May 2011 - Isis-fish-devel - mailman.cloud.codelutin.com

Versions de R utilisées par Isis
by Eric Chatellier 31 May '11

31 May '11

Bonjour, Je viens de regarder comment fonctionnait jri (pour accéder a R en java). Sous windows seulement, il y a une restriction de version, jri (2.9.x ne fonctionne que avec R 2.9.x) c'est qu'on a actuellement. J'ai essayer de mettre a jour jri : jri (2.11.1 fonctionne avec 2.13.x, mais pas avec 2.9.x). C'est un bug de la librairie, il ne compare que les 3 premiers caractères de la version. Faut-il mettre à jour la version pour pouvoir utiliser des versions plus récentes de R ? -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Import des matrices ND
by Eric Chatellier 31 May '11

31 May '11

Bonjour Stéphanie, Il ne va pas être possible d'avoir le code d'import des matrices ND dans la version actuelle de IsisFish. (dans la prochaine oui). En attendant, je t'ai fait une règle qui contient une copie du code d'import que tu pourras utiliser. À voir peut-être avec un dev car le code est un peu jeune et pas forcement évident à utiliser. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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structure du fichier pour utiliser importCSV
by Stephanie MAHEVAS 24 May '11

24 May '11

Bonjour je voudrais initialiser une matrice ND à partir d'un fichier csv avec la methode importCVS. Il s'agit d'une matrice à 3 dimensions. Comment doit etre structuré le fichier? Quelle est la regle generale quelque soit la dimension? J'aurais peut-etre pu repondre moi-meme à la question en regardant le source de cette methode mais je ne sais pas comment y acceder... :-\ il n'y a pas src à côté de javaDoc Nuiton-Matrix. merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Nouveau repo pour les scripts
by Benjamin POUSSIN 23 May '11

23 May '11

Salut, Eric, j'ai normalement tout fait pour que ca marche, il faut maintenant verifier et corriger :). - script python qui genere le fichier de mot de passe - cron qui le lance une fois par jour - conf apache qui l'utilise Le repo http://www.isis-fish.org/svn/isis-fish-public/ est accessible en lecture sans mot de passe, il faudra vérifier que pour l'écriture ce n'est pas le cas :D -- Benjamin POUSSIN -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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forcer Fishing Mortality
by Stephanie.Mahevas＠ifremer.fr 19 May '11

19 May '11

Bonjour je voudrais court-circuiter le calcul de F dans ISIS. Bon evidemment ca doit vous paraitre bizarre puisqu'ISIS est initialement fait pour ca... mais bon les pressions sont fortes pour que l'on puisse tester des procedures avec de F fixes. J'avoue ne pas trop savoir comment prendre le truc par le bon bout. Je ne pense pas que l'on ait besoin d'un nouveau simulateur car tout les calculs matriciels a chaque pas de temps ne changent pas. Ce qui change c'est simplement que dans siMatrix la methode matrixFishingMortality() n'a plus besoin d'etre appliquee car MATRIX_FISHING_MORTALITY sera initialisee dans une Regle ForcingMortality avec en entree deux fichiers ascii. Faut-il que je definisse une nouvelle methode matrixFishingMortality avec un parametre booleen qui par defaut est egal a False et qui lorsq'il est mis a TRUE par la ForcingMortality ne fait pas le calcul de matrixFishingMortality ? si oui qu'est-ce que cela implique comme consequences? comment faire pour que ce parametre soit accessible dans une regle? comment puis-je acceder a MATRIX_FISHING_MORTALITY qui est attache a ResultName dans une regle? merci stephanie

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CR réunion Group Screening : 6/05/2011
by Eric Chatellier 13 May '11

13 May '11

CR réunion Group Screening ========================== CR de la réunion pour faire le points après l'ajout du group screening et de la mise en facteur des règles et population de départ dans IsisFish 3.4.0.0. Les groupes doivent être crée en tant que groupe discret ou groupe continue. Un groupe discret accepte des facteurs discrets et continus (continue dicretisés). Un groupe continue n'accepte que des facteurs continue. Ajouter une validation lors du lancement de l'AS pour vérifier que tous les facteurs d'un groupe discret ont la même cardinalité. Supprimer la sélection d'un opérateur pour les facteurs continus. L'opérateur est maintenant toujours * pour l'application du coefficient. Ajouter les valeurs min et max pour les facteurs de type matrice continue et équation continue. Vérifier que la valeur min est inférieure à la valeur max. Pour les règles, le code actuel est bon et permet de faire des scenarios de gestion (chaque facteur est une liste de règles) : facteur discret. Voir pour pouvoir mettre en paramètres également les paramètres d'une liste des règles fixes : facteur discret ou continu. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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