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Probleme de lancement d'analyse de sensibilite (sous 3.3.0.5)
by Jessica Andre 16 Aug '10

16 Aug '10

Bonjour, Malheureusement, je crois qu'il va y avoir beaucoup de messages de ma part dans les prochains temps... Le site web fonctionne de nouveau et j'ai downloadé la version 3.3.0.5 qui fonctionne (je peux l'ouvrir et faire des simulations). Par contre quand j'essaye de faire une analyse de sensibilité simple (juste 2 tailles de maille de filet différentes pour tester), ISIS se ferme (même problème que la version 3.3.0.3 quand j'avais essayé de faire une analyse de sensibilité). Aucun fichier debug n'apparait. Peut-être j'oublie de sélectionner quelque chose. Ma démarche est la suivante : Dans l'onglet Paramètre : - Sélection d'une ancienne simulation - Je nomme mon analyse de sensibilité - J'ai un nombre d'année définie pour la simulation (5 ans) - J'ai une stratégie, une population et une règle (InterdictionEnginPreSimu : pas graballnet de mars a avril) sélectionnés - La matrice de population initiale et les paramètres de règles sont remplis Dans l'onglet Analyse de sensibilité : - je veux tester mon paramètre d'engin donc je lui donne 2 valeurs possible, 137 et 144. Je sauve et le facteur a modifier apparait a gauche sous le dossier « Facteurs » Dans l'onglet Méthode de la sensibilité : - je choisi une Méthode (SensitivityCalculatorJavaExpandGrid) , qui a une valeur par défaut de 2 - j'ajoute un export (SensitivitySpawningBiomassY2.java) et je sélectionne ma population Dans l'onglet Export des résultats: - je sélectionne tout Dans l'onglet Choix des résultats : - je sélectionne tout Dans l'onglet Paramètres avancés: - Je ne touche a rien Dans l'onglet Analyse des résultats : - ben vide pour l'instant mais j'aimerai bien le remplir... Je reviens a l'onglet Paramètres, je lance la simulation, ISIS réfléchi 1 seconde....et se ferme. Qu'est-ce-que je fais de faux ?! Merci d'avance ! Jess ******************************************************************************** Dr Jessica André Junior Research Fellow (Resource Security & Harvest Strategy) Tasmanian Aquaculture and Fisheries Institute (TAFI) University of Tasmania, Private Bag 49 Hobart, TAS 7001, Australia Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 ********************************************************************************

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Re: [Isis-fish-users] calcul des distances
by Sigrid.Lehuta＠ifremer.fr 05 Aug '10

05 Aug '10

c'est la moyenne des distances entre le port et chaque cellule de la zone metier. SiMatrix :ligne 1096 private double distance(Collection<Zone> zones, Cell cell) { double result = 0; List<Cell> cells = getCells(zones); if (cells.size() == 0) { // normalement il devrait y avoir des mailles, mais pour les // ancienne zone AuPort, il n'y en avait pas if (log.isWarnEnabled()) { log.warn("Calcul d'une distance avec une zone sans maille"); } return 0; } for (Cell c : cells) { result += distance(c, cell); } if (log.isDebugEnabled()) { log.debug(" result=" + result + " nbMaille=" + cells.size()); } result = result / (double) cells.size(); return result; } Bastien PREUSS <bastien.preuss(a)ifremer.fr> a écrit : > Bonjour, > Petite question sur le calcul des distances géographiques dans ISIS: > Pour calculer les temps de trajets on utilise la vitesse des navires et la > distance entre le port et la zone de pêche. Mais comment est calculée cette > distance? Est-ce la distance entre la maille du port et la maille la plus > proche de la zone de pêche, ou la distance moyenne entre la maille du port > et l'ensemble des mailles du port, ou autre? > > > Merci. > > Bastien > > > > _______________________________________________ > Isis-fish-users mailing list > Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users >

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Erreur en cours de simulation avec TAC.
by Benoit Archambault 05 Aug '10

05 Aug '10

Bonjour, Lorsque je fais ma simulation en utilisant la rule TACpoids, j'ai une erreur durant la 4eme année. Je n'arrive pas à l'interpréter, si quelqu'un a déjà rencontré cela :) Merci, Benoit Fin du Debug, le fichier complet fait 11 Mo, donc dispo sur demande.. : INFO [Thread-66] (SubProcessSimulationLauncher.java:267) run - dans un sous processus> INFO [SimThread sim_TEST_WITH_TACS_2010-07-26-14-35] (TACpoids.java:224) aw$original$_AW_$preAction$_AW_$rules_TACpoids - [TAC] Use case 2 INFO [Thread-66] (SubProcessSimulationLauncher.java:267) run - dans un sous processus> INFO [SimThread sim_TEST_WITH_TACS_2010-07-26-14-35] (TACpoids.java:248) aw$original$_AW_$preAction$_AW_$rules_TACpoids - [TAC] il y a des metiers possibles INFO [Thread-66] (SubProcessSimulationLauncher.java:267) run - dans un sous processus> INFO [SimThread sim_TEST_WITH_TACS_2010-07-26-14-35] (TACpoids.java:224) aw$original$_AW_$preAction$_AW_$rules_TACpoids - [TAC] Use case 2 INFO [Thread-66] (SubProcessSimulationLauncher.java:267) run - dans un sous processus> INFO [SimThread sim_TEST_WITH_TACS_2010-07-26-14-35] (TACpoids.java:248) aw$original$_AW_$preAction$_AW_$rules_TACpoids - [TAC] il y a des metiers possibles INFO [Thread-66] (SubProcessSimulationLauncher.java:267) run - dans un sous processus> INFO [SimThread sim_TEST_WITH_TACS_2010-07-26-14-35] (TACpoids.java:224) aw$original$_AW_$preAction$_AW_$rules_TACpoids - [TAC] Use case 2 INFO [Thread-66] (SubProcessSimulationLauncher.java:267) run - dans un sous processus> INFO [SimThread sim_TEST_WITH_TACS_2010-07-26-14-35] (TACpoids.java:248) aw$original$_AW_$preAction$_AW_$rules_TACpoids - [TAC] il y a des metiers possibles INFO [Thread-66] (SubProcessSimulationLauncher.java:267) run - dans un sous processus> INFO [SimThread sim_TEST_WITH_TACS_2010-07-26-14-35] (TACpoids.java:224) aw$original$_AW_$preAction$_AW_$rules_TACpoids - [TAC] Use case 2 INFO [Thread-66] (SubProcessSimulationLauncher.java:267) run - dans un sous processus>ERROR [SimThread sim_TEST_WITH_TACS_2010-07-26-14-35] (InProcessSimulatorLauncher.java:428) localSimulateSameThread - Error during simulation INFO [Thread-66] (SubProcessSimulationLauncher.java:267) run - dans un sous processus>java.util.NoSuchElementException: L'objet passé en argument n'a pas été retrouvé ou la dimension donnée ne convient pas:Gillnet_unspecified_spring in [bottom_otter_trawl_stern_mixed, Danish_Seine_mixed, Gillnet_fixed_demersal, Longline_autres, Longline_cod, Mixed_Traps_crab, Pot_crab]

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Analyse basique de sensibilité : group screening ?
by Benoit Archambault 05 Aug '10

05 Aug '10

Bonjour, je voudrais conduire une analyse basique de la sensibilité de mon modèle. Le nombre de paramètres important et le temps me restant ne m'autorisent pas à conduire une analyse poussée. J'aimerais donc faire une analyse basique de type group screening, pour identifier les paramètres ou groupes de paramètres les plus influents sur mes sorties. Si vous avez des suggestions, des références ou des conseils pour la méthodologie à suivre je suis preneur car c'est un domaine que je ne connais pas trop. Merci , Benoit (ca sera tout pour aujourd'hui !)

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Probleme de lancement isis
by Jessica Andre 04 Aug '10

04 Aug '10

Bonjour, Un question pour Eric ou Jean... Je suis sur la version 3.3.0.3. Hier j'ai tenté plusieurs fois de faire une analyse de sensitivité et lorsque je l'ai lancée ca a fermé le programme. Ce matin, je ne peux plus ouvrir ISIS du tout . .. J'ai réinstallé ISIS (toujours 3.3.0.3) mais même topo : je ne peux pas toujours pas ouvrir le programme. J'ai attaché le débug. Je voulais aussi installer la version 3.3.0.5 mais ne peux plus accéder au site ISIS wiki (très lent hier, ne marche plus du tout aujourd'hui). Est-ce que le site est momentanément inaccessible pour des raisons techniques ou est ce que ca vient de mon coté? Décidément, j'aurai mieux fait de rester couchée ce matin... Merci d'avance Jess ******************************************************************************** Dr Jessica André Junior Research Fellow (Resource Security & Harvest Strategy) Tasmanian Aquaculture and Fisheries Institute (TAFI) University of Tasmania, Private Bag 49 Hobart, TAS 7001, Australia Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 ********************************************************************************

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Probleme de log et de simulation
by Jessica Andre 03 Aug '10

03 Aug '10

Bonjour, Je me fait les dents sur une simulation simple sur 5 ans : 1 espèce (femelle seulement), un engin, un métier, 1 zone qui sert de zone de pêche, de recrutement et de reproduction et 1 seul type de navire. Et quelque soit mes changements, j'obtiens toujours le même résultat. Il me semble que seule la dynamique des populations tourne mais pas le modèle d'exploitation. Je ne sais pas vraiment ou est l'erreur, il me semble avoir rempli toute les données nécessaires... J'ai attache le log. A propos de log, j'ai aussi des problèmes de ce cote la : - Je ne peux pas m'envoyer le log par courriel (peut-être parce qu'on a un système de serveur différent ici, on utilise pas « smtp » mais « exchange ») - Je ne peux pas copier le log dans sa totalité pour le mettre dans un document .txt (je ne peux que copier que ce qui est visible a l'écran, ce qui n'est qu'une partie du log). J'ai du récupérer le log dans le dossier « Temp » de mon « Local Settings », ce qui n'est pas très pratique. Si quelqu'un a une suggestion, je suis preneuse... Jess ******************************************************************************** Dr Jessica André Junior Research Fellow (Resource Security & Harvest Strategy) Tasmanian Aquaculture and Fisheries Institute (TAFI) University of Tasmania, Private Bag 49 Hobart, TAS 7001, Australia Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au<mailto:Jessica.Andre@utas.edu.au> Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 ********************************************************************************

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carctères spéciaux
by Paul MARCHAL 30 Jul '10

30 Jul '10

Bonjour, Juste un petit retour d'expérience: j'avais des caractères spéciaux dans mes commentaires (à, é, etc.). A chaque fois que j'ouvrais mon script, isis transformait mes caractères spéciaux en 4-5 caractères bizarres (un peu comme ceux que l'on voit dans Tintin pour masquer pudiquement les injures proférées par le Cpt Haddock). A l'ouverture suivante, chacun des caractères bizarres se transforme en 4-5 caractères extravagants (qu'Hergé aurait pu inventer pour traduire à un public non averti les récents propos de certains joueurs de foot français). Et ainsi de suite, à chaque nouvelle ouverture de fichier, le nombre (et l'excentricité) des caractères augmente exponentiellement. Finalement: au bout d'une vingtaine d'ouvertures de script, le fichier ne s'ouvre plus du tout. C'est très agaçant (mais heureusement facile à résoudre). Paul -- Paul Marchal IFREMER DOP/DHMMN 150, Quai Gambetta BP 699 62321 Boulogne sur mer FRANCE Tel: (+33) 321 99 56 86 Fax: (+33) 321 99 56 01 Mail: paul.marchal(a)ifremer.fr

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telechargement des résultats depuis caparmor
by Sigrid.Lehuta＠ifremer.fr 29 Jul '10

29 Jul '10

Salut Eric, aurais tu une idee pourquoi certaines simus terminée sur caparmor ne se dézipent pas ? pour etre précise : la simu ne descend pas dans la partie basse de l interface, le zip est bien téléchargé dans le isis monitoring mais ne se dézippe pas dans le dossier simulation. ca concernait environ 150 simus au plan precedant et ca recommence sur celui ci (c est nouveau d ailleurs car ca a tres bien fonctionné plus les plans precedants avec 2176/2176 simus dézippées!) du coup je suis obligée de les recupérer et de les dézipper a la main. C est pas la mort mais je m'habitue au luxe du tout automatique ! merci d avance de ton aide. Sigrid

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modification d un script impossible
by Sigrid.Lehuta＠ifremer.fr 26 Jul '10

26 Jul '10

hello, je n arrive pas a modifier le script (plan d analyse) de calibration d un seul parametre. la derniere fois que j ai reussi a l ouvrir et le verifier dans l interface de script j avais un pb d accents qui s etaient transformes en "%&####@" etc. comme je n arrivait pas a le modifier dans isis j ai corrigé le script dans un editeur de texte. Apres redemarrage d isis, la modif n est pas prise en compte :je ne peux pas ouvrir le script dans l interface d edition et les parametres "public" que j avais modifiés dansl editeur de texte apparaissent inchangés dans l interface de lancement. je ne comprend rien. pouvez vous jeter un oeil ? merci

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Isis-Fish 3.3.0.5 est disponible
by Eric Chatellier 23 Jul '10

23 Jul '10

Bonjour, Une nouvelle version d'Isis-Fish est disponible au téléchargement à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… Corrections : * utilisation d'une mauvaise version de la librairie d'affichage des cartes Le changelog complet est disponible à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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