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Probleme - "simulator" is null - au lancement sur datarmor
by PETITJEAN Loup Dec. 19, 2025

Dec. 19, 2025

Bonjour, Je reviens vers vous avec un nouveau problème sur lequel j'aurais bien besoin de vos lumières ! J'essaie de lancer plusieurs simulations sur datarmor en faisant varier le forçage du nombre de bateaux par flottille entre chaque simulation. Pour ça j'utilise un PBS qui va appeler un script R. Ce script R génère mes différentes simulations à partir d'un zip d'une simulation préparée. Un fichier de forçage est affecté à chaque simulation. ISIS est ensuite lancé à partir du script R pour chaque simulation. Pour appliquer le forçage j'utilise une règle (le init surtout) qui va venir injecter les données du fichier dans le context de la simulation. Problème : Les simulations se lancent sans problème quand je n'utilise pas la règle (pas de forçage), mais avec celle-ci la simulation ne se lance pas. Il semblerait que le simulateur ne soit pas trouvé. J'avais utilisé une règle similaire en local, et le forçage s'effectuait correctement. Je vous partage en pièce jointe le zip de la simulation préparée ainsi que le debug correspondant pour deux simulations préparées, une avec le lanceur datarmor et une avec le lanceur sous-processus (pas tout à fait le même debug) .Si vous avez besoin de quoi que ce soit d'autre tenez moi au courant. En vous souhaitant une très bonne journée ! Loup Petitjean

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[ANN] - ISIS-Fish 4.5.0.0 released
by Eric Chatellier Nov. 26, 2025

Nov. 26, 2025

The ISIS-Fish team is pleased to announce the isis-fish-4.5.0.0 release! Simulateur de pêcherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://isis-fish.org Changes ------- #11775: Les sémantiques des matices de types Month ou TimeStep ne sont pas correctement exportées #11845: Les facteur discret de type equation ne fonctionnent pas dans certains cas. #12820: Problème de refraichissement des écrans #12889: Dans l'affichage des résultats, menu Exports, impossible de faire défiler le menu #12949: Les exports 1 fois/ an ne fonctionnent pas si la simulation est arrêtée avant la fin #11686: Utiliser un simulateur différent par population #12888: Permettre d'utiliser une équation d'activité à la place d'une équation d'inactivité #12951: Aide / documentation des équations dans l'UI #12958: Analyser la consommation mémoire des simus en 4.4.8.2 (par rapport à la 4.4.8.1) Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: https://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * https://forge.codelutin.com/attachments/download/9074/isis-fish-4.5.0.0-bin… Have fun! -ISIS-Fish team -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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Problème suppression métier à partir d'une région importée
by PETITJEAN Loup Nov. 25, 2025

Nov. 25, 2025

Bonjour à tous·tes, Je suis un nouvel utilisateur d'ISIS-Fish et j'ai rencontré un problème en voulant simplifier une région importée. En bref je ne parviens pas à supprimer certains métiers qui ne sont pourtant plus impliqués dans aucune de mes stratégies/flottilles. Dans le détail : 1) Première tentative, dans l'ordre j'ai : - commencé par supprimer les espèces qui ne m'intéressaient pas pour n'en garder qu'une, - supprimé les stratégies qui ne m'intéressaient pas non plus, pour n'en garder que deux, - supprimé les flottilles qui ne correspondaient pas aux stratégies conservées, - supprimé les métiers pratiqués qui ne m'intéressaient pas pour chacune de mes flottilles, - pris la confiance et ai supprimé les navires et les engins qui ne correspondaient pas aux métiers qui m'intéressaient, - essayé de supprimer un métier anciennement pratiqué par une de mes flottilles, et ai reçu ce message : [cid:4ac7fada-1760-4063-ad9e-81b35514c533] l'option "Oui" ne supprime pas le métier, sachant que le métier en question n'apparaît plus ni dans les métiers pratiqués et sélectionnés pour la flottille (mais toujours dans Métiers disponibles), ni dans la matrice de Proportion métier dans l'onglet Saisie des mois pour la stratégie concernée. 2) J'ai réessayé d'abord en ne supprimant pas les engins, puis en ne supprimant ni les engins ni les navires, puis ni les engins navires et espèces, ça n'a rien changé. 3) J'ai fait tourner une simulation avec cette région enregistrée sans suppression des métiers inutiles dans l'onglet Métier (mais dans stratégies et flottilles), et dans les résultats de MatrixLandingPerMet je n'ai bien que les métiers d'intérêts proposés dans Métiers. Comme la simulation tourne comme voulu, je ne sais pas s'il s'agit vraiment d'un problème mais je serais curieux d'avoir votre point de vue. En vous souhaitant une très bonne journée, Loup

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bug 4.5.0
by Stephanie MAHEVAS Nov. 18, 2025

Nov. 18, 2025

java.lang.RuntimeException: failed to lazily initialize a collection of role: fr.ifremer.isisfish.entities.SpeciesImpl.population, could not initialize proxy - no Session at jaxx.runtime.swing.nav.tree.NavTreeNode.populateChilds(NavTreeNode.java:298) at jaxx.runtime.swing.nav.tree.NavTreeNode.findNodeById(NavTreeNode.java:164) at jaxx.runtime.swing.nav.tree.NavTreeNode.findNodeById(NavTreeNode.java:177) at jaxx.runtime.swing.nav.tree.NavTreeNode.findNodeById(NavTreeNode.java:177) at jaxx.runtime.swing.nav.tree.NavTreeNode.findNodeById(NavTreeNode.java:177) at jaxx.runtime.swing.nav.tree.NavTreeNode.findNodeById(NavTreeNode.java:42) at jaxx.runtime.swing.nav.NavHelper.findNode(NavHelper.java:863) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputHandler.updateTreeNode(InputHandler.java:748) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputSaveVerifier.cancel(InputSaveVerifier.java:329) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputSaveVerifier.checkEdit(InputSaveVerifier.java:123) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputTabbedPaneListener.canChangeTab(InputTabbedPaneListener.java:114) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputTabbedPaneListener.stateChanged(InputTabbedPaneListener.java:69) at java.desktop/javax.swing.JTabbedPane.fireStateChanged(JTabbedPane.java:447) at java.desktop/javax.swing.JTabbedPane$ModelListener.stateChanged(JTabbedPane.java:298) at java.desktop/javax.swing.DefaultSingleSelectionModel.fireStateChanged(DefaultSingleSelectionModel.java:148) at java.desktop/javax.swing.DefaultSingleSelectionModel.setSelectedIndex(DefaultSingleSelectionModel.java:79) at java.desktop/javax.swing.JTabbedPane.setSelectedIndexImpl(JTabbedPane.java:651) at java.desktop/javax.swing.JTabbedPane.setSelectedIndex(JTabbedPane.java:626) at java.desktop/javax.swing.plaf.basic.BasicTabbedPaneUI$Handler.mousePressed(BasicTabbedPaneUI.java:4140) at java.desktop/javax.swing.plaf.synth.SynthTabbedPaneUI$1.mousePressed(SynthTabbedPaneUI.java:320) at java.desktop/java.awt.Component.processMouseEvent(Component.java:6618) at java.desktop/javax.swing.JComponent.processMouseEvent(JComponent.java:3398) at java.desktop/java.awt.Component.processEvent(Component.java:6386) at java.desktop/java.awt.Container.processEvent(Container.java:2266) at java.desktop/java.awt.Component.dispatchEventImpl(Component.java:4996) at java.desktop/java.awt.Container.dispatchEventImpl(Container.java:2324) at java.desktop/java.awt.Component.dispatchEvent(Component.java:4828) at java.desktop/java.awt.LightweightDispatcher.retargetMouseEvent(Container.java:4948) at java.desktop/java.awt.LightweightDispatcher.processMouseEvent(Container.java:4572) at java.desktop/java.awt.LightweightDispatcher.dispatchEvent(Container.java:4516) at java.desktop/java.awt.Container.dispatchEventImpl(Container.java:2310) at java.desktop/java.awt.Window.dispatchEventImpl(Window.java:2780) at java.desktop/java.awt.Component.dispatchEvent(Component.java:4828) at java.desktop/java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(EventQueue.java:775) at java.desktop/java.awt.EventQueue$4.run(EventQueue.java:720) at java.desktop/java.awt.EventQueue$4.run(EventQueue.java:714) at java.base/java.security.AccessController.doPrivileged(AccessController.java:400) at java.base/java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(ProtectionDomain.java:87) at java.base/java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(ProtectionDomain.java:98) at java.desktop/java.awt.EventQueue$5.run(EventQueue.java:747) at java.desktop/java.awt.EventQueue$5.run(EventQueue.java:745) at java.base/java.security.AccessController.doPrivileged(AccessController.java:400) at java.base/java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(ProtectionDomain.java:87) at java.desktop/java.awt.EventQueue.dispatchEvent(EventQueue.java:744) at java.desktop/java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(EventDispatchThread.java:203) at java.desktop/java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(EventDispatchThread.java:124) at java.desktop/java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(EventDispatchThread.java:113) at java.desktop/java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(EventDispatchThread.java:109) at java.desktop/java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(EventDispatchThread.java:101) at java.desktop/java.awt.EventDispatchThread.run(EventDispatchThread.java:90) Caused by: org.hibernate.LazyInitializationException: failed to lazily initialize a collection of role: fr.ifremer.isisfish.entities.SpeciesImpl.population, could not initialize proxy - no Session at org.hibernate.collection.internal.AbstractPersistentCollection.throwLazyInitializationException(AbstractPersistentCollection.java:612) at org.hibernate.collection.internal.AbstractPersistentCollection.withTemporarySessionIfNeeded(AbstractPersistentCollection.java:218) at org.hibernate.collection.internal.AbstractPersistentCollection.initialize(AbstractPersistentCollection.java:591) at org.hibernate.collection.internal.AbstractPersistentCollection.read(AbstractPersistentCollection.java:149) at org.hibernate.collection.internal.PersistentBag.toArray(PersistentBag.java:393) at java.base/java.util.ArrayList. (ArrayList.java:181) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.tree.loadors.PopulationsNodeLoador.getData(PopulationsNodeLoador.java:56) at jaxx.runtime.swing.nav.NavNodeChildLoador.loadChilds(NavNodeChildLoador.java:129) at jaxx.runtime.swing.nav.tree.NavTreeNode.populateChilds(NavTreeNode.java:296) ... 49 more -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ UMR MARBEC (MARine Biodiversity, Exploitation & Conservation) IRD, IFREMER, CNRS, Univ Montpellier IFREMER/LMH (Laboratoire Méditérranée Halieutique) Station Ifremer, avenue Jean Monnet, CS 30171, 34203 Sète cedex Tel: (33) 4 99 57 32 39 - 06 75 83 59 33 Salle de réunion personnelle ZOOM https://umontpellier-fr.zoom.us/j/8237835263?pwd=Y6VOgaGKn9c54T9i4c6bKmQ52M… o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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version d isis sur datarmor
by Sigrid LEHUTA Oct. 16, 2025

Oct. 16, 2025

Hello On constate d'importantes differences de sorties de simu entre versions d isis, entre pc et entre local/datarmor... On n'a pas été assez rigoureuses pour vraiment trier ce qui est dû à quoi. Pour limiter le probleme, on va essayer de tout faire en 8.2. peut on mettre a jour la version d'isis sur datarmor. si je ne me trompe pas actuellement c est la 4.4.8.1. peux tu installer la 4.4.8.2 ? et les suivantes pour le futur ? Merci Pour info notre pbs dit ca # exécutable ISIS export ISIS_BIN=/appli/emh-commun/isis-fish/isis-fish-4.4.8*.1*/isis-fish-4.4.8.1.jar -- /!\ Boite mail saturée (en cours de nettoyage laborieux) Pour ma santé mentale et l'environnement, merci d'éviter les pièces jointes au maximum. -- Sigrid LEHUTA ><> __/\__ ~ ><> ~ \____/ ~ Fisheries modeller IFREMER - HALGO-EMH Ecology and modeling for fisheries science DECOD Dynamics and sustainability of ecosystems: from source to sea AFH Association Française d'Halieutique (AFH) Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Tel. : 02 40 37 42 38 (8238) Participez à l'ENQUETE Réduction des captures de dauphins : https://http-proxy.cloud.codelutin.com/enquete_delmoges https://peche.ifremer.fr/Le-role-de-l-Ifremer/Recherche/Projets/Description… https://www.francefilierepeche.fr/projets/gemmbe/ https://delmoges.recherche.univ-lr.fr/presentation-du-projet/ https://www.ices.dk/advice/ESD/Pages/Bay-of-Biscay-and-the-Iberian-Coast_La… https://halgo.ifremer.fr/en https://www.umr-decod.fr/en https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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Versions 4.4.8; 2 +: java.lang.ArrayIndexOutOfBoundsException: Index 6492 out of bounds for length 5779
by Sigrid LEHUTA Oct. 16, 2025

Oct. 16, 2025

Bonsoir, nous nous sommes aperçues qu'a partir de la version 448.2 cette règle ne fonctionne plus. Elle marche en 448.1. si on commente le code L364-396 ca marche. Je ne vois pas à quoi peuvent correspondre ces indices et tailles de matrices qui posent problème à la ligne 369. je pense donc que c est plutot lié aux optimisations de calcul matriciel avec le changement de version. Pourriez vous permettre au code de fonctionner ? Merci ! -- /!\ Boite mail saturée (en cours de nettoyage laborieux) Pour ma santé mentale et l'environnement, merci d'éviter les pièces jointes au maximum. -- Sigrid LEHUTA ><> __/\__ ~ ><> ~ \____/ ~ Fisheries modeller IFREMER - HALGO-EMH Ecology and modeling for fisheries science DECOD Dynamics and sustainability of ecosystems: from source to sea AFH Association Française d'Halieutique (AFH) Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Tel. : 02 40 37 42 38 (8238) Participez à l'ENQUETE Réduction des captures de dauphins : https://http-proxy.cloud.codelutin.com/enquete_delmoges https://peche.ifremer.fr/Le-role-de-l-Ifremer/Recherche/Projets/Description… https://www.francefilierepeche.fr/projets/gemmbe/ https://delmoges.recherche.univ-lr.fr/presentation-du-projet/ https://www.ices.dk/advice/ESD/Pages/Bay-of-Biscay-and-the-Iberian-Coast_La… https://halgo.ifremer.fr/en https://www.umr-decod.fr/en https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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Message Restriction Activity
by list.isis-fish.org Oct. 11, 2025

Oct. 11, 2025

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You have (3) important emails awaiting delivery to your inbox
by list.isis-fish.org Oct. 10, 2025

Oct. 10, 2025

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URGENT: bug de regle
by Sigrid LEHUTA Oct. 8, 2025

Oct. 8, 2025

Bonjour, j ai une regle qui modifie les proportions strategy met (pj). les log montrent que la modification est bien fairte chaque mois, mais l'effort nominal qui en resulte n est modifié que le premier mois (dans les resultats). Comprends tu ce qui peut se passer ? version 4.4.8.1 Dsl :c est urgent, on est en groupe de travail, on doit rendre des simus demain... Merci ! -- /!\ Boite mail saturée (en cours de nettoyage laborieux) Pour ma santé mentale et l'environnement, merci d'éviter les pièces jointes au maximum. -- Sigrid LEHUTA ><> __/\__ ~ ><> ~ \____/ ~ Fisheries modeller IFREMER - HALGO-EMH Ecology and modeling for fisheries science DECOD Dynamics and sustainability of ecosystems: from source to sea AFH Association Française d'Halieutique (AFH) Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Tel. : 02 40 37 42 38 (8238) Participez à l'ENQUETE Réduction des captures de dauphins : https://http-proxy.cloud.codelutin.com/enquete_delmoges https://peche.ifremer.fr/Le-role-de-l-Ifremer/Recherche/Projets/Description… https://www.francefilierepeche.fr/projets/gemmbe/ https://delmoges.recherche.univ-lr.fr/presentation-du-projet/ https://www.ices.dk/advice/ESD/Pages/Bay-of-Biscay-and-the-Iberian-Coast_La… https://halgo.ifremer.fr/en https://www.umr-decod.fr/en https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish Sept. 30, 2025

Sept. 30, 2025

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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