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structure du fichier pour utiliser importCSV
by Stephanie MAHEVAS 24 May '11

24 May '11

Bonjour je voudrais initialiser une matrice ND à partir d'un fichier csv avec la methode importCVS. Il s'agit d'une matrice à 3 dimensions. Comment doit etre structuré le fichier? Quelle est la regle generale quelque soit la dimension? J'aurais peut-etre pu repondre moi-meme à la question en regardant le source de cette methode mais je ne sais pas comment y acceder... :-\ il n'y a pas src à côté de javaDoc Nuiton-Matrix. merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Nouveau repo pour les scripts
by Benjamin POUSSIN 23 May '11

23 May '11

Salut, Eric, j'ai normalement tout fait pour que ca marche, il faut maintenant verifier et corriger :). - script python qui genere le fichier de mot de passe - cron qui le lance une fois par jour - conf apache qui l'utilise Le repo http://www.isis-fish.org/svn/isis-fish-public/ est accessible en lecture sans mot de passe, il faudra vérifier que pour l'écriture ce n'est pas le cas :D -- Benjamin POUSSIN -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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forcer Fishing Mortality
by Stephanie.Mahevas＠ifremer.fr 19 May '11

19 May '11

Bonjour je voudrais court-circuiter le calcul de F dans ISIS. Bon evidemment ca doit vous paraitre bizarre puisqu'ISIS est initialement fait pour ca... mais bon les pressions sont fortes pour que l'on puisse tester des procedures avec de F fixes. J'avoue ne pas trop savoir comment prendre le truc par le bon bout. Je ne pense pas que l'on ait besoin d'un nouveau simulateur car tout les calculs matriciels a chaque pas de temps ne changent pas. Ce qui change c'est simplement que dans siMatrix la methode matrixFishingMortality() n'a plus besoin d'etre appliquee car MATRIX_FISHING_MORTALITY sera initialisee dans une Regle ForcingMortality avec en entree deux fichiers ascii. Faut-il que je definisse une nouvelle methode matrixFishingMortality avec un parametre booleen qui par defaut est egal a False et qui lorsq'il est mis a TRUE par la ForcingMortality ne fait pas le calcul de matrixFishingMortality ? si oui qu'est-ce que cela implique comme consequences? comment faire pour que ce parametre soit accessible dans une regle? comment puis-je acceder a MATRIX_FISHING_MORTALITY qui est attache a ResultName dans une regle? merci stephanie

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CR réunion Group Screening : 6/05/2011
by Eric Chatellier 13 May '11

13 May '11

CR réunion Group Screening ========================== CR de la réunion pour faire le points après l'ajout du group screening et de la mise en facteur des règles et population de départ dans IsisFish 3.4.0.0. Les groupes doivent être crée en tant que groupe discret ou groupe continue. Un groupe discret accepte des facteurs discrets et continus (continue dicretisés). Un groupe continue n'accepte que des facteurs continue. Ajouter une validation lors du lancement de l'AS pour vérifier que tous les facteurs d'un groupe discret ont la même cardinalité. Supprimer la sélection d'un opérateur pour les facteurs continus. L'opérateur est maintenant toujours * pour l'application du coefficient. Ajouter les valeurs min et max pour les facteurs de type matrice continue et équation continue. Vérifier que la valeur min est inférieure à la valeur max. Pour les règles, le code actuel est bon et permet de faire des scenarios de gestion (chaque facteur est une liste de règles) : facteur discret. Voir pour pouvoir mettre en paramètres également les paramètres d'une liste des règles fixes : facteur discret ou continu. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Passage des facteurs numériques en pourcentage
by Eric Chatellier 28 Apr '11

28 Apr '11

Bonjour, Dans IsisFish 3.4, une des évolutions consiste a transformer les facteurs numériques actuels (continous : min/max et discret) en pourcentage. Si j'ai bien compris cette modification concerne les facteurs continues seulement (remplacement de min/max par valeur/opérateur/poucentage). Cette modification impliquera certainement que les anciennes AS ne pourront plus être rechargées (ou seulement les facteurs en question). Merci de me corrigé si ce n'est pas cela. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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GroupScreening dans IsisFish 3.4
by Eric Chatellier 14 Apr '11

14 Apr '11

Bonjour, La fonctionnalité de GroupScreening a été ajoutée. Elle n'a cependant pas été testée car les script d'AS ne les gèrent pas encore. Les règles et populations de départ peuvent également être mis en facteur. Cordialement. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Isis-Fish 3.3.0.8 est disponible
by Eric Chatellier 05 Apr '11

05 Apr '11

Bonjour, Une nouvelle version d'Isis-Fish est disponible au téléchargement à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… Changements : * Correction d'une erreur lors de la visualisation des saisons d'une population Le changelog complet est disponible à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Migration de base IsisFish 3.3.1.0
by Eric Chatellier 31 Mar '11

31 Mar '11

Bonjour, Je travaille sur IsisFish 3.1, et je vais ajouter une nouvelle migration de base pour supprimer une mauvaise contrainte sur une table. Le problème vient du groupe de maturité qui impose (faussement) d'être unique sur les populations, ce qui fait que si deux population n'ont pas de groupe de maturité, il se produit plein d'erreur. Cette erreur sera donc supprimée. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Re: [Isis-fish-devel] Isis-Fish 3.3.0.7 est disponible
by Bastien Preuss 21 Jan '11

21 Jan '11

Bonjour Eric, Comme tu le sais, je suis en 64bits, mais je fais tourner ISIS en 32bits sur ma machine en ayant installé Java et R en 32bits. Y a-t-il un réel intérêt à passer en 64bits pour ISIS? N'y a -t-il pas le risques de rencontrer de nouveaux bugs? Merci. Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-devel-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-devel-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : vendredi 21 janvier 2011 04:55 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org; isis-fish-devel(a)list.isis-fish.org Objet : [Isis-fish-devel] Isis-Fish 3.3.0.7 est disponible Bonjour, Une nouvelle version d'Isis-Fish est disponible au téléchargement à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.c gi/about/download Changements : * ajout des scripts de lancement pour la version 64bits Note: * les fichier go.bat et go.sh ont été renommés en isisfish.bat et isisfish.sh pour le version normale et isisfish64.bat et isisfish64.sh pour la version 64bits * attention a n'utiliser la version 64bits que si java et R sont également en 64bits Le changelog complet est disponible à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.c gi/v3/news -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-devel mailing list Isis-fish-devel(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-devel

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Isis-Fish 3.3.0.7 est disponible
by Eric Chatellier 20 Jan '11

20 Jan '11

Bonjour, Une nouvelle version d'Isis-Fish est disponible au téléchargement à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… Changements : * ajout des scripts de lancement pour la version 64bits Note: * les fichier go.bat et go.sh ont été renommés en isisfish.bat et isisfish.sh pour le version normale et isisfish64.bat et isisfish64.sh pour la version 64bits * attention a n'utiliser la version 64bits que si java et R sont également en 64bits Le changelog complet est disponible à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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