[Isis-fish-users] Datarmor : usage des noeuds de login FIXED

[slehuta]

Autant pour moi la simu "simple" etait foireuse. Ca marche avec
datasession0.  

J ai aussi trouvé un moyen de lancer les plans de simus depuis datarmor
sans transferts de fichiers (meme system qu avec calibrar avec un
wrapper R). Je privilegierai ce system autant que possible avant la
prochaine version.  

Merci

Le 2020-03-24 23:31, slehuta a écrit :

> Bonsoir,  
> 
> J ai testé une simu simple sur datarmor en remplacant le serveur datarmor par datasession0 
> 
> la simu s arrete en janvier 0 et voici le debug. je n y vois rien d instructif... Et toi ?  
> 
> Merci 
> 
> 2020-03-24 23:11:33,378 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:206) setText - backup database en cours
> 2020-03-24 23:11:33,430 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:206) setText - backup database terminé
> 2020-03-24 23:11:33,435 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:206) setText - Compilation des scripts
> 2020-03-24 23:11:33,816 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:206) setText - Temps de compilation 0.379s
> 2020-03-24 23:11:33,928 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationJob.java:210) run - Start simulation: sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11
> 2020-03-24 23:11:33,932 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationMonitor.java:347) simulationStart - Saving simulation sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11 as started
> 2020-03-24 23:11:33,932 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:166) message - Connexion à Datarmor
> 2020-03-24 23:11:33,932 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationControl.java:206) setText - Connexion à Datarmor
> 2020-03-24 23:11:33,937 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:532) openSSHSession - Try to log on slehuta at datasession0:22
> 2020-03-24 23:11:33,937 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:548) openSSHSession - Can't read ssh key : C:\Users\slehuta\.ssh\isis_rsa
> 2020-03-24 23:11:33,941 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationStorage.java:571) getSimulation - Try to open simulation sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11(C:\Users\slehuta\isis-fish-4\isis-database\simulations\sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11)
> 2020-03-24 23:11:39,616 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:166) message - Upload de la simulation
> 2020-03-24 23:11:39,617 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationControl.java:206) setText - Upload de la simulation
> 2020-03-24 23:11:39,617 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:700) uploadSimulation - Creating remote temp directory (if not exists) /home1/datahome/slehuta/isis-tmp/
> 2020-03-24 23:11:40,094 INFO [pool-4-thread-1] (SSHUtils.java:221) exec - JSch channel exit-status: 0
> 2020-03-24 23:11:44,227 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:166) message - Attente du démarrage de la simulation
> 2020-03-24 23:11:44,228 INFO [pool-4-thread-1] (SimulationControl.java:206) setText - Attente du démarrage de la simulation
> 2020-03-24 23:11:45,477 INFO [pool-4-thread-1] (SSHUtils.java:221) exec - JSch channel exit-status: 0
> 2020-03-24 23:11:45,477 INFO [pool-4-thread-1] (SSHSimulatorLauncher.java:1159) sendStartSimulationRequest - Job submitted with job id : 8129535.datarmor0
> 2020-03-24 23:15:35,949 INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:206) setText - Téléchargement des résultats
> 2020-03-24 23:15:40,421 INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:206) setText - Simulation terminée
> 2020-03-24 23:15:40,422 INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:206) setText - Suppression des fichiers de simulation
> 2020-03-24 23:15:40,807 INFO [monitor-thread] (SSHUtils.java:221) exec - JSch channel exit-status: 0
> 2020-03-24 23:15:41,065 WARN [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:533) checkProgression - Simulation exception : java.lang.NullPointerException
> at fr.ifremer.isisfish.result.ResultInfoHelper.extractRecursiveResults(ResultInfoHelper.java:93)
> at fr.ifremer.isisfish.result.ResultInfoHelper.extractAllNecessaryResults(ResultInfoHelper.java:71)
> at fr.ifremer.isisfish.simulator.ResultManager.isEnabled(ResultManager.java:208)
> at simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:178)
> at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:430)
> at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:260) 
> 
> 2020-03-24 23:15:41,065 INFO [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:457) waitAndCheckProgression - Job sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11 finished
> 2020-03-24 23:15:41,065 INFO [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:568) doPostSimulationOperation - Do post simulation operation for sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11
> 2020-03-24 23:15:41,066 INFO [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:391) simulationStop - Saving simulation sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11 as stopped
> 2020-03-24 23:24:05,559 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:103) <init> - fr.ifremer.isisfish.logging.console.LogConsoleHandler at 389b7dbd
> 2020-03-24 23:24:05,563 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:399) getLevelReader - (levels:[])(file:simulation.log (offsetfile:offsets_0, nbLines:30))
> 2020-03-24 23:24:05,564 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:125) start - with reader (levels:[])(file:simulation.log (offsetfile:offsets_0, nbLines:30)) in 5
> 2020-03-24 23:24:05,564 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsole.java:118) newConsole - handler start in 5
> 2020-03-24 23:24:05,590 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsole.java:160) <init> - fr.ifremer.isisfish.logging.console.LogConsole[$JFrame0,0,0,543x509,invalid,hidden,layout=java.awt.BorderLayout,title=Console de log simulation 'sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11',resizable,normal,defaultCloseOperation=DISPOSE_ON_CLOSE,rootPane=javax.swing.JRootPane[,8,31,527x470,invalid,layout=javax.swing.JRootPane$RootLayout,alignmentX=0.0,alignmentY=0.0,border=javax.swing.plaf.synth.SynthBorder at 1d31d011,flags=16777673,maximumSize=,minimumSize=,preferredSize=],rootPaneCheckingEnabled=true]
> 2020-03-24 23:24:05,590 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:263) propertyChange - change newLinesInEditor : 30 --> 26
> 2020-03-24 23:24:05,605 INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationLoggerUtil.java:82) showSimulationLogConsole - affichage de la console de log pour la simulation sim_Test_datasession0_2020-03-24-23-11
> 2020-03-24 23:24:05,613 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:263) propertyChange - change newLinesInEditor : 26 --> 25
> 2020-03-24 23:24:07,383 INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:263) propertyChange - change newLinesInEditor : 25 --> 67
> 
> Le 2020-03-24 14:36, D Croizé-Fillon a écrit : 
> Cela devrait également être possible pour vous maintenant
> 
> Denis
> 
> Le 24/03/2020 à 10:17, D Croizé-Fillon a écrit : C'est un problème d'accès via pulse.
> 
> J'attends des ajustements mais ce n'est pas encore en place.
> 
> Pour l'instant, elle vous est inaccessible via pulse mais Sigrid a l'accès
> 
> Denis
> 
> Le 24/03/2020 à 10:11, Eric Chatellier a écrit : Le 24/03/2020 à 09:00, D Croizé-Fillon a écrit : Bonjour,
> 
> pourriez vous essayer en ne changeant que le serveur cible ?
> 
> La soumission de job est possible (mais je n'ai pas beaucoup validé, c'est du test). Le qsub interactif ne fonctionne pour l'instant pas. 
> Bonjour,
> 
> Je voulais tester, mais j'ai l'impression que la machine est inacessible
> 
> ssh echatell at datasession0.ifremer.fr
> ssh: connect to host datasession0.ifremer.fr port 22: Connection timed out
> 
> J'y arrive sans problème sur "datarmor.ifremer.fr"
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