=============================== CR Réunion IsisFish du 27/08/12 ===============================
Présents : Stéphanie, Jean, Eric.
Paramètrescontinus: par défaut en distributionuniforme %. Avantage : fonctionnepour toutes les méthodes.
Les paramètresdiscrets n'ont pas de distribution non, ils peuvent avoir une distribution. Et il faut prevoir le cas. Il se trouve qu'actuellement aucune des methodes qui sont proposees pour les param discrets ne travaillent sur les distributions.
Quantile function = distribution inverse pour passer de [0,1] à la distribution.
Gestion de la distribution dans les méthodes d'AS =================================================
Passage en revue des méthodes d'AS pour étudier le support de la distribution.
Morris ------
Message d'erreur si tous les paramètres ne sont pas continus et bornés.
Sobol -----
Message d'erreur si tous les facteurs ne sont pas continus Utiliser Sobol2002 Stephanie doit vérifier si on peut pas accepter des discrets.
LHS (Random, Optimum) ---------------------
Message d'erreur si tous les paramètres ne sont pas continus Besoin d'appliquer la fonction inverse de distribution sur le retour de la méthode LHS pour prendre en compte la distribution.
Rajouter une méthode RandomLHSFiltrée (en plus de RandomLHS) qui enlève les lignes en double. Garder le nombre de lignes stockées dans une variable dans le RData.
Fast ----
Message d'erreur si tous les facteurs ne sont pas continus
regularFractions ----------------
Voir si on utilise pas le package de Hervé. Envoyer un mail sur ML Mexico. Fonctionne que sur discret. Si continu, besoin de discrétisation. Il faudrait peut-être faire ça en R et proposer à Hervé si il ne le fait pas déjà dans son package. En attendant une vrai release sur CRAN du package d'Hervé, on utilise la fonction.
expandGrid ----------
Renommer en regularExpandGrid. Afficher un message d'erreur si tous les paramètres ne sont pas bornés.
Créer un nouveau script randomExpandGrid qui prend la distribution (utiliser d.... pour le tirage) c'est un cas de figure ou la distribution des parametres discrets
Merci Eric mes commentaires : Le 28/08/2012 10:06, Eric Chatellier a écrit : pourrait etre utilisee
JavaExpandGrid --------------
A supprimer
FrF2 ----
A supprimer
RDOptimal ---------
Basé sur l'expandGrid donc idem ExpandGrid
Tous ----
Renommer les classes pour ne pas avoir SensitivityCalculatorR en préfixe. A vérifier la raison du préfixe.
Propriétés distribution =======================
Dans l'API d'ISIS-Fish, configurer chaque distribution pour déterminer: * si les paramètres sont bornésou pas. * si les paramètres doivent être continusou pas
Divers ======
A faire : * Permettre d'exporter/importer l'arbre des facteurs (Mexico ?) pour les advanced users.
utile pour faire des plans d'analyse qui ne rentrent pas dans la configuration AS
* Il y a déjà les méthodes pour. Rajouter les boutons.
Memory leak: ------------ Eric fait une release dans l'aprèm pour : * corriger le problème de mémoire récemment corrigé * optimiser l'utilisationdu cache Isis * supprimerla base sur Caparmor quand AS pour Steph.
Manuel ======
Rajouter : Dire qu'on fait anova pour les méthodes ....., pour modifier il faut aller taper dans le RData. Plus generalement, mettre le manuel à jour pour les AS et le reste a-t-on rajouter une description de la partie "Variable"?
Envisager une traduction du manuel en anglais
-- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas@ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................