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java.lang.OutOfMemoryError: PermGen space ?
by Loic GASCHE 09 Jan '13

09 Jan '13

Salut les lutins, Je crois que j'ai un nouveau message d'erreur à rajouter à ma collec' : ERROR|12:05:08,758|InProcessSimulatorLauncher.java|431|localSimulateSameThread|Error during simulation java.lang.OutOfMemoryError: PermGen space at java.lang.String.intern(Native Method) at fr.ifremer.isisfish.util.Cache.get(Cache.java:121) at fr.ifremer.isisfish.aspect.CacheAspect.call(CacheAspect.java:81) at scripts.SiMatrix_1_1424742491_1788840605___AW_JoinPoint.proceed(Unknown Source) at scripts.SiMatrix_1_1424742491_1788840605___AW_JoinPoint.invoke(Unknown Source) at scripts.SiMatrix.survivalRatePerZone(SiMatrix.java) at scripts.SiMatrix.aw$original$_AW_$matrixAbundance$_AW_$scripts_SiMatrix(SiMatrix.java:1331) at scripts.SiMatrix_1_309349757__450468485___AW_JoinPoint.proceed(Unknown Source) at fr.ifremer.isisfish.util.Cache.realCall(Cache.java:204) at fr.ifremer.isisfish.util.Cache.get(Cache.java:129) at fr.ifremer.isisfish.aspect.CacheAspect.call(CacheAspect.java:81) at scripts.SiMatrix_1_309349757__450468485___AW_JoinPoint.proceed(Unknown Source) at scripts.SiMatrix_1_309349757__450468485___AW_JoinPoint.invoke(Unknown Source) at scripts.SiMatrix.matrixAbundance(SiMatrix.java) at simulators.DefaultSimulator.computeMonth(DefaultSimulator.java:459) at simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:216) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:391) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:265) INFO|12:05:08,773|InProcessSimulatorLauncher.java|464|localSimulateSameThread|Simulation time: 126.047 Qu'est-ce que ça veut dire ? Ca marchait très bien, puis j'ai rajouté mon modèle de gravité... Je ne sais pas s'il y a un lien... Loïc

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Conditionner le nom d'un setValue(...) à un choix de population ?
by Loic GASCHE 09 Jan '13

09 Jan '13

Bonjour, Une question : est-il possible de faire en sorte que le nom donné à une variable dans un setValue() soit dynamique en fonction des paramètres choisis et pas fixe ? Par exemple dans mon cas serait-il possible d'avoir quelque chose du genre : context.setValue("TAC_"param_population"_HCR", TacReel) au lieu d'avoir juste context.setValue("TAC_HCR", TacReel) ? Loïc

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Echange de valeurs entre scripts (encore) ?
by Loic GASCHE 07 Jan '13

07 Jan '13

Bonjour les lutins (et les autres) et bonne année ! J'ai toujours un soucis pour faire utiliser une valeur venant d'une règle dans une autre règle. Ici ce que je veux faire est : - Avoir un TAC choisi à l'avance pour 2008,2009 et 2010 (grâce à la règle TACpoidsPop20082011) - Pour les années suivantes avoir une règle permettant de calculer le TAC en fonction des objectifs de gestion fixés (HCR_transition_MSY), cette valeur calculée étant appliquée par TACpoidsPop_pourHCR. Le soucis est que pour mon HCR j'ai besoin de récupérer la valeur du TAC que l'on avait choisie pour 2010, et qu'à priori ça ne marche pas (TAC=0 dans les logs). J'ai essayé pas mal de choses (changer le setValue et le getValue de place,...) mais je ne vois toujours pas d'où vient le problème. Une idée ? PS : s'il y a d'autres éléments faux n'hésitez pas :) !

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pas d'export des resultats...
by Stephanie.Mahevas＠ifremer.fr 07 Jan '13

07 Jan '13

bonsoir malgre le changement dans le .bat (900M), je n'ai pas d'exports... Voici mon debug Merci Stephanie

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CR rencontres annuelles ISIS-Fish 2012
by Stephanie MAHEVAS 07 Jan '13

07 Jan '13

Chers ISIS-Fishiens, je vous souhaite à tous une excellente année 2013! En prévision d'une année riche de beaux projets et développements autour d'ISIS-Fish, je vous annonce que les prochaines Rencontres Annuelles ISIS-Fish auront lieu à Nantes les 5 et 6 Décembre 2013. Merci de bloquer ces dates dès à présent! Je vous joins le Compte-rendu de nos discussions et le relevé de conclusions des dernières rencontres. Bonne lecture et à bientôt Stéphanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish 31 Dec '12

31 Dec '12

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/v4/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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Mise à jour de la version de Java utilisée par ISIS-Fish (7)
by Eric Chatellier 21 Dec '12

21 Dec '12

Bonjour, Le support du JDK 6 s'arrêtera en février 2013, les mises à jour ne seront plus assurées [1]. Nous encourageons donc les utilisateurs d'ISIS-Fish à anticiper l'arrêt de ce support et à passer à la version 7 [2]. Une prochaine mise à jour d'ISIS-Fish (probablement 4.3.x.x) imposera au minimum une version 7 pour continuer à fonctionner. Cordialement, Eric Chatellier. [1] : https://blogs.oracle.com/henrik/entry/java_6_eol_h_h [2] : http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Documentation sur les règles
by Eric Chatellier 20 Dec '12

20 Dec '12

Bonjour, J'ai ajouté un début de doc sur les règles à cette adresse: http://www.isis-fish.org/v4/user/scripts/rules.html -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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pb synchro
by Stephanie MAHEVAS 20 Dec '12

20 Dec '12

j'ai des fichiers qui ne se synchronisent pas... merci steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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utilisation de context.getValue dans ISIS
by Loic GASCHE 18 Dec '12

18 Dec '12

Bonjour, Après maintes tentatives d'utilisation de context.getValue dans une règle afin de récupérer des valeurs/TimeStep/Population définis dans une autre règle je viens lacer un appel au secours : Comment est-on sensés uriliser cette commande ? En ce qui concerne setValue on a dans l'API : setValue(String name, Object value) Permet de stocker une valeur en fonction d'une cle. Donc est-ce que ça ne permet de stocker qu'une valeur ou peut-on aussi stocker le nom d'une population ou un timestep ? Pour getValue on a : getValue(String name) Permet de recuperer une valeur prealablement stocker avec un setValue. Apparemment ça rend un "Object" ce qui tendrait à me faire dire qu'on peut stocker et retrouver n'importe quoi avec setValue et getValue et pas juste des valeurs, est-ce juste ? Autre question : Comment ISIS sait-il que le "Object" sorti par getValue est une "Population" ou un "TimeStep" ? Dans SiMatrix getVAlue est utilisé de la manière suivante : SiMatrix result = (SiMatrix) context.getValue(SiMatrix.class.getName()); ce qui ne semble pas tout à fait correspondre à ce qui est décrit dans la doc des API donc je suis un peu paumé... Il faut déjà que ISIS sache à quoi correspond "context", et apparemment le import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext; au début ne suffit pas ? Il faut faire comme dans SiMatrix et rajouter protected SimulationContext context = null; ?? A quoi servent le (SiMatrix) avant context.get... et le SiMatrix au début de al ligne ? Help ? Loïc

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