September 2009 - Isis-fish-devel - mailman.cloud.codelutin.com

Vérification des bugs (isis 3.2)
by Eric Chatellier 21 Oct '09

21 Oct '09

Bonjour, Voici le rapport des bugs qui ont été vérifiés. Cette liste contient seulement les bug "fermés", avec pour chaque bug un commentaire. J'ai réouvert un seul bug qui a été fixé pour la fonctionnalité demandée mais qui peut être mieux corrigé (rappel) Bonne journée -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com Bugs vérifiés ------------- [#1706] V3.1.3 Importation nouvelle base en zip impossible Bug non reproduit [#1773] Rendre configurable le chemin/nom qsub Ok dans une interface graphique [#1774] La mise a jour des datas ne fonctionnent pas. Pas ok, mais du a un isis-database-3 corrompu. [#1777] Le rendu des resultats sur les cartes ne fonctionne pas. Ok [#1780] Exception a la fin d'une simution dans un sous process, mais tout semble fonctionner... Ce bug n'a pas été corrigé, mais il n'a pas pu être reproduit. [#1781] Probleme rechargement d'une sim + lancement de la simu. Rechargement et lancement d'une simulation sans erreurs [#1782] Probleme lors du lancement d'une simulation avec un plan d'analyse Max de 3 simu. Lancement d'un plan de simulation, pas d'erreur [#1791] Probleme pour utilise un repo de data recupere via svn Ce n'était pas un bug, mais un probleme de configuration d'isis [#1792] numero de la version quand on dézip Le zip contient bien un dossier principal avec la version [#1793] probleme de taille de fenetre La liste des script modifié s'affiche dans une liste déroulante [#1794] fichier de lancement go.bat mauvais Le script windows est maintenant correct. [#1798] suppression population impossible Creation suppression de population fonctionnent [#1799] Entrer deux facteurs identiques sur deux groupes différents de la même population Fixé dans le cas des groupes de population. Mais le cas se reproduit dans d'autres écrans (non bloquant, bug réouvert) [#1817] manque de zones de saisie dans l'interface Population/Saison_ Bloquant EC Fixé (validé par la recopie des bases anchois/langoustine) [#1818] Taille minimum nécessaire pour les fenêtres de saisie Fixé [#1819] Boite à cocher "changement de groupe" non cochée Fixé [#1820] Problème dans l'interface SetOfVessel/InputEffortDescription Fixé (les boutons sauver/annuler ont été réparés) [#1821] Les boutons &amp;amp;quot;annuler&amp;amp;quot; ne fonctionnent pas Fixé (les boutons sauver/annuler ont été réparés) [#1822] Mauvaises traductions Fixé [#1823] Noeuds de l'arbre de saisie non traduits Fixé [#1824] Bug rechargement de simulation:recherche du fichier xml mexico design Fixé [#1827] Bug simulation sur caparmor Non fixé. Probleme de caparmor, mais ne semble plus se reproduire sur caparmor 2 [#1828] Problème d'envoi des simulations sur caparmor Fixé. [#1829] Bug rechargement analyse sensibilité Fixé. [#1831] Non réactualisation du nombre d'année au chargement d'une simulation Fixé. [#1834] Ecran des facteurs équation trop grand sur les petites résolutions Fixé. [#1838] Equation continue plante Fixé. [#1839] Bouton sauver les paramètres de la simulation non fonctionnel Fixé. [#1841] Fuite mémoire lors de l'éxecution de simulations Fuite mémoire non resolu. Temporairement contourné (desactivation de in process) [#1843] Probleme pour creer des facteurs continus a partir d'equation Fixé. [#1844] Rechargement des prescripts dans l'interface de simulation ne fonctionne pas Fixé. [#1845] La base de données maintenant genere un fichier dans le repertoire de base pour chaque String Non fixé. Impossible a desactiver. [#1846] Lorsque l'on passe au dessus d'un sigma, il s'inverse, il ne faut pas Fixé. [#1847] Generation du prescript donne des semantiques null pour les dimensions des matrices Fixé (sémantiques plus nulles) [#1848] trop d'export au chargement d'une AS Fixé. [#1849] Mise en facteur equation Fixé. [#1850] Boucles de vérifications de simulations en trop ? Non fixé. Mais optimisé pour qu'elle soit faites moins souvent. [#1851] Rechargement de base ayant le meme nom en AS Fixé. [#1854] Impossible (à nouveau) de supprimer une population dans l interface de saisie Fixé. [#1855] Impossible de copier le contenu et d'agrandir une fenêtre d'erreur Fixé. [#1856] Rappel : les equations n'apparaissent pas dans la fenêtre de saisie des migrations Fixé. [#1857] Probleme de rafraichissement apres l'import (Exception) Fixé. [#1858] L'arbre ne se met pas a jour lorsqu'on creer une entité Fixé. [#1860] Fenetre de confiramtion de suppression trop grande Fixé. [#1861] Erreur lorsqu'on annule une modification sur input>espece>popalation>migration Fixé. [#1862] Traduction : interface de saisie des saisons Non spacialized / Spacialized Fixé. [#1863] Fenêtre de saisie de la distribution de la reproduction / saison = tableau 1 ligne x nb de mois de la saison Fixé. [#1864] Pas de rafraichissement de la matrice de changement de groupe apres avoir cocher/décocher le bouton spatialisé Fixé. [#1865] Le bouton Sauver ne se dégrise pas dans l interface de saisie de la reproduction apres une modif Fixé (les boutons sauver/annuler ont été réparés) [#1866] message d'erreur quand on ouvre une saison Fixé (pas reproduit) [#1867] les informations relatives à un groupe de population ne s'affichent pas les cases Fixé. [#1868] Saisie des strategies/Saisie des mois : le nom des mois n'est pas affiché Fixé. [#1869] La methode init() des Plan d'analyse n'est plus appelée Fixé. [#1870] Onglet Strategie/Saisie des mois : Disparition du nombre de jours d inactivité Fixé. [#1871] Onglet Strategie/Caractéristiques : Proportion du nombre de navires à zéro Fixé. [#1872] Impossible de supprimer un script... Fixé. [#1873] Erreur quand on tente de sauver : interface de saisie des populations/ capturabilité Non reproduit. [#1874] Ne peux pas ajouter de saison Fixé (validé par la recopie des bases) [#1875] Impossible d'aller sur une stratégie Fixé. [#1876] Impossibilité de créer une saison Fixé (validé par la recopie des bases) [#1877] Manque de cohérence dans les UI de mise en facteur Fixé. [#1878] La règle cantonnement ne fonctionne pas:fr.ifremer.isisfish.entities.ZoneImpl.cell, no session or session was closed Fixé. [#1881] Cliquer sur annuler decoche la boite-à-cocher Fixé. [#1882] si on ajoute deux regles de gestion identiques elles ne sont pas independantes Fixé. [#1883] impossible d ouvrir une seconde fenetre de lancement de simulation Fixé. [#1884] inpossible de modifier les parametres d une ancienne simulation rechargée Fixé. [#1885] error pendant une simu : fr.ifremer.isisfish.entities.PopulationImpl.populationGroup, no session or session was closed Fixé. [#1889] ordre des onglets - interface de saisie de pop Fixé. [#1890] Redimmensionnment de l'arbre de saisie de la base Fixé. [#1894] les parametres des simulations ne sont plus sauvegardés Fixé. [#1895] Les parametres des plan d'analyses ne sont pas restaurés au rechergement d'une simulation Fixé. [#1899] Les exports ne ferment pas les connexions à la base de données Fixé. [#1900] les regions ne se rechargent pas bien dans les ecrans de saisie Fixé. [#1904] Un accent en trop dans le résumé de simulation Fixé. _______________________________________________ Isis-fish-devel mailing list Isis-fish-devel(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-devel

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Isis-Fish 3.2.0.7 est disponible.
by Eric Chatellier 28 Sep '09

28 Sep '09

Bonjour, Une nouvelle version d'Isis-Fish est disponible au téléchargement à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… Pour les utilisateurs utilisant déjà la banches 3.2, il n'est pas nécessaire d'effectuer la migration des scripts. Cependant, pour les utilisateurs utilisant toujours la version 3.1, merci de vous référer au précédent mail décrivant la migration. Cette version corrige principalement : * quelques problèmes avec les interfaces de saisie et de simulation * les plans d'analyse * l'utilisation de Caparmor Le changelog complet est disponible à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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Plan de Sigrid et caparmor
by Jean Couteau 28 Sep '09

28 Sep '09

On a bossé sur le plan de Sigrid et on a identifié un bug que nous avons corrigé (version 3.2.0.7-SNAPSHOT) (mise sur CAPARMOR et sur le poste de Stéphanie). Ce bug faisait que le plan ne créait pas toutes les simulations, il plantait pseudo-aléatoirement. A-priori ce bug est corrigé (on a relancé le plan 3 fois et les 228 simus ont été crées a chaque fois). Concernant les problèmes que nous avions eu sur les équations, 6 simulations ont déjà tournées sur Caparmor et bilan des courses : l'anchois meurt dans d'atroces souffrances en 3 ans et nous on a aucune trace d'équations qui ne fonctionneraient pas ou qui auraient des problèmes d'encoding (simulations effectuées en local sur une année ou sur caparmor sur 10 années) (que ce soit sur windows ou linux, et pour caparmor à partir de windows ou linux). Le plan étant en train de tourner sur Caparmor, on le laisse tourner pour que Sigrid ai les résultats en revenant (à partir du poste de Stéphanie). PS : 2 simus ont planté sur caparmor (7 et 18) elles ont été relancées, il faudra peut-être en relancer quelques unes qui auront planté sur caparmor mais dans l'ensemble, il n'y a pas l'air d'y avoir d'erreurs. Donc conclusion tout semble rouler. PS : j'espère qu'on a bien paramétré le plan, il faudra vérifier car les abondances semblent anormalement faibles (mais elles sont créées par le plan et varient autour de deux valeurs qui semblent correspondre aux deux fichiers d'inputs du plan) donc on sait pas trop quoi penser là dessus.

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mon plan de gestion qui faisait des betises sur caparmor
by Sigrid.Lehuta＠ifremer.fr 25 Sep '09

25 Sep '09

hello desolee de ne pas avoir donné de nouvelles avant. est ce que stephanie a pu vous transmettre mon plan et les fichiers necessaires pour voir ce qui a raté ? sinon j essaierai de vous preparer et envoyer le pack. pouvez vous me rappeler l adresse du ftp code lutin ca serait surement plus simple. les erreurs rencontrees sous caparmor etaient : la non application inopinée en plein milieu de simu de la mortalite naturelle. le buggage sans log de certaines simus. en local j ai eu le probleme qu isis ne chargeait pas toutes les simus (exemple sur 228 il ne prepare que 6 et s arrete apres) il y a quelques problemes mineurs deja identifiéds je crois de rafraichissement des fenetres. et je me rappelle que de ca. merci de voir ca A+

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logo PAMPA
by Dominique PELLETIER 22 Sep '09

22 Sep '09

Bonjour à tous, Juste pour vous informer que la personne dont j'avais parlé pour proposer un logo ISIS est OK et m'envoie un devis. Je pense pouvoir financer celà sur mon projet. A Tchao Dominique -- Dominique Pelletier IFREMER BP 70 29280 Plouzané, France Tél. (33) 0298224684 Fax. (33) 0229008547

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Re: [Isis-fish-devel] [Isis-fish-users] equation de prix : comment utiliser un resultat dans l equation ???
by Eric Chatellier 09 Sep '09

09 Sep '09

Sigrid LEHUTA a écrit : >> Tu peux essayer avec : >> String name = >> scripts.ResultName.MATRIX_CATCH_WEIGHT_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP; Actuellement ça ne compile pas car les equations ne sont pas compilées avec les classpath des scripts (isis-database-3). Ça devrait ? -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-devel mailing list Isis-fish-devel(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-devel

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Nouvelle version d'IsisFish 3.2 disponible au telechargement
by Eric Chatellier 07 Sep '09

07 Sep '09

Bonjour, La nouvelle version d'IsisFish est a present disponible au telechargement. Il s'agit de la version 3.2. Cette version initie la branche 3.2 d'IsisFish, tous les utilisateurs sont invites a utiliser cette nouvelle version. Les versions 3.1 ne beneficieront plus d'aucun support. Avant de commencer ------------------ Cette version apporte de nouvelles fonctionnalites et de profonds changements. Avant toutes chose, il est conseille d'effectuer une sauvegarde de vos donnees a partir de la version 3.1.3 d'IsisFish. Action a effectuer: - exportez votre base de donnees de travail pour la V3.1.3 Dans l'interface de saisie de la pecherie, ouvrez votre region, et cliquez dans Fichier > Exporter la region et choisissez un repertoire pour enregistrer votre region - fermez maintenant IsisFish-3.1.3 - renommez le dossier "isis-database-3" en "isis-database-3.1.3" (ce dossier est normalement situe dans votre repertoire utilisateur, sous windows C:\Documents and settings\<user>\) Tele©chargement de la nouvelle version ------------------------------------- Rendez vous ensuite sur le site http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/. Dans le menu, dirigez vous ensuite sur "Telechargement". Et telechargez la derniere version (par exemple isis-fish-3.2.x.y-bin.zip). Decompressez l'archive que vous venez de telecharger. Apres avoir telecharge IsisFish -------------------------------- Lancez la nouvelle version en cliquant sur le fichier "go.bat" present dans le repertoire d'IsisFish apres decompression. IsisFish telecharge un nouveau "isis-database-3" et vous propose une migration de la base de donnees. Il vous proposera egalement cette migration pour toutes vos bases de donnees. Il est obligatoire d'accepter cette migration, sans quoi ces bases ne fonctionneront pas. Vous n'avez aucun problemes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Dans le cas ou vous n'auriez aucun probleme apparent (IsisFish se lance) verifiez quand meme que le fichier debug.txt ne contient aucune erreur. S'il en contient, n'hesitez pas a demander de l'aide sur isis-fish-users(a)list.isis-fish.org en envoyant votre fichier debug.txt. Dirigez-vous dans l'interfaces des scripts et verifiez que vos scripts ne contiennent pas d'erreurs et compilent (en cliquant sur verifier). Vous avez des problemes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Si vous avez des problemes (isis ne se lance pas, ou rien ne fonctionne). Envoyez un message a la liste isis-fish-users(a)list.isis-fish.org en precisant le comportement d'IsisFish ou les erreurs rencontrees et accompagnez votre message du fichier debug.txt. Apres le premier lancement -------------------------- Si le premier lancement d'IsisFish s'est bien passe, vous pouvez : - reimporter vos bases de donnees (en acceptant la migration demandee normalement) - faire tourner une simulation Si la simulation n'a pas fonctionne, vous pouvez demander de l'aide sur isis-fish-users(a)list.isis-fish.org en joignant votre fichier debug.txt Vous pouvez ensuite, recopier vos anciens scripts (plans d'analyses, regles, export) depuis le dossier "isis-database-3.1.3" que vous avez sauvegarde vers le dossier "isis-database-3". N'oubliez pas ensuite de valider tous vos scripts dans l'interfaces dans l'interface de gestion des scripts et de verifier qu'ils compilent bien. Informations complementaires ---------------------------- Les informations complementaires concernant IsisFish sont presentes sur le wiki. En particulier : - le manuel : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… - les changements : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-devel mailing list Isis-fish-devel(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-devel

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Test des règles entre isis 3.1 et 3.2
by Eric Chatellier 01 Sep '09

01 Sep '09

Bonjour, J'ai terminé les tests sur les regles qui était à la fois dans isis 3.1 et isis 3.2. Les regles fonctionnent, et les resultats sont similaires ormit : - ChangementParamControlablePreSimu (je regarde rapidement pourquoi elle ne fonctionne pas dans isis 3.1) - GraviteCPUE Elle tourne, mais je ne sais pas quelle sont les influences de la règles sur les résultats - TailleMin Quelque soient les paramètres, les résultat ne varient pas. Pouvez-vous m'apporter quelques précisions sur ces trois règles ? Merci. -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com Tests des regles 3.1 - 3.2 ========================== Données ------- Données utilisé pour tous les tests. Base langoustine : - nombre de jours d'inactivité augmentés (changement int>double) - 10 ans - toutes les stratégies - population de départ à 10000 Base anchois - 10 ans - toutes les strategies - population de départ à 10000 Test 1 : aucune règles ---------------------- Cette simulation sert de témoin pour déterminer si une règles modifient bien les résultats et que les modifications sont les mêmes entre isis 3.1 et 3.2. Test 2 : Cantonnement --------------------- Ok, résultat identiques. Test 3 : CantonnementPreSimu ---------------------------- Ok, résultat identiques. Test 4 : ChangementParamControlablePreSimu ------------------------------------------ Quelques difficultés a tester cette regles. Fonctionne dans isis 3.2, mais pas dans isis 3.1. (java.lang.IndexOutOfBoundsException: Index: 12, Size: 12) Dans isis 3.2, elle fonctionne correctement. Test 5 : GraviteCPUE -------------------- La regle tourne sur les deux versions. Par contre, elle ne semble pas avoir d'influence sur les résultats. Comment puis-je confirmer son fonctionnement ? Test 6 : InterdictionEngin -------------------------- Ok, résultat identiques. Test 7 : InterdictionEnginPreSimu --------------------------------- Ok, résultat identiques. Test 8 : TacPoids ----------------- Avec 900 tonnes, les résultats sont inchangés. Second test avec 50 tonnes également. Avec 1 tonnes, les résultats sont bien different des simuations sans règles et egaux entre les deux versions d'isis. Test 9 : TailleMin ------------------ Je n'ai pas trouver les bons parametres a renseigner pour que les resultats soient modifiés. _______________________________________________ Isis-fish-devel mailing list Isis-fish-devel(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-devel

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