[Isis-fish-users] PBS sur cluster

[Eric Chatellier]

> Bonjour Eric,
Bonjour,

> Par contre il semble que le gestionnaire de job ne reçoive pas bien
> l’information pour lancer la simu.
>
> On ne trouve pas de fichier de type attendu.
De quel fichier parler vous ?


> Je mets ci-dessous un fichier toto.pbs de la forme et avec les
> instructions
> attendu par PBS. On arrive à faire tourner la simu en le lançant à la
> main.

La simulation apparait-elle dans la queue des simulations en cours (dans
isis) ?

Sur le cluster, il doit y avoir plusieurs fichiers dans
le dossier "isis-tmp" :
 - simulation-sim_sim_test_1_2010-04-19-16-52_2010-04-29-08-51-pbs.id
(l'identifiant du job)
 - simulation-sim_sim_test_1_2010-04-19-16-52_2010-04-29-08-51-output.txt
(la sortie de isis sur le cluster)

Et si la simulations a réussie:
 - simulation-sim_sim_test_1_2010-04-19-16-52_2010-04-29-08-51-result.zip
 - simulation-sim_sim_test_1_2010-04-19-16-52_2010-04-29-08-51-result.md5

> Un autre soucis : le nom de la simu contient un espace (entre le nom entré
> par l’utilisateur et la date incrémentée automatiquement), ça pose
> problème lors de la lecture du fichier

Quel soucis, vous avez un message d'erreur en particulier ?

Normalement les identifiants sont entre quote "",
les espaces ne devrait pas poser de problèmes.

Plus globalement, il devrait y avoir des erreurs sur le isis client
(debug.txt) ou sur le isis cluster (output.txt).

Autre question sinon, qu'affiche la commande qsub lorsque
vous la lancez à la main ?
De mémoire sour caparmor ca écrit :
$ qsub -q qLong
simulation-sim_sim_test_1_2010-04-19-16-52_2010-04-29-08-51-script.seq
46456465.service4

46456465.service4 est l'identifiant du job.

Sur caparmor, qsub sort églalement des fichiers dans le compte
utilisateur pour savoir si la soumission du job à réussie.
-- 
Éric Chatellier