[Isis-fish-users] Datarmor : usage des noeuds de login

slehuta Sigrid.Lehuta at ifremer.fr
Mar 24 Mar 23:31:19 CET 2020


Bonsoir,  

J ai testé une simu simple sur datarmor en remplacant le serveur
datarmor par datasession0 

la simu s arrete en janvier 0 et voici le debug. je n y vois rien d
instructif... Et toi ?  

Merci 

2020-03-24 23:11:33,378 INFO [AWT-EventQueue-0]
(SimulationControl.java:206) setText - backup database en cours
2020-03-24 23:11:33,430 INFO [AWT-EventQueue-0]
(SimulationControl.java:206) setText - backup database terminé
2020-03-24 23:11:33,435 INFO [AWT-EventQueue-0]
(SimulationControl.java:206) setText - Compilation des scripts
2020-03-24 23:11:33,816 INFO [AWT-EventQueue-0]
(SimulationControl.java:206) setText - Temps de compilation 0.379s
2020-03-24 23:11:33,928 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationJob.java:210)
run - Start simulation: sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11
2020-03-24 23:11:33,932 INFO [pool-4-thread-1]
(SimulationMonitor.java:347) simulationStart - Saving simulation
sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11 as started
2020-03-24 23:11:33,932 INFO [pool-4-thread-1]
(SSHSimulatorLauncher.java:166) message - Connexion à Datarmor
2020-03-24 23:11:33,932 INFO [pool-4-thread-1]
(SimulationControl.java:206) setText - Connexion à Datarmor
2020-03-24 23:11:33,937 INFO [pool-4-thread-1]
(SSHSimulatorLauncher.java:532) openSSHSession - Try to log on
slehuta at datasession0:22
2020-03-24 23:11:33,937 INFO [pool-4-thread-1]
(SSHSimulatorLauncher.java:548) openSSHSession - Can't read ssh key :
C:\Users\slehuta\.ssh\isis_rsa
2020-03-24 23:11:33,941 INFO [AWT-EventQueue-0]
(SimulationStorage.java:571) getSimulation - Try to open simulation
sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11(C:\Users\slehuta\isis-fish-4\isis-database\simulations\sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11)
2020-03-24 23:11:39,616 INFO [pool-4-thread-1]
(SSHSimulatorLauncher.java:166) message - Upload de la simulation
2020-03-24 23:11:39,617 INFO [pool-4-thread-1]
(SimulationControl.java:206) setText - Upload de la simulation
2020-03-24 23:11:39,617 INFO [pool-4-thread-1]
(SSHSimulatorLauncher.java:700) uploadSimulation - Creating remote temp
directory (if not exists) /home1/datahome/slehuta/isis-tmp/
2020-03-24 23:11:40,094 INFO [pool-4-thread-1] (SSHUtils.java:221) exec
- JSch channel exit-status: 0
2020-03-24 23:11:44,227 INFO [pool-4-thread-1]
(SSHSimulatorLauncher.java:166) message - Attente du démarrage de la
simulation
2020-03-24 23:11:44,228 INFO [pool-4-thread-1]
(SimulationControl.java:206) setText - Attente du démarrage de la
simulation
2020-03-24 23:11:45,477 INFO [pool-4-thread-1] (SSHUtils.java:221) exec
- JSch channel exit-status: 0
2020-03-24 23:11:45,477 INFO [pool-4-thread-1]
(SSHSimulatorLauncher.java:1159) sendStartSimulationRequest - Job
submitted with job id : 8129535.datarmor0
2020-03-24 23:15:35,949 INFO [monitor-thread]
(SimulationControl.java:206) setText - Téléchargement des résultats
2020-03-24 23:15:40,421 INFO [monitor-thread]
(SimulationControl.java:206) setText - Simulation terminée
2020-03-24 23:15:40,422 INFO [monitor-thread]
(SimulationControl.java:206) setText - Suppression des fichiers de
simulation
2020-03-24 23:15:40,807 INFO [monitor-thread] (SSHUtils.java:221) exec -
JSch channel exit-status: 0
2020-03-24 23:15:41,065 WARN [monitor-thread]
(SimulationMonitor.java:533) checkProgression - Simulation exception :
java.lang.NullPointerException
at
fr.ifremer.isisfish.result.ResultInfoHelper.extractRecursiveResults(ResultInfoHelper.java:93)
at
fr.ifremer.isisfish.result.ResultInfoHelper.extractAllNecessaryResults(ResultInfoHelper.java:71)
at
fr.ifremer.isisfish.simulator.ResultManager.isEnabled(ResultManager.java:208)
at simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:178)
at
fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:430)
at
fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:260)


2020-03-24 23:15:41,065 INFO [monitor-thread]
(SimulationMonitor.java:457) waitAndCheckProgression - Job
sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11 finished
2020-03-24 23:15:41,065 INFO [monitor-thread]
(SimulationMonitor.java:568) doPostSimulationOperation - Do post
simulation operation for sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11
2020-03-24 23:15:41,066 INFO [monitor-thread]
(SimulationMonitor.java:391) simulationStop - Saving simulation
sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11 as stopped
2020-03-24 23:24:05,559 INFO [AWT-EventQueue-0]
(LogConsoleHandler.java:103) <init> -
fr.ifremer.isisfish.logging.console.LogConsoleHandler at 389b7dbd
2020-03-24 23:24:05,563 INFO [AWT-EventQueue-0]
(LogConsoleHandler.java:399) getLevelReader -
(levels:[])(file:simulation.log (offsetfile:offsets_0, nbLines:30))
2020-03-24 23:24:05,564 INFO [AWT-EventQueue-0]
(LogConsoleHandler.java:125) start - with reader
(levels:[])(file:simulation.log (offsetfile:offsets_0, nbLines:30)) in 5
2020-03-24 23:24:05,564 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsole.java:118)
newConsole - handler start in 5
2020-03-24 23:24:05,590 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsole.java:160)
<init> -
fr.ifremer.isisfish.logging.console.LogConsole[$JFrame0,0,0,543x509,invalid,hidden,layout=java.awt.BorderLayout,title=Console
de log simulation
'sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11',resizable,normal,defaultCloseOperation=DISPOSE_ON_CLOSE,rootPane=javax.swing.JRootPane[,8,31,527x470,invalid,layout=javax.swing.JRootPane$RootLayout,alignmentX=0.0,alignmentY=0.0,border=javax.swing.plaf.synth.SynthBorder at 1d31d011,flags=16777673,maximumSize=,minimumSize=,preferredSize=],rootPaneCheckingEnabled=true]
2020-03-24 23:24:05,590 INFO [AWT-EventQueue-0]
(LogConsoleHandler.java:263) propertyChange - change newLinesInEditor :
30 --> 26
2020-03-24 23:24:05,605 INFO [AWT-EventQueue-0]
(SimulationLoggerUtil.java:82) showSimulationLogConsole - affichage de
la console de log pour la simulation
sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11
2020-03-24 23:24:05,613 INFO [AWT-EventQueue-0]
(LogConsoleHandler.java:263) propertyChange - change newLinesInEditor :
26 --> 25
2020-03-24 23:24:07,383 INFO [AWT-EventQueue-0]
(LogConsoleHandler.java:263) propertyChange - change newLinesInEditor :
25 --> 67

Le 2020-03-24 14:36, D Croizé-Fillon a écrit :

> Cela devrait également être possible pour vous maintenant
> 
> Denis
> 
> Le 24/03/2020 à 10:17, D Croizé-Fillon a écrit : C'est un problème d'accès via pulse.
> 
> J'attends des ajustements mais ce n'est pas encore en place.
> 
> Pour l'instant, elle vous est inaccessible via pulse mais Sigrid a l'accès
> 
> Denis
> 
> Le 24/03/2020 à 10:11, Eric Chatellier a écrit : Le 24/03/2020 à 09:00, D Croizé-Fillon a écrit : Bonjour,
> 
> pourriez vous essayer en ne changeant que le serveur cible ?
> 
> La soumission de job est possible (mais je n'ai pas beaucoup validé, c'est du test). Le qsub interactif ne fonctionne pour l'instant pas. 
> Bonjour,
> 
> Je voulais tester, mais j'ai l'impression que la machine est inacessible
> 
> ssh echatell at datasession0.ifremer.fr
> ssh: connect to host datasession0.ifremer.fr port 22: Connection timed out
> 
> J'y arrive sans problème sur "datarmor.ifremer.fr"
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