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loading old simulation
by shopkins Feb. 5, 2021

Feb. 5, 2021

Bonjour Madame / Monsieur: I am trying to load an old simulation that was originally ran in isis-fish 4.4.2.5. I am unsure what this following error message corresponds to though: _fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Can't load old simulation_ _ at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsHandler.loadOldSimulation(ParamsHandler.java:236)_ _ at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsHandler.lambda$loadOldSimulation$2(ParamsHandler.java:324)_ _ at java.awt.event.InvocationEvent.dispatch(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventQueue.access$500(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source)_ _ at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)_ _ at java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source)_ _ at java.awt.EventDispatchThread.run(Unknown Source)_ _Caused by: java.lang.NullPointerException_ _ at jaxx.runtime.context.DefaultJAXXContext.setContextValue(DefaultJAXXContext.java:77)_ _ at jaxx.runtime.context.DefaultJAXXContext.setContextValue(DefaultJAXXContext.java:72)_ _ at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.SimulatorContext.setRegionStorage(SimulatorContext.java:86)_ _ at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsHandler.loadOldSimulation(ParamsHandler.java:211)_ _ ... 15 more_ Can you help or troubleshoot this issue? Merci Beaucoup, Stéphanie

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Bug : mise a jour du dépot de scripts sous pulse secure
by slehuta Jan. 29, 2021

Jan. 29, 2021

Hello pulse secure est le logiciel qui nous permet d'accéder au réseau ifremer depuis l'extérieur. je m'apercois que lorsqu'il est connecté, si je passe d'une version d isis a une autre, isis ne demande pas de changer le depot de scripts et conserve ceux de la version précédente. Cela peut il etre réglé ? Merci

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Pb passage de la V4.4.2.5 à la V4.4.4.1 : base GdL
by slehuta Jan. 28, 2021

Jan. 28, 2021

Hello en rechargeant dans la V4.4.4.1 ou V4.4.4.3 une base exportée en V 4.4.2.5, les tableaux des stratégies (effort /mois/metier) sont remplis de zéros. Quelques fois si je charge la base en V4.4.2.5, puis ouvre la V4.4.4.1, j ai l'erreur ci-dessous. Pas de soucis en V4.4.5 en revanche mais je n'ai pas fini de la tester (reproductibilité des resultats d anciennes simus, etc) D'autre part, supprimer localement la base ne fonctionne pas en V4.4.4 (elle reste dans le menu deroulant meme si on ne peut plus l ouvrir) Eric préferes tu faire une nouvelle V4.4.4 qui corrige ces bugs ou passer directement a la V4.4.5 et "interdire"/alerter sur l'utilisation de la V4.4.4 ? En attendant que j ai fini les checks de V4.4.5 on resterait en V 4.4.2.5. en pj une base pour reproduire le bug. Merci Sigrid org.hibernate.service.spi.ServiceException: Unable to create requested service [org.hibernate.engine.jdbc.env.spi.JdbcEnvironment] at org.hibernate.service.internal.AbstractServiceRegistryImpl.createService(AbstractServiceRegistryImpl.java:275) at org.hibernate.service.internal.AbstractServiceRegistryImpl.initializeService(AbstractServiceRegistryImpl.java:237) at org.hibernate.service.internal.AbstractServiceRegistryImpl.getService(AbstractServiceRegistryImpl.java:214) at org.hibernate.id.factory.internal.DefaultIdentifierGeneratorFactory.injectServices(DefaultIdentifierGeneratorFactory.java:152) at org.hibernate.service.internal.AbstractServiceRegistryImpl.injectDependencies(AbstractServiceRegistryImpl.java:286) at org.hibernate.service.internal.AbstractServiceRegistryImpl.initializeService(AbstractServiceRegistryImpl.java:243) at org.hibernate.service.internal.AbstractServiceRegistryImpl.getService(AbstractServiceRegistryImpl.java:214) at org.hibernate.boot.internal.InFlightMetadataCollectorImpl. (InFlightMetadataCollectorImpl.java:175) at org.hibernate.boot.model.process.spi.MetadataBuildingProcess.complete(MetadataBuildingProcess.java:118) at org.hibernate.boot.model.process.spi.MetadataBuildingProcess.build(MetadataBuildingProcess.java:83) at org.hibernate.boot.internal.MetadataBuilderImpl.build(MetadataBuilderImpl.java:473) at org.hibernate.boot.internal.MetadataBuilderImpl.build(MetadataBuilderImpl.java:84) at org.nuiton.topia.migration.TopiaMigrationEngine.preInit(TopiaMigrationEngine.java:244) at org.nuiton.topia.framework.TopiaContextImpl.preInitServices(TopiaContextImpl.java:270) at org.nuiton.topia.framework.TopiaContextImpl. (TopiaContextImpl.java:222) at org.nuiton.topia.TopiaContextFactory.getContext(TopiaContextFactory.java:182) at fr.ifremer.isisfish.datastore.DataStorage.getStorage(DataStorage.java:223) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputHandler.loadRegion(InputHandler.java:193) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputHandler.lambda$regionChange$1(InputHandler.java:261) at java.awt.event.InvocationEvent.dispatch(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.access$500(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.run(Unknown Source) Caused by: org.hibernate.HibernateException: com.zaxxer.hikari.pool.HikariPool$PoolInitializationException: Failed to initialize pool: Erreur générale: "java.lang.IllegalStateException: Unable to read the page at position 1374390369739 [1.4.200/6]" General error: "java.lang.IllegalStateException: Unable to read the page at position 1374390369739 [1.4.200/6]" [50000-200] at org.hibernate.hikaricp.internal.HikariCPConnectionProvider.configure(HikariCPConnectionProvider.java:63) at org.hibernate.boot.registry.internal.StandardServiceRegistryImpl.configureService(StandardServiceRegistryImpl.java:107) at org.hibernate.service.internal.AbstractServiceRegistryImpl.initializeService(AbstractServiceRegistryImpl.java:246) at org.hibernate.service.internal.AbstractServiceRegistryImpl.getService(AbstractServiceRegistryImpl.java:214) at org.hibernate.engine.jdbc.env.internal.JdbcEnvironmentInitiator.buildJdbcConnectionAccess(JdbcEnvironmentInitiator.java:145) at org.hibernate.engine.jdbc.env.internal.JdbcEnvironmentInitiator.initiateService(JdbcEnvironmentInitiator.java:66) at org.hibernate.engine.jdbc.env.internal.JdbcEnvironmentInitiator.initiateService(JdbcEnvironmentInitiator.java:35) at org.hibernate.boot.registry.internal.StandardServiceRegistryImpl.initiateService(StandardServiceRegistryImpl.java:101) at org.hibernate.service.internal.AbstractServiceRegistryImpl.createService(AbstractServiceRegistryImpl.java:263) ... 32 more Caused by: com.zaxxer.hikari.pool.HikariPool$PoolInitializationException: Failed to initialize pool: Erreur générale: "java.lang.IllegalStateException: Unable to read the page at position 1374390369739 [1.4.200/6]" General error: "java.lang.IllegalStateException: Unable to read the page at position 1374390369739 [1.4.200/6]" [50000-200] at com.zaxxer.hikari.pool.HikariPool.throwPoolInitializationException(HikariPool.java:576) at com.zaxxer.hikari.pool.HikariPool.checkFailFast(HikariPool.java:562) at com.zaxxer.hikari.pool.HikariPool. (HikariPool.java:115) at com.zaxxer.hikari.HikariDataSource. (HikariDataSource.java:81) at org.hibernate.hikaricp.internal.HikariCPConnectionProvider.configure(HikariCPConnectionProvider.java:59) ... 40 more Caused by: org.h2.jdbc.JdbcSQLNonTransientException: Erreur générale: "java.lang.IllegalStateException: Unable to read the page at position 1374390369739 [1.4.200/6]" General error: "java.lang.IllegalStateException: Unable to read the page at position 1374390369739 [1.4.200/6]" [50000-200] at org.h2.message.DbException.getJdbcSQLException(DbException.java:505) at org.h2.message.DbException.getJdbcSQLException(DbException.java:429) at org.h2.message.DbException.get(DbException.java:194) at org.h2.message.DbException.convert(DbException.java:347) at org.h2.engine.Database.openDatabase(Database.java:333) at org.h2.engine.Database. (Database.java:301) at org.h2.engine.Engine.openSession(Engine.java:74) at org.h2.engine.Engine.openSession(Engine.java:192) at org.h2.engine.Engine.createSessionAndValidate(Engine.java:171) at org.h2.engine.Engine.createSession(Engine.java:166) at org.h2.engine.Engine.createSession(Engine.java:29) at org.h2.engine.SessionRemote.connectEmbeddedOrServer(SessionRemote.java:340) at org.h2.jdbc.JdbcConnection. (JdbcConnection.java:173) at org.h2.jdbc.JdbcConnection. (JdbcConnection.java:152) at org.h2.Driver.connect(Driver.java:69) at com.zaxxer.hikari.util.DriverDataSource.getConnection(DriverDataSource.java:136) at com.zaxxer.hikari.pool.PoolBase.newConnection(PoolBase.java:369) at com.zaxxer.hikari.pool.PoolBase.newPoolEntry(PoolBase.java:198) at com.zaxxer.hikari.pool.HikariPool.createPoolEntry(HikariPool.java:467) at com.zaxxer.hikari.pool.HikariPool.checkFailFast(HikariPool.java:541) ... 43 more Caused by: java.lang.IllegalStateException: Unable to read the page at position 1374390369739 [1.4.200/6] at org.h2.mvstore.DataUtils.newIllegalStateException(DataUtils.java:950) at org.h2.mvstore.MVStore.readPage(MVStore.java:2213) at org.h2.mvstore.MVMap.readPage(MVMap.java:672) at org.h2.mvstore.MVMap.readOrCreateRootPage(MVMap.java:688) at org.h2.mvstore.MVMap.setRootPos(MVMap.java:682) at org.h2.mvstore.MVStore.openMap(MVStore.java:576) at org.h2.mvstore.MVStore.openMap(MVStore.java:535) at org.h2.mvstore.MVStore.openMap(MVStore.java:516) at org.h2.mvstore.MVStore.removeMap(MVStore.java:2742) at org.h2.engine.Database.handleUpgradeIssues(Database.java:866) at org.h2.engine.Database.open(Database.java:742) at org.h2.engine.Database.openDatabase(Database.java:307) ... 58 more Caused by: java.lang.IllegalStateException: Unsupported type 17 [1.4.200/3] at org.h2.mvstore.DataUtils.newIllegalStateException(DataUtils.java:950) at org.h2.mvstore.type.ObjectDataType.newType(ObjectDataType.java:165) at org.h2.mvstore.type.ObjectDataType.read(ObjectDataType.java:229) at org.h2.mvstore.type.ObjectDataType.read(ObjectDataType.java:114) at org.h2.mvstore.Page.read(Page.java:605) at org.h2.mvstore.Page.read(Page.java:239) at org.h2.mvstore.MVStore.readPage(MVStore.java:2211) ... 68 more

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DATARMOR - Fiche -Utilisation memoire-
by Sigrid LEHUTA Jan. 12, 2021

Jan. 12, 2021

Bonjour la liste ISIS et Bonne Année ! J'ai reçu ce message qui m'invite a redimensionner mes jobs futurs, au vu de la mauvaise optimisation des ressources mémoire de datarmor au cours de mes précédents jobs. Évidemment je n'y comprends rien ;-) Pourriez vous m'aider à comprendre et agir en réponse ? Merci ! Sigrid -------- Message transféré -------- Sujet : DATARMOR - Fiche -Utilisation memoire- Date : Mon, 11 Jan 2021 16:48:10 +0000 De : root <root(a)ifremer.fr> Pour : slehuta(a)ifremer.fr Bonjour, vous trouverez ci-joint la fiche rattachée à votre user slehuta concernant votre utilisation mémoire sur Datarmor.

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish Dec. 31, 2020

Dec. 31, 2020

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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Re: [Isis-fish-users] plan de simulation sur datarmor
by slehuta Dec. 8, 2020

Dec. 8, 2020

Salut Eric, aucune des simu n a été rapatrié... comment as tu acces a cette info ? Que dois je faire relancer ? merci Le 2020-12-08 10:03, Eric Chatellier a écrit : > Le 08/12/2020 à 09:00, slehuta a écrit : > >> Salut >> >> j'ai testé avec "datarmor", la connexion etait ok et j ai ce message > Je vois que cela fonctionnait hier, mais pas ce matin. > > Problème de réseau ? ou datarmor n'est plus joignable temporairement ?

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charger une ancienne simu
by slehuta Dec. 8, 2020

Dec. 8, 2020

Hello Eric, j'ai ce message d erreur en rechargeant une vieille simu. La simu a tourné en 4.4.0 et j ai essayé de la charge en 4.4.2 et en 4.4.5. Vois tu d ou ca vient ? Merci fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Impossible de charger une ancienne simulation at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsHandler.loadOldSimulation(ParamsHandler.java:263) at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsHandler.lambda$loadOldSimulation$3(ParamsHandler.java:304) at java.awt.event.InvocationEvent.dispatch(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.access$500(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.run(Unknown Source) Caused by: java.lang.NullPointerException at jaxx.runtime.context.DefaultJAXXContext.setContextValue(DefaultJAXXContext.java:77) at jaxx.runtime.context.DefaultJAXXContext.setContextValue(DefaultJAXXContext.java:72) at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.SimulatorContext.setRegionStorage(SimulatorContext.java:86) at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsHandler.loadOldSimulation(ParamsHandler.java:238) ... 15 more

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plan de simulation sur datarmor
by slehuta Dec. 8, 2020

Dec. 8, 2020

Bonjour Eric, j ai relancé mon plan sur datarmor depuis la 4.4.5.1. et cette fois non, plus ça ne fonctionne pas. Le debug est trop gros pour etre joint, je met simplement la fin ci dessous s'il t en faut plus tu me dis. Vois tu où est le problème ? Merci Sigrid 2020-12-07 14:43:35,637 INFO [monitor-thread] (SSHSimulatorLauncher.java:533) openSSHSession - Try to log on slehuta@datasession0:22 2020-12-07 14:43:35,637 INFO [monitor-thread] (SSHSimulatorLauncher.java:541) openSSHSession - Ssh key found 'C:\ISIS-Fish\toto.txt' will be used to connect to 2020-12-07 14:43:35,640 ERROR [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:530) checkProgression - Progression thread update error java.rmi.RemoteException: Can't connect; nested exception is: com.jcraft.jsch.JSchException: java.net.UnknownHostException: datasession0 at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SSHSimulatorLauncher.updateControl(SSHSimulatorLauncher.java:353) ~[isis-fish-4.4.5.1.jar:4.4.5.1] at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.checkProgression(SimulationMonitor.java:498) [isis-fish-4.4.5.1.jar:4.4.5.1] at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.waitAndCheckProgression(SimulationMonitor.java:441) [isis-fish-4.4.5.1.jar:4.4.5.1] at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.run(SimulationMonitor.java:396) [isis-fish-4.4.5.1.jar:4.4.5.1] Caused by: com.jcraft.jsch.JSchException: java.net.UnknownHostException: datasession0 at com.jcraft.jsch.Util.createSocket(Util.java:394) ~[jsch-0.1.55.jar:?] at com.jcraft.jsch.Session.connect(Session.java:215) ~[jsch-0.1.55.jar:?] at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SSHSimulatorLauncher.openSSHSession(SSHSimulatorLauncher.java:577) ~[isis-fish-4.4.5.1.jar:4.4.5.1] at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SSHSimulatorLauncher.getSSHSession(SSHSimulatorLauncher.java:496) ~[isis-fish-4.4.5.1.jar:4.4.5.1] at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SSHSimulatorLauncher.updateControl(SSHSimulatorLauncher.java:351) ~[isis-fish-4.4.5.1.jar:4.4.5.1] ... 3 more Caused by: java.net.UnknownHostException: datasession0 at java.net.AbstractPlainSocketImpl.connect(Unknown Source) ~[?:1.8.0_241] at java.net.PlainSocketImpl.connect(Unknown Source) ~[?:1.8.0_241] at java.net.SocksSocketImpl.connect(Unknown Source) ~[?:1.8.0_241] at java.net.Socket.connect(Unknown Source) ~[?:1.8.0_241] at java.net.Socket.connect(Unknown Source) ~[?:1.8.0_241] at java.net.Socket.<init>(Unknown Source) ~[?:1.8.0_241] at java.net.Socket.<init>(Unknown Source) ~[?:1.8.0_241] at com.jcraft.jsch.Util$1.run(Util.java:362) ~[jsch-0.1.55.jar:?] at java.lang.Thread.run(Unknown Source) ~[?:1.8.0_241] 2020-12-07 14:43:35,651 INFO [monitor-thread] (SSHSimulatorLauncher.java:533) openSSHSession - Try to log on slehuta@datasession0:22 2020-12-07 14:43:35,651 INFO [monitor-thread] (SSHSimulatorLauncher.java:541) openSSHSession - Ssh key found 'C:\ISIS-Fish\toto.txt' will be used to connect to

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[ANN] - ISIS-Fish 4.4.5.1 released
by Eric Chatellier Dec. 1, 2020

Dec. 1, 2020

The ISIS-Fish team is pleased to announce the isis-fish-4.4.5.1 release! Simulateur de pêcherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://isis-fish.org Changes ------- #11097: Les simulations issues des plan indépendant ne fonctionne pas sur datarmor #10994: Pouvoir définir une Collection d'entité en paramètre de script Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: https://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * https://forge.codelutin.com/attachments/download/6506/isis-fish-4.4.5.1-bin… Have fun! -ISIS-Fish team -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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Pas de peche
by Charlotte Sève Oct. 15, 2020

Oct. 15, 2020

Hello, Depuis hier, mes simulations ne veulent pas lancer la dynamique de pêche alors que je sélectionne les stratégies dans l'interface de lancement (cf parameters properties ci-joint). Ci-joint le débug. Est-ce que quelqu'un aurait une solution ? Merci beaucoup et bonne journée ! Charlotte -- *Charlotte Sève*, PhD Student CRIOBE - USR 3278 (CNRS-EPHE-UPVD) Phone: +33 6 21 10 10 16 Skype: charlotteseve

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