December 2020 - Isis-fish-devel - mailman.cloud.codelutin.com

Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish Dec. 31, 2020

Dec. 31, 2020

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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Formation JAVA
by slehuta Dec. 16, 2020

Dec. 16, 2020

Bonjour les lutins, Nous avons 2 étudiants qui démarrent des thèses sur ISIS (Antoine et Stéphanie) et éventuellement une troisième qui travaille dessus depuis quelques temps (Charlotte) à qui la super formation Java que nous avons pu suivre cette année serait bénéfique. Vous semble t'il possible de la redonner debut 2021 ? (Stephanie quitte Nantes mi avril) Vu les effectifs ça devrait pouvoir se faire en présentiel mais c'est vous qui voyez. Il y a peut etre des options pour le faire en visio. D'autre part, Stéphanie ne parle pas très bien français, est ce qu'on version anglaise vous parait jouable ? Merci !

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Modification du fonctionnement des simulation sur datarmor
by Eric Chatellier Dec. 1, 2020

Dec. 1, 2020

Bonjour, Suite à une utilisation non conforme de datarmor par ISIS-Fish, j'ai effectué des modifications pour utiliser le transfert de fichier en FTP au lieu de SSH. La connexion SSH est toujours utilisé pour passer les commandes (qsub...). Serveur FTP ----------- Le service FTP tourne sur eftp.ifremer.fr et on ne peut écrire que dans /scratch (qui correspond à /home1/scratch/user/eftp/). J'ai donc été contraint de tout modifier pour: - uploader les fichiers dans /home1/scratch/user/eftp/ - lancer les simulations à partir des fichiers présent dans /home1/scratch/user/eftp/ - suite à la simulation, écrire les résultats également dans /home1/scratch/user/eftp/ Scratch ------- En me renseignant sur les différents partages "datahome", "datawork" et "scratch", je me suit aperçu que "scratch" était le plus adapté également pour faire tourner les simulations (emplacement du "isis-fish-4"): - accès plus rapide que sur les autres disques (haute performance) - espace de stockage de 10To - pas de sauvegarde - suppression automatique tous les 15 jours Le "HOME" d'ISIS-fish est donc maintenant /home1/scratch/user/isis-fish-4 Il faut noter qu'il est à l'extérieur de /home1/scratch/user/eftp/, donc son contenu n'est pas visible depuis le FTP. Il n'est donc plus possible de connaître la progression d'une simulation, mais je pense que ce n'était très peu utilisé finalement, car au vu du nombre de simulation, lorsque que l'état de la simulation est vérifié, elle est soit non démarrée, soit finie, mais très rarement "en cours". Authentification ---------------- Le login/mot de passe pour le FTP n'est pas le même que celui de datarmor. Il faut utiliser un compte "extranet", à configurer dans ISIS-fish pour s'y connecter. Je continue les tests sur datarmor... -- Éric Chatellier -www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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[ANN] - ISIS-Fish 4.4.5.1 released
by Eric Chatellier Dec. 1, 2020

Dec. 1, 2020

The ISIS-Fish team is pleased to announce the isis-fish-4.4.5.1 release! Simulateur de pêcherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://isis-fish.org Changes ------- #11097: Les simulations issues des plan indépendant ne fonctionne pas sur datarmor #10994: Pouvoir définir une Collection d'entité en paramètre de script Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: https://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * https://forge.codelutin.com/attachments/download/6506/isis-fish-4.4.5.1-bin… Have fun! -ISIS-Fish team -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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