February 2013 - Isis-fish-devel - mailman.cloud.codelutin.com

Gestion de la distribution dans les méthodes d'AS
by Eric Chatellier 22 Nov '13

22 Nov '13

Bonjour, J'ai un peu progressé dans la compréhension de l'utilisation de la distribution dans les méthodes d'AS. Il y a plusieurs cas: * soit la méthode prend en paramètres la distribution directement (Fast99) * soit des paramètres de la distribution peuvent être calculé avant par une distribution (Sobol) * soit la méthode gère elle même la distribution, non modifiable (LHS) * soit la distribution ne peut pas être gérée Voici en détail les problèmes rencontrés suivant les méthodes de calcul: Morris ------ Morris prend en paramètres deux vecteurs correspondant aux valeurs min et max de chaque facteur. Si les facteurs n'ont pas été défini en distribution uniforme avec des valeurs min et max, cela pose problème. Sobol ----- Sobol prend en paramètres 2 dataframe qui peuvent être défini manuellement suivant une méthode de distribution. C'est donc théoriquement possible. RandomLHS et OptimumLHS ----------------------- RandomLHS gère elle même une distribution uniforme entre 0 et 1. help(randmonLHS) : An ‘n’ by ‘k’ Latin Hypercube Sample matrix with values uniformly distributed on [0,1] Donc en faisant un produit en croix entre min et max, il est possible d'obtenir la valeur réelle du facteur. Mais dans le cas d'une distribution non uniforme, comment peut-on exploiter la valeur entre 0 et 1 ? ExpandGrid ---------- Pas de gestion de la distribution. RDOpimal -------- Pas de gestion de la distribution. Apparemment Sigrid avait bien aidé Jean sur ce script. RegularFraction --------------- Pas de gestion de la distribution. JavaExpandGrid et FrF2 ---------------------- JavaExpandGrid calcule manuellement les valeurs des facteurs. Donc a moins de refaire le calcul pour toutes les distributions possibles, autant supprimer cette méthode. FrF2 est la même méthode que RegularFraction. Stéphanie, tu aurais un moment pour rediscuter de ca ? -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Re: [Isis-fish-devel] Fichiers simulation-as_H.oxxxxxxx dans le home
by Eric Chatellier 06 Feb '13

06 Feb '13

Le 05/02/2013 14:36, Tina ODAKA a écrit : > hi eric, > yep, i told loic to talk to you. > but pbs does not have option not to make it. > thats why i asked him to talk to you.... hi I have tried anyway a few things: qsub -k n option still generates files and options described here: http://www.clusterresources.com/torquedocs21/users/2.2files.shtml#stdout #PBS -e /tmp/error.$PBS_O_JOBID #PBS -o /tmp/output.$PBS_O_JOBID into qsub script. But job seams to not start. (i don't receive mails from pbs) -- Éric Chatellier - Code Lutin Tel: 02.40.50.29.28 - http://www.codelutin.com

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Fichiers simulation-as_H.oxxxxxxx dans le home
by Eric Chatellier 05 Feb '13

05 Feb '13

Bonjour, Je viens d'avoir un retour d'un utilisateur qui avait énormément de fichier généré par les job caparmor dans son home. Ces fichiers ne nous sont pas utiles. Est-il possible, par une option, de ne pas générer ces fichiers ? Merci. -- Éric Chatellier - Code Lutin Tel: 02.40.50.29.28 - http://www.codelutin.com

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nettoyage des fichiers dans le "home" de caparmor ?
by Loic GASCHE 05 Feb '13

05 Feb '13

Bonjour, J'ai eu Tina au téléphone et il semblerait qu'ISIS génère encore pleins de petits fichiers dans mon "home" quand je fais tourner des simus sur caparmor, et que ces fichiers ne sont pas supprimés en fin d'AS on dirait. Tina demande s'il ne serait pas possible de faire une procédure automatique dans ISIS qui fasse ce ménage (comme on nettoie "temp" ou "isis-database" ?) ? Loïc

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