentId, IModel<Personne> rowModel) { + item.add(new Label(componentId, getDataModel(rowModel))); + } + + /** {@inheritDoc} */ + @Override + public IModel<Serializable> getDataModel(final IModel<Personne> rowModel) { + return new Model<Serializable>(rowModel) { + /** {@inheritDoc} */ + @Override + public String getObject() { + String typeDroit; + if (rowModel.getObject() instanceof Utilisateur) { + Utilisateur util = (Utilisateur) rowModel.getObject(); + typeDroit = templatePage.enumValueMessage(util.getTypeDroit()) + + (util.isValide() ? "" : " " + + templatePage.getString(templatePage.getClass().getSimpleName() + ".IsNotValid")); + } else { + typeDroit = templatePage.getString(Personne.class.getSimpleName()); + } + return typeDroit; + } + }; + } +} Property changes on: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/personne/TypeDroitColumn.java ___________________________________________________________________ Added: svn:keywords + Author Date Id Revision HeadURL

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r234 - in trunk/cantharella.web/src/main: java/nc/ird/cantharella/web/pages resources
by echatellier＠users.forge.codelutin.com 28 May '13

28 May '13

Author: echatellier Date: 2013-05-28 15:05:00 +0200 (Tue, 28 May 2013) New Revision: 234 Url: http://forge.codelutin.com/projects/cantharella/repository/revisions/234 Log: fixes #1731 : Add the page "Mentions l?\195?\169gales" Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/ImprintPage.html trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_en.properties trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_fr.properties Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/ImprintPage.html =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/ImprintPage.html 2013-05-28 12:17:05 UTC (rev 233) +++ trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/ImprintPage.html 2013-05-28 13:05:00 UTC (rev 234) @@ -38,12 +38,26 @@ <wicket:message key="ImprintPage.Hosting.Address"/> <h3><wicket:message key="ImprintPage.Reproduction"/></h3> + - <wicket:message key="ImprintPage.Reproduction.data"/> : <wicket:message key="ImprintPage.Reproduction.1"/> <wicket:message key="ImprintPage.Reproduction.2"/> <wicket:message key="ImprintPage.Reproduction.3"/> <wicket:message key="ImprintPage.Reproduction.4"/> + - <wicket:message key="ImprintPage.Reproduction.source"/> : <wicket:message key="ImprintPage.Reproduction.5"/> <wicket:message key="ImprintPage.Reproduction.6"/> + <ul> + <li><a href="http://www.hibernate.org/">Hibernate</a> : LGPL 2.1</li> + <li><a href="http://ehcache.sourceforge.net/">EHCache</a> : Apache 2.0</li> + <li><a href="http://sourceforge.net/projects/c3p0">C3P0</a> : LGPL 2.1</li> + <li><a href="http://commons.apache.org/">Apache Commons</a> - Apache 2.0</li> + <li><a href="http://www.springsource.org/">Spring</a> : Apache 2.0</li> + <li><a href="http://wicket.apache.org/">Wicket</a> : Apache 2.0</li> + <li><a href="http://maven.apache.org/">Maven</a> : Apache 2.0</li> + <li><a href="http://logging.apache.org/log4j/">Log4J</a> : Apache 2.0</li> + <li><a href="http://www.slf4j.org/">SLF4J</a> : MIT</li> + <li><a href="http://www.junit.org/">JUnit</a> : CPL 1.0</li> + </ul> <h3><wicket:message key="ImprintPage.Responsability"/></h3> <wicket:message key="ImprintPage.Responsability.1"/> @@ -86,19 +100,7 @@ <wicket:message key="ImprintPage.Credits.9.Title"/>: <wicket:message key="ImprintPage.Credits.9.Value"/> </div> - <wicket:message key="ImprintPage.Credits.Librairies"/> - <ul> - <li><a href="http://www.hibernate.org/">Hibernate</a> : LGPL 2.1</li> - <li><a href="http://ehcache.sourceforge.net/">EHCache</a> : Apache 2.0</li> - <li><a href="http://sourceforge.net/projects/c3p0">C3P0</a> : LGPL 2.1</li> - <li><a href="http://commons.apache.org/">Apache Commons</a> - Apache 2.0</li> - <li><a href="http://www.springsource.org/">Spring</a> : Apache 2.0</li> - <li><a href="http://wicket.apache.org/">Wicket</a> : Apache 2.0</li> - <li><a href="http://maven.apache.org/">Maven</a> : Apache 2.0</li> - <li><a href="http://logging.apache.org/log4j/">Log4J</a> : Apache 2.0</li> - <li><a href="http://www.slf4j.org/">SLF4J</a> : MIT</li> - <li><a href="http://www.junit.org/">JUnit</a> : CPL 1.0</li> - </ul> + </wicket:extend> </body> </html> \ No newline at end of file Modified: trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_en.properties =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_en.properties 2013-05-28 12:17:05 UTC (rev 233) +++ trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_en.properties 2013-05-28 13:05:00 UTC (rev 234) @@ -81,45 +81,46 @@ ContactPage.Send.EmailException=Problems when sending the message ImprintPage=Imprint -ImprintPage.AccessRights=Droit d'accès, de rectification, de suppression des données nominatives -ImprintPage.AccessRights.Info=Conformément à la loi n° 78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez d'un droit d'opposition (art. 26) d'accès (art. 34 à 38), de rectification (art. 36) et de suppression des données qui vous concernent. 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ImprintPage.Hosting.Address=Centre IRD de Nouméa BPA5 98848 Nouméa cedex Nouvelle Calédonie ImprintPage.Reproduction=Droits de reproduction, copyright, licence -ImprintPage.Reproduction.1=Le code source du Site, la base de données et son architecture sont propriétés de l'IRD (Le Sextant, 44, Boulevard de Dunkerque, 13572 Marseille cedex 02, France, <a href="http://www.ird.fr/">www.ird.fr</a>) -ImprintPage.Reproduction.2=Les informations diffusées sur les serveurs IRD sont la propriété de l'IRD ou leur représentation est dûment autorisée par leur auteur ou ses ayants droit. -ImprintPage.Reproduction.3=Toute copie totale ou partielle ne peut se faire sans l'accord de l'IRD ou de leur auteur. -ImprintPage.Reproduction.4=L'utilisation de ce Site et de son contenu n’est permise qu’à des fins pédagogiques, d'enseignement et de recherche pour le compte d’académique ou d'études privées par des particuliers ne donnant lieu à aucune exploitation commerciale. -ImprintPage.Reproduction.5=L'accès à ce Service est subordonné au respect des présentes Conditions Générales d’Utilisation. -ImprintPage.Reproduction.6=Cantharella est mis à votre disposition sous licence <a href="http://www.gnu.org/licenses/why-affero-gpl.html">Affero GPL</a>. +ImprintPage.Reproduction.data=Concernant les données +ImprintPage.Reproduction.1=Les informations diffusées sur les serveurs IRD sont la propriété de l'IRD (Le Sextant, 44, Boulevard de Dunkerque, 13572 Marseille cedex 02, France) et de ses partenaires où leur représentation est dûment autorisée par leur auteur ou ses ayants droit. +ImprintPage.Reproduction.2=Toute copie totale ou partielle ne peut se faire sans l'accord de l'IRD ou de leur auteur. +ImprintPage.Reproduction.3=L'utilisation de ce Site et de son contenu n'est permise qu’à des fins pédagogiques, d'enseignement et de recherche pour le compte d’académique ou d'études privées par des particuliers ne donnant lieu à aucune exploitation commerciale. +ImprintPage.Reproduction.4=L'accès à ce Service est subordonné au respect des présentes Conditions Générales d’Utilisation. +ImprintPage.Reproduction.source=Concernant la partie logicielle du système d’information +ImprintPage.Reproduction.5=Cantharella est mis à votre disposition sous licence <a href="http://www.gnu.org/licenses/why-affero-gpl.html">Affero GPL</a>. +ImprintPage.Reproduction.6=Tout le code source de ce produit est disponible sur la forge de <a href="http://forge.codelutin.com/projects/cantharella">Code Lutin</a> en vertu des licences open source des composants utilisés : ImprintPage.Responsability=Limitation de responsabilité ImprintPage.Responsability.1=Les utilisateurs sont responsables des interrogations qu'ils formulent ainsi que l'interprétation et l'utilisation qu'ils font des résultats. Ils doivent se conformer aux réglementations en vigueur et aux recommandations de la CNIL lorsque les données ont un caractère nominatif. ImprintPage.Responsability.2=L'IRD n'assure aucune garantie, de quelque nature et à quelque titre que ce soit, en rapport avec cette application informatique et son contenu. En aucun cas l'IRD ne pourra être tenu pour responsable de tout dommage, de quelque nature que ce soit, notamment perte d'exploitation, perte de données ou toute autre perte financière résultant de l'exploitation ou de l'impossibilité d'exploiter. @@ -107,7 +109,7 @@ ImprintPage.Credits.3.Title=Conception ImprintPage.Credits.3.Value=Sylvain PETEK Adrien CHEYPE ImprintPage.Credits.4.Title=Développements -ImprintPage.Credits.4.Value=Adrien CHEYPE Mickael TRICOT Alban DIGUER +ImprintPage.Credits.4.Value=Adrien CHEYPE Mickael TRICOT Alban DIGUER Benjamin POUSSIN Éric CHATELLIER ImprintPage.Credits.5.Title=Conception graphique ImprintPage.Credits.5.Value=Elise COSTE, Pôle web de l'IRD Adrien CHEYPE ImprintPage.Credits.6.Title=Logo @@ -118,7 +120,6 @@ ImprintPage.Credits.8.Value=<a href="https://www.ird.fr/dsi/">DSI</a> de l'IRD : soutien SPIRALES 2008, 2009, 2010, 2012 <a href="http://www.ird.fr/l-ird/organigramme/direction-generale-deleguee-a-l-aird-d…">DVS</a> de l'IRD : « Maturation de projet innovant 2011 » ImprintPage.Credits.9.Title=Soutiens ImprintPage.Credits.9.Value=<a href="http://www.upmc.fr/fr/recherche/pole_4/pole_vie_et_sante/systematique_adapt…">UMR7138</a> – Systématique, Adaptation, Evolution <a href="http://www.pharmadev.ird.fr/">UMR152</a> – Pharma-Dev -ImprintPage.Credits.Librairies=Tout le code source de ce produit est disponible sur la forge de <a href="http://forge.codelutin.com/projects/cantharella">Code Lutin</a> en vertu des licences open source des composants utilisés ResetPasswordPage=Mot de passe oublié ResetPasswordPage.Reset.OK=Nouveau mot de passe envoyé par mail

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r233 - trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/document/panel
by echatellier＠users.forge.codelutin.com 28 May '13

28 May '13

Author: echatellier Date: 2013-05-28 14:17:05 +0200 (Tue, 28 May 2013) New Revision: 233 Url: http://forge.codelutin.com/projects/cantharella/repository/revisions/233 Log: Force attachement download Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/document/panel/DocumentLinkPanel.java Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/document/panel/DocumentLinkPanel.java =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/document/panel/DocumentLinkPanel.java 2013-05-28 10:15:32 UTC (rev 232) +++ trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/document/panel/DocumentLinkPanel.java 2013-05-28 12:17:05 UTC (rev 233) @@ -51,7 +51,7 @@ final Document document = model.getObject(); ResourceLink<Document> link = new ResourceLink<Document>("link", new ByteArrayResource(document - .getFileMimetype(), document.getFileContent())); + .getFileMimetype(), document.getFileContent(), document.getFileName())); add(link); // les images ne doivent pas être mise en cache car les liens

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r232 - trunk/cantharella.web/src/main/webapp/js
by echatellier＠users.forge.codelutin.com 28 May '13

28 May '13

Author: echatellier Date: 2013-05-28 12:15:32 +0200 (Tue, 28 May 2013) New Revision: 232 Url: http://forge.codelutin.com/projects/cantharella/repository/revisions/232 Log: Hide menu on mouse out Modified: trunk/cantharella.web/src/main/webapp/js/slidemenu.js Modified: trunk/cantharella.web/src/main/webapp/js/slidemenu.js =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/webapp/js/slidemenu.js 2013-05-27 08:18:51 UTC (rev 231) +++ trunk/cantharella.web/src/main/webapp/js/slidemenu.js 2013-05-28 10:15:32 UTC (rev 232) @@ -4,7 +4,7 @@ * $Id$ * $HeadURL$ * %% - * Copyright (C) 2009 - 2012 IRD (Institut de Recherche pour le Developpement) and by respective authors (see below) + * Copyright (C) 2009 - 2013 IRD (Institut de Recherche pour le Developpement) and by respective authors (see below) * %% * This program is free software: you can redistribute it and/or modify * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published by @@ -21,7 +21,7 @@ * #L% */ var slideMenu=function(){ - var sp,st,t,m,sa,l,w,sw,ot; + var sp,st,t,m,sa,l,w,sw,ot,ssl; return{ build:function(sm,sw,mt,s,sl,h){ sp=s; st=sw; t=mt; @@ -30,9 +30,13 @@ l=sa.length; w=m.offsetWidth; sw=w/l; ot=Math.floor((w-st)/(l-1)); var i=0; for(i;i<l;i++){x=sa[i]; x.style.width=sw+'px'; this.timer(x)} - if(sl!=null){m.timer=setInterval(function(){slideMenu.slide(sa[sl-1])},t)} + if(sl!=null){ssl=sl;m.timer=setInterval(function(){slideMenu.slide(sa[sl-1])},t)} }, - timer:function(s){s.onmouseover=function(){clearInterval(m.timer);m.timer=setInterval(function(){slideMenu.slide(s)},t)}}, + timer:function(s){ + s.onmouseover=function(){clearInterval(m.timer);m.timer=setInterval(function(){slideMenu.slide(s)},t)}; + s.onmouseout=function(e){clearInterval(m.timer);m.timer=setInterval(function(){slideMenu.slide(sa[ssl-1])},t)}; + }, + slide:function(s){ var cw=parseInt(s.style.width,'10'); if(cw<st){

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r231 - in trunk/cantharella.web/src/main: java/nc/ird/cantharella/web/pages resources
by echatellier＠users.forge.codelutin.com 27 May '13

27 May '13

Author: echatellier Date: 2013-05-27 10:18:51 +0200 (Mon, 27 May 2013) New Revision: 231 Url: http://forge.codelutin.com/projects/cantharella/repository/revisions/231 Log: Add molecule count on home page Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/HomePage.html trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/HomePage.java trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_en.properties trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_fr.properties Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/HomePage.html =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/HomePage.html 2013-05-27 08:17:59 UTC (rev 230) +++ trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/HomePage.html 2013-05-27 08:18:51 UTC (rev 231) @@ -103,6 +103,7 @@ <li> <wicket:message key="Lots.stat" /></li> <li> <wicket:message key="Extractions.stat" /></li> <li> <wicket:message key="Purifications.stat" /></li> + <li> <wicket:message key="Molecules.stat" /></li> <li> <wicket:message key="ResultatsTestsBio.stat" /></li> </ul> Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/HomePage.java =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/HomePage.java 2013-05-27 08:17:59 UTC (rev 230) +++ trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/HomePage.java 2013-05-27 08:18:51 UTC (rev 231) @@ -33,11 +33,14 @@ import nc.ird.cantharella.service.services.CampagneService; import nc.ird.cantharella.service.services.ExtractionService; import nc.ird.cantharella.service.services.LotService; +import nc.ird.cantharella.service.services.MoleculeService; import nc.ird.cantharella.service.services.PersonneService; import nc.ird.cantharella.service.services.PurificationService; import nc.ird.cantharella.service.services.SpecimenService; import nc.ird.cantharella.service.services.StationService; import nc.ird.cantharella.service.services.TestBioService; +import nc.ird.cantharella.utils.BeanTools.AccessType; +import nc.ird.cantharella.utils.CollectionTools; import nc.ird.cantharella.web.pages.domain.utilisateur.ManageUtilisateurPage; import nc.ird.cantharella.web.pages.domain.utilisateur.ReadUtilisateurPage; import nc.ird.cantharella.web.pages.domain.utilisateur.RegisterPage; @@ -50,11 +53,7 @@ import nc.ird.cantharella.web.utils.models.LoadableDetachableSortableListDataProvider; import nc.ird.cantharella.web.utils.security.AuthContainer; import nc.ird.cantharella.web.utils.security.AuthRole; -import nc.ird.cantharella.utils.BeanTools.AccessType; -import nc.ird.cantharella.utils.CollectionTools; -import org.slf4j.Logger; -import org.slf4j.LoggerFactory; import org.apache.wicket.MarkupContainer; import org.apache.wicket.ajax.AjaxRequestTarget; import org.apache.wicket.ajax.markup.html.AjaxFallbackLink; @@ -73,6 +72,8 @@ import org.apache.wicket.model.Model; import org.apache.wicket.model.PropertyModel; import org.apache.wicket.spring.injection.annot.SpringBean; +import org.slf4j.Logger; +import org.slf4j.LoggerFactory; /** * Home page @@ -115,6 +116,10 @@ @SpringBean private PurificationService purificationService; + /** Service : molecule */ + @SpringBean + private MoleculeService moleculeService; + /** Service : test biologique */ @SpringBean private TestBioService testBioService; @@ -239,6 +244,8 @@ .countExtractions()))); userContent.add(new Label(getResource() + ".Statistics.Purifications", String.valueOf(purificationService .countPurifications()))); + userContent.add(new Label(getResource() + ".Statistics.Molecules", String.valueOf(moleculeService + .countMolecules()))); userContent.add(new Label(getResource() + ".Statistics.TestsBio", String.valueOf(testBioService .countResultatsTestsBio()))); Modified: trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_en.properties =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_en.properties 2013-05-27 08:17:59 UTC (rev 230) +++ trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_en.properties 2013-05-27 08:18:51 UTC (rev 231) @@ -4,7 +4,7 @@ # $Id$ # $HeadURL$ # %% -# Copyright (C) 2009 - 2012 IRD (Institut de Recherche pour le Developpement) and by respective authors (see below) +# Copyright (C) 2009 - 2013 IRD (Institut de Recherche pour le Developpement) and by respective authors (see below) # %% # This program is free software: you can redistribute it and/or modify # it under the terms of the GNU Affero General Public License as published by @@ -66,6 +66,7 @@ Lots.stat=Samples Extractions.stat=Extractions Purifications.stat=Purifications +Molecules.stat=Molecules ResultatsTestsBio.stat=Bioassay results Modified: trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_fr.properties =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_fr.properties 2013-05-27 08:17:59 UTC (rev 230) +++ trunk/cantharella.web/src/main/resources/web_fr.properties 2013-05-27 08:18:51 UTC (rev 231) @@ -4,7 +4,7 @@ # $Id$ # $HeadURL$ # %% -# Copyright (C) 2009 - 2012 IRD (Institut de Recherche pour le Developpement) and by respective authors (see below) +# Copyright (C) 2009 - 2013 IRD (Institut de Recherche pour le Developpement) and by respective authors (see below) # %% # This program is free software: you can redistribute it and/or modify # it under the terms of the GNU Affero General Public License as published by @@ -65,6 +65,7 @@ Lots.stat=Lots Extractions.stat=Extractions Purifications.stat=Purifications +Molecules.stat=Molécules ResultatsTestsBio.stat=Résultats de tests biologiques

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r230 - trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model
by echatellier＠users.forge.codelutin.com 27 May '13

27 May '13

Author: echatellier Date: 2013-05-27 10:17:59 +0200 (Mon, 27 May 2013) New Revision: 230 Url: http://forge.codelutin.com/projects/cantharella/repository/revisions/230 Log: Add 'formuleBrute' field in index Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Molecule.java Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Molecule.java =================================================================== --- trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Molecule.java 2013-05-27 08:01:35 UTC (rev 229) +++ trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Molecule.java 2013-05-27 08:17:59 UTC (rev 230) @@ -94,6 +94,7 @@ /** Formule brute */ @Length(max = LENGTH_MEDIUM_TEXT) @NotEmpty + @Field private String formuleBrute; /** Masse molaire */

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r229 - trunk
by echatellier＠users.forge.codelutin.com 27 May '13

27 May '13

Author: echatellier Date: 2013-05-27 10:01:35 +0200 (Mon, 27 May 2013) New Revision: 229 Url: http://forge.codelutin.com/projects/cantharella/repository/revisions/229 Log: Update libs Modified: trunk/pom.xml Modified: trunk/pom.xml =================================================================== --- trunk/pom.xml 2013-05-24 15:39:12 UTC (rev 228) +++ trunk/pom.xml 2013-05-27 08:01:35 UTC (rev 229) @@ -5,7 +5,7 @@ <parent> <groupId>org.nuiton</groupId> <artifactId>mavenpom4redmine</artifactId> - <version>3.4.10</version> + <version>3.4.11</version> </parent> <groupId>nc.ird</groupId> @@ -121,7 +121,7 @@ <version.commons-collections>3.2.1</version.commons-collections> <version.commons-codec>1.8</version.commons-codec> <version.postgresql>9.1-901-1.jdbc4</version.postgresql> - <version.h2>1.3.171</version.h2> + <version.h2>1.3.172</version.h2> <version.validation-api>1.1.0.Final</version.validation-api> <version.hibernate-jpa-2.0-api>1.0.1.Final</version.hibernate-jpa-2.0-api> <version.hibernate>4.2.2.Final</version.hibernate>

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r228 - in trunk: cantharella.utils/src/main/java/nc/ird/cantharella/utils cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur
by echatellier＠users.forge.codelutin.com 24 May '13

24 May '13

Author: echatellier Date: 2013-05-24 17:39:12 +0200 (Fri, 24 May 2013) New Revision: 228 Url: http://forge.codelutin.com/projects/cantharella/repository/revisions/228 Log: Add document mamanagement for User (same as personne) Modified: trunk/cantharella.utils/src/main/java/nc/ird/cantharella/utils/BeanTools.java trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ManageUtilisateurPage.html trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ManageUtilisateurPage.java trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ReadUtilisateurPage.html trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ReadUtilisateurPage.java Modified: trunk/cantharella.utils/src/main/java/nc/ird/cantharella/utils/BeanTools.java =================================================================== --- trunk/cantharella.utils/src/main/java/nc/ird/cantharella/utils/BeanTools.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) +++ trunk/cantharella.utils/src/main/java/nc/ird/cantharella/utils/BeanTools.java 2013-05-24 15:39:12 UTC (rev 228) @@ -307,7 +307,8 @@ switch (accessType) { case GETTER: try { - PropertyDescriptor prodDesc = new PropertyDescriptor(property, bean.getClass(), "is" + StringUtils.capitalize(property), null); + PropertyDescriptor prodDesc = new PropertyDescriptor(property, bean.getClass(), "is" + + StringUtils.capitalize(property), null); Method method = prodDesc.getReadMethod(); value = method.invoke(bean); } catch (RuntimeException e) { Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ManageUtilisateurPage.html =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ManageUtilisateurPage.html 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) +++ trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ManageUtilisateurPage.html 2013-05-24 15:39:12 UTC (rev 228) @@ -77,6 +77,8 @@ </fieldset> + <wicket:panel wicket:id="ManageListDocumentsPanel" /> + <div class="actions"> <input type="submit" wicket:message="value:Submit" wicket:id="Update" /> <input type="submit" wicket:message="value:Submit" wicket:id="Valid" /> Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ManageUtilisateurPage.java =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ManageUtilisateurPage.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) +++ trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ManageUtilisateurPage.java 2013-05-24 15:39:12 UTC (rev 228) @@ -45,6 +45,7 @@ import nc.ird.cantharella.utils.BeanTools.AccessType; import nc.ird.cantharella.utils.CollectionTools; import nc.ird.cantharella.web.pages.TemplatePage; +import nc.ird.cantharella.web.pages.domain.document.panel.ManageListDocumentsPanel; import nc.ird.cantharella.web.pages.domain.personne.panels.ManagePersonnePanel; import nc.ird.cantharella.web.pages.model.ManageUtilisateurModel; import nc.ird.cantharella.web.utils.CallerPage; @@ -148,6 +149,7 @@ */ public ManageUtilisateurPage(Integer idPersonne, final CallerPage callerPage) { super(ManageUtilisateurPage.class); + final CallerPage currentPage = new CallerPage(this); // Initialisation des modèles try { @@ -346,6 +348,11 @@ updateAvailableCampagnes(); formView.add(campagnesContainer); + // add list document panel + ManageListDocumentsPanel manageListDocumentsPanel = new ManageListDocumentsPanel("ManageListDocumentsPanel", + utilisateurModel, currentPage); + formView.add(manageListDocumentsPanel); + // Action : mise à jour de l'utilisateur Button updateButton = new SubmittableButton(ACTION_UPDATE, new SubmittableButtonEvents() { @Override Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ReadUtilisateurPage.html =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ReadUtilisateurPage.html 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) +++ trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ReadUtilisateurPage.html 2013-05-24 15:39:12 UTC (rev 228) @@ -44,7 +44,9 @@ <legend><wicket:message key="ManageUtilisateurPage.Authorizations" /></legend> <wicket:panel wicket:id="ReadDroitsUtilisateurPanel" /> </fieldset> - + + <wicket:panel wicket:id="ReadListDocumentsPanel" /> + <form wicket:id="Form"> <div class="actions"> <a class="edit" wicket:id="ReadUtilisateurPage.Personne.Update" wicket:message="title:Update"> Modified: trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ReadUtilisateurPage.java =================================================================== --- trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ReadUtilisateurPage.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) +++ trunk/cantharella.web/src/main/java/nc/ird/cantharella/web/pages/domain/utilisateur/ReadUtilisateurPage.java 2013-05-24 15:39:12 UTC (rev 228) @@ -28,6 +28,7 @@ import nc.ird.cantharella.data.model.Utilisateur.TypeDroit; import nc.ird.cantharella.service.services.PersonneService; import nc.ird.cantharella.web.pages.TemplatePage; +import nc.ird.cantharella.web.pages.domain.document.panel.ReadListDocumentsPanel; import nc.ird.cantharella.web.pages.domain.personne.panels.ReadPersonnePanel; import nc.ird.cantharella.web.pages.domain.utilisateur.panels.ReadDroitsUtilisateurPanel; import nc.ird.cantharella.web.utils.CallerPage; @@ -104,6 +105,11 @@ autorizationsFieldset.add(new ReadDroitsUtilisateurPanel("ReadDroitsUtilisateurPanel", utilisateurModel)); add(autorizationsFieldset); + // add list document panel + ReadListDocumentsPanel readListDocumentsPanel = new ReadListDocumentsPanel("ReadListDocumentsPanel", + utilisateurModel, currentPage); + add(readListDocumentsPanel); + // Action : mise à jour (redirection vers le formulaire) Link<Utilisateur> updateLink = new Link<Utilisateur>(getResource() + ".Personne.Update", utilisateurModel) { @Override

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r227 - trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model
by echatellier＠users.forge.codelutin.com 24 May '13

24 May '13

Author: echatellier Date: 2013-05-24 17:38:34 +0200 (Fri, 24 May 2013) New Revision: 227 Url: http://forge.codelutin.com/projects/cantharella/repository/revisions/227 Log: Fix lazy problems during hibernate search indexing Add some missing field indexing Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Extraction.java trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Lot.java trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/MethodeExtraction.java trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/MethodePurification.java trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Molecule.java trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Partie.java trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Purification.java trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Specimen.java trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Station.java Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Extraction.java =================================================================== --- trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Extraction.java 2013-05-24 15:37:24 UTC (rev 226) +++ trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Extraction.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) @@ -91,6 +91,7 @@ /** Méthode pour l'extraction **/ @NotNull @ManyToOne(fetch = FetchType.EAGER, optional = false) + @IndexedEmbedded private MethodeExtraction methode; /** Date de la manip */ @@ -119,7 +120,6 @@ /** Créateur */ @NotNull @ManyToOne(fetch = FetchType.LAZY, optional = false) - @IndexedEmbedded private Personne createur; /** Extraits produits par l'extraction */ Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Lot.java =================================================================== --- trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Lot.java 2013-05-24 15:37:24 UTC (rev 226) +++ trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Lot.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) @@ -101,7 +101,6 @@ /** createur */ @NotNull @ManyToOne(fetch = FetchType.LAZY, optional = false) - @IndexedEmbedded private Personne createur; /** Date */ @@ -141,6 +140,7 @@ /** Partie */ @ManyToOne(fetch = FetchType.EAGER, optional = true) + @IndexedEmbedded private Partie partie; /** Droits attribués aux personnes */ Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/MethodeExtraction.java =================================================================== --- trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/MethodeExtraction.java 2013-05-24 15:37:24 UTC (rev 226) +++ trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/MethodeExtraction.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) @@ -27,6 +27,7 @@ import java.util.List; import javax.persistence.Column; +import javax.persistence.Embeddable; import javax.persistence.Entity; import javax.persistence.FetchType; import javax.persistence.GeneratedValue; @@ -40,6 +41,7 @@ import org.hibernate.annotations.Cascade; import org.hibernate.annotations.CascadeType; import org.hibernate.annotations.Type; +import org.hibernate.search.annotations.Field; import org.hibernate.validator.constraints.Length; import org.hibernate.validator.constraints.NotEmpty; @@ -49,6 +51,7 @@ * @author Adrien Cheype */ @Entity +@Embeddable public class MethodeExtraction extends AbstractModel implements Comparable<MethodeExtraction> { /** Id de la méthode */ @@ -60,6 +63,7 @@ @Length(max = LENGTH_MEDIUM_TEXT) @Column(unique = true) @NotEmpty + @Field private String nom; /** Description de la méthode */ Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/MethodePurification.java =================================================================== --- trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/MethodePurification.java 2013-05-24 15:37:24 UTC (rev 226) +++ trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/MethodePurification.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) @@ -27,6 +27,7 @@ import java.util.List; import javax.persistence.Column; +import javax.persistence.Embeddable; import javax.persistence.Entity; import javax.persistence.FetchType; import javax.persistence.GeneratedValue; @@ -41,6 +42,7 @@ import org.hibernate.annotations.Cascade; import org.hibernate.annotations.CascadeType; import org.hibernate.annotations.Type; +import org.hibernate.search.annotations.Field; import org.hibernate.validator.constraints.Length; import org.hibernate.validator.constraints.NotEmpty; @@ -49,6 +51,7 @@ * @author Adrien Cheype */ @Entity +@Embeddable public class MethodePurification extends AbstractModel implements Comparable<MethodePurification> { /** Id de la méthode */ @@ -60,6 +63,7 @@ @Length(max = LENGTH_MEDIUM_TEXT) @Column(unique = true) @NotEmpty + @Field private String nom; /** Description de la méthode */ Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Molecule.java =================================================================== --- trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Molecule.java 2013-05-24 15:37:24 UTC (rev 226) +++ trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Molecule.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) @@ -130,7 +130,6 @@ /** Créateur */ @NotNull @ManyToOne(fetch = FetchType.LAZY, optional = false) - @IndexedEmbedded private Personne createur; /** Produit utilisé obtenir le résultat */ Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Partie.java =================================================================== --- trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Partie.java 2013-05-24 15:37:24 UTC (rev 226) +++ trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Partie.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) @@ -23,6 +23,7 @@ package nc.ird.cantharella.data.model; import javax.persistence.Column; +import javax.persistence.Embeddable; import javax.persistence.Entity; import javax.persistence.GeneratedValue; import javax.persistence.Id; @@ -31,6 +32,7 @@ import nc.ird.cantharella.data.model.utils.AbstractModel; import org.apache.commons.beanutils.BeanComparator; +import org.hibernate.search.annotations.Field; import org.hibernate.validator.constraints.Length; import org.hibernate.validator.constraints.NotEmpty; @@ -41,6 +43,7 @@ */ @Entity @Table +@Embeddable public class Partie extends AbstractModel implements Comparable<Partie> { /** Id de la partie */ @@ -52,6 +55,7 @@ @Length(max = LENGTH_MEDIUM_TEXT) @NotEmpty @Column(unique = true) + @Field private String nom; /** {@inheritDoc} */ Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Purification.java =================================================================== --- trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Purification.java 2013-05-24 15:37:24 UTC (rev 226) +++ trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Purification.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) @@ -98,6 +98,7 @@ /** Méthode pour la purification **/ @NotNull @ManyToOne(fetch = FetchType.EAGER, optional = false) + @IndexedEmbedded private MethodePurification methode; /** Paramètres qui caractérisent la méthode pour cette purification */ @@ -135,7 +136,6 @@ /** Créateur */ @NotNull @ManyToOne(fetch = FetchType.LAZY, optional = false) - @IndexedEmbedded private Personne createur; /** Fractions produites par la purification */ Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Specimen.java =================================================================== --- trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Specimen.java 2013-05-24 15:37:24 UTC (rev 226) +++ trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Specimen.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) @@ -166,7 +166,6 @@ /** Créateur */ @NotNull @ManyToOne(fetch = FetchType.LAZY, optional = false) - @IndexedEmbedded private Personne createur; /** Attached documents. */ Modified: trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Station.java =================================================================== --- trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Station.java 2013-05-24 15:37:24 UTC (rev 226) +++ trunk/cantharella.data/src/main/java/nc/ird/cantharella/data/model/Station.java 2013-05-24 15:38:34 UTC (rev 227) @@ -100,7 +100,6 @@ /** Créateur */ @NotNull @ManyToOne(fetch = FetchType.LAZY, optional = false) - @IndexedEmbedded private Personne createur; /** Localité */ @@ -128,7 +127,10 @@ /** Stations */ @NotNull - @ManyToMany(mappedBy = "stations", fetch = FetchType.LAZY) + @ManyToMany(mappedBy = "stations", fetch = FetchType.EAGER) + // FIXME echatellier 20130524 EAGER for hibernate search (no other simple solution) + @Fetch(value = FetchMode.SUBSELECT) + // see HHH-1718 @IndexedEmbedded private List<Campagne> campagnes;

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r226 - trunk
by echatellier＠users.forge.codelutin.com 24 May '13

24 May '13

Author: echatellier Date: 2013-05-24 17:37:24 +0200 (Fri, 24 May 2013) New Revision: 226 Url: http://forge.codelutin.com/projects/cantharella/repository/revisions/226 Log: Update hibernate Modified: trunk/pom.xml Modified: trunk/pom.xml =================================================================== --- trunk/pom.xml 2013-05-23 12:24:45 UTC (rev 225) +++ trunk/pom.xml 2013-05-24 15:37:24 UTC (rev 226) @@ -124,7 +124,7 @@ <version.h2>1.3.171</version.h2> <version.validation-api>1.1.0.Final</version.validation-api> <version.hibernate-jpa-2.0-api>1.0.1.Final</version.hibernate-jpa-2.0-api> - <version.hibernate>4.2.1.Final</version.hibernate> + <version.hibernate>4.2.2.Final</version.hibernate> <version.hibernate-validator>5.0.1.Final</version.hibernate-validator> <version.hibernate-search>4.2.0.Final</version.hibernate-search> <version.lucene>3.6.2</version.lucene>

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