[Isis-fish-commits] r3909 - in branches/4.0.1/src: main/java/fr/ifremer/isisfish main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore main/java/fr/ifremer/isisfish/entities main/java/fr/ifremer/isisfish/logging main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io main/java/fr/ifremer/isisfish/map main/java/fr/ifremer/isisfish/mexico main/java/fr/ifremer/isisfish/rule main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher main/java/fr/ifremer/isisfish/si

Author: echatellier Date: 2014-03-25 22:46:51 +0100 (Tue, 25 Mar 2014) New Revision: 3909 Url: http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/repository/revisions/3909 Log: Fix javadoc Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisConfig.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisFish.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ExportStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/JavaSourceStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/RegionStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultDatabaseStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultMappedStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultStorageInMemory.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/RuleStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ScriptStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SensitivityAnalysisStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SensitivityExportStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationPlanStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulatorStorage.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/StorageChangeListener.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/entities/PopulationImpl.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/LogLevel.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/LogLevelUtil.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/SimulationLoggerUtil.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsole.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsoleHandler.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsoleModel.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogMail.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/FileOffsetReader.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/LineReader.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/MemoryOffsetReader.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/CellSelectionLayer.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/IsisMapBean.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/ResultatLayer.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/mexico/MexicoHelper.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/rule/Rule.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/MetierMonitor.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/Objective.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/PopulationMonitor.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationContext.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationControl.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationException.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationMeta.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationProperties.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationResultXML.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationVariable.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulatorServerBadIdException.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationExecutor.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationMonitor.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationService.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/package-info.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/sensitivity/domain/ContinuousDomain.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/MatrixType.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/MonthType.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/RangeOfValuesType.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/TimeStepType.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/TimeUnitType.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/WelcomeSaveVerifier.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/InputAction.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/InputSaveVerifier.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/OpenMapEvents.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckRegion.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResult.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultFrame.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultTableModel.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultTableRenderer.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/model/GearPopulationSelectivityModel.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/model/MetierSeasonInfoTargetSpeciesTableModel.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/models/common/ScriptParametersTableModel.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/model/FactorCardinalityTableModel.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/wizard/ContinuousPanel.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/simulator/SimulAction.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/simulator/filter/SimulationFilterUtil.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/Interval.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/editor/EquationTableEditor.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/AcceptorFactory.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/CompositeFilterAcceptor.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterAcceptor.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterDialog.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterModel.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ArgTypes.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/CellPointcomparator.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/CompileHelper.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/IsisCacheBackendOnReferenceMap.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHAgent.java branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHUtils.java branches/4.0.1/src/test/java/fr/ifremer/isisfish/entity/PersistenceTest.java Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisConfig.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisConfig.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisConfig.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -104,10 +104,12 @@ /** * La version du logiciel constitue de l.d.a.r - * <li>l: le numero de version du logiciel - * <li>d: le numero de version du schema de la base de donnees - * <li>a: le numero de version de l'api des scripts - * <li>r: le numero de version de de l'interface graphique ou autre modif mineur + * <ul> + * <li>l: le numero de version du logiciel</li> + * <li>d: le numero de version du schema de la base de donnees</li> + * <li>a: le numero de version de l'api des scripts</li> + * <li>r: le numero de version de de l'interface graphique ou autre modif mineur</li> + * </ul> * <p> * lors de l'increment de l, d, a et r sont remis a 0 * lors de l'increment de d, a et r sont remis a 0 Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisFish.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisFish.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/IsisFish.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -94,7 +94,7 @@ * * Created: 1 aout 2005 18:37:25 CEST * - * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> * @author chemit * @version $Revision$ * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ExportStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ExportStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ExportStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -46,7 +46,7 @@ * * Created: 18 août 2005 15:07:36 CEST * - * @author Grégoire DESSARD <dessard@codelutin.com> + * @author Grégoire DESSARD <dessard@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Last update: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/JavaSourceStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/JavaSourceStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/JavaSourceStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -133,7 +133,7 @@ * {@link fr.ifremer.isisfish.IsisConfig#getJavadocDirectory()} * * @param force force javadoc build even if destination file is never - * @param out output print stream. if <tt>null</tt standart output will be used + * @param out output print stream. if <tt>null</tt> standart output will be used * @return 0 si la generation a reussi, une autre valeur sinon */ public int doJavadoc(boolean force, PrintWriter out) { Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/RegionStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/RegionStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/RegionStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -55,7 +55,7 @@ * * Created: 17 août 2005 03:44:57 CEST * - * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> * * @version $Revision$ * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultDatabaseStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultDatabaseStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultDatabaseStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -69,7 +69,7 @@ * * Created: 29 sept. 2004 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultMappedStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultMappedStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultMappedStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -85,7 +85,7 @@ * * Created: 31 aout 2012 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin : poussin@codelutin.com * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultStorageInMemory.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultStorageInMemory.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ResultStorageInMemory.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -65,7 +65,7 @@ * * Created: 29 sept. 2004 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin : poussin@codelutin.com * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/RuleStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/RuleStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/RuleStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -46,12 +46,12 @@ * Il se trouve dans le package portant le nom de la region de cette maniere * plusieurs region peuvent avoir des regles avec le meme nom mais pas le * meme code. - * <p/> + * <p> * Gere les fichiers VCS de type {@link Rule} (package rules) * * Created: 17 août 2005 11:11:51 CEST * - * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> * * @version $Revision$ * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ScriptStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ScriptStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/ScriptStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -40,7 +40,7 @@ * * Created: 18 août 2005 15:07:36 CEST * - * @author Grégoire DESSARD <dessard@codelutin.com> + * @author Grégoire DESSARD <dessard@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Last update: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SensitivityAnalysisStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SensitivityAnalysisStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SensitivityAnalysisStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -42,12 +42,12 @@ /** * Cette class permet de stocker les fichiers de calculateur de sensibilité. - * <p/> + * <p> * Gere les fichiers VCS de type {@link SensitivityAnalysis} (package sensitivityanalysis). * * Created: 17 août 2005 11:11:51 CEST * - * @author chatellier <chatellier@codelutin.com> + * @author chatellier <chatellier@codelutin.com> * @version $Revision$ * Last update: $Date$ by : $Author$ */ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SensitivityExportStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SensitivityExportStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SensitivityExportStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -42,7 +42,7 @@ * * Created: 18 août 2005 15:07:36 CEST * - * @author chatellier eric <chatellier@codelutin.com> + * @author chatellier eric <chatellier@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Last update: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationPlanStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationPlanStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationPlanStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -44,12 +44,12 @@ /** * Class permettant de representer un plan de simulation. * Un plan de simulation est un fichier Java que l'on compile si besoin. - * <p/> + * <p> * Gere les fichiers VCS de type {@link SimulationPlan} (package simulationplans) * * Created: 17 août 2005 11:11:51 CEST * - * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin POUSSIN : poussin@codelutin.com * * @version $Revision$ * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulationStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -63,7 +63,7 @@ * * Created: 17 août 2005 03:48:50 CEST * - * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin POUSSIN : poussin@codelutin.com * @version $Revision$ * * Last update: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulatorStorage.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulatorStorage.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/SimulatorStorage.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -41,7 +41,7 @@ * * Created: 18 août 2005 15:07:36 CEST * - * @author Grégoire DESSARD <dessard@codelutin.com> + * @author Grégoire DESSARD <dessard@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Last update: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/StorageChangeListener.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/StorageChangeListener.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/datastore/StorageChangeListener.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -31,9 +31,11 @@ * Listener for change made on storage. * * Such as : + * <ul> * <li>region added</li> * <li>script removed</li> * <li>plan renamed</li> + * </ul> * * @author chatellier * @version $Revision: 1.0 $ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/entities/PopulationImpl.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/entities/PopulationImpl.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/entities/PopulationImpl.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -670,7 +670,7 @@ /** * Convertie une matrice N 2D en une matrice N 1D strucutre pour les calculer. * - * N2D[classes, zones] --> N1D[classe1(zone1, zone2, ...), classe2(zone1, zone2, ...)] + * N2D[classes, zones] --> N1D[classe1(zone1, zone2, ...), classe2(zone1, zone2, ...)] * * @see #split2D(MatrixND) */ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/LogLevel.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/LogLevel.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/LogLevel.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -26,8 +26,8 @@ package fr.ifremer.isisfish.logging; /** - * abstraction of a log level - * <p/> + * abstraction of a log level. + * * a LogLevel is defined by 3 properties : * <ul> * <li> his name (given by {@link #name()}) </li> @@ -36,10 +36,10 @@ * <li> his mask value (given by {@link #mask()}) </li> * </ul> * The mask value is introduced to make possible some performant search. - * <p/> - * Using the <b>"<code>1 << ordinal()</code>"</b> idiom is the easiest manner to manage + * + * Using the <b>"<code>1 << ordinal()</code>"</b> idiom is the easiest manner to manage * operations of set of LogLevels. - * <p/> + * <p> * To obtain a LogLevel from his severity, use {@link #getLogLevel(int)} * * @author chemit Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/LogLevelUtil.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/LogLevelUtil.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/LogLevelUtil.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -35,17 +35,17 @@ * To make performant filtering operations on a lots of LogRecord, * we use as representation for set of LogLevel an integer * as the sum of the {@link LogLevel#mask()} values. - * <p/> + * * The <code>0</code> value correspond to all levels and is a violating the rule * (but how to make a search with no level ?) - * <p/> + * * to test if a set of LogLevel contains a given LogLevel use * {@link #contains(int, int)} - * <p/> + * * to add a level in a set of LogLevel use {@link #addToSet(int, int)} - * <p/> + * * to remove a level in a set of LogLevel use {@link #removeFromSet(int, int)} - * <p/> + * * to obtain all levels contained in a set of LogLevel use * {@link #getLogLevels(int)} * @@ -80,7 +80,7 @@ /** * Compute the sum of levels toInit() value for * all given levels (given with their ordinal value). - * <p/> + * <p> * This value will be used for a performant filter process. * * @param firstOrdinal the first level of levels to use Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/SimulationLoggerUtil.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/SimulationLoggerUtil.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/SimulationLoggerUtil.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -51,15 +51,15 @@ * * Usefull class for dealing with hot configuration of log4J. this is temporary * we must find a way to abstract this layer. - * <p/> + * * the class offers three public static methods : - * <p/> + * * {@link #addSimulationAppender(String, String, String, String, String, String)} * to add a logger for a given simulation in a given thread, with simulLogLevel, * scriptLogLvel and libLogLevel given. - * <p/> + * * {@code #removeAppender(String, String)} to remove a appender of a simulation - * <p/> + * * {@link #showSimulationLogConsole(String)} to display the log console of * a simulation, given his name. * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsole.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsole.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsole.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -179,8 +179,8 @@ protected boolean disableScroll = true; /** - * the console listen the change on the model - * <p/> + * the console listen the change on the model. + * * TODO Deal with ui data update : use a Timer (or a Worker) * * @param e change event Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsoleHandler.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsoleHandler.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsoleHandler.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -61,7 +61,7 @@ /** * This class is responsible of provinding LogRecord, it deals with LogReecord * stored in a file with a serializedForm for performance issue. - * <p/> + * * <b>Use one LogConsoleHandler for one log file</b> * * @author chemit Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsoleModel.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsoleModel.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogConsoleModel.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -34,7 +34,7 @@ /** * This class is the model used in LogConsole. - * <p/> + * * The model deals with ChangeEvent to notify ui, model has changed. * * @author chemit Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogMail.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogMail.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/console/LogMail.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -71,7 +71,6 @@ * * @author chemit */ - public class LogMail extends LogMailUI { /** serialVersionUID */ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/FileOffsetReader.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/FileOffsetReader.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/FileOffsetReader.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -37,7 +37,7 @@ /** * A simple implementation of {@link OffsetReader} using a file for * dealing with offsets. - * <p/> + * * The offset of lines are pre-computed in a file {@link #offsetFile}, generated * by {@link #createOffsets(LineReader)}. or * {@link #createOffsets(LineReader , LineReader)}. Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/LineReader.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/LineReader.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/LineReader.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -35,10 +35,10 @@ /** * A lineReader reads lines from a file using a {@link java.io.RandomAccessFile}. - * <p/> - * To perfrom efficient io operations, we use a {@link OffsetReader} to obtain + * + * To perform efficient io operations, we use a {@link OffsetReader} to obtain * the offset of the first char of a line. - * <p/> + * * You can create a new LineReader from a previous one, the matchings lines of * the new LineReader will all match the parent one (subset LineReader). * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/MemoryOffsetReader.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/MemoryOffsetReader.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/logging/io/MemoryOffsetReader.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -34,9 +34,8 @@ /** * This class is a Offset Reader using a memory cache. - * <p/> + * * All offsets are saved in memory. - * <p/> * * @author chemit */ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/CellSelectionLayer.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/CellSelectionLayer.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/CellSelectionLayer.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -227,13 +227,11 @@ * listener is interested in. * Layers interested in receiving events should register for * receiving events in "select" mode. - * <code> * <pre> * return new String[1] { * SelectMouseMode.modeID * }; * </pre> - * <code> * @see NavMouseMode#modeID * @see SelectMouseMode#modeID * @see NullMouseMode#modeID Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/IsisMapBean.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/IsisMapBean.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/IsisMapBean.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -68,7 +68,7 @@ * * Created: 16 mai 2005 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/ResultatLayer.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/ResultatLayer.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/map/ResultatLayer.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -298,11 +298,10 @@ * The source MouseEvents will only get sent to the MapMouseListener if the * mode is set to one that the listener is interested in. Layers interested * in receiving events should register for receiving events in "select" - * mode. <code> + * mode. * <pre> * return new String[1] { SelectMouseMode.modeID }; * </pre> - * <code> * @see SelectMouseMode#modeID */ public String[] getMouseModeServiceList() { Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/mexico/MexicoHelper.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/mexico/MexicoHelper.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/mexico/MexicoHelper.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -180,23 +180,23 @@ * * Format is : * <pre> - * <mx name="une matrice"> - * <dimension name="classe" size="2"> - * <label>jeune</label> - * <label>vieux</label> - * </dimension> - * <dimension name="x" size="3"> - * <label>0</label> - * <label>1</label> - * <label>2</label> - * </dimension> - * <d>2.0</d> - * <d>3.1415</d> - * <d>2.0</d> - * <d>3.1415</d> - * <d>2.0</d> - * <d>3.1415</d> - * </mx> + * <mx name="une matrice"> + * <dimension name="classe" size="2"> + * <label>jeune</label> + * <label>vieux</label> + * </dimension> + * <dimension name="x" size="3"> + * <label>0</label> + * <label>1</label> + * <label>2</label> + * </dimension> + * <d>2.0</d> + * <d>3.1415</d> + * <d>2.0</d> + * <d>3.1415</d> + * <d>2.0</d> + * <d>3.1415</d> + * </mx> * </pre> * * @param matrix matrix @@ -265,23 +265,23 @@ * * Format is : * <pre> - * <mx name="une matrice"> - * <dimension name="classe" size="2"> - * <label>jeune</label> - * <label>vieux</label> - * </dimension> - * <dimension name="x" size="3"> - * <label>0</label> - * <label>1</label> - * <label>2</label> - * </dimension> - * <d>2.0</d> - * <d>3.1415</d> - * <d>2.0</d> - * <d>3.1415</d> - * <d>2.0</d> - * <d>3.1415</d> - * </mx> + * <mx name="une matrice"> + * <dimension name="classe" size="2"> + * <label>jeune</label> + * <label>vieux</label> + * </dimension> + * <dimension name="x" size="3"> + * <label>0</label> + * <label>1</label> + * <label>2</label> + * </dimension> + * <d>2.0</d> + * <d>3.1415</d> + * <d>2.0</d> + * <d>3.1415</d> + * <d>2.0</d> + * <d>3.1415</d> + * </mx> * </pre> * * @param mxElement dom element @@ -386,16 +386,16 @@ * * Format is : * <pre> - * <rules> - * <rule name="RuleName1"> - * <param key="rule.0.parameter.param1">param1</param> - * <param key="rule.0.parameter.pop">topiaId1</param> - * </rule> - * <rule name="RuleName2"> - * <param key="rule.0.parameter.param1">param2</param> - * <param key="rule.0.parameter.pop">topiaId2</param> - * </rule> - * </rules> + * <rules> + * <rule name="RuleName1"> + * <param key="rule.0.parameter.param1">param1</param> + * <param key="rule.0.parameter.pop">topiaId1</param> + * </rule> + * <rule name="RuleName2"> + * <param key="rule.0.parameter.param1">param2</param> + * <param key="rule.0.parameter.pop">topiaId2</param> + * </rule> + * </rules> * </pre> * * @param rules rules list @@ -429,16 +429,16 @@ * * Format is : * <pre> - * <rules> - * <rule name="RuleName1"> - * <param key="rule.0.parameter.param1">param1</param> - * <param key="rule.0.parameter.pop">topiaId1</param> - * </rule> - * <rule name="RuleName2"> - * <param key="rule.0.parameter.param1">param2</param> - * <param key="rule.0.parameter.pop">topiaId2</param> - * </rule> - * </rules> + * <rules> + * <rule name="RuleName1"> + * <param key="rule.0.parameter.param1">param1</param> + * <param key="rule.0.parameter.pop">topiaId1</param> + * </rule> + * <rule name="RuleName2"> + * <param key="rule.0.parameter.param1">param2</param> + * <param key="rule.0.parameter.pop">topiaId2</param> + * </rule> + * </rules> * </pre> * * @param rulesElement rules dom element @@ -484,7 +484,7 @@ * <li>Species:Nephrops</li> * <li>Population:Anchois</li> * <li>TimeStep:21</li> - * <li>... + * <li>...</li> * </ul> * * @param content content to parse Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/rule/Rule.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/rule/Rule.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/rule/Rule.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -37,12 +37,14 @@ * ait, doivent etre des attributs public commencant par param. * * <p> Les types acceptable pour un parametre sont: - * <li> un nombre (int, long, float, double, ...) - * <li> un boolean - * <li> une chaine String - * <li> un objet Date ({@link fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep}) - * <li> un objet Month ({@link fr.ifremer.isisfish.types.Month}) - * <li> Le type d'une entité (@see fr.ifremer.isisfish.entities) + * <ul> + * <li> un nombre (int, long, float, double, ...)</li> + * <li> un boolean</li> + * <li> une chaine String</li> + * <li> un objet Date ({@link fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep})</li> + * <li> un objet Month ({@link fr.ifremer.isisfish.types.Month})</li> + * <li> Le type d'une entité (@see fr.ifremer.isisfish.entities)</li> + * </ul> * * <p> Pour supporter d'autre type il faut créer des converters commons-beanutils * //{@link fr.ifremer.isisfish.rule.RuleHelper#getRuleAsProperties(int, org.nuiton.topia.TopiaContext, Rule)} Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/MetierMonitor.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/MetierMonitor.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/MetierMonitor.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -179,7 +179,7 @@ // ////////////////////////////////////////////////////////////////////////// - /** key <Metier, Month, Month> value: <Licence> */ + /** key <Metier, Month, Month> value: <Licence> */ protected MultiKeyMap list = new MultiKeyMap(); class Licence { Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/Objective.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/Objective.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/Objective.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -41,7 +41,7 @@ * * @param context optimisation context * @param exports exports - * @param observation observation + * @param observations observations * @return double value */ double eval(OptimizationContext context, List<MatrixND> exports, List<MatrixND> observations); Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/PopulationMonitor.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/PopulationMonitor.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/PopulationMonitor.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -70,9 +70,9 @@ protected List<Population> pops = null; /** current number of fish by Pop */ protected Map<Population, MatrixND> Ns = new HashMap<Population, MatrixND>(); - /** reproduction key: <date, pop> value:<MatrixND> */ + /** reproduction key: <date, pop> value:<MatrixND> */ protected Map<Population, Map<TimeStep, MatrixND>> reproductions = new HashMap<Population, Map<TimeStep, MatrixND>>(); - /** discard key: <date, pop> value:<MatrixND> */ + /** discard key: <date, pop> value:<MatrixND> */ protected Map<Population, Map<TimeStep, MatrixND>> discards = new HashMap<Population, Map<TimeStep, MatrixND>>(); /** catch per population, only last catch is remaining */ protected Map<Population, MatrixND> catchs = new HashMap<Population, MatrixND>(); @@ -222,7 +222,7 @@ /** * * TODO les reproductions qui sont trop veille pour encore servir - * doivent être supprimées. c-a-d date < currentDate - etalement - gap between repro recru + * doivent être supprimées. c-a-d date < currentDate - etalement - gap between repro recru * Une autre facon de faire est de supprimer les repro == 0 car normalement * toute la repro doit etre utilisé au bout d'un certain temps * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationContext.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationContext.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationContext.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -46,11 +46,13 @@ /** * Keep all information on one simulation. * - * <li> Launch parameter - * <li> Database (TopiaContext) - * <li> SimulationControl - * <li> Effective by pop (N) - * <li> Result + * <ul> + * <li> Launch parameter</li> + * <li> Database (TopiaContext)</li> + * <li> SimulationControl</li> + * <li> Effective by pop (N)</li> + * <li> Result</li> + * </ul> * * Created: 3 juil. 2006 17:05:27 * @@ -86,7 +88,7 @@ /** TopiaContext must be used to save result */ protected TopiaContext dbResult = null; - /** CacheAspect des variables d'entités. Topia id > map of attributes. */ + /** CacheAspect des variables d'entités. Topia id > map of attributes. */ protected Map<TopiaEntity, SimulationVariable> variablesCache = new HashMap<TopiaEntity, SimulationVariable>(); /** Context value used in equation. */ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationControl.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationControl.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationControl.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -41,7 +41,7 @@ * * Created: Fri Oct 6 2000 * - * @author POUSSIN Benjamin <poussin@codelutin.com> + * @author POUSSIN Benjamin <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationException.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationException.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationException.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -30,7 +30,7 @@ * * Created: Wed Aug 14 2002 * - * @author <poussin@codelutin.com> + * @author <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationMeta.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationMeta.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationMeta.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -40,7 +40,7 @@ /** * This enum represents all properties on which we can perform search. - * <p/> + * * Each constant is also used as acceptor for the property it represents (using {@link FilterAcceptor#accept(Object, Object)} * and permit to access SimulationProperties values with methods * {@link #getValue(SimulationProperties)} Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationProperties.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationProperties.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationProperties.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -42,14 +42,14 @@ /** * This class contains all usefull informations about a simulation. - * <p/> + * * This is used for filter or search a simulation. - * <p/> + * <p> * This is a mix of SimulationParameter and SimulationInformation. - * <p/> - * The class is only a properties container, no method to acces a data directly + * <p> + * The class is only a properties container, no method to access a data directly * (except to obtain name of underlying simulation). - * <p/> + * <p> * For this purpose use {@link SimulationMeta#getValue(SimulationProperties)} * and {@link SimulationMeta#getDateValue(SimulationProperties)} */ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationResultXML.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationResultXML.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationResultXML.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -43,29 +43,29 @@ /** - * <!ELEMENT outData (m,d,i,s)*> - * <!ELEMENT m (dim+, (d|i|s)+)> - * <!ELEMENT dim (label)+)> - * <!ELEMENT d (#PCDATA)> - * <!ELEMENT i (#PCDATA)> - * <!ELEMENT s (#PCDATA)> + * <!ELEMENT outData (m,d,i,s)*> + * <!ELEMENT m (dim+, (d|i|s)+)> + * <!ELEMENT dim (label)+)> + * <!ELEMENT d (#PCDATA)> + * <!ELEMENT i (#PCDATA)> + * <!ELEMENT s (#PCDATA)> * - * <!ATTLIST m + * <!ATTLIST m * name CDATA #REQUIRED - * step CDATA #IMPLIED> + * step CDATA #IMPLIED> * - * <!ATTLIST dim + * <!ATTLIST dim * name CDATA #REQUIRED - * size CDATA #REQUIRED> + * size CDATA #REQUIRED> * - * <!ATTLIST d - * step CDATA #IMPLIED> + * <!ATTLIST d + * step CDATA #IMPLIED> * - * <!ATTLIST i - * step CDATA #IMPLIED> + * <!ATTLIST i + * step CDATA #IMPLIED> * - * <!ATTLIST s - * step CDATA #IMPLIED> + * <!ATTLIST s + * step CDATA #IMPLIED> * * @author poussin */ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationVariable.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationVariable.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulationVariable.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -56,7 +56,7 @@ /** Managed entity id. */ protected TopiaEntity topiaEntity; - /** Variable name > variable entity. */ + /** Variable name > variable entity. */ protected Map<String, Variable> variablesCache = new HashMap<String, Variable>(); public SimulationVariable(SimulationContext simulationContext, TopiaEntity topiaEntity) { Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulatorServerBadIdException.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulatorServerBadIdException.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/SimulatorServerBadIdException.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -30,7 +30,7 @@ * * Created: Fri Sep 6 2002 * - * @author <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin : poussin@codelutin.com * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SSHSimulatorLauncher.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -75,22 +75,22 @@ * * Caparmor file layout ($i = plan/as increment) : * <ul> - * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-preparation.zip - * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-prescript.bsh - * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-script.seq - * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-result.zip - * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-result.zip.md5 - * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-output.txt - * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-pbs.id + * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-preparation.zip</li> + * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-prescript.bsh</li> + * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-script.seq</li> + * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-result.zip</li> + * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-result.zip.md5</li> + * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-output.txt</li> + * <li>$ISIS-TMP/simulation-$id-pbs.id</li> * </ul> * All $ISIS-TMP/simulation-$id-* files are deteled after result download. * * Special case : * <ul> * <li>standalone zip : $ISIS-TMP/simulation-$shortid-result.zip - * (uploaded at first simulation) + * (uploaded at first simulation)</li> * <li>standalone simulations : $ISIS-TMP/simulation-$shortid-script.seq - * (uploaded at last simulation) + * (uploaded at last simulation)</li> * </ul> * where {@code $shortid} is id of parent job (without increment), they are not * deleted after result download. @@ -254,16 +254,16 @@ * * Dans le cas de ssh: * <ul> - * <li>upload la simulation - * <li>construit le script pour qsub - * <li>upload le script qsub - * <li>ajoute le script a qsub - * <ul> + * <li>upload la simulation</li> + * <li>construit le script pour qsub</li> + * <li>upload le script qsub</li> + * <li>ajoute le script a qsub</li> + * </ul> * * Et : * <ul> - * <li>lance le thread de control de la simulation - * <ul> + * <li>lance le thread de control de la simulation</li> + * </ul> */ @Override public void simulate(SimulationService simulationService, @@ -600,7 +600,7 @@ /** * Add ssh key into $HOME/.ssh/authorized_keys file. * - * Just connect and do an "echo xx >> .ssh/authorized_keys" + * Just connect and do an "echo xx >> .ssh/authorized_keys" * * @param session opened session * @param sshKey Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationExecutor.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationExecutor.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationExecutor.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -40,9 +40,11 @@ * executer les jobs soumis dans la queue de {@link SimulationService} * <p> * Les fonctionnalites en plus par rapport a un {@link ThreadPoolExecutor} sont: - * <li> la possibilite de suspendre l'executor puis ensuite de le relancer + * <ul> + * <li> la possibilite de suspendre l'executor puis ensuite de le relancer</li> * <li> l'utilisation de beforeExecute pour fixer le {@link SimulatorLauncher} - * du job + * du job</li> + * </ul> * <p> * Il est aussi possible d'ecoute l'etat de l'attribut pause * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationMonitor.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationMonitor.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationMonitor.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -506,7 +506,7 @@ * * @param job job to check progression * @param launcher SimulatorLauncher that manage simulation - * @return <tt>true</tt> is simulation is finished, <tt>false<tt> otherwise + * @return {@code true} is simulation is finished, {@code false} otherwise */ protected boolean checkProgression(SimulationJob job, SimulatorLauncher launcher) { Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationService.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationService.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/SimulationService.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -1097,12 +1097,14 @@ /** * Prepare les fichiers qui seront utilsé à la simulation: - * <li> scripts - * <li> rules - * <li> exports - * <li> simulators - * <li> export de la database de la region - * <li> simultionplan + * <ul> + * <li> scripts</li> + * <li> rules</li> + * <li> exports</li> + * <li> simulators</li> + * <li> export de la database de la region</li> + * <li> simultionplan</li> + * </ul> * <p> * Le tout est zippé et le zip est retourné, il peut-être directement * importé dans le {@link SimulationStorage} (en le renommant comme Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/package-info.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/package-info.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/launcher/package-info.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -54,7 +54,7 @@ * </ul> * * <h2>Architecture global</h2> - * <img src="doc-files/isis-simulation.png" alt="archi"/> + * <img src="doc-files/isis-simulation.png" alt="archi"> * * <h2>Principe general</h2> * <p> Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/sensitivity/domain/ContinuousDomain.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/sensitivity/domain/ContinuousDomain.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/simulator/sensitivity/domain/ContinuousDomain.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -62,7 +62,7 @@ /** Continuous domain distribution. */ protected Distribution distribution; - /** Distribution params (param name > param value). */ + /** Distribution params (param name > param value). */ protected Map<String, Object> distributionParameters = new HashMap<String, Object>(); /** Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/MatrixType.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/MatrixType.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/MatrixType.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -56,7 +56,7 @@ * * Created: 23 janv. 2006 * - * @author Arnaud Thimel <thimel@codelutin.com> + * @author Arnaud Thimel <thimel@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/MonthType.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/MonthType.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/MonthType.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -40,7 +40,7 @@ * * Created: 19 janv. 2006 * - * @author Arnaud Thimel <thimel@codelutin.com> + * @author Arnaud Thimel <thimel@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/RangeOfValuesType.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/RangeOfValuesType.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/RangeOfValuesType.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -40,7 +40,7 @@ * * Created: 19 janv. 2006 * - * @author Arnaud Thimel <thimel@codelutin.com> + * @author Arnaud Thimel <thimel@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/TimeStepType.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/TimeStepType.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/TimeStepType.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -40,7 +40,7 @@ * * Created: 19 janv. 2006 * - * @author Arnaud Thimel <thimel@codelutin.com> + * @author Arnaud Thimel <thimel@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/TimeUnitType.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/TimeUnitType.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/types/hibernate/TimeUnitType.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -40,7 +40,7 @@ * * Created: 19 janv. 2006 * - * @author Arnaud Thimel <thimel@codelutin.com> + * @author Arnaud Thimel <thimel@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/WelcomeSaveVerifier.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/WelcomeSaveVerifier.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/WelcomeSaveVerifier.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -56,7 +56,7 @@ /** * Check that all 'input' opened interface has no non-saved modification. * - * @return <tt>true> if interface can be closed + * @return {@code true} if interface can be closed */ public boolean allIsSaved() { boolean canExit = true; Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/InputAction.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/InputAction.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/InputAction.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -84,7 +84,7 @@ * * Created: 1 aout 2005 18:37:25 CEST * - * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> * @version $Revision: 1312 $ * * Last update: $Date: 2008-08-28 10:21:07 +0200 (jeu, 28 aoû 2008) $ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/InputSaveVerifier.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/InputSaveVerifier.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/InputSaveVerifier.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -146,7 +146,7 @@ /** * Delete one entity and commit the change, try to selected intelligently * other node in tree. - * <p/> + * <p> * Refresh all ui component where name match "input<entity type without * package >.*" */ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/OpenMapEvents.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/OpenMapEvents.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/OpenMapEvents.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -41,7 +41,7 @@ * * Created: 5 septembre 2005 03:21:41 CEST * - * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> * @version $Revision: 202 $ * * Last update: $Date: 2006-06-30 18:39:09 +0200 (ven, 30 jun 2006) $ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckRegion.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckRegion.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckRegion.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -66,7 +66,7 @@ * * Created: 9 janv. 2004 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResult.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResult.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResult.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -38,7 +38,7 @@ * * Created: 9 janv. 2004 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultFrame.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultFrame.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultFrame.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -37,7 +37,7 @@ * * Created: 10 janv. 2004 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultTableModel.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultTableModel.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultTableModel.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -47,7 +47,7 @@ * * Created: 10 janv. 2004 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultTableRenderer.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultTableRenderer.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/check/CheckResultTableRenderer.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -35,7 +35,7 @@ * * Created: 10 janv. 2004 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/model/GearPopulationSelectivityModel.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/model/GearPopulationSelectivityModel.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/model/GearPopulationSelectivityModel.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -48,8 +48,10 @@ * Table model for {@link Gear}#{@link Selectivity}. * * Columns : + * <ul> * <li>selectivity population name</li> * <li>selectivity equation</li> + * </ul> * * @author chatellier * @version $Revision$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/model/MetierSeasonInfoTargetSpeciesTableModel.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/model/MetierSeasonInfoTargetSpeciesTableModel.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/input/model/MetierSeasonInfoTargetSpeciesTableModel.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -49,9 +49,11 @@ * Table model for {@link MetierSeasonInfo}#{@link TargetSpecies}. * * Columns : + * <ul> * <li>target species name</li> * <li>target species equation</li> * <li>target species primaryCatch</li> + * </ul> * * @author chatellier * @version $Revision$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/models/common/ScriptParametersTableModel.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/models/common/ScriptParametersTableModel.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/models/common/ScriptParametersTableModel.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -43,9 +43,11 @@ * Model de la table de definition de parametre d'un script. * * Columns : + * <ul> * <li>Parameter name</li> * <li>Parameter value</li> * <li>Parameter factor (if enabled)</li> + * </ul> * * @author chatellier * @version $Revision$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/model/FactorCardinalityTableModel.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/model/FactorCardinalityTableModel.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/model/FactorCardinalityTableModel.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -40,9 +40,11 @@ * Model de la table de definition des cadinalité de facteurs. * * Columns : + * <ul> * <li>Factor name</li> * <li>Cardinality</li> - * + * </ul> + * * @author chatellier * @version $Revision$ * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/wizard/ContinuousPanel.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/wizard/ContinuousPanel.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/sensitivity/wizard/ContinuousPanel.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -32,7 +32,7 @@ * <ul> * <li>{@link EquationContinuousPanelUI}</li> * <li>{@link ContinuousDistributionPanel}</li> - * <ul> + * </ul> * * @author chatellier * @version $Revision$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/simulator/SimulAction.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/simulator/SimulAction.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/simulator/SimulAction.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -106,7 +106,7 @@ * * Created: 1 aout 2005 18:37:25 CEST * - * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Last update: $Date$ @@ -267,7 +267,7 @@ * <li>params</li> * <li>simulation plans</li> * <li>factors list</li> - * <ul> + * </ul> * * Open old simulation: * <ul> Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/simulator/filter/SimulationFilterUtil.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/simulator/filter/SimulationFilterUtil.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/simulator/filter/SimulationFilterUtil.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -43,7 +43,7 @@ import java.util.TreeMap; /** - * This class offers methods to select or filter simulation name via an ui + * This class offers methods to select or filter simulation name via an ui. * * @see #selectSimulation(List) * @see #selectSimulation(FilterModel) @@ -55,14 +55,14 @@ static private Log log = LogFactory.getLog(SimulationFilterUtil.class); /** - * Open the filter simulation filter dialog using list of simualtion names - * to create FilterModel, and waits for user to select a simualtion in a non + * Open the filter simulation filter dialog using list of simulation names + * to create FilterModel, and waits for user to select a simulation in a non * empty filter result. - * <p/> + * * If user cancels, it returns <code>null</code> * * @param names the list of simulation names to used - * @return name of the simulation choosed by user or null if it cancel + * @return name of the simulation chosen by user or null if it cancel * operation * @throws java.text.ParseException if problem while init dialogModel * @throws java.io.IOException todo @@ -80,11 +80,11 @@ /** * Open the filter simulation filter dialog using directly a given - * FilterModel, and waits for user to select a simualtion in a non + * FilterModel, and waits for user to select a simulation in a non * empty filter result. * * @param model model to used - * @return name of the simulation choosed by user or null if it cancel + * @return name of the simulation chosen by user or null if it cancel * operation * @throws java.text.ParseException if problem while init dialogModel * @throws java.io.IOException todo @@ -110,7 +110,7 @@ * Open the filter simulation dialog and waits for user to accept a * non empty filter result. * It used a list of simulation names to create FilterModel. - * <p/> + * <p> * If user cancels, it returns an empty list. * * @param names the list of simulation names to used @@ -132,7 +132,7 @@ * Open the filter simulation dialog and waits for user to accept a * non empty filter result. * It used directly the given FilterModel. - * <p/> + * <p> * If user cancels, it returns the previous result list. * * @param model filterModel to use Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/Interval.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/Interval.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/Interval.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -37,7 +37,7 @@ * * Created: Wed Oct 4 2000 * - * @author POUSSIN Benjamin <bpoussin@free.fr> Copyright COGITEC + * @author POUSSIN Benjamin <bpoussin@free.fr> Copyright COGITEC * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/editor/EquationTableEditor.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/editor/EquationTableEditor.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/editor/EquationTableEditor.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -51,7 +51,7 @@ * * Created: 23 mars 2004 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/AcceptorFactory.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/AcceptorFactory.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/AcceptorFactory.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -34,7 +34,7 @@ /** * This class is an Acceptor factory. - * <p/> + * <p> * For simple {@link Acceptor} we use a cache to use an unique instance. * * @author chemit Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/CompositeFilterAcceptor.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/CompositeFilterAcceptor.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/CompositeFilterAcceptor.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -27,10 +27,9 @@ /** - * this class is a concrete implementation of {@link FilterAcceptor} + * This class is a concrete implementation of {@link FilterAcceptor} * with an internal {@link Acceptor} (delegate Acceptor operations), - * and an internal {@link ValueGetter} (delegate ValueGetter operations) - * <p/> + * and an internal {@link ValueGetter} (delegate ValueGetter operations). * * @author chemit * @see Acceptor Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterAcceptor.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterAcceptor.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterAcceptor.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -27,8 +27,7 @@ /** * Class representing an Acceptor and ValueGetter for object of - * type <code>M</code> and parameter of type <code>T</code> - * <p/> + * type <code>M</code> and parameter of type <code>T</code>. * * @author chemit * @see Acceptor Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterDialog.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterDialog.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterDialog.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -30,22 +30,22 @@ /** * Contrat à respecter pour qu'un dialogue puisse bénéficier du mécanisme de * filtre. - * <p/> * * Cette méthode est invoquée lors d'un appel à {@link #doFilter()} ou * {@link #doCheck()}. - * <p/> + * <p> * La méthode {@link #doReset()} permet de réinitialiser le dialogModel * (et le dialogue) */ public interface FilterDialog<M, R> { /** - * launch filter proccess. - * <p/> + * launch filter process. + * * This operation acts in three step : - * <ul><li>clean model</li> - * <ul><li>push ui values to model </li> + * <ul> + * <li>clean model</li> + * <li>push ui values to model </li> * <li> for all original items and only for detected as usable params * try to accept item</li> * </ul> Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterModel.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterModel.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/ui/widget/filter/FilterModel.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -34,7 +34,7 @@ /** * This class represents a generic filter model. - * <p/> + * * It contains all data to be used for filter process. * * @author chemit @@ -52,7 +52,7 @@ /** list of param keys to be used */ protected List<String> paramKeys; - /** map -> paramKey to param models */ + /** map -> paramKey to param models */ protected Map<String, FilterParamModel<M, ?>> paramModels; /** * flag to says inclusive mode (need one param accept) Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ArgTypes.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ArgTypes.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ArgTypes.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -33,7 +33,7 @@ /** * Annotation utilisée pour specifier le type des parametres. * - * Pour etre plus explicit que "List" en renseignant "List<Zone>" par exemple. + * Pour etre plus explicit que "List" en renseignant "List<Zone>" par exemple. * * Doit pouvoir être remplacé par l'introspection java sans problème. * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/CellPointcomparator.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/CellPointcomparator.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/CellPointcomparator.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -36,7 +36,7 @@ * * Created: 6 septembre 2005 00:57:33 CEST * - * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin POUSSIN <poussin@codelutin.com> * * @version $Revision$ * Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/CompileHelper.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/CompileHelper.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/CompileHelper.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -154,10 +154,12 @@ * @param out l'objet sur lequel on ecrit la sortie (erreur) de la * compilation * @return un nombre different de 0 s'il y a une erreur + * <ul> * <li> -1000 si l'exception vient de la recherche du compilateur par - * introspection - * <li> -10000 si une autre exception - * <li> sinon les valeurs retourné par le compilateur java + * introspection</li> + * <li> -10000 si une autre exception</li> + * <li> sinon les valeurs retourné par le compilateur java</li> + * </ul> */ public static int compile(File rootSrc, File src, File dest, PrintWriter out) { int result = compile(rootSrc, Collections.singletonList(src), dest, out); @@ -174,10 +176,12 @@ * @param out l'objet sur lequel on ecrit la sortie (erreur) de la * compilation * @return un nombre different de 0 s'il y a une erreur + * <ul> * <li> -1000 si l'exception vient de la recherche du compilateur par - * introspection - * <li> -10000 si une autre exception - * <li> sinon les valeurs retourné par le compilateur java + * introspection</li> + * <li> -10000 si une autre exception</li> + * <li> sinon les valeurs retourné par le compilateur java</li> + * </ul> */ public static int compile(File rootSrc, Collection<File> src, File dest, PrintWriter out) { @@ -260,8 +264,8 @@ * * Add : * <ul> - * <li>System.getProperty("java.class.path") - * <li>All first jar dependency (META-INF/MANIFEST.MF) + * <li>System.getProperty("java.class.path")</li> + * <li>All first jar dependency (META-INF/MANIFEST.MF)</li> * </ul> * @param classpath initial classpath * @return classpath as string Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/IsisCacheBackendOnReferenceMap.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/IsisCacheBackendOnReferenceMap.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/IsisCacheBackendOnReferenceMap.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -34,15 +34,15 @@ /** * IsisCacheBackendOnReferenceMap utilise pour mettre les resultats de methode durant la simulation - pour minimiser les appels - - Created: 25 août 06 22:42:47 + * pour minimiser les appels * + * Created: 25 août 06 22:42:47 + * * @author poussin * @version $Revision$ - - Last update: $Date$ - by : $Author$ + * + * Last update: $Date$ + * by : $Author$ */ public class IsisCacheBackendOnReferenceMap implements IsisCacheBackend { @@ -64,7 +64,7 @@ static final private Object NULL = new Object(); /** - * map<TimeStep, Map<Key, Value>> + * map<TimeStep, Map<Key, Value>> * TimeStep peut etre null via l'objet NULL * Key est la cle calcule par computeKey * Value est la valeur du cache @@ -129,7 +129,7 @@ } /** - * remove all values in cache for the specied TimeStep + * remove all values in cache for the specified TimeStep */ @Override public void removeStep(Object o) { Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHAgent.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHAgent.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHAgent.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -61,7 +61,7 @@ /** * Passphrase associated to key file path. * - * private key file path => passphrase. + * private key file path =< passphrase. * * Ensure that passphrase are valid before add into. */ Modified: branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHUtils.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHUtils.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/main/java/fr/ifremer/isisfish/util/ssh/SSHUtils.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -133,7 +133,7 @@ } /** - * Track progress every 10% if 100kb < filesize < 1mb. For larger + * Track progress every 10% if 100kb < filesize < 1mb. For larger * files track progress for every percent transmitted. * @param filesize the size of the file been transmitted * @param totalLength the total transmission size Modified: branches/4.0.1/src/test/java/fr/ifremer/isisfish/entity/PersistenceTest.java =================================================================== --- branches/4.0.1/src/test/java/fr/ifremer/isisfish/entity/PersistenceTest.java 2014-03-25 17:03:20 UTC (rev 3908) +++ branches/4.0.1/src/test/java/fr/ifremer/isisfish/entity/PersistenceTest.java 2014-03-25 21:46:51 UTC (rev 3909) @@ -85,7 +85,7 @@ * * Created: 3 août 2004 * - * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> + * @author Benjamin Poussin <poussin@codelutin.com> * @version $Revision$ * * Mise a jour: $Date$