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Reproduction/recrutement
by Stephanie MAHEVAS Nov. 8, 2021

Nov. 8, 2021

Bonjour, Je m'interroge sur l'application du décalage entre la reproduction et le recrutement (nombre de mois entre repro et recrut) et je ne sais pas comment vérifier dans le code ce qu'il se passe (?). Sur le site web, il y a un exemple très clair qui dit que c'est apres la saison de reproduction (ci-dessous). Mais, je trouve que c'est tres contraignant car si le recrutement démarre avant la fin de la reproduction, on ne peut pas le décrire. C'est embetant si il y a de la reproduction et du recrutement toute l'année... Est-ce que le nombre de mois entre la reproduction et le recrutement est compté à partir de la fin de la saison de reproduction (comme c'est décrit dans l'exemple) ou dès le premier mois de la reproduction ? Est-ce qu'on a accès au code? j'ai cherché dans les sources de l'API mais niet... Merci Steph ** *It is called for each time step within the recruitment period (spawning month + recruitment delay + recruitment distribution) : For example, if the spawning period extends from January to March, the delay from spawning to the start of recruitment is 8 months and the recruitment (p) is spread over two months (with a 0.7 of the recruitment the first month and 0.3 the second), then reproductions will hold* * * In September o January (index 0) : ReproductionData (with reproduction data for January, p=0.7) * In October: o January (index 0): ReproductionData (with reproduction data for January, p=0.3) o February (index 1): ReproductionData (with reproduction data for February, p=0.7) * In November o February (index 1): ReproductionData (with reproduction data for February, p=0.3) o March (index 2): ReproductionData (with reproduction data for March, p=0.7) * In December o March (index 2): ReproductionData (with reproduction data for March, p=0.3) * -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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lancement isis avec .sh
by Stephanie MAHEVAS Nov. 5, 2021

Nov. 5, 2021

Bonjour Eric, que se passe t-il (que l'on ne voit pas) quand on lance isis avec le .sh au lieu du .bat sous windows ? merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (stephanie.mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ Tel: (33) 2 40 37 41 81 - 06 75 83 59 33 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Help pour définir des zones dans ISIS
by dedah.ahmed-babou＠ird.fr Oct. 19, 2021

Oct. 19, 2021

Bonjour à toutes et à tous, Est-ce que quelqu'un aurait une solution plus pratique pour définir des zones dans ISIS de manière plus rapide? En fait, je travaille sur une grille assez fine et je passe par mal de temps à faire des clics pour définir une zone sachant que je dois en définir plusieurs dont chacune comporte plusieurs centaines de cellules, en plus la définition des cellules sur terre. Avec mes remerciements. Dedah.

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish Sept. 30, 2021

Sept. 30, 2021

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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getBiomass MatrixND
by Stephanie MAHEVAS July 16, 2021

July 16, 2021

Bonjour Eric, la classe populationMonitor n'a pas de methode pour recuperer la biomasse par groupe et par zone (uniquement getBiomass(pop) qui est un double) comme l'abondance (getN(pop) qui est MatrixND). Serait-il possible de rajouter cette méthode, histoire de ne pas faire le produit à la main de getN(pop) par getWeight(group) ? Merci Steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Noms trop longs dans simulations
by Stephanie MAHEVAS July 13, 2021

July 13, 2021

Bonjour de manière récurrente, nous avons des soucis pour échanger entre nous des simulations qui ont tourné avec ISIS. On ne parvient pas sous windows à faire un copier coller du repertoire de la simulation et le message d'erreur est que le nom du fichier est trop long. Est-il possible de solutionner ce problème (sans changer de système d'exploitation !) ? Merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish June 30, 2021

June 30, 2021

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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Probleme plan de simulations
by Charlotte Sève June 28, 2021

June 28, 2021

Bonsoir, J'essaye de lancer un plan de simu sur la version 4.4.5.3 de ISIS sur mon serveur et je n'arrive pas à faire tourner les simulations... elles se lancent et s'arrêtent toutes en janvier 0. Individuellement, la règle appelée par le plan de simulation fonctionne... Ci-joint le debug - est-ce que quelqu'un saurait m'indiquer d'où vient le problème ? Merci beaucoup et bonne semaine à tous :) Charlotte -- *Charlotte Sève*, PhD Student CRIOBE - USR 3278 (CNRS-EPHE-UPVD) Phone: +33 6 21 10 10 16 Skype: charlotteseve

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Nouvelle version ISIS - dossier database vide
by Charlotte Sève June 25, 2021

June 25, 2021

Bonjour à tous, La version 4.4.5.3. de ISIS a été installée sur le serveur de mon laboratoire. J'arrive très bien à ouvrir et à lancer les simulations mais la boîte de dépôt reste dans l'ancien dossier database (le 4.4.2.5, ça date...) Est-ce que quelqu'un a déjà été confronté à ce bug et aurait une idée de comment résoudre ce problème ? Merci beaucoup et bonne journée :) Charlotte -- *Charlotte Sève*, PhD Student CRIOBE - USR 3278 (CNRS-EPHE-UPVD) Phone: +33 6 21 10 10 16 Skype: charlotteseve

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[ANN] - ISIS-Fish 4.4.6.0 released
by Eric Chatellier June 3, 2021

June 3, 2021

The ISIS-Fish team is pleased to announce the isis-fish-4.4.6.0 release! Simulateur de pêcherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://isis-fish.org Changes ------- #10755: Utilisation des nœuds FTP pour les transferts sur datarmor Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: https://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * https://forge.codelutin.com/attachments/download/6739/isis-fish-4.4.6.0-bin… Have fun! -ISIS-Fish team -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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