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[ANN] - ISIS-Fish 4.4.7.0 released
by Eric Chatellier Feb. 16, 2022

Feb. 16, 2022

The ISIS-Fish team is pleased to announce the isis-fish-4.4.7.0 release! Simulateur de pêcherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://isis-fish.org Changes ------- #11477: Ajouter un menu pour extraire toutes des données de référence d'une simulation #11478: Modifier la configuration de R pour que cela soit plus simple pour l'utilisateur #11489: Importer une zone à partir d'un fichier shapefile (*.shp) Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: https://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * https://forge.codelutin.com/attachments/download/6890/isis-fish-4.4.7.0-bin… Have fun! -ISIS-Fish team -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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Re: [Isis-fish-users] Récupérer la biomasse initiale
by Charlotte Sève Feb. 10, 2022

Feb. 10, 2022

Hello Eric et Stephanie, Merci pour vos réponses. Récupérer les effectifs initiaux via getSimulationStorage().getParameter().getNumberOf(pop) et ensuite faire une boucle sur les groupes pour récupérer la biomasse devrait le faire, et je peux utiliser ça dans Init. Je vais faire ça ! Merci beaucoup ! Charlotte Le jeu. 10 févr. 2022 à 13:13, Stephanie Mahevas < Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr> a écrit : > La biomasse aurait été mieux mais le pb de beginmonth c'est que les > processus biologiques qui peuvent exister à t=0 ont déjà eu lieu. > Reste simplement à boucler sur les groupes pour calculer la biomasse > > Le 10 févr. 2022 12:40, Eric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> a > écrit : > > Le 10/02/2022 à 11:43, Stephanie MAHEVAS a écrit : > > Salut > > Est-il possible de récupérer les effectifs initiaux qui sont saisis dans > > l'interface de lancement ? > > Si, via getSimulationStorage().getParameter().getNumberOf(pop) > > C'est utilisable dans la méthode init() aussi. > > > Mais les effectifs initiaux et la biomass ce n'est pas pareil si ? > > -- > Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28 > > > -- *Charlotte Sève*, PhD Student CRIOBE - UAR 3278 (CNRS-EPHE-UPVD) Phone: +33 6 21 10 10 16 Skype: charlotteseve

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Récupérer la biomasse initiale
by Charlotte Sève Feb. 10, 2022

Feb. 10, 2022

Bonjour tout le monde, Je souhaiterais récupérer la biomasse initiale de ma population pour l'utiliser dans une règle. Est-ce que quelqu'un sait quel est le code pour la récupérer ? NB: j'ai besoin de la biomasse totale sur toute ma région (un peu comme dans le Population monitor getBiopass(pop), mais pour la biomasse initiale Merci beaucoup pour votre aide, Charlotte -- *Charlotte Sève*, PhD Student CRIOBE - UAR 3278 (CNRS-EPHE-UPVD) Phone: +33 6 21 10 10 16 Skype: charlotteseve

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Vocabulaire Isis-Fish
by Etienne JOUBERT Feb. 9, 2022

Feb. 9, 2022

Bonjour à tous, J'espère que vous allez bien et que vous avez passé un agréable week-end. J'ai quelques questions à vous poser, concernant certains termes du volet pêche du simulateur. J'ai essayé de faire des recherches sur leur calcul/définition précise, dans la bibliographie de la communauté sur le site ou dans le FAQ, mais je garde quelques incertitudes. 3 termes me posent problème : la sélectivité, l'accessibilité et le facteur de standardisation. Accepteriez-vous de valider ou corriger mes définitions et méthodes de calcul s'il vous plaît? - La sélectivité : Probabilité d'attraper le poisson en question lors de la pêche (compris entre 0 et 1). Si on se base sur des observations cela revient au nombre de prises de l'espèce étudiée, dans une zone durant une période donnée, divisée par le nombre total de prises dans la zone d'étude pour un engin donné. - L'accessibilité : Probabilité d'attraper le poisson en question par unité d'effort de pêche pour un engin non sélectif (compris entre 0 et 1). Soit le nombre d'individus de l'espèce étudiée, attrapés durant une période de temps et dans une zone donnée, divisé par le nombre d'heures d'activité moyen d'un engin sur la même période et zone. -Le Facteur de standardisation : taux de correction permettant de comparer les différentes activités de pêche (compris entre 0 et 1). Correspond pour chaque engin au temps de pêche minimal parmi les différents engins du modèle divisé par le temps de pêche de l'engin en question. Je vous souhaite une bonne journée et vous remercie d'avance pour votre aide. Bien cordialement, Etienne Joubert

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish Dec. 31, 2021

Dec. 31, 2021

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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Individus contribuant au rectrutement
by dedah.ahmed-babou＠ird.fr Dec. 10, 2021

Dec. 10, 2021

Bonjour à tous, Est-ce que quelqu'un(e) pourrait m'aider a avoir un bout de code qui permettrait de récupérer, dans l'éditeur de l'équation du recrutement, le nombre d'individus d'âge 2 à la saison de reproduction qui s'étale sur deux mois (ce sont les individus qui seront utilisés pour générer un recrutement suivant une relation stock-recrutement). Merci par avance.

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récupérer la liste des cellules des zones ISIS
by Sigrid LEHUTA Dec. 9, 2021

Dec. 9, 2021

Bonjour, y a t'il un moyen de récuperer en txt ou csv la liste des cellules latitude et longitude (La,Lo) appartenant a chaque zone ? Merci -- NB : Please note that I do not work on Wednesdays Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER Nantes Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105, 44311 Nantes Cedex 03, France Tél : 02 40 37 42 38 (N° interne : 8238) Membre de l'Association Française d'Halieutique https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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export 0's in metiers that do not exist in strategies
by Stéphanie Hopkins Nov. 25, 2021

Nov. 25, 2021

Bonjour à touts: I have just noticed from my resultsExport files, that isis-fish-4.4.6.1 assign a zero value instead of dropping values where strategies do not match metiers. Attached is my database file and an example export. Bon Cordialement, Stéphanie

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Afficher un message dans les logs ISIS
by dedah.ahmed-babou＠ird.fr Nov. 23, 2021

Nov. 23, 2021

Bonjour, Est-ce qu'il y aurait un un moyen d'écrire un message [System.out.println("Toto: "+var);] dans un éditeur ISIS (editeur de l'équation de recrutement par exemple) qui s'affichera après le lancement de la simulation dans les logs. C'est pour tester si les valeurs prises par une variable sont exactes. Avec mes remerciements. Dedah.

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Deblocage ISIS
by dedah.ahmed-babou＠ird.fr Nov. 10, 2021

Nov. 10, 2021

Bonjour à toutes et à tous, Quand je clique dans l'éditeur ISIS sur la classe MatrixND ( org.nuiton.math.matrix.MatrixND) le lien ne fonctionne pas. [ http://nuiton.page.nuiton.org/nuiton-matrix/nuiton-matrix/apidocs/org/nuito… | http://nuiton.page.nuiton.org/nuiton-matrix/nuiton-matrix/apidocs/org/nuito… ] Je n'ai pas réussi a avoir la description de cette classe ni dans le site ISIS ni dans le gitlab. Si vous avez une idée de où trouver cette classe et comment ses objets fonctionnent. Avec mes remerciements. Cordialement. Dedah.

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