Bonjour, Le script que vous soumettez permet également d'indiquer les ressources que vous souhaitez utiliser (nombre de coeurs, de noeuds de calcul, de mémoire, ...) Vous trouverez des exemples sous /export/home/services/exemples/PBS Si, par exemple, vous souhaitez obtenir 1 Go de mémoire, vous aurez la directive #PBS -l mem=1000mb Pour un job avec 1 coeur utilisant 2 Go sur la queue sequentiel : #PBS -q sequentiel #PBS -l select=1:ncpus=1:mem=2000mb J'espère que cela répond à votre question initiale. Bon après-midi, Denis Le 11/18/2013 12:42 PM, Eric Chatellier a écrit :
Bonjour, Nous n'utilisons actuellement aucune directive particuliere pour PBS.
Voici un de nos script:
#!/bin/csh
cd "/home3/caparmor/poussin/isis-fish-4.2.1"
setenv R_HOME /appli/R/2.15.0-gnu-4.3/lib64/R setenv LD_LIBRARY_PATH ${R_HOME}/lib
/home3/caparmor/poussin/jdk7x64/bin/java -Djava.library.path=jri64 -DR.type=jni -Xmx6000M -jar isis-fish*.jar --option launch.ui false --option perform.vcsupdate false --option perform.migration false --option perform.cron false --simulateRemotelly "sim_test_7D_Bis_Caparmor_6gigas_Carnivores_Poissons_ttesStrat_2013-11-15-17-58" "/home1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-sim_test_7D_Bis_Caparmor_6gigas_Carnivores_Poissons_ttesStrat_2013-11-15-17-58-preparation.zip" "/home1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-sim_test_7D_Bis_Caparmor_6gigas_Carnivores_Poissons_ttesStrat_2013-11-15-17-58-result.zip"
& "/home1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-sim_test_7D_Bis_Caparmor_6gigas_Carnivores_Poissons_ttesStrat_2013-11-15-17-58-output.txt"
rm -rf "$HOME/isis-fish-4/isis-database/simulations/sim_test_7D_Bis_Caparmor_6gigas_Carnivores_Poissons_ttesStrat_2013-11-15-17-58"
Cordialement, Eric Chatellier.
Le 18/11/2013 10:16, Denis Croizé-Fillon a écrit :
Bonjour,
Pourriez vous me fournir les directives PBS qui sont en entête de votre script. La limite mémoire est peut-être à ce niveau là car chaque noeud dispose de 24 Go de mémoire. Vous pouvez donc accéder à 23 Go et quelques au mieux.
Denis