March 2012 - Isis-fish-users - mailman.cloud.codelutin.com

Pas de résultats dans l'AS
by Bastien Preuss March 13, 2012

March 13, 2012

Toujours pour le même soucis, je viens de remarquer quelque chose détonnant : Après mon AS où les résultats sont vides (mail précédent), jai fermé Isis, puis je lai rouvert, et jai relancé une nouvelle AS, et là apparait en tête de la liste des simulations en cours, la simulation n°18 de mon AS précédente !! Il sagit effectivement de la simu spécifiée dans le message derreur du mail précédent, mais elle apparaissait pourtant comme terminée avant que je ferme Isis. Par contre là elle ne tourne pas, rien nest indiqué dans la colonne « Etat », se sont mes autres simu de la nouvelle AS qui tournent. Là je ne comprends pas très bien pourquoi Isis fait cela ? Ce genre de pb a-t-il déjà été rencontré ? Y a-t-il des raisons a priori ? Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss March 12, 2012

March 12, 2012

C'est bon ça fonctionne !! Merci. -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 23:41 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 13:37, bastien preuss a écrit : > Effectivement, > > Du coup je remets comme avant ?: > > "C:\Progam Files(x86)\R\R-2.9.2\bin" Oui. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Pas de résultat dans le .Rdata
by Bastien Preuss March 12, 2012

March 12, 2012

Bonjour, jai un autre problème, lorsque que je fais une AS sur lune de mes espèces, les simu tournent, mais après, mes résultats sont vides rien dans le R.data et pas de fichiers .csv dans le dossier de la simu. Jai vérifié, et jai bien sélectionné les exports dans la fenêtre dAS. Jai fait une AS avec une autre espèce et tout a fonctionné correctement, et dans le débug, je ne vois pas doù vient lerreur. Je mets le debug en pièce jointe. Merci davance. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss March 12, 2012

March 12, 2012

ça y est isis démarre, c'était un pb de guillemets autour du chemin d'accès. Donc maintenant quand je lance l'AS, ça plante toujours, mais il n'y a plus mention du pb 32-64 bits, mais seulement la ligne suivante (je mets aussi le debug en PJ): Cannot find JRI native library! Please make sure that the JRI native library is in a directory listed in java.library.path. java.lang.UnsatisfiedLinkError: C:\Documents and Settings\bpreuss\Desktop\isis-fish-3.3.0.9\jri\jri.dll: Can't find dependent libraries -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 22:45 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 12:41, Bastien Preuss a écrit : > Isis ne s'ouvre plus même en rajoutant \bin ... > Que contient le debug.txt dans ce cas ? -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss March 12, 2012

March 12, 2012

Isis ne s'ouvre plus même en rajoutant \bin ... -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 22:37 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 12:33, Bastien Preuss a écrit : > Je remplace uniquement le "java" au début de la dernière ligne? > Ou toutes les fois où "java" apparait? Au debut de la dernier ligne. > Parce que là Isis ne démarre m^me plus ! A verifier que le chemin est bon. J'ai oublier le \bin je pense: C:\Program Files(x86)\Java\jdk1.6.0_24\bin\java -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss March 12, 2012

March 12, 2012

Voici le contenu de mon isifish.bat @echo off echo [Script] Isis starting... C:\Program Files (x86)\Java\jdk1.6.0_24\java -Xmx1024M -Djava.library.path=jri -DR.type=jni -jar isis-fish-3.3.0.9.jar %1 %2 %3 %4 %5 %6 %7 %8 %9 > debug.txt 2>&1 -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 22:24 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 12:19, Bastien Preuss a écrit : > Je rencontre toujours le pb sur ma machine avec 32 et 64 bits. > Pour récapituler : > > J'ai dans le path : %R_HOME%\bin\i386; %JAVA_HOME%\bin > Dans la variable R_HOME : C:\Progam Files(x86)\R\R-2.9.2 > Dans la variable JAVA_HOME : C:\Program Files(x86)\Java\jrk1.6.0_24 Ca m'a l'air bon. Il est possible qu'il y ait un autre Java sur le PC pour qu'il en trouve un autre dans ce cas. Sinon, une autre solution, dans le fichier isisfish.bat tu peux remplacer "java" par: "C:\Program Files(x86)\Java\jdk1.6.0_24\java" il n'y aura plus de doute. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss March 12, 2012

March 12, 2012

Je remplace uniquement le "java" au début de la dernière ligne? Ou toutes les fois où "java" apparait? Parce que là Isis ne démarre m^me plus ! -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 22:24 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 12:19, Bastien Preuss a écrit : > Je rencontre toujours le pb sur ma machine avec 32 et 64 bits. > Pour récapituler : > > J'ai dans le path : %R_HOME%\bin\i386; %JAVA_HOME%\bin > Dans la variable R_HOME : C:\Progam Files(x86)\R\R-2.9.2 > Dans la variable JAVA_HOME : C:\Program Files(x86)\Java\jrk1.6.0_24 Ca m'a l'air bon. Il est possible qu'il y ait un autre Java sur le PC pour qu'il en trouve un autre dans ce cas. Sinon, une autre solution, dans le fichier isisfish.bat tu peux remplacer "java" par: "C:\Program Files(x86)\Java\jdk1.6.0_24\java" il n'y aura plus de doute. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss March 12, 2012

March 12, 2012

Je rencontre toujours le pb sur ma machine avec 32 et 64 bits. Pour récapituler : J'ai dans le path : %R_HOME%\bin\i386; %JAVA_HOME%\bin Dans la variable R_HOME : C:\Progam Files(x86)\R\R-2.9.2 Dans la variable JAVA_HOME : C:\Program Files(x86)\Java\jrk1.6.0_24 -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 21:20 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 11:08, bastien preuss a écrit : > Sur un de mes autres ordi où ça ne fonctionne pas non plus et qui est en 32 > bits le message du debug dit : > > Cannot find JRI native library! > Please make sure that the JRI native library is in a directory listed in > java.library.path. > > java.lang.UnsatisfiedLinkError: C:\Documents and > Settings\bpreuss\Desktop\isis-fish-3.3.0.8\jri\jri.dll > > donc est-ce que là aussi le %Java_HOME%\bin est nécessaire? Non, là c'est différent. Soit le R_HOME n'est pas défini. Soit le dossier "bin" de R n'est pas dans le path. http://www.isis-fish.org/v4/user/installationr.html#Windows -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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pb 32-64 bits
by Bastien Preuss March 12, 2012

March 12, 2012

Bonjour, Jai un soucis avec une AS qui ne se lance pas, dans le message derreur, il semble y avoir un pb de fichier .dll en 32 bits alors que ma machine est en 64 Je mets le debug en pièce jointe, si quelquun saurait comment résoudre le pb. Pour précision jessaie de tout utiliser en version 32 bits car R 2.9.2 nexiste quen 32 bits. Merci. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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by Postmaster ISIS-Fish March 1, 2012

March 1, 2012

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