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Une nouvelle application ISIS au canada
by Stephanie MAHEVAS 11 Jan '10

11 Jan '10

Bonjour pour information, une nouvelle application ISIS-Fish va etre développée au Canada (Gofe du St Laurent) pour évaluer l'impact d'aires marines protégées. Un stagiaire (Benoit Archambault, Agro Campus Rennes) démarrera le travail fin février à Nantes (Ifremer) puis à Rimouski (Quebec). Une premiere reunion a eu lieu à Rimouski en decembre 2009 pour valider la faisabilite du projet (ci-joint le CR). stephanie -------- Message original -------- Sujet: TR: Compte rendu de l'atelier ISIS-Fish--Zones de protection marines Date: Wed, 23 Dec 2009 14:52:03 -0500 De: Cantin, Guy <Guy.Cantin(a)dfo-mpo.gc.ca> Pour :: <Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr> Salut Stéphanie, Voici le message un peu plus petit Guy ______________________________________________ *De : * Cantin, Guy *Envoyé : * 23 décembre 2009 14:48 *À : * Chiasson, Mireille; Arseneau, Cédric; Lessard, Frédéric; Hardy, Magalie; Castonguay, Martin; Baril, Daniel; Cabana, Anne-Marie; Nellis, Pierre; Massicotte, Éric *Cc : * Dalcourt, Marie-France; Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr; Duplisea, Daniel; Dupont, Patrick; Malouin, Vincent; Boudreau, Marcel; Lemay, Michel; Lagacé, Anne *Objet :* Compte rendu de l'atelier ISIS-Fish--Zones de protection marines Bonjour tout le monde, Je tiens d'abord à vous réitérer nos remerciements pour votre participation à l'atelier de travail sur le projet ISIS-Fish--Zones de protection marines. Ce fut stimulant et profitable et vos commentaires / idées vont réellement permettre de mettre le projet sur les rails. Nous espérons que ce beau projet ait réussi à attiser votre intérêt pour que nous puissions travailler ensemble, de telle sorte que les résultats soient utiles au plus grand nombre. Voici le compte rendu de cette rencontre. N'hésitez pas à commenter-corriger-rectifier-questionner. <<CR_ISIS-Fish_SI_atelier_déc2009.doc>> <<2009_049_F[1].pdf>> Nous apprécierions recevoir vos commentaires d'ici le 22 janvier si possible Votre collaboration est cruciale au succès de ce projet! Je vous souhaite un joyeux temps des fêtes! Guy *Guy Cantin*, M. Sc. Biologiste, Zones de protection marines | Biologist, Marine Protected Areas Gestion des océans | Oceans Management Direction régionale océans, habitat et espèces en péril | Regional Oceans, Habitat and Species at risk Branch Pêches et Océans Canada | Fisheries and Oceans Canada Institut Maurice-Lamontagne C.P. 1000, 850, route de la Mer Mont-Joli QC, G5H 3Z4 Guy.Cantin(a)dfo-mpo.gc.ca <mailto:Guy.Cantin@dfo-mpo.gc.ca> Téléphone | Telephone 418-775-0725 / Télécopieur | Facsimile 418-775-775-0718 Gouvernement du Canada | Government of Canada Pensez environnement. N'imprimez que si nécessaire et recto-verso Think Environment. Print only if necessary and on both sides _____________________________________________ *De : * Dalcourt, Marie-France *Envoyé : * 27 novembre 2009 13:20 *À : * Dalcourt, Marie-France; Stephanie MAHEVAS; Cantin, Guy; Cabana, Anne-Marie; Lessard, Frédéric; Malouin, Vincent; Boudreau, Marcel; Duplisea, Daniel; Chiasson, Mireille; Dupont, Patrick *Cc : * Lemay, Michel; Nellis, Pierre; Hardy, Magalie *Objet :* Réunion ISIS-Fish, 2-3 décembre: Modélisation de la pêches sur des sites d'intérêt pour de futures zones de protection marines *Date : * 2 décembre 2009 13:00 à 3 décembre 2009 13:00 (GMT-05:00) Est (É.-U. et Canada). *Où : * IML, Mont-Joli, salle 582a Bonjour toutes et tous, Voici un ordre du jour amélioré pour la réunion spéciale sur le projet conjoint ISIS-Fish. Merci de me confirmer votre participation ou le nom de votre représentant. J'aimerais aussi que les présentateurs vérifient le temps qui leur est alloué et qu'ils m'indiquent tout besoin additionnel. Nous pouvons imprimer des copies des présentations si nous les recevons à l'avance. Je joins à nouveau la description du projet de stage pour ceux qui ne l'avaient pas. Le reste de l'information vous sera transmis sur place. Nous aurons le temps de faire une bonne mise en contexte en début de réunion pour permettre à tous de participer pleinement aux discussions. Au plaisir de vous voir bientôt! << Fichier: description stage ISIS-Fish.doc >> << Fichier: Agenda_projet ISIS-Fish.doc >> *Marie-France Dalcourt* Chargée d'équipe / Team Lead Division de la gestion des océans /Oceans Management Branch Pêches et Océans Canada / Fisheries and Oceans Canada Institut Maurice-Lamontagne / Maurice Lamontagne Institute 850, route de la Mer Mont-Joli (Québec) G5H 3Z4 tél.: (418) 775-0873 télec. /fax: (418) 775-0718 courriel: Marie-france.Dalcourt(a)dfo-mpo.gc.ca -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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plan sur caparmor suite de la liste
by Sigrid LEHUTA 11 Jan '10

11 Jan '10

Bonjour tout le monde, j ai relancé cette nuit mon plan sur caparmor et cette fois il a été au bout cependant, j ai un soucis de telechargement de resultats : pour une trentaine de simus la simu se termine, descend dans la liste des simu terminées mais il n y a pas d'export (ou pas tous) et c est marqué "telechargement des resultats" au lieu de simu terminée... pourtant les resultats sont sur caparmor. Comment puis je forcer leur reccuperation ? Sinon j ai a nouveau le probleme avec SpeciesTargetSpecies dans la regle ruleB_Fr_anchois pour 6 simulations. merci de votre aide. -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 23 (interne : 8123)

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Nouvelle Application ISIS au Canada -[Fwd: TR: Compte rendu de l'atelier ISIS-Fish--Zones de protection marines]
by Stephanie MAHEVAS 11 Jan '10

11 Jan '10

Bonjour pour information, une nouvelle application ISIS-Fish va etre développée au Canada (Gofe du St Laurent) pour évaluer l'impact d'aires marines protégées. Un stagiaire (Benoit Archambault, Agro Campus Rennes) démarrera le travail fin février à Nantes (Ifremer) puis à Rimouski (Quebec). Une premiere reunion a eu lieu à Rimouski en decembre 2009 pour valider la faisabilite du projet (ci-joint le CR). stephanie -------- Message original -------- Sujet: TR: Compte rendu de l'atelier ISIS-Fish--Zones de protection marines Date: Wed, 23 Dec 2009 14:52:03 -0500 De: Cantin, Guy <Guy.Cantin(a)dfo-mpo.gc.ca> Pour :: <Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr> Salut Stéphanie, Voici le message un peu plus petit Guy ______________________________________________ *De : * Cantin, Guy *Envoyé : * 23 décembre 2009 14:48 *À : * Chiasson, Mireille; Arseneau, Cédric; Lessard, Frédéric; Hardy, Magalie; Castonguay, Martin; Baril, Daniel; Cabana, Anne-Marie; Nellis, Pierre; Massicotte, Éric *Cc : * Dalcourt, Marie-France; Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr; Duplisea, Daniel; Dupont, Patrick; Malouin, Vincent; Boudreau, Marcel; Lemay, Michel; Lagacé, Anne *Objet :* Compte rendu de l'atelier ISIS-Fish--Zones de protection marines Bonjour tout le monde, Je tiens d'abord à vous réitérer nos remerciements pour votre participation à l'atelier de travail sur le projet ISIS-Fish--Zones de protection marines. Ce fut stimulant et profitable et vos commentaires / idées vont réellement permettre de mettre le projet sur les rails. Nous espérons que ce beau projet ait réussi à attiser votre intérêt pour que nous puissions travailler ensemble, de telle sorte que les résultats soient utiles au plus grand nombre. Voici le compte rendu de cette rencontre. N'hésitez pas à commenter-corriger-rectifier-questionner. <<CR_ISIS-Fish_SI_atelier_déc2009.doc>> <<2009_049_F[1].pdf>> Nous apprécierions recevoir vos commentaires d'ici le 22 janvier si possible Votre collaboration est cruciale au succès de ce projet! Je vous souhaite un joyeux temps des fêtes! Guy *Guy Cantin*, M. Sc. Biologiste, Zones de protection marines | Biologist, Marine Protected Areas Gestion des océans | Oceans Management Direction régionale océans, habitat et espèces en péril | Regional Oceans, Habitat and Species at risk Branch Pêches et Océans Canada | Fisheries and Oceans Canada Institut Maurice-Lamontagne C.P. 1000, 850, route de la Mer Mont-Joli QC, G5H 3Z4 Guy.Cantin(a)dfo-mpo.gc.ca <mailto:Guy.Cantin@dfo-mpo.gc.ca> Téléphone | Telephone 418-775-0725 / Télécopieur | Facsimile 418-775-775-0718 Gouvernement du Canada | Government of Canada Pensez environnement. N'imprimez que si nécessaire et recto-verso Think Environment. Print only if necessary and on both sides _____________________________________________ *De : * Dalcourt, Marie-France *Envoyé : * 27 novembre 2009 13:20 *À : * Dalcourt, Marie-France; Stephanie MAHEVAS; Cantin, Guy; Cabana, Anne-Marie; Lessard, Frédéric; Malouin, Vincent; Boudreau, Marcel; Duplisea, Daniel; Chiasson, Mireille; Dupont, Patrick *Cc : * Lemay, Michel; Nellis, Pierre; Hardy, Magalie *Objet :* Réunion ISIS-Fish, 2-3 décembre: Modélisation de la pêches sur des sites d'intérêt pour de futures zones de protection marines *Date : * 2 décembre 2009 13:00 à 3 décembre 2009 13:00 (GMT-05:00) Est (É.-U. et Canada). *Où : * IML, Mont-Joli, salle 582a Bonjour toutes et tous, Voici un ordre du jour amélioré pour la réunion spéciale sur le projet conjoint ISIS-Fish. Merci de me confirmer votre participation ou le nom de votre représentant. J'aimerais aussi que les présentateurs vérifient le temps qui leur est alloué et qu'ils m'indiquent tout besoin additionnel. Nous pouvons imprimer des copies des présentations si nous les recevons à l'avance. Je joins à nouveau la description du projet de stage pour ceux qui ne l'avaient pas. Le reste de l'information vous sera transmis sur place. Nous aurons le temps de faire une bonne mise en contexte en début de réunion pour permettre à tous de participer pleinement aux discussions. Au plaisir de vous voir bientôt! << Fichier: description stage ISIS-Fish.doc >> << Fichier: Agenda_projet ISIS-Fish.doc >> *Marie-France Dalcourt* Chargée d'équipe / Team Lead Division de la gestion des océans /Oceans Management Branch Pêches et Océans Canada / Fisheries and Oceans Canada Institut Maurice-Lamontagne / Maurice Lamontagne Institute 850, route de la Mer Mont-Joli (Québec) G5H 3Z4 tél.: (418) 775-0873 télec. /fax: (418) 775-0718 courriel: Marie-france.Dalcourt(a)dfo-mpo.gc.ca -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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modele bio économique
by chirine HUSSEIN 08 Jan '10

08 Jan '10

Bonjour à tous, Une question en ce qui concerne le modele bio économique, Qu'entendez -vous précisément par : couts fixes (en euros) associés à setOf vessels ? On suppose que par exemple les frais de place au port doivent etre mis dans "Other RunningCoast" associé à chaque métier (terme employé dans l'article Pelletier et al. 2009). Est-ce bien exact ? merci bien par l'avance. Chirine

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Debug de l'AS Morris
by Delphine.Rocklin＠ifremer.fr 08 Jan '10

08 Jan '10

Hello ça a encore planté...je me demande si ce n'est pas parce que j'ai ajouté des exports. Hier ça a fonctionné (sur 2 ans) en demandant uniquement SensitivityBiomassY3 et SensitivityCapturesWeightY1..pour l'AS que j'ai essayée sur 15 ans hier (et qui n'a pas fonctionné) j'avais ajouté les autres (Ref&RelativeRef)...et pour l'essai sur 2 ans aujourd'hui (qui a aussi plancé), pareil... c'est peut-être un des pbs non ? Pour la ReferenceSimulation, il faut bien mettre le nom uniquement non ? Quid du doc des AS ? Est-ce que vous l'avez ? Ci-joint le debug... Merci ! Delphine

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Toujours le problème de RData - pas de résultats
by Delphine.Rocklin＠ifremer.fr 07 Jan '10

07 Jan '10

Hello, il y a vraiment qqch que je ne comprends pas. Hier j'ai fait tourner une AS Morris d'essai sur 2 ans (sans espace dans le nom de l'AS) pour vérifier si le pb de fichier .RData sans résultats (illisible du moins) venait de là. Pour la simu sur 2 ans, pas de soucis, j'ai bien les résultats, quand je fais un ls(), tout apparaît, super... J'ai donc relancé une analyse sur 15 ans (comme ttes mes simulations), sans mettre d'espace dans le nom, et là, paf, de nouveau, il n'y a pas de résultats dans le fichier .RData...je ne comprends pas trop d'où peut venir le pb..si quelqu'un a une idée, je suis preneuse.... delphine

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retour sur les erreurs sur caparmor
by Sigrid LEHUTA 07 Jan '10

07 Jan '10

Re bonjour, concernant le premier probleme mentionné : arret d une simu qui tourne en local, voici le message d erreur de l une d'elle : ERROR|14:57:19,420|LazyInitializationException.java|42|<init>|failed to lazily initialize a collection of role: fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfoImpl.speciesTargetSpecies, no session or session was closed org.hibernate.LazyInitializationException: failed to lazily initialize a collection of role: fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfoImpl.speciesTargetSpecies, no session or session was closed at org.hibernate.collection.AbstractPersistentCollection.throwLazyInitializationException(AbstractPersistentCollection.java:380) at org.hibernate.collection.AbstractPersistentCollection.throwLazyInitializationExceptionIfNotConnected(AbstractPersistentCollection.java:372) at org.hibernate.collection.AbstractPersistentCollection.initialize(AbstractPersistentCollection.java:365) at org.hibernate.collection.AbstractPersistentCollection.read(AbstractPersistentCollection.java:108) at org.hibernate.collection.PersistentBag.iterator(PersistentBag.java:272) at fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfoAbstract.getSpeciesTargetSpecies(MetierSeasonInfoAbstract.java:243) at fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfoImpl.getTargetFactor(MetierSeasonInfoImpl.java:60) at scripts.SiMatrix.aw$original$_AW_$matrixFishingMortality$_AW_$scripts_SiMatrix(SiMatrix.java:578) at scripts.SiMatrix_1__1474794626__1158348500___AW_JoinPoint.proceed(Unknown Source) at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.realCall(Cache.java:148) at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.call(Cache.java:123) at scripts.SiMatrix_1__1474794626__1158348500___AW_JoinPoint.proceed(Unknown Source) at scripts.SiMatrix_1__1474794626__1158348500___AW_JoinPoint.invoke(Unknown Source) at scripts.SiMatrix.matrixFishingMortality(SiMatrix.java) at simulators.DefaultSimulator.computeMonth(DefaultSimulator.java:472) at simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:221) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:390) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:259) ERROR|14:57:19,420|InProcessSimulatorLauncher.java|426|localSimulateSameThread|Error during simulation org.hibernate.LazyInitializationException: failed to lazily initialize a collection of role: fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfoImpl.speciesTargetSpecies, no session or session was closed at org.hibernate.collection.AbstractPersistentCollection.throwLazyInitializationException(AbstractPersistentCollection.java:380) at org.hibernate.collection.AbstractPersistentCollection.throwLazyInitializationExceptionIfNotConnected(AbstractPersistentCollection.java:372) at org.hibernate.collection.AbstractPersistentCollection.initialize(AbstractPersistentCollection.java:365) at org.hibernate.collection.AbstractPersistentCollection.read(AbstractPersistentCollection.java:108) at org.hibernate.collection.PersistentBag.iterator(PersistentBag.java:272) at fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfoAbstract.getSpeciesTargetSpecies(MetierSeasonInfoAbstract.java:243) at fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfoImpl.getTargetFactor(MetierSeasonInfoImpl.java:60) at scripts.SiMatrix.aw$original$_AW_$matrixFishingMortality$_AW_$scripts_SiMatrix(SiMatrix.java:578) at scripts.SiMatrix_1__1474794626__1158348500___AW_JoinPoint.proceed(Unknown Source) at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.realCall(Cache.java:148) at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.call(Cache.java:123) at scripts.SiMatrix_1__1474794626__1158348500___AW_JoinPoint.proceed(Unknown Source) at scripts.SiMatrix_1__1474794626__1158348500___AW_JoinPoint.invoke(Unknown Source) at scripts.SiMatrix.matrixFishingMortality(SiMatrix.java) at simulators.DefaultSimulator.computeMonth(DefaultSimulator.java:472) at simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:221) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:390) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:259) INFO|14:57:20,488|InProcessSimulatorLauncher.java|456|localSimulateSameThread|Simulation time: 127.590 par ailleurs je viens de la relancer sur caparmor elle tourne sans erreur cette fois ... Avez vous une idée de ce qui s est passé ? Merci -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 23 (interne : 8123)

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une petite liste de pb rencontrés avec un plan sur caparmor
by Sigrid LEHUTA 07 Jan '10

07 Jan '10

Hello j ai rencontré des soucis avec caparmor lors d un plan d analyse, je les liste pour ne pas oublier et pour qu on trouve la raison - reccuperation de la simu, le repertoire resultExports existe mais est vide (la simu tourne correctement avec export en local) (60 simus sur 790) - arret de la simu apparement a cause d'une regle de gestion (source de l erreur inconnue: je creuse cet aprem) mais la simu tourne en local - disparition d un export : la matrice existe mais l export ne s est pas fait A+ -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 23 (interne : 8123)

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plantage de caparmor
by Stephanie MAHEVAS 07 Jan '10

07 Jan '10

Bonjour il semblerait que caparmor nous fasse quelques caprices.... les simu s'auto-arretent!! (PS : elles tournent en local sans probleme) voici le log d'une simu qui s'est arretée: INFO|09:19:50,617|InProcessSimulatorLauncher.java|311|localSimulateSameThread|1/7/10 9:19 AM Java version: 1.6.0_16-b01 Isis-fish version: 3.2.0.8 INFO|09:19:50,632|InProcessSimulatorLauncher.java|285|changeClassLoader|Classloader used for simulation: fr.ifremer.isisfish.aspect.AspectClassLoader@107dcfe [file:/home1/caparmor/smahevas/isis-database-3/simulations/sim_SAMigration_test_234_2010-01-07-10-18_13/, file:/home1/caparmor/smahevas/isis-build/sim_SAMigration_test_234_2010-01-07-10-18_13/] INFO|09:19:50,754|SimulationStorage.java|296|setParameter|DEBUG: store param: {libLogLevel=error, plan.0.parameter.directory=Inputs_Anchois/SAMigration/, rule.0.parameter.beginMonth=6, plan.0.parameter.simulationNumber=790, usePreScript=false, analysePlanNumber=13, rule.1.parameter.beginMonth=6, onlyExport=false, rules=TACfix_Fr_Anchois,TACfix_Es_Anchois,Cantonnement_hypReport_Anchois,Paita4_20002007suite_Anchois,, plan.0.parameter.first=234, rule.2.parameter.endMonth=6, rule.2.parameter.beginMonth=3, rule.3.parameter.TAC=true, simulatorName=DefaultSimulator.java, rule.1.parameter.beginDate=6, rule.1.parameter.pop=fr.ifremer.isisfish.entities.Population#1169028645847#0.8922880465329557, rule.0.parameter.SSBmay=0.0, exportDirectory=D:\SimulationsISIS\isis-export, rule.1.parameter.endMonth=5, rule.3.parameter.beginDate=0, description=, rule.1.parameter.endDate=119, plans=SAMigration,, rule.0.parameter.TAC=33000.0, simulLogLevel=info, population.Anchois_long.number=[[0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 2.149474576E8, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 2.042000847E9, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 4.191475424E9, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 3.761580508E9, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 6.448423729E8, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], [1.450473E8, 6.3991456E7, 7.6789747E7, 1.19450717E8, 0.0, 7.92275167E8, 0.0], [5.0753617E7, 2.2391302E7, 2.6869562E7, 4.1797097E7, 0.0, 2.77225641E8, 0.0], [6275399.0, 2768559.0, 3322270.0, 5167976.0, 0.0, 3.4277392E7, 0.0]], regionName=SAMigration, rule.0.parameter.endMonth=5, numberOfSensitivitySimulation=-1, rule.3.parameter.endDate=500, rule.3.parameter.pop=fr.ifremer.isisfish.entities.Population#1169028645847#0.8922880465329557, rule.3.parameter.NbAnneesDepuis2000=8, rule.1.parameter.allocCountries=0.5, scriptLogLevel=info, preScript=, useStatistic=false, analysePlan=, populations=Anchois_long, rule.0.parameter.pop=fr.ifremer.isisfish.entities.Population#1169028645847#0.8922880465329557, strategies=Espagnols,BolBretons,PelProfil1,PelProfil2,BolBasques, rule.0.parameter.beginDate=6, rule.1.parameter.SSBmay=0.0, rule.2.parameter.zone=fr.ifremer.isisfish.entities.Zone#1169028645767#0.37798185123822536, resultNames=matrixEffortPerStrategyMet,matrixEffortNominalPerStrategyMet,matrixCatchPerStrategyMetPerZonePop,matrixCatchWeightPerStrategyMetPerZonePop,matrixFishingMortality,matrixAbundance,matrixBiomass,matrixGrossValueOfLandingsPerSpeciesPerStrategyMet,matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMet,matrixGrossValueOfLandingsOtherSpeciesPerStrategyMet,matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel,matrixPrice,, rule.0.parameter.endDate=119, rule.2.parameter.beginDate=0, rule.0.parameter.allocCountries=0.5, numberOfYear=10, rule.3.parameter.report=1, useOptimization=true, rule.2.parameter.reportHypothese=0, exports=Abundances.java,BiomassRelative.java,BiomasseLastYear.java,Biomasses.java,CapturesNombre.java,CapturesPoids.java,CapturesPoidsLastYear.java,CapturesPoidsRelative.java,EffortsMetier.java,EffortsNominalMetier.java,GrossValueOfLandingsPerStrMetSigrid.java,, useAnalysePlan=true, rule.3.parameter.tacInTons=0.0, rule.2.parameter.endDate=300, rule.1.parameter.TAC=33000.0, isisFishVersion=3.2.0.8} INFO|09:19:50,759|InProcessSimulatorLauncher.java|197|message|Mise en place des aspects Cache INFO|09:19:50,759|SimulationControl.java|192|setText|Mise en place des aspects Cache INFO|09:19:50,777|CompileHelper.java|116|loadClass|Can't load class: simulators.DefaultSimulator java.lang.ClassNotFoundException: simulators.DefaultSimulator at fr.ifremer.isisfish.aspect.AspectClassLoader.findClass(AspectClassLoader.java:86) at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:307) at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:252) at fr.ifremer.isisfish.util.CompileHelper.loadClass(CompileHelper.java:114) at fr.ifremer.isisfish.datastore.JavaSourceStorage.getCodeClass(JavaSourceStorage.java:139) at fr.ifremer.isisfish.datastore.JavaSourceStorage.getNewInstance(JavaSourceStorage.java:154) at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulatorStorage.getNewSimulatorInstance(SimulatorStorage.java:76) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:370) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:259) ERROR|09:19:50,777|InProcessSimulatorLauncher.java|426|localSimulateSameThread|Error during simulation fr.ifremer.isisfish.IsisFishException: Can't load class: simulators.DefaultSimulator at fr.ifremer.isisfish.datastore.JavaSourceStorage.getCodeClass(JavaSourceStorage.java:142) at fr.ifremer.isisfish.datastore.JavaSourceStorage.getNewInstance(JavaSourceStorage.java:154) at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulatorStorage.getNewSimulatorInstance(SimulatorStorage.java:76) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:370) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:259) INFO|09:19:51,531|InProcessSimulatorLauncher.java|456|localSimulateSameThread|Simulation time: 0.912 Pouvez-vous m'expliquer le bins...? serait-ce du au changement de repertoire ...? Autre question : est-ce que le plan de simulation s'arrete lorsque l'on a le message de caparmor "quota depasse"? merci stephanie et sigrid -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Lire le fichier R.Data d'une analyse de sensibilité
by Delphine.Rocklin＠ifremer.fr 06 Jan '10

06 Jan '10

Salut les ISISiens, petit souci. J'ai fait tourner une AS Morris et j'ai donc obtenu un R.Data. Cependant je n'arrive pas à le lire sous TinnR. Je ne comprends pas, je le load en donnant à R le chemin pour trouver le fichier R.Data. Ca semble fonctionner Par contre, qd je lance la commande as_AS_EtatInitial_201001051913_0.SensitivityBiomassY3.isis.methodAnalyse (en enlevant bien les tirets entre les dates / heures, comme dit dans la page internet d'ISIS), ben là, il me répond que l'objet est introuvable... Comment ça se fait? Je suis sûre que ce n'est qu'un grossier oubli de qqch de ma part, mais bon... Merci Delph

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