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Probleme simulation
by Charlotte Sève Feb. 21, 2020

Feb. 21, 2020

Hello, J'essaye de lancer une simulation et je n'arrive pas à comprendre pourquoi ISIS plante après le premier mois de simu... Est-ce que quelqu'un saurait m'aider là-dessus ? Voilà le debug en p-j Merci beaucoup ! Charlotte -- *Charlotte Sève*, PhD Student CRIOBE - USR 3278 (CNRS-EPHE-UPVD) Phone: +33 6 21 10 10 16 Skype: charlotteseve

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dRE: Changement de la carte par défaut
by BACH Adrian Feb. 20, 2020

Feb. 20, 2020

Bonjour Eric, Merci pour votre réponse, je viens de réussir à les ajouter, le système de projection qui a fonctionné est WGS, et les latitudes et longitudes semblent bien correspondre. Est-ce surprenant? -----Message d'origine----- De : Eric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Envoyé : jeudi 20 février 2020 17:14 À : BACH Adrian <Adrian.BACH(a)seaboost.fr> Cc : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Changement de la carte par défaut Le 20/02/2020 à 16:45, BACH Adrian a écrit : > Bonjour, > > Je suis en train d'essayer de définir la région d'ISIS sur la baie de Toulon, mais la carte par défaut n'est pas assez fine. > J'ai à disposition un shapefile des communes de France et autre du trait de côte (plus fin) de la côte PACA. > J'ai essayé d'ajouter les deux dans ISIS en les projetant au préalable dans le système World Mercator, mais le trait est discontinu et la carte commune ne semble pas apparaître. > Est-ce que ces couches sont suffisantes pour définir terre et mer dans ISIS? Si non, de quel type de fichier ai-je besoin? Je ne connais pas le fonctionnement interne d'un shape file, mais si vous voulez, je peux tester vos fichiers si vous pensez qu'ils devraient fonctionner. -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28 ________________________________ Ce message et ses pièces jointes peuvent contenir des informations confidentielles ou privilégiées et ne doivent donc pas être diffusés, exploités ou copiés sans autorisation. Si vous avez reçu ce message par erreur, merci de le signaler à l'expéditeur et le détruire ainsi que les pièces jointes. Les messages électroniques étant susceptibles d'altération, Egis décline toute responsabilité si ce message a été altéré, déformé ou falsifié. Merci. This message and its attachments may contain confidential or privileged information that may be protected by law; they should not be distributed, used or copied without authorisation. If you have received this email in error, please notify the sender and delete this message and its attachments. As emails may be altered, Egis is not liable for messages that have been modified, changed or falsified. Thank you. ________________________________

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Re: [Isis-fish-users] Changement de la carte par défaut
by BACH Adrian Feb. 20, 2020

Feb. 20, 2020

Bonjour, Je suis en train d'essayer de définir la région d'ISIS sur la baie de Toulon, mais la carte par défaut n'est pas assez fine. J'ai à disposition un shapefile des communes de France et autre du trait de côte (plus fin) de la côte PACA. J'ai essayé d'ajouter les deux dans ISIS en les projetant au préalable dans le système World Mercator, mais le trait est discontinu et la carte commune ne semble pas apparaître. Est-ce que ces couches sont suffisantes pour définir terre et mer dans ISIS? Si non, de quel type de fichier ai-je besoin? Merci, à bientôt! Adrian -----Message d'origine----- De : Isis-fish-users <isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org> De la part de isis-fish-users-request(a)list.isis-fish.org Envoyé : mercredi 12 février 2020 12:00 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Lot Isis-fish-users, Vol 124, Parution 3 Envoyez vos messages pour la liste Isis-fish-users à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Pour vous (dés)abonner par le web, consultez http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users ou, par email, envoyez un message avec 'help' dans le corps ou dans le sujet à isis-fish-users-request(a)list.isis-fish.org Vous pouvez contacter l'administrateur de la liste à l'adresse isis-fish-users-owner(a)list.isis-fish.org Si vous répondez, n'oubliez pas de changer l'objet du message afin qu'il soit plus spécifique que "Re: Contenu du digest de Isis-fish-users..." Thèmes du jour : 1. Re: Finesse du trait de côte ISIS (slehuta) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Tue, 11 Feb 2020 17:24:11 +0100 From: slehuta <Sigrid.Lehuta(a)ifremer.fr> To: isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Cc: BACH Adrian <Adrian.BACH(a)seaboost.fr> Subject: Re: [Isis-fish-users] Finesse du trait de côte ISIS Message-ID: <313c4c89ba404457a4783778df778418(a)ifremer.fr> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Bonjour Adrian, bienvenu dans la communauté des utilisateurs d'ISIS ! Tu peux ajouter un shape file dans l'interface ("Ajouter une carte" cf capture d'écran) qui se substitue à la carte par défaut. Dans les prochaines versions nous travaillons à la création des zones de maniere automatique à partir de shape files, un peu de patience... N'hésite pas à nous contacter pour obtenir de l'aide dans ton développement de modèle et pour nous exposer le contexte de ton étude (thèse, stage, encadrement, questions, etc). Sigrid Le 2020-02-11 16:55, BACH Adrian a écrit : > Bonjour, > > Je travaille avec l'Ifremer de la Seyne-sur-Mer sur l'effet de l'installation d'équipements de restauration écologique dans les ports sur la population de Sar à l'échelle de la rade de Toulon. Nous voulons utiliser ISIS pour simuler différents scénarios d'équipement des ports. > > C'est ma première approche du logiciel et je viens de définir les limites de la zone d'étude ainsi qu'un maillage temporaire. Je joins au mail une capture d'écran G-earth de la zone d'étude et de l'interface ISIS pour que vous puissiez faire la comparaison. Est-ce possible d'obtenir un trait de côte plus précis ? Ou une échelle plus fine ? > > Ça semble essentiel car les zones de vie du Sar sont côtières et les juvéniles s'installent près des côtes dans les eaux très peu profondes (rarement plus d'un mètre). > > N'hésitez pas à me conseiller des lectures si jamais. > > Merci d'avance, > > Adrian > ------------------------- > Ce message et ses pièces jointes peuvent contenir des informations confidentielles ou privilégiées et ne doivent donc pas être diffusés, exploités ou copiés sans autorisation. Si vous avez reçu ce message par erreur, merci de le signaler à l'expéditeur et le détruire ainsi que les pièces jointes. Les messages électroniques étant susceptibles d'altération, Egis décline toute responsabilité si ce message a été altéré, déformé ou falsifié. Merci. > > This message and its attachments may contain confidential or privileged information that may be protected by law; they should not be distributed, used or copied without authorisation. If you have received this email in error, please notify the sender and delete this message and its attachments. As emails may be altered, Egis is not liable for messages that have been modified, changed or falsified. Thank you. > ------------------------- > > _______________________________________________ > Isis-fish-users mailing list > Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users -------------- section suivante -------------- Une pièce jointe HTML a été nettoyée... URL: <http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/attachments/20200211/bb…> ------------------------------ Subject: Pied de page des remises groupées _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users ------------------------------ Fin de Lot Isis-fish-users, Vol 124, Parution 3 *********************************************** ________________________________ Ce message et ses pièces jointes peuvent contenir des informations confidentielles ou privilégiées et ne doivent donc pas être diffusés, exploités ou copiés sans autorisation. Si vous avez reçu ce message par erreur, merci de le signaler à l'expéditeur et le détruire ainsi que les pièces jointes. Les messages électroniques étant susceptibles d'altération, Egis décline toute responsabilité si ce message a été altéré, déformé ou falsifié. Merci. This message and its attachments may contain confidential or privileged information that may be protected by law; they should not be distributed, used or copied without authorisation. If you have received this email in error, please notify the sender and delete this message and its attachments. As emails may be altered, Egis is not liable for messages that have been modified, changed or falsified. Thank you. ________________________________

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[ANN] - ISIS-Fish 4.4.4.1 released
by Eric Chatellier Feb. 20, 2020

Feb. 20, 2020

The ISIS-Fish team is pleased to announce the isis-fish-4.4.4.1 release! Simulateur de pêcherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://isis-fish.org Changes ------- Changes in this version includes: Anomalie #10689: Le script isisfish.bat ne fonctionne pas Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: https://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * https://forge.codelutin.com/attachments/download/6058/isis-fish-4.4.4.1-bin… Have fun! -ISIS-Fish team -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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cr.getFecundity() undefined for PopulationGroup
by Charlotte Sève Feb. 20, 2020

Feb. 20, 2020

Hello, Dans mon équation de reproduction j'essaye de calculer le nombre d'oeufs en fonction de la fécondité et malheureusement je n'arrive pas bien à comprendre d'où vient le problème suivant : The method cr.getFecundity() is undefined for the type PopulationGroup Est-ce que quelqu'un a une idée pour m'orienter sur l'origine du problème ? Merci beaucoup et bonne journée ! Charlotte -- *Charlotte Sève*, PhD Student CRIOBE - USR 3278 (CNRS-EPHE-UPVD) Phone: +33 6 21 10 10 16 Skype: charlotteseve

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Matrice de connectivité
by Charlotte Sève Feb. 20, 2020

Feb. 20, 2020

Hello, Est-ce que quelqu'un saurait s'il est possible d'appeler la matrice de connectivité dans ISIS en utilisant : "pop.getBean.getFieldPopulationMappingZoneReproZoneRecru" ? Merci beaucoup ! Charlotte

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Finesse du trait de côte ISIS
by BACH Adrian Feb. 11, 2020

Feb. 11, 2020

Bonjour, Je travaille avec l'Ifremer de la Seyne-sur-Mer sur l'effet de l'installation d'équipements de restauration écologique dans les ports sur la population de Sar à l'échelle de la rade de Toulon. Nous voulons utiliser ISIS pour simuler différents scénarios d'équipement des ports. C'est ma première approche du logiciel et je viens de définir les limites de la zone d'étude ainsi qu'un maillage temporaire. Je joins au mail une capture d'écran G-earth de la zone d'étude et de l'interface ISIS pour que vous puissiez faire la comparaison. Est-ce possible d'obtenir un trait de côte plus précis ? Ou une échelle plus fine ? Ça semble essentiel car les zones de vie du Sar sont côtières et les juvéniles s'installent près des côtes dans les eaux très peu profondes (rarement plus d'un mètre). N'hésitez pas à me conseiller des lectures si jamais. Merci d'avance, Adrian ________________________________ Ce message et ses pièces jointes peuvent contenir des informations confidentielles ou privilégiées et ne doivent donc pas être diffusés, exploités ou copiés sans autorisation. Si vous avez reçu ce message par erreur, merci de le signaler à l'expéditeur et le détruire ainsi que les pièces jointes. Les messages électroniques étant susceptibles d'altération, Egis décline toute responsabilité si ce message a été altéré, déformé ou falsifié. Merci. This message and its attachments may contain confidential or privileged information that may be protected by law; they should not be distributed, used or copied without authorisation. If you have received this email in error, please notify the sender and delete this message and its attachments. As emails may be altered, Egis is not liable for messages that have been modified, changed or falsified. Thank you. ________________________________

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droit de modification du site web et doc pour faire les modifs
by Stephanie MAHEVAS Jan. 31, 2020

Jan. 31, 2020

Bonjour pouvez-vous donner les droits de modification du site web à Jean.Baptiste.Lecomte(a)ifremer.fr ? y a t-il une doc disponible pour apprendre à modifier le site ? merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Probleme creation pop ISIS v4.4.3.1
by Charlotte Sève Jan. 28, 2020

Jan. 28, 2020

Re-salut, Nouveau problème lors de la création d'une population dans cette version 4.4.3.1 d'ISIS. Voir le débug en p-j... Merci beaucoup, Ciao Charlotte -- *--* *Charlotte Sève*, PhD Student CRIOBE (USR 3278 CNRS-EPHE-UPVD) Phone: +33 6 21 10 10 16 | Skype: charlotteseve Mail: charlotte.m.seve(a)gmail.com

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[ANN] - ISIS-Fish 4.4.4.0 released
by Eric Chatellier Jan. 28, 2020

Jan. 28, 2020

The ISIS-Fish team is pleased to announce the isis-fish-4.4.4.0 release! Simulateur de pêcherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://isis-fish.org Changes ------- Changes in this version includes: Anomalie #7151: Détecter la modification externe des fichiers script Anomalie #7179: Ajouter une documentation concernant l'import des matrices Anomalie #8447: importer région ayant le même nom qu'un région existante Anomalie #9556: Simulation information : start/end Anomalie #10447: null child not allowed : le retour Anomalie #10448: ISIS NE PEUT PAS CHARGER LA LISTE DES POPULATIONS ET DES STRATEGIES Anomalie #10472: Erreur à l'ouverture des formules dans l'interface d'édition de scripts Anomalie #10630: Impossible de charger rJava depuis IsisFish à partir de Java 10 Evolution #3938: Séparer la liste metier season info zones en deux listes : sélectionnée / non sélectionnées Evolution #4288: Add synthax editor and checker for simulation prescript Evolution #9070: mettre dans Isis un Helper qui permette de lancer facilement des programmes externe Evolution #9225: Dans la méthode "Objective.eval" Ajouter 2ème paramètre SimulationStorage Evolution #9679: Ajouter un rapport de bug directement dans Isis Evolution #9745: Amélioration de la paramétrisation de la reproduction du modèle populationel Evolution #10432: Ajouter le bouton Compiler sur les equations dans les AS Evolution #10434: Sauvegarde des paramètres d'AS pour pouvoir revenir dessus plus tard Evolution #10437: Ne compiler que les equations réelement utilisées par les objets sélectionnée dans la simulation. Evolution #10439: Ajouter la possibilité d'avoir les logs d'un plan ou d'une AS dans un fichier dédié Evolution #10440: Ajouter les script de pre simu dans une AS Evolution #10458: Ne pas necessiter de connexion internet pour lancer une simulation Evolution #10459: Regrouper tous les fichiers de configuration dans le dossier isis-fish-4/config Tâche #10631: Assurer la compatibilité Java 11 Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: https://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * https://forge.codelutin.com/attachments/download/6015/isis-fish-4.4.4.0-bin… Have fun! -ISIS-Fish team -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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