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Remplissage métier
by Pierre ISSAC 08 Jun '17

08 Jun '17

Bonjour, est-il possible de créer automatiquement des métier dans ISIS en utilisant une table extérieure ?

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Type mismatch: cannot convert from List<Captures_AgeStructure> to List<Export>
by Sigrid Lehuta 29 May '17

29 May '17

Hello j ai cette erreur d compilation du script en pj. Ca fonction qd je mets plusieurs exports ds la liste mais pas s'il n y en a qu'un. Merci de votre aide ! 1. ERROR in C:\Users\slehuta\isis-fish-4\isis-community-database\scripts\RunExportOnManySimulationResult.java (at line 62) protected List<Export> exports = Arrays.asList( //new Discards_AgeStructure(), new Captures_AgeStructure() //new Landings_AgeStructure() //new Landings_month(), //new Captures_AgeStructure_month() //new RegionDefinition() ); ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ Type mismatch: cannot convert from List<Captures_AgeStructure> to List<Export>

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Utiliser librairie extérieure à ISIS
by Audric Vigier 29 May '17

29 May '17

Bonjour, Je cherche à utiliser une librairie d'optim dans ISIS-Fish (http://openrules.com/jsr331/downloads.htm).Le problème c'est qu'ils ne sont pas clairs sur la manière de l'installer, sauf pour Eclipse, que je ne peux pas utiliser puisque je veux appeler cette librairie depuis une règle de gestion ISIS. J'ai voulu installer org.jcp.jsr331.tck <http://openrules.com/jsr331/org.jcp.jsr331.tck.zip>.zip en le dézippant quelque part et en rajoutant son répertoire dans la variable d'environnement PATH; j'ai aussi copié-collé le contenu de lib contenant tous les .jar dans C:\Program Files (x86)\Java\jre1.8.0_111\lib. Mais quand j'essaye d'appeler la librairie (import javax.constraints.* par exemple, d'après leur documentation .pdf ((http://openrules.com/downloads/jsr331/JSR331.UserManual.v081.pdf))) ISIS me renvoie "The import javax.constraints cannot be resolved", comme si je n'avais rien installé. Que faire pour utiliser cette librairie? Si je ne peux pas l'utiliser avec ISIS, est-ce que vous connaissez d'autres libraires pour résoudre des équations non linéaires en qq lignes de commande? Bon après-midi, Audric -- Audric Vigier Doctorant à Ifremer, unités EMH (Nantes) et STH/LBH (Brest) E-mail : audric.vigier(a)ifremer.fr Tel : +33 (0)2 40 37 41 64 (8164)

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Erreur interface ISIS 4.4.1.0-rc-1
by Audric Vigier 29 May '17

29 May '17

Rebonjour, Je viens de lancer une simu dans ISIS. Je suis ensuite retourné dans l'interface de la base de données, puis j'ai voulu aller dans celle listant les simulations en cours. Après clic, ISIS m'a renvoyé une erreur "durationMillis must not be negative" dans plusieurs pop-ups., l'interface ISIS étant devenue grise. Une fois les pop-ups fermées, ISIS me renvoie 2 pop-ups dès que je passe la souris là où devraient se trouver les 6 onglets (base de données, simu, visualiser des résultats, ...). J'avais déjà eu l'erreur ce week-end, mais c'est la première fois que j'arrive à la reproduire. J'ai laissé le debug en PJ. A+ Audric -- Audric Vigier Doctorant à Ifremer, unités EMH (Nantes) et STH/LBH (Brest) E-mail : audric.vigier(a)ifremer.fr Tel : +33 (0)2 40 37 41 64 (8164)

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Methode d'import de matrices avec semantics
by Sigrid Lehuta 23 May '17

23 May '17

Hello, Quelques infos sur le nouveau format d'import de matrices dans isis qui permet d associer les semantics lors de l'import. c est valable dans les scripts mais aussi pour charger les observations dans la base de donnees. le format est celui de la matrice en csv en pj. Voici un exemple de code R qui cree une matrice csv au bon format (année, mois, engin, ages) avec les semantices et un script java qui fait l'import lignes 112-113. Easy !! Le 14 février 2017 à 11:57, Eric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> a >> écrit : >> >>> Le 14/02/2017 à 11:18, Sigrid Lehuta a écrit : >>> > Voilà le type de format que la méthode devrait prendre en entrée. >>> Je viens de tester avec la dernière version du code et cela fonctionne >>> avec ton >>> fichier. >>> >>> Par exemple, dans le init() d'une regle, j'ai mis: >>> File matrixFile = new File(param_nomfichier_matrix); >>> MatrixND matrix = MatrixFactory.getInstance().cr >>> eate(matrixFile); >>> >>> Et la "matrix" et bien les sémantiques du bon type. >>> >>> Tu peux tester avec cette version d'Isis: >>> https://forge.codelutin.com/attachments/download/4517/isis-f >>> ish-4.4.1.0-r4389-bin.zip >>> >>> > On avait aussi parlé d'avoir des objets "Step" comme semantics voir des >>> > Integer (pour les années). >>> Pour les sémantiques, tu peux mettre: >>> des objets du modèle : Metier, Stragegy, Population... >>> des types de données Isis : TimeStep >>> des classes java : java.lang.Integer >>> >>> Par exemple: >>> >>> [2,2,2] >>> java.lang.Integer:1,2 >>> TimeStep:1,2 >>> Metier:MonMetier1,MonMetier2 >>> 0;0;0;1 >>> 0;1;0;2 >>> 1;1;0;3 >>> >>> >>> -- >>> Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28 >>> >>> _______________________________________________ >>> Isis-fish-devel mailing list >>> Isis-fish-devel(a)list.isis-fish.org >>> http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-devel >>> >> >> >

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ISIS 4.4.1.0-SNAPSHOT ne charge pas une région
by Audric Vigier 15 May '17

15 May '17

Bonjour, En chargeant une région en particulier, ISIS-Fish me renvoie l'erreur "Can't load region", chose qu'il ne fait pas avec les autres régions. Cette région s'était chargée correctement la dernière fois pourtant. J'ai laissé région + debug en PJ. Bonne journée, Audric -- Audric Vigier Doctorant à Ifremer, unités EMH (Nantes) et STH/LBH (Brest) E-mail : audric.vigier(a)ifremer.fr Tel : +33 (0)2 40 37 41 64 (8164)

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Exports après la fin de la simulation
by Sigrid Lehuta 09 May '17

09 May '17

Re Hello, j'utilise le script "runExportsOnManySimulationResults" pour exporter des resultats de 12 simus que j'avais oublier d inclure au moment des simus en particulier les captures aux ages avec l'export Captures_AgeStructure.java. Cela fonctionne il creer les results exports mais seul celui de la première simulation est complet (9 populations, 16 années etc), les autres ont 1 pop et 1 année. J ai verifier dans l interface les resultats sont complets. c est un peu difficile d envoyer une simu elles sont tres lourdes ... (scripts et ex d export incomplet en pj) Voyez vous d ou vient le pb ? Merci

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish 31 Mar '17

31 Mar '17

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/v4/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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[ANN] - ISIS-Fish 4.4.1.0-rc-1 released
by Eric Chatellier 17 Mar '17

17 Mar '17

The ISIS-Fish team is pleased to announce the isis-fish-4.4.1.0-rc-1 release! Simulateur de pecherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://doc.codelutin.com/isis-fish Changes ------- Changes in this version include: New features: o Pouvoir copier/coller une partie de base dans une autre base Issue: 429. Thanks to Jean Couteau. Resolved by bpoussin. o Lorsqu'on utilise ses propres fichiers cartes, ne pas utiliser de couleur de fond Issue: 8833. Thanks to Benjamin Poussin. Resolved by bpoussin. o Export / Import des éléments d'une région, soit pour import dans une autre région, soit pour fusion de deux régions. Issue: 8737. Thanks to Benjamin Poussin. Resolved by bpoussin. o Améliorer l'affichage du temps de progression des simulations Issue: 8484. Thanks to Benjamin Poussin. Resolved by bpoussin. o Log de toutes les modifications de la base Issue: 8451. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Amélioration du fond de carte Issue: 419. Thanks to Jean Couteau. Resolved by bpoussin. o Supprimer l'option -Xmx des scripts de lancement Issue: 8834. Thanks to Benjamin Poussin. Resolved by echatellier. o Pouvoir utilisé des objets natifs java pour les semantiques dans IsisMatrixSemanticMapper Issue: 8972. Thanks to Benjamin Poussin. Resolved by bpoussin. o Pouvoir charger des matrice d'observation avec sémantique Issue: 8971. Thanks to Benjamin Poussin. Resolved by bpoussin. o Modification de la finesse de la résolution spatiale Issue: 8734. Thanks to Benjamin Poussin. Resolved by echatellier. Fixed Bugs: o getRecruitment Issue: 8968. Thanks to Sigrid Lehuta. Resolved by bpoussin. o Impossible d'utiliser R via le package rJava en x64 Issue: 8787. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Les resultats nécéssaires aux exports sont mal pris en compte par le cache Issue: 8802. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Lors du changement des shp file, la carte ne se met pas a jour Issue: 8827. Thanks to Benjamin Poussin. Resolved by echatellier. o Les shapes chargés dans l'onglet de définition de la pêcherie, n'apparaissents pas dans l'onglet zones Issue: 9085. Thanks to Sigrid Lehuta. Resolved by echatellier. Changes: o Update to h2 1.4.194 Issue: 7988. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: https://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * isis-fish-4.4.1.0-rc-1-bin.zip -https://forge.codelutin.com/attachments/download/4558 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -ISIS-Fish team -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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Fwd: exports incomplets
by Sigrid Lehuta 16 Mar '17

16 Mar '17

Hello mon mail de ce matin n'est pas passé car la simu en pj est trop grosse .... je vous le renvoie sans la simu, j espere que ca vous suffira a identifier le probleme sinon, dites le moi je ferai un file sender ou autre. Merci d'avance ! ---------- Message transféré ---------- De : Sigrid Lehuta <sigridlehuta(a)gmail.com> Date : 13 mars 2017 à 11:57 Objet : exports incomplets À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Bonjour, j'ai crée de nouveaux exports, si certains fonctionnent bien d'autres sont incomplets (il manque des espèces ou des années). je les ai demandés durant la simulation, puis ré ecportés apres simulation (grace à un code d'éric) et le résultat est différent mais tjs incomplet. Je ne comprends pas du tout ce qui se passe. en pj les exports, le code d export apres coup pour les petites tetes, et une simu avec seulement 1 resultat sinon c est trop lourd. Merci

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