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cannot find symbol, symbol : variable matrixFishingMortalityPerGroup
by Loic GASCHE 10 Aug '12

10 Aug '12

Bonjour, Je n'arrive pas à compiler mon DefaultSimulator après avoir modifié la boucle pour la création de ma matrice de mortalité par pêche totale. Le message d'erreur est : C:\Users\lgasche\isis-fish-4\isis-community-database\simulators\DefaultSimulator_F.java:508: cannot find symbol symbol : variable matrixFishingMortalityPerGroup location: class simulators.DefaultSimulator_F MatrixND totalFishingMortality = siMatrix.TotalFishingMortality(step, pop, matrixFishingMortalityPerGroup); // context.getSimulationStorage().getResultStorage()); Apparemment il n'arrive pas à trouver la matrice matrixFishingMortalityPerGroup créée juste avant qui sert au calcul de la mortalité totale... mais je ne vois pas pourquoi... Une idée ? Loïc

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[ANN] - IsisFish 4.1.0.3 released
by forge.codelutin.com Release Notification 10 Aug '12

10 Aug '12

The IsisFish team is pleased to announce the isis-fish-4.1.0.3 release! Simulateur de pecherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/isis-fish Changes ------- Changes in this version include: New features: o Make TimeStep type managed by MatrixSemanticMapper Issue: 1390. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Add new variable tab for population Issue: 1389. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Fixed Bugs: o Can't open database in offline mode Issue: 1388. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Script are compiled using default encoding Issue: 1395. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o When using statistics, if an exception occurs, it's masked by another one Issue: 1393. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Changes: o Update to nuiton-matrix 2.3 Issue: 1400. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * isis-fish-4.1.0.3-bin.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/422 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -IsisFish team

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Can't get scenarios from calculator
by Loic GASCHE 10 Aug '12

10 Aug '12

Bonjour les lutins, J'ai essayé de faire tourner une AS sur le PC de Fabian, et on se retrouve avec le message suivant : Can't get scenarios from calculator. On avait déjà eu cette erreur en tentant de faire tourner ISIS sur le serveur linux ici, mais je n'ai pas trouvé d'autres messages y faisant référence. Une idée sur le cause de cette erreur et comment la corriger ? Loïc ------------ Erreur Message: fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Can't get scenarios from calculator Level: SEVERE Stack Trace: Can't get scenarios from calculator fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService.submit(SimulationService.java:528) fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.SimulAction.launchSimulation(SimulAction.java:1127) fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.SimulAction.launchSimulationWithSensibility(SimulAction.java:1140) fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsUI.launchSimulation(ParamsUI.java:370) fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsUI.doActionPerformed__on__buttonSimulParamsSimulate(ParamsUI.java:614) sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method) sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source) sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source) java.lang.reflect.Method.invoke(Unknown Source) jaxx.runtime.JAXXUtil$1.invoke(JAXXUtil.java:257) $Proxy4.actionPerformed(Unknown Source) javax.swing.AbstractButton.fireActionPerformed(Unknown Source) javax.swing.AbstractButton$Handler.actionPerformed(Unknown Source) javax.swing.DefaultButtonModel.fireActionPerformed(Unknown Source) javax.swing.DefaultButtonModel.setPressed(Unknown Source) javax.swing.plaf.basic.BasicButtonListener.mouseReleased(Unknown Source) java.awt.Component.processMouseEvent(Unknown Source) javax.swing.JComponent.processMouseEvent(Unknown Source) java.awt.Component.processEvent(Unknown Source) java.awt.Container.processEvent(Unknown Source) java.awt.Component.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.LightweightDispatcher.retargetMouseEvent(Unknown Source) java.awt.LightweightDispatcher.processMouseEvent(Unknown Source) java.awt.LightweightDispatcher.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Window.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.EventQueue.access$000(Unknown Source) java.awt.EventQueue$1.run(Unknown Source) java.awt.EventQueue$1.run(Unknown Source) java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) java.security.AccessControlContext$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) java.security.AccessControlContext$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) java.awt.EventQueue$2.run(Unknown Source) java.awt.EventQueue$2.run(Unknown Source) java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) java.security.AccessControlContext$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.run(Unknown Source) null fr.ifremer.isisfish.mexico.MexicoHelper.getStringFromObject(MexicoHelper.java:545) fr.ifremer.isisfish.mexico.xml.DiscreteDomainXMLVisitor.visit(DiscreteDomainXMLVisitor.java:57) fr.ifremer.isisfish.simulator.sensitivity.domain.DiscreteDomain.accept(DiscreteDomain.java:106) fr.ifremer.isisfish.mexico.xml.FactorXMLVisitor.visit(FactorXMLVisitor.java:134) fr.ifremer.isisfish.simulator.sensitivity.Factor.accept(Factor.java:263) fr.ifremer.isisfish.mexico.xml.FactorGroupXMLVisitor.visit(FactorGroupXMLVisitor.java:73) fr.ifremer.isisfish.simulator.sensitivity.FactorGroup.accept(FactorGroup.java:278) fr.ifremer.isisfish.mexico.xml.DesignPlanXMLVisitor.visit(DesignPlanXMLVisitor.java:63) fr.ifremer.isisfish.simulator.sensitivity.DesignPlan.accept(DesignPlan.java:101) fr.ifremer.isisfish.mexico.MexicoHelper.getDesignPlanAsXML(MexicoHelper.java:102) fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService.submit(SimulationService.java:448) fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.SimulAction.launchSimulation(SimulAction.java:1127) fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.SimulAction.launchSimulationWithSensibility(SimulAction.java:1140) fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsUI.launchSimulation(ParamsUI.java:370) fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsUI.doActionPerformed__on__buttonSimulParamsSimulate(ParamsUI.java:614) sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method) sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source) sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source) java.lang.reflect.Method.invoke(Unknown Source) jaxx.runtime.JAXXUtil$1.invoke(JAXXUtil.java:257) $Proxy4.actionPerformed(Unknown Source) javax.swing.AbstractButton.fireActionPerformed(Unknown Source) javax.swing.AbstractButton$Handler.actionPerformed(Unknown Source) javax.swing.DefaultButtonModel.fireActionPerformed(Unknown Source) javax.swing.DefaultButtonModel.setPressed(Unknown Source) javax.swing.plaf.basic.BasicButtonListener.mouseReleased(Unknown Source) java.awt.Component.processMouseEvent(Unknown Source) javax.swing.JComponent.processMouseEvent(Unknown Source) java.awt.Component.processEvent(Unknown Source) java.awt.Container.processEvent(Unknown Source) java.awt.Component.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.LightweightDispatcher.retargetMouseEvent(Unknown Source) java.awt.LightweightDispatcher.processMouseEvent(Unknown Source) java.awt.LightweightDispatcher.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Window.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.EventQueue.access$000(Unknown Source) java.awt.EventQueue$1.run(Unknown Source) java.awt.EventQueue$1.run(Unknown Source) java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) java.security.AccessControlContext$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) java.security.AccessControlContext$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) java.awt.EventQueue$2.run(Unknown Source) java.awt.EventQueue$2.run(Unknown Source) java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) java.security.AccessControlContext$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.run(Unknown Source)

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non static method / static context ?
by Loic GASCHE 08 Aug '12

08 Aug '12

J'ai déplacé l'algorithme d'optimisation depuis SiMatrix vers RuleUtil, mais lorsque je vérifie SiMatrix j'ai le message suivant : C:\Users\lgasche\isis-fish-4\isis-database\scripts\SiMatrix.java:1660: non-static method fmin(fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep,double,double,double,double,double,double) cannot be referenced from a static context Fgroup = RuleUtil.fmin(step,0.0,2.0,1.0e-10,Cgroup,Mgroup,NgroupJan); Je n'arrive pas trop à comprendre ce que cela signifie, est-ce que quelqu'un pourrait m'éclairer ? PS : meanOverDim n'apparait toujours pas dans MatrixND quand on y accède depuis le site (directement ou en passant par nuiton matrix)... bizarre.

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Disparition de meanOverDim de MatrixND ?
by Loic GASCHE 08 Aug '12

08 Aug '12

Encore une question aux lutins : Qu'est devenue meanOverDim ? Il me semble qu'avant cette fonction était dans MatrixND (et on l'avait utilisée dans SiMatrix avec Eric pour le calcul de F), mais je n'arrive pas à en retrouver la trace... Loïc

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Différences entre deux fishingMortality
by Eric Chatellier 08 Aug '12

08 Aug '12

Bonjour, Actuellement dans IsisFish il y a un résultat matrixFishingMortality qui est calculé et une fonction totalFishingMortality qui somme cette matrice. Loic est en train de calculer une autre mortalité avec une fonction également nommé totalFishingMortality mais qui renvoie cette fois une matrice. Quelle est la différence entre ces deux mortalités ? Il faudra faire attention a bien différencier les noms de méthodes. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Message d'erreur à l'ouverture d'une zone
by Loic GASCHE 08 Aug '12

08 Aug '12

Salut les lutins, Nous sommes plusieurs à avoir rencontré le problème suivant : A l'ouverture d'une zone dans ISIS, nous avons un message d'erreur qui s'affiche, et la zone refuse de s'ouvrir... A priori cela se produit uniquement en l'absence de connexion à internet. Le debug est en PJ.

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Target Factor n'affectant pas la mortalité par pêche (et donc rien dans le modèle)...
by Loic GASCHE 18 Jul '12

18 Jul '12

Bonjour, Pour tenter de calibrer ma mortalité par pêche sur celle d'une année donnée, j'ai fait une AS sur le TargetFactor de mon modèle pour voir comment celui-ci pouvait faire évoluer F. Et il apparait que quelle que soit la valeur du TargetFactor testée la valeur de F n'est pas impactée du tout. Comme le TF rentre directement dans l'équation de calcul de la mortalité par pêche, ce résultat est plus que bizarre... J'ai fait différentes AS/simus avec des méthodes différentes et des durées différentes, aucun changement n'est apparu. J'ai essayé de faire une AS sur une autre base de données, mais l'AS ne s'est pas lancée et je n'ai pas eu le temps de regarder pourquoi. J'ai voulu essayer avec des paramètres discrets mais la fenêtre de sélection se figeait au moment de valider. J'ai quand même testé avec les deux types de paramètres continus à tout hasard mais le résultat est le même. J'ai mis le débug que j'obtiens en pièce jointe. Les deux premières erreurs concernent mon essai avec la base Gascogne, et la troisième erreur semble correspondre à un soucis de java a vue de nez... Donc voilà, si quelqu'un a déjà rencontré ce problème ou a une idée sur la manière de le résoudre je suis preneur ! Loïc

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[ANN] - IsisFish 4.1.0.2 released
by forge.codelutin.com Release Notification 18 Jul '12

18 Jul '12

The IsisFish team is pleased to announce the isis-fish-4.1.0.2 release! Simulateur de pecherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/isis-fish Changes ------- Changes in this version include: Fixed Bugs: o La sauvegarde des facteurs discrets ne fonctionne plus Issue: 1346. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/files/isis-fish * isis-fish-4.1.0.2-bin.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/409 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -IsisFish team

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Temps d' upload / download / suppression des simus ?
by Loic GASCHE 12 Jul '12

12 Jul '12

Bonjour les lutins (si vous n'êtes pas tous en vacances), Je ne sais pas si le sujet a déjà été mis sur la table, mais je m'interroge grandement sur la lenteur des échanges entre caparmor et ISIS... Par exemple il faut plusieurs heures pour charger une AS sur caparmor (plus même je pense que le temps de simulation en lui même)... et il faut des dizaines d'heures pour télécharger les résultats de cette même AS depuis caparmor vers mon pc. Autant dire qu'on perd une grande partie des avantages donnés par caparmor en termes de temps de simulation... Je ne sais pas trop comment sont échangées les données entre caparmor et le pc, mais n'y aurait-t-il pas moyen d'accélérer cette phase ? Par exemple au lieu de télécharger et supprimer chaque simu avant de passer à la suivante, ne pourrait-on pas toutes les télécharger et laisser la suppression se faire en arrière-plan après (pendant qu'on lance ou télécharge une autre AS) ? Loïc

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