March 2014 - Echobase-devel - mailman.cloud.codelutin.com

Formats pour le site des indicateurs
by Tony Chemit 06 Mar '14

06 Mar '14

Hello, J'ai un peu retravaillé Coser et on devrait au final être libre de faire ce que l'on veut. On peut alors utiliser aussi des espèces pour les listes d'espèces. J'ai joint des examples de fichiers d'indicateurs (indicators*.csv). A toi de me dire si tu préfères qu'on conserve l'ancien format (fichiers EST*.txt). Au final je pense qu'on a besoin d'à peu près toutes les données, donc... il est peut-être plus judicieux de conserver le même format (le nom des colonnes je veux dire). Il me faut aussi des informations pour ta série de campagne, je te joins le fichier des zones si tu peux rajouter une ligne et me le renvoyer c'est cool (fichier webzones.csv). Aussi joint le fichier des types d'indicateurs, si ça ne te convient pas, il faut que tu rajoutes des lignes dedans (fichier webindicators.csv). Voila si tu peux me faire ça fissa, ça me permettra d'intégrer ça dans Coser au plus vite. N'hésites pas à appeler si besoin. tony. -- Tony Chemit -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 http://www.codelutin.com email: chemit(a)codelutin.com twitter: https://twitter.com/tchemit

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Protocole PELGAS?
by Tony Chemit 06 Mar '14

06 Mar '14

Salut, Il faudra aussi je pense fournir un protocole pour complêter la page : http://www.ifremer.fr/SIH-indices-campagnes/survey.action tony. -- Tony Chemit -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 http://www.codelutin.com email: chemit(a)codelutin.com twitter: https://twitter.com/tchemit

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Exemple du format des communautés d'espèces
by Tony Chemit 04 Mar '14

04 Mar '14

La dernière colonne (colonne Code) est utilisée pour les indicateurs communautés. bon courage! tony. -- Tony Chemit -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 http://www.codelutin.com email: chemit(a)codelutin.com twitter: https://twitter.com/tchemit

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Exemples de fichier d'indicateur pour Coser
by Tony Chemit 04 Mar '14

04 Mar '14

-- Tony Chemit -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 http://www.codelutin.com email: chemit(a)codelutin.com twitter: https://twitter.com/tchemit

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Release EchoR
by Mathieu Doray 03 Mar '14

03 Mar '14

Salut! je viens de faire une release d'EchoR qui intègre la fonction 'GridMap4Echobase' qui permet d'interroger Echobase et de créer les cartes pour le site des indicateurs. La fonction a un fichier d'aide et s'utilise comme ça : path.maps='~/.gvfs/donnees2 sur nantes/Campagnes/bd/Echobase/ConnectionExterne/R/' library(EchoR) GridMaps4Echobase(mission='PELGAS',voyage='%',path.export=path.maps,host='acoustica',dbname='Echobase-test',user='echobase', password='echobase',port=5433) Elle crée des fichiers images avec les cartes des valeurs moyennes dans le dossier path.export/meanMaps/ Tu peux télécharger le package ici : https://forge.ifremer.fr/frs/?group_id=212 Les packages R requis sont listés là : https://forge.ifremer.fr/plugins/mediawiki/wiki/echor/index.php/Help#Softwa… A demain... M -- Mathieu Doray, PhD Ifremer Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique rue de l'Ile d'Yeu B.P. 21105 44311 Nantes Cedex 03 mathieu.doray(a)ifremer.fr Tel./Phone: 02 40 37 41 65 / International: 332 40 37 41 65 Fax : 02.40.37.40.01 / International: 332 40 37 40 01 CV / resume: http://annuaire.ifremer.fr/cv/17093/

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